Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13864 LG3 36872621 36877105 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 36872671 synonymous_variant p.Ile17Ile
A/T 36872690 stop_gained p.Arg24*
A/T 36872756 stop_gained p.Arg46*
G/A 36872857 intron_variant
A/T 36872864 intron_variant
C/T 36873387 splice_region_variant&intron_variant
G/T 36873401 missense_variant p.Arg86Leu
A/G 36873566 intron_variant
A/G 36873600 intron_variant
A/G 36873817 intron_variant
A/G 36873860 intron_variant
A/T 36873876 intron_variant
T/A,C 36873915 intron_variant
G/A 36873916 intron_variant
A/T 36874022 missense_variant p.Gln138Leu
A/T 36874024 missense_variant p.Ser139Cys
T/C 36874076 splice_region_variant&intron_variant
T/A 36874081 intron_variant
T/A 36874414 intron_variant
A/T 36874449 intron_variant
T/A 36874867 intron_variant
A/T 36874970 intron_variant
A/T 36874973 intron_variant
C/T 36875021 intron_variant
A/G 36875024 intron_variant
G/T 36875070 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13864.1
MKRSPSSSCSSSSETPIAEQGKRRPNYPRRNNLKSQKCKQNQTTCRRSSVYRGVTRHRWTGRFEAHLWDKTSWNNIQSKKGKQGAYDTEEAAARTYDLAALKYWGKDAVLNFPIGNYTKDLEEIDKVSKEEYLASLRRQSSGFSRGISKYRGVARHHHNGRWEARIGRVCGNKYLYLGTYKTQEEAAVAYDLAAIEYRGLNAVTNFDISNYIDKRKKDQTQETVAQRETVPNSSDSEEAEVEQQQNTTTPTPSENLHMAAVQHNQVPHTPLKEESSSLVTIMDHVLEQDLPWSFMYTGVSEFQDQDFAFSKAEDLVAMFGGGSGFEEDIDFLLSTEPCCETGSDVNMRAVFDSIECGEGGGNMVHGDNKQKEILSFASSSPSSTTTSVSCNYA*


CDS Sequence:
>Vu_13864.1
ATGAAGAGGTCTCCATCATCTTCTTGTTCATCATCTTCTGAAACTCCCATTGCTGAGCAAGGAAAAAGAAGACCTAATTATCCAAGGAGGAACAACTTGAAGTCACAGAAATGCAAGCAGAATCAAACCACTTGCAGAAGAAGTTCTGTCTATAGAGGAGTTACAAGACATAGGTGGACAGGTAGGTTTGAAGCTCACCTATGGGATAAGACCTCTTGGAACAACATTCAAAGCAAGAAGGGTAAACAAGGAGCATACGATACTGAAGAAGCTGCAGCCCGTACCTATGATCTTGCAGCCCTGAAGTACTGGGGAAAAGATGCAGTTTTGAATTTTCCGATAGGAAATTACACAAAGGATCTTGAGGAAATTGACAAAGTTTCAAAAGAAGAATATTTAGCTTCTTTGCGGCGCCAAAGCAGTGGTTTTTCTAGAGGCATATCTAAGTATCGTGGGGTTGCTAGGCATCATCATAATGGGCGTTGGGAAGCGCGCATAGGAAGAGTGTGTGGAAACAAGTACCTTTACTTGGGAACATATAAAACTCAAGAGGAGGCAGCTGTGGCATATGACTTAGCAGCAATAGAGTACAGAGGACTGAATGCAGTGACCAATTTTGACATAAGCAACTACATTGACAAAAGGAAAAAGGACCAAACTCAAGAAACAGTAGCACAAAGAGAAACAGTTCCCAACTCCTCAGACTCAGAAGAAGCAGAAGTAGAACAACAACAGAACACAACTACGCCAACCCCTTCTGAGAATCTGCACATGGCAGCAGTGCAGCACAACCAAGTTCCACACACACCCCTTAAGGAAGAGTCATCATCACTGGTCACTATTATGGATCATGTGCTTGAACAGGATCTGCCATGGAGCTTCATGTACACTGGGGTGTCTGAGTTTCAAGATCAAGACTTTGCTTTCAGCAAAGCTGAGGATTTAGTAGCCATGTTTGGAGGTGGTTCAGGGTTTGAGGAAGACATTGATTTTCTGTTGAGCACAGAGCCTTGTTGTGAGACTGGGAGTGATGTCAATATGAGAGCAGTTTTTGATAGCATTGAATGTGGTGAGGGTGGTGGAAACATGGTGCATGGGGATAACAAGCAGAAGGAGATACTATCTTTTGCATCTTCTTCTCCATCATCTACAACAACTTCAGTTTCTTGTAACTATGCTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13864::LG3:36870621-36872621(+)
ATTTGATTAAAAAGTAGTAAGATTAATATAATATATTGAGTGCCAAAAATTCAAACACTTTGCCTAACGTTGTTCATTAACCAAATTAATTTGTAGAAATTGTATACGTATTAGCATAGAGATATCTTAACAATAATTTTAAAGCATAAACATTGTGAAATTGTGAAATGACAAATTTCAAGCCAGTTTTTTAATTGAAAATATAATTGTAAGAGTTGAAAGATGATTATTTTTTATTCATGAATAATATTCAGAGTTGGTATTTGAAATGGTATGAATTGATATGTAATCAAATCATTTAAATAGTAAAAAATTAATGCTAACTATTAAATATGTATAGTTTTTCAGACAACAACGTCTTAAATGTTTTTTAATTAATGAATTTGGGTGTTTCAATATTCTTTTATAGACAGTTTTATACGTTATTTTGTTCAGTAAATCAATATCTGAGATGTTAAGAGAATCACTGCAAAGTAATTAATAAGAGAGAAAACGTGATTCATGCATAATTAAGAATAACTGAGTTCATCTTCAACAACACCACGGAAGGAAAAAATACCACATTAATGTTTGGTCTATAACACAATATTGTTTCAAACATTCATAACTCTATTCAAATTGAGATGATGCGTCAAAATAATAAATGAATGAAAATGATTAAATATATGTATTATTTTTTCTTTTTGCTTTCAATAAAGTAATATATTTTGAATTTCCTTTATTTGATATATAAAAATTTTGAATTTCATATTTATTTTTGTGTGTTATTTTTCTTGTATTTTCAAAATATATGAATCGATGTTGATTTTTAATTTTTAAAATATATTTAAAACTTTTTAGTATATCAATATCATATATTTTAAAAATTTAACACACAGATAATATAACAAAAGAAACAAATACTAAACTTAAAAATAATGGTACTATTATTTTAATACCCAATAAATTTTTATAACTTTAAATTCATTATTTTAATTTTTAACTTTTTTCTACAAATACAAAAATTGATTTTTTTAATGATCAAAGAGTTGTTAGTGATAAAATAGACAATCTAAACTTATACATATATGAAAATAACTTAAAGGAAGCATTGCTTAATGTGATTCAACTTTCAAAGTGGCACTATTCATCTTGTAAATTGCACACACAAGAATTATGATGAGAATGAGATAAAAAGATTAAAACATATATAGCTAACAAACAGAACAAAGATTGAGAGTGTTTCCATCCTTTCATAACTTCTGAATTTTCTTTGTTTCTTGCACAAAACATTCTCAACTAATTTCTGATTAAGGTACATTCTCTCATATCTCACATGTTTGTGCCAACAACTAATATTACAGACACACAAAAAAGAAAAAACACAGTCTAAAATGACAGTATCTGACGTGGACTCTTGACACTACCCAATTAAGTCAGGTAAAGTTCTCTTCTTTTTTCATTATTTTAATGACTGAGAACCAATTTAAAAATGGTTAAAAAATAAGGTTGAGATTCCTAAACAAAAGAAAGCCAGCTTAGAATACATAATCCCATTGGTAGCATGGCTGCACCACCCTTGTTCCTCAAGTTCAAGCCACATAATTAGCCATGGTTAATTCATCAAGTTAAATTCCAACCCAAGGTTAAACCAACCATCATCACTTCCTTTTCTCTTCTTCCATTTACTTTCAGTTCCTTTTTTCCACTTCCACCCTTCTTACAATTGCAGATTCAATTGTCTATATAACTATTTTCCCCTTCTTTTTATACATCCAAATTTCTTCCTTTTTTTCCTTCTTTCTCTCTATTTTGGTGAACCACTTTAGGTAACCAGATTGCTCCCACAACTGTACATATAAATATGCCATCATAGAACATCATAGAAGGGAAAAAGAGAGAAACTTGGCAAGGCAAAACATTTAAAAATCCATTTTTTATCTCCATTCACACACCCCATTTGAGTTTTTCTTCCATTTCTGTTCTTTTGGGGCAAAAGGGTGTTCAGATTGAGGCACCAA


Gene Sequence:
>Vu_13864(+)
ATGAAGAGGTCTCCATCATCTTCTTGTTCATCATCTTCTGAAACTCCCATTGCTGAGCAAGGAAAAAGAAGACCTAATTATCCAAGGAGGAACAACTTGAAGTCACAGAAATGCAAGCAGAATCAAACCACTTGCAGAAGAAGTTCTGTCTATAGAGGAGTTACAAGGTTCATGAATTTCACTTTTCAATTGTAAATTTTGAATTCTCCTCAGTGATTCTTCATCTGCATTTGCATGTCTCTCATTTCTCTTTGATCATCAGACATAGGTGGACAGGTAGGTTTGAAGCTCACCTATGGGATAAGACCTCTTGGAACAACATTCAAAGCAAGAAGGGTAAACAAGGTAATTGCTTTTCTCTCTTCAATTATCCAATTAACAAGAGAGAAAATCAAGGAGATCTAATCTAATTTAACATCTTTTCTTTATGTTTTCTTAATTAATATTATTATTACTGTTATTATCAGTTTCTGACCTTGTTTTGTTTCTGCTAATCTTTCTGATTGCAACGTTTACACGCTTTTGGGGCTGTTTAGTTTATTTGGGTAAGTCATTTTCTCATGCACTTGGATCTCACAAAATCCTAGTCAACTTTTTCATTTTTTTTTTCTGAATTCTTAATTATTAATTGAACTGCAGTATTTCTTTTTCTGGATTGTTATTGTTTTTTTTAATGTCAAGAAAGATTCTGATCATGATGCTGTTGTTTGGACCCAATTCTCTGCTTTTTTTAATTTTATTTTTTAATATTTTCCTTTTTTTTTTTCTGCAGGAGCATACGATACTGAAGAAGCTGCAGCCCGTACCTATGATCTTGCAGCCCTGAAGTACTGGGGAAAAGATGCAGTTTTGAATTTTCCGGTATATCAATTTTTTTCAATTTATCCCATAGATAAAAATGTAATCTTTTTAAAGTTTACAATATGATGTAAAATTCTCTTCTCTAAAGTATATTAAATATATAATTTTTTAAATTATAAAAAGTTGTATTTCATCTTTATAATGTATTATATAATAGTTAATCTTTATTCTCTATAAAAATAAAGTAAATCATTTTTTTGACAAATAATATATTACAGTTCCTTGATAAATTAATTATAATATAAAAAATATTTCAGATGTTGTTCATTAGAATCAATGTTTTATATTAATTTTATAAAACATTGAGACTGAATTTTTTAGAATTTAATTTAGGGAAAAAATATTTTTTTATAATAGTTTAGAAGAAATATTTAACCTAAAAAAATATAATCATATGATTAAAAAGTTTATTTTTTTGTGTAATGTAAAAAATTGTGACAATATAGTGTTTTTGTTTTGTTCAGATAGGAAATTACACAAAGGATCTTGAGGAAATTGACAAAGTTTCAAAAGAAGAATATTTAGCTTCTTTGCGGCGCCAAAGCAGTGGTTTTTCTAGAGGCATATCTAAGTATCGTGGGGTTGCTAGGTTAGTTGAATTGTGATTAAAATCATTTCTTTTTTTACTTTTTTTTTTCACTGTATTTTACAATTGTAATTGTAATTTTCCTAATAAATTAAGGGTAAAATTAAATTTCTTTTTTCTGTAAATATTGTTATTCTGATATTAATATATTTATGTTTATATTTGCACAGGCATCATCATAATGGGCGTTGGGAAGCGCGCATAGGAAGAGTGTGTGGAAACAAGTACCTTTACTTGGGAACATATAGTAAGTAGTCACATTTATTTTCTATTTTTCAATCATTAAATTTTACTGTATATTTTTTTTTTTGTGAAATTCCAAAGCTAAATAAAAATACAGATAATTTCACATGTGGCAATTGATAAAGTGGGAGAAAGTACACTTTGTAGACCCCAAAGCTATGAATACTCATATCTTGGTTACAATTTAGAAACTTGCTATTTTTCGGCTTCTTTCTTATCCATATGTTGCACAAAAATAAGTCAAACTTTCAATCAGATTTATACCCTCTTTTTTTATTTAAAGATAACATCCACAAAATACTAATAATTGAATGATAAAAGTTAGAGTTAAACAGTATTTGTATTCAGCTGAAGAAAATATGTGTAAATAGAAGAGACACAGAAAATTTACAAAATTTTAGTTTTCTTTCTTTTAATTTTCAATTCAAATTTCAAAATCTTCTCTTTATACTCAACCTCCCTCTAGTTAAACAAAATAGTATTTGGTTATAATCTTCTTCAAAATCACATTTTCACGTTATATAAGACAAAAATTCGCTCACAAATTCCAAGTACATGTCACGGCTGATTACAAAATTTCTATTCTCTTTGTCTGACTCTATTTATTTTTGTAATTGAAAAATAATTTTGACAAAAAAAAATTGTTCAAGAAATAAAACACAAGTAAAAGAAAAAAAAAACTCAAGAATTGTTTTAGCTTCATTTTTATTCCGAAAGAATAGTTTTTAAAGAATTTTTTTTGTTGAGTTGAAGAGAAGGGGTGTTTGACATAAAATCTCTTTGTTGTGTGTGTGACATGTAAAAGAACATGGTATTTTATAATGAAAGGTGAAAATAAAAGAACAAATAAATGTTTCCTTAATTTTTAAGAAAATATTTGACAAGTACAGGTTGTAAACCTGCAGTTCTCATAATTAATGACAGTGAAAAAAAGAAAAAAAGAGAAAAGGTTGAGTTCTAGGATGCATCATGTGTGTGAGTTGTTCTCATTGCTTGAACTGTAGCTGCAGTAGTGTTGTCCAGTAGTTGCAGTATGCATCAATTTCTGGTCTGACATTACAATATGTGGCTGTGGATCACATAAAAATAGCAGCATAGGAAAGTTACAGCTGCAAACACTCACCAACATGGCACGTGCATTACCCCCCTCTTCCTTTCTTCATGGGTCCACTTTATTCAAAGTCACCACCACACCCTTCTCTGTGGGGTTATCATAACCATAATTCAGTTGCAATTTTATATAACTTTTATACTAGTTAACTTTTTAACTTTTATTCATGGTAAAATTTTAATTCTTCTGCTGATTTTTTATCATGTCAAAAATTTTACAGAGATCAAATTCATAAAATGACAAGTGTAAGCAAGTAAAAACATTATGCCATTTCTTCTATTGAAATATTTTGTTCTAATTAAGAAGTTTTTGAAAGTTTAAGCAATGTGATTTGTGATAATTAGGTTAGTTTGAAGAGAATTTAGTTGGCCAAGTTGAATCTAACATTTGACAATAGAACCCTAAACCTCATAGACAAGCATGTTGGAGGGTACAGCATATGCTTGACTTTGTACTTTGTTCATATGCAGTGTCCACAATCTCTTGCCAGCATGTCGGTCAAAAGTATGAATTTAAAAATTGTCAATCTTGAGGGCAGAATAAAATAAAAGGCTTGTTTGAATAGTTATATAGATAGCTGAAAAGATATGCTAAGAATTAAAAAGAGAAGTAGATCAGGAAGCAGGACACAAACACCCCCCAAATTCAGTAAGCACGTGAACACTAATCCTGTCCTCATACTTCAAAAGCTTTTAACTTTGTGAGATTCTATGTATGTCATAAAGTTGTCTTTTTTTCAAACCTTATTCTTTCTTAATTAAATAATCACCAACTACTTTTAGTTAACACTGCTGTGTTTCTTAACAATTTTGATTGTCTTTTAATCCAGTGATCAGATTCTGAATCTGATAATGTCATCAAATAAACTGTCTACAATTATCACTTCAAATGTGTTAAGATAACATCATAAGATCATATAGAATTTTGTCTTTAAAACATCATATGATCATATATTTTCCCTGTGTAAGAATCATTTCTTCTGTTTTAAGTGCTAATCATTTAGGGGTATTTATTTTTTCTTTTGCTTGATTTGAACTGCAAAGAAACTCAAGAGGAGGCAGCTGTGGCATATGACTTAGCAGCAATAGAGTACAGAGGACTGAATGCAGTGACCAATTTTGACATAAGCAACTACATTGACAAAAGGAAAAAGGACCAAACTCAAGAAACAGTAGCACAAAGAGAAACAGTTCCCAACTCCTCAGACTCAGAAGAAGCAGAAGTAGAACAACAACAGAACACAACTACGCCAACCCCTTCTGAGAATCTGCACATGGCAGCAGTGCAGCACAACCAAGTTCCACACACACCCCTTAAGGAAGAGTCATCATCACTGGTCACTATTATGGATCATGTGCTTGAACAGGATCTGCCATGGAGCTTCATGTACACTGGGGTGTCTGAGTTTCAAGATCAAGACTTTGCTTTCAGCAAAGCTGAGGATTTAGTAGCCATGTTTGGAGGTGGTTCAGGGTTTGAGGAAGACATTGATTTTCTGTTGAGCACAGAGCCTTGTTGTGAGACTGGGAGTGATGTCAATATGAGAGCAGTTTTTGATAGCATTGAATGTGGTGAGGGTGGTGGAAACATGGTGCATGGGGATAACAAGCAGAAGGAGATACTATCTTTTGCATCTTCTTCTCCATCATCTACAACAACTTCAGTTTCTTGTAACTATGCTTAG