Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13836 LG3 35999713 36004551 probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein glycosylation, protein glycosylation, protein glycosylation, protein glycosylation, protein glycosylation
Cellular Component   located in   Golgi apparatus
Molecular Function   enables   glycosyltransferase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 36002285 upstream_gene_variant
A/C 36002320 upstream_gene_variant
T/A 36002636 upstream_gene_variant
C/T 36002650 upstream_gene_variant
C/A 36002726 upstream_gene_variant
A/G 36002733 upstream_gene_variant
T/C 36002970 upstream_gene_variant
G/T 36003896 synonymous_variant p.Thr834Thr
A/T 36003948 missense_variant p.Thr852Ser
G/T 36004076 upstream_gene_variant
C/G 36004082 upstream_gene_variant
A/G 36004514 missense_variant p.His962Arg
G/A 36004533 synonymous_variant p.Leu968Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13836.1
MNTFPPLLAIIFACLLCTIMFYTGNCNSNIRCNKKDKDALLKFKQGIEDPAGVLFSWSTQHDCCEWKGVMCDNFTSRVTQLSLPCYTTPPTYTDKIDKSHCLTGSIYLSLFVLEFEFLYHLNLSNNNFSTIQFGSHVYSLNCHNLSTATPSHRCVNSSDLRYLDLSFNFYAKTSLQWLSHFSSLKYLNLDGIDLHRETKWLQSVIKLPSLLELHMHHCHLKDLSPYLQFANFTALKVLSLPGNDFRSVLPKWLFNLSSGISSIDLGSNFLQGQLPKAMLDLRHLEILNLHDNYFNGPIPHWLGEFEHLRHLNLRKNMFSGSIPTSLGNLSSLVFLGVNSNRLTGVVSEKTFARLSKLKKLGIFISPPLIFDFDSNWIPPFQLERLNLAFSGTKFPEWLYTQKSLESLSIYESSFEGSEKFWNFLSRMKEVNLEQNSIDGNLSNVLLNSAFVSLSSNDLKGWLPRLSSNVVVVRLSNNSLSGNLSSLLCDDEMLNGKSNLVYLDVSLNRLSGGLTNCWGNWKSLVHVNLGSNYLTGKISPSMGLLPNLTSFHLHENKLYGEIPSSLKNCHSLLIFNVRENNFSGNIPNWIPDAAKVLQLRSNHFTGNIPPHICQMSSLIVLDIADNTISGHIPNCLHNITALVSGKTSVHMLSFFFPLPDGRYYTFEDNLELPEGENSEKAMAMTAKSNKSNTSLTVPNLFLFFILLSLFSLFIFLFFPTATILHSSTYPHASTTINVYVADLPRSLNYDLLHRYWTSFSDSRLSTDEDHRHPPSLHPVAKYPPYPDNPLIKQYSAEYWIMGDLMTPPQHRVTSFAKRVLDPRLADVVFVPFFATLSAEMQLGANKGAFRKKTGNEDYKRQREVMDAVRSTEAWNRSGGRDHVFVLTDPVAMWHVKDEIAPAILLVVDFGGWYRLDSRGSNSIESGVVPHTQAPGKYWTIRVNFGTFRVFYVVLAVTIIGIVRHCEQMSLMQQQF*


CDS Sequence:
>Vu_13836.1
ATGAATACATTTCCTCCTCTGCTTGCAATCATCTTTGCCTGTTTGCTATGCACAATCATGTTCTATACTGGCAATTGCAACTCCAATATTCGCTGCAACAAGAAAGACAAGGATGCTCTCTTAAAGTTCAAGCAAGGAATCGAAGATCCAGCAGGTGTGCTCTTTTCATGGTCAACTCAACACGATTGTTGCGAATGGAAAGGAGTCATGTGTGACAATTTCACGAGTAGAGTCACTCAACTCAGTCTTCCTTGTTACACAACTCCTCCAACTTACACTGATAAAATAGATAAATCACACTGCCTCACAGGTTCCATTTACCTATCCTTGTTTGTCCTGGAGTTTGAATTTCTATATCACTTGAATCTGAGTAATAACAACTTCTCAACTATTCAATTTGGTTCTCATGTGTATTCCCTAAATTGCCATAATCTGTCTACTGCTACTCCTTCCCATCGATGTGTAAACTCTTCAGATCTTCGTTATCTTGATTTATCGTTCAACTTTTATGCCAAGACCAGTCTTCAATGGCTTTCTCATTTTTCCTCCTTGAAATATCTTAACCTCGATGGCATTGATCTTCACAGGGAAACCAAATGGCTTCAATCAGTCATCAAGCTTCCATCACTTTTAGAGCTCCACATGCATCATTGTCATCTTAAAGACTTGAGTCCGTATCTTCAATTTGCCAATTTTACAGCACTCAAAGTTCTTTCTCTTCCTGGAAATGATTTTAGGTCAGTGTTACCAAAATGGCTATTCAATTTAAGTAGTGGTATCTCTTCCATTGACCTAGGGTCAAATTTTTTACAAGGTCAACTACCTAAGGCGATGTTAGATCTTCGACACTTGGAAATCTTGAACTTGCACGACAATTACTTCAACGGACCAATTCCACATTGGTTAGGAGAATTTGAACATCTGAGACATCTTAATCTTAGAAAAAACATGTTTTCTGGATCTATTCCCACAAGTTTGGGAAATCTATCATCCTTAGTTTTCTTAGGGGTCAACTCAAATAGATTGACGGGAGTTGTGTCTGAGAAAACTTTTGCCAGACTGTCAAAATTGAAGAAGTTAGGCATATTCATATCACCACCATTAATCTTTGATTTTGACTCCAACTGGATTCCTCCCTTTCAACTTGAGCGATTAAATCTTGCATTTTCAGGAACTAAATTTCCTGAGTGGTTATACACACAAAAGTCTCTTGAATCTTTAAGTATTTACGAATCATCATTTGAGGGTAGCGAAAAATTTTGGAATTTTCTGTCAAGAATGAAAGAAGTGAATTTAGAACAGAATTCGATAGATGGGAACTTGTCAAACGTGTTGTTGAACTCTGCTTTCGTATCTTTGTCATCAAATGATCTGAAGGGTTGGTTGCCTCGATTGTCATCGAACGTGGTCGTTGTACGGTTGTCAAACAACTCATTATCAGGAAACTTGTCTTCTCTCTTGTGTGATGATGAGATGTTGAATGGGAAAAGTAATTTGGTGTACTTGGACGTATCACTTAATCGTCTGTCGGGAGGACTTACAAATTGTTGGGGAAACTGGAAATCATTGGTTCATGTTAATTTGGGAAGCAATTATCTAACAGGCAAGATATCACCATCAATGGGCCTGTTGCCTAATCTCACATCATTCCATCTACATGAAAATAAGCTCTATGGAGAAATTCCCTCCTCGCTGAAAAATTGTCACTCTTTGTTAATCTTCAATGTTCGGGAAAACAACTTTTCAGGAAATATACCAAATTGGATACCAGATGCTGCAAAAGTTCTCCAATTAAGATCCAATCATTTTACAGGAAATATCCCACCACATATATGCCAAATGTCTTCCCTCATTGTTTTGGATATTGCAGATAACACAATCTCAGGACATATACCCAACTGCCTTCACAATATCACAGCCTTAGTTTCCGGCAAAACTTCAGTCCACATGCTTTCTTTTTTCTTTCCCTTGCCTGATGGTCGCTACTACACCTTTGAAGACAATCTTGAGCTGCCCGAGGGAGAGAACAGTGAGAAAGCGATGGCAATGACGGCGAAGAGTAACAAGAGCAACACCTCCTTAACCGTTCCGAATCTGTTTCTCTTCTTCATCCTCCTCTCCCTTTTCTCACTTTTCATCTTCCTCTTCTTCCCCACCGCCACAATCCTACACTCTTCTACCTACCCTCACGCTTCTACCACCATCAACGTCTACGTCGCCGACCTCCCCCGATCCCTCAACTACGACCTTCTCCACCGTTACTGGACCTCGTTCTCCGACTCCCGACTCTCCACCGATGAAGATCACCGGCATCCCCCCTCCCTCCATCCAGTGGCCAAATACCCGCCTTACCCGGACAACCCTCTCATCAAACAGTACAGCGCGGAGTACTGGATCATGGGCGACCTTATGACCCCACCACAACATCGCGTCACATCCTTCGCCAAGCGTGTCCTCGACCCGCGTCTCGCCGACGTCGTTTTCGTTCCGTTCTTCGCCACGCTCAGCGCGGAGATGCAGCTCGGAGCGAACAAGGGCGCGTTCAGGAAGAAGACCGGGAACGAGGATTACAAGCGGCAGAGGGAGGTCATGGACGCCGTTAGAAGCACCGAGGCCTGGAACCGTTCCGGAGGACGAGATCACGTGTTTGTGCTGACGGACCCGGTGGCCATGTGGCATGTCAAAGATGAGATTGCCCCTGCTATTTTGCTCGTTGTGGATTTTGGCGGTTGGTATAGGCTTGACTCCAGAGGTTCTAACTCTATTGAGAGTGGTGTGGTTCCTCATACTCAAGCACCGGGTAAGTATTGGACTATCCGTGTTAACTTTGGTACGTTTCGTGTGTTTTATGTTGTGCTTGCTGTTACCATCATTGGAATTGTGAGACATTGCGAACAAATGTCGCTGATGCAGCAACAATTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13836::LG3:35997713-35999713(+)
AACGCATGATGTATCCTCTGGCTGGGCTGTACTGGATAGTTTGACTATTCCTGAATGCAGGTTGCATTAAACTGCAGCATTAGAAATTAGCTTAAAAGATTTCTTTATATGCTTGTGTTTTTTAGTACTATTTACTGCTTTTTGTGTTGATGCTAATGGCTATTGATTGGAGTTTCTTCCCTTTTGATCATGTCATCCCCAAAGGCATAATCAGTGACAGTTTTGCCTGAATGCTTTTTCTTTTCTTTTATCGCTCTTTATGAAAAACCATCTGCTGGATTTTTATTGAAAAAAAAATCAATGAAGTGGTTTATTGCTTAATAGTGAAAGCTTTCATTTTAAAAGTATCATTATAATTTTGTAATTGAAAATGAAAAATCCATATAGAGATAGGAAGAGTAAAAGACAAAACGTAGAAATGAATATATATGAAAATATACCCAAATAATAAGAAAAAAAAAACACACTCCTTTCCACTATAAAATGGGTGAAATTAAATTTATCAGTAATTGTTTCTATTTTTGAAATTATTTTAAGTATTTTAGAGATTAATATTTTTATTTTTATTTAGTTATTTATCACCTCAGTAATTAACGTTTTGAGAGAGAGAATTATGTAATTTGTGTTTATCGTATTCTCTTATCTGAATAAAAAATAGTTTATTCAAAAAATATTAATAGTTTATCATATTAATTATAATATTTATCATTTTTCTTCAAAAAATATTAATTAGTTAAGACAATTTAAACAGATCTTATGTTAACAAATTATTCTCAATTAGTAATAATTGGAAGTAAATAAATGAACTGATAAAAAGGACAAATGAGAATTTTACTGTGTATTCTAGTTTGTATATAAGAGCGAATTAATATAAGATATTTTATCGGTTATAAGAAAACTTAAAATAATAAAAAAAGAAAAAAGCATCACTTTTTCGTTAGAAAAGTTAATAACTAATAACAAATGTAATTCTATTGGTGATATGTAAATGCTAAAAATGTCGTTATTCGATTAGCCGAAGGAAATTGATAATTATTCTATGTAAAATGATACTTGAACAACCATTTTTGACAACATTTAGACACGTGCACACATGTCAAAATCTGAGTGGTCCAGTTGGAAAAATTAAATGAAAATGGACCACTCAGATTTTGACACGTGTGCGCGTGTCTAAATGTTGTCAAAAATGGTTGTTCAAGTGTCATTTTCCTTATTCTATTAGCTTAAGGAAATTGATAATTTTGGGAACCGACAATTTTGTTTGACTGTAACACTAATTACCCTGCAGCAATCTTAACAATATAGCACATCCAACCATTCATATAAGGGTATTGCTTCTACACTCTATCAAATTTCTGTCTCACCCCATCAACAGTGGGATTTATCCTACAGTTACATTCTGTTGTAATACTGAATTAAACTACTTTGATATTTATGTTTTAATTGAAATTTAAATATTAATATAAAATATAATATAACTACATAGAGCTATTAATTTACATACTGTCACTGTAGAGAGTAAGACTTTGATTTTTGAAATTTCTCATTCCATCATGTGACTTGGGCATCAAAGATAATAAATGAGCTTTTATTAAGGATTGAAATTTCTCACTCCATCGTGTGGGGAACATATTCTGTCATGCGCGTACAAATACACGGAGATTTAGCTGCACAAACAGTTGCAATGGTAATAATATTTTCCATTCAACATAAAATTTTATCTGATGTGAAGTATTTTATCCTGTTATCCAGATATGAACGATGGAAAATGATATTTTAACCGACACAAAATTTTTATATTCATTTGAAATTATTTTTTATTTATTAATTATTTTTTATTTTTATCTTTTTAAAAAAATACAAAAGTTCATTCTACCTTTACTAAAATATAATGCGTCAAAGTCCAAACTCTTCAACAGTATAAATAGAGTCCTTCATTTTATAATATCAAGACAAATTCAGAATGTCAGTAGAGTTCCATTGAATCAAGGTTCAGACCA


Gene Sequence:
>Vu_13836(+)
ATGAATACATTTCCTCCTCTGCTTGCAATCATCTTTGCCTGTTTGCTATGCACAATCATGTTCTATACTGGCAATTGCAACTCCAATATTCGCTGCAACAAGAAAGACAAGGATGCTCTCTTAAAGTTCAAGCAAGGAATCGAAGATCCAGCAGGTGTGCTCTTTTCATGGTCAACTCAACACGATTGTTGCGAATGGAAAGGAGTCATGTGTGACAATTTCACGAGTAGAGTCACTCAACTCAGTCTTCCTTGTTACACAACTCCTCCAACTTACACTGATAAAATAGATAAATCACACTGCCTCACAGGTTCCATTTACCTATCCTTGTTTGTCCTGGAGTTTGAATTTCTATATCACTTGAATCTGAGTAATAACAACTTCTCAACTATTCAATTTGGTTCTCATGTGTATTCCCTAAATTGCCATAATCTGTCTACTGCTACTCCTTCCCATCGATGTGTAAACTCTTCAGATCTTCGTTATCTTGATTTATCGTTCAACTTTTATGCCAAGACCAGTCTTCAATGGCTTTCTCATTTTTCCTCCTTGAAATATCTTAACCTCGATGGCATTGATCTTCACAGGGAAACCAAATGGCTTCAATCAGTCATCAAGCTTCCATCACTTTTAGAGCTCCACATGCATCATTGTCATCTTAAAGACTTGAGTCCGTATCTTCAATTTGCCAATTTTACAGCACTCAAAGTTCTTTCTCTTCCTGGAAATGATTTTAGGTCAGTGTTACCAAAATGGCTATTCAATTTAAGTAGTGGTATCTCTTCCATTGACCTAGGGTCAAATTTTTTACAAGGTCAACTACCTAAGGCGATGTTAGATCTTCGACACTTGGAAATCTTGAACTTGCACGACAATTACTTCAACGGACCAATTCCACATTGGTTAGGAGAATTTGAACATCTGAGACATCTTAATCTTAGAAAAAACATGTTTTCTGGATCTATTCCCACAAGTTTGGGAAATCTATCATCCTTAGTTTTCTTAGGGGTCAACTCAAATAGATTGACGGGAGTTGTGTCTGAGAAAACTTTTGCCAGACTGTCAAAATTGAAGAAGTTAGGCATATTCATATCACCACCATTAATCTTTGATTTTGACTCCAACTGGATTCCTCCCTTTCAACTTGAGCGATTAAATCTTGCATTTTCAGGAACTAAATTTCCTGAGTGGTTATACACACAAAAGTCTCTTGAATCTTTAAGTATTTACGAATCATCATTTGAGGGTAGCGAAAAATTTTGGAATTTTCTGTCAAGAATGAAAGAAGTGAATTTAGAACAGAATTCGATAGATGGGAACTTGTCAAACGTGTTGTTGAACTCTGCTTTCGTATCTTTGTCATCAAATGATCTGAAGGGTTGGTTGCCTCGATTGTCATCGAACGTGGTCGTTGTACGGTTGTCAAACAACTCATTATCAGGAAACTTGTCTTCTCTCTTGTGTGATGATGAGATGTTGAATGGGAAAAGTAATTTGGTGTACTTGGACGTATCACTTAATCGTCTGTCGGGAGGACTTACAAATTGTTGGGGAAACTGGAAATCATTGGTTCATGTTAATTTGGGAAGCAATTATCTAACAGGCAAGATATCACCATCAATGGGCCTGTTGCCTAATCTCACATCATTCCATCTACATGAAAATAAGCTCTATGGAGAAATTCCCTCCTCGCTGAAAAATTGTCACTCTTTGTTAATCTTCAATGTTCGGGAAAACAACTTTTCAGGAAATATACCAAATTGGATACCAGATGCTGCAAAAGTTCTCCAATTAAGATCCAATCATTTTACAGGAAATATCCCACCACATATATGCCAAATGTCTTCCCTCATTGTTTTGGATATTGCAGATAACACAATCTCAGGACATATACCCAACTGCCTTCACAATATCACAGCCTTAGTTTCCGGCAAAACTTCAGTCCACATGCTTTCTTTTTTCTTTCCCTTGCCTGATGGTCGCTACTACACCTTTGAAGACAATCTTGAGCTGGTTACAAAGGGTCAAGCAATAAAATACGGAAAAAACCTGCACTTTATGAACTTAATTGATTTGTCAAGTAACAATATTTCTGGAGCATTACCTCCACAAATGTTTAGACTCCTTGGATTATGTTCCTTGAACTTGTCCCACAATAAATTAACCGGAAAATTTCCAAATGAGATTGGAAACATGAACCAGTTGGAGTCCCTTGATTTTTCAGCAAACCAACTTTGGGGTGAAATTCCCCAAACTCTATCAAATCTGTCCTTTTTGAGTTACTTAAACCTGTCATTCAACAATTTCACAGGCAAAATACCATCAGGAACACAGCTCCAAGGTTTCGGTGAACTTAGCTATATCGGTAATACTTATCTTTGTGGACCTCCACTTACAAAAACATGCTTCCAAGATTATGTAAAGCAAATAAAAGAAGATGAGGATAAATCTGAATTTTGGTCATGGTTTTATACTGGAACAGAAACTGGATTTGGCATGAGTTTTTTGGGAGTTTGCTGTGCCCTTTTCTTAAATGGAAAATGGAGGCACGCTTACTTCAAGTTTCTCTGTCGTTTGATAGATCGACTTTATGTTATGGGACTCATCACTATAAATTCCTTCTCTTTTGCGTAGTGGTAAGCAGAAACTTTCAATTGGGGTTTCGATTTATTTTATTTATCGAATTGATCATACTAGAGGCTTTTATATTACATGCCTGTGATAATGACAATGCTTTTATTATATTATACCTTCAGGCATTCCTCATTCTTCAGAAGGGAATAAGTCATCAAGTGGGAGAGAAAAAAAAGACAGTGATGCAATTTTGATGGCAACAGCGACCACTGTCCATTAGCTCAAGATTTAGATTTTGTTTTTATTCCATCGGCAGACTGCGATTATACTTCTAGACTTCTCTTTTATTTCTTTATTTTCCCACGTAAGGATCTTACAGCATTACGTAATTAATGGCGTTAATCACTACAGCATTATCTTCTGAAGATGCATCCATTTTCATTTTCAAAAACCTTTACTTTACTCTCCCAATTTAAGTTTCTTGTCCGTTTACAATCATAGTATTTTGTTTTTATCTGAAAACTCTTTAATTTATCTGTCAAATTTTACCCTTCTCATGTTTTTCATTAATTAGTTCAAACTTCTTTAAGCTTATATCTGGAAAAAATTATGTTTTAGGAAATTTACAATGTTTAAATTTGTATCAGTTTGATTTTTTTTTTTGTTTTAATAAATTCATTCAGTTTTTTAAATTTTAAGTTCTTAGTTTAGAAAGAATAGTTTAATTTTTACTACATAAAAAGTTAACTAAGTACTTTCAAAATTTAACATTATAATATTTATAAATAAAAATCAGATAATTTAAATGTTTAATCATTAAAATATTAATATAAAATAACATTTAATAATTAAAAAGTACGTGACACTTCACTTCGATATTAATTCTAAAGGAAGAGAAACAAAGAAAAAGAACATGTAAAATGAAGGAGAGAGGAGAGACAAAACTGATACAAGAGAGAAAAAAAAGAAGATAAAGAAAGAGTATAATATATTAAGTATATATTATTTATTCTAAAATATATGTTAAATAAAGTAATAATTTCTTTTTCTTTTTTAAAGAAAAATACCCACCATCTTCTTGTTTTCTTCTCCCTTGTGTCACCTTATGTTCTTACAGGGAGCCCGAGGGAGAGAACAGTGAGAAAGCGATGGCAATGACGGCGAAGAGTAACAAGAGCAACACCTCCTTAACCGTTCCGAATCTGTTTCTCTTCTTCATCCTCCTCTCCCTTTTCTCACTTTTCATCTTCCTCTTCTTCCCCACCGCCACAATCCTACACTCTTCTACCTACCCTCACGCTTCTACCACCATCAACGTCTACGTCGCCGACCTCCCCCGATCCCTCAACTACGACCTTCTCCACCGTTACTGGACCTCGTTCTCCGACTCCCGACTCTCCACCGATGAAGATCACCGGCATCCCCCCTCCCTCCATCCAGTGGCCAAATACCCGCCTTACCCGGACAACCCTCTCATCAAACAGTACAGCGCGGAGTACTGGATCATGGGCGACCTTATGACCCCACCACAACATCGCGTCACATCCTTCGCCAAGCGTGTCCTCGACCCGCGTCTCGCCGACGTCGTTTTCGTTCCGTTCTTCGCCACGCTCAGCGCGGAGATGCAGCTCGGAGCGAACAAGGGCGCGTTCAGGAAGAAGACCGGGAACGAGGATTACAAGCGGCAGAGGGAGGTCATGGACGCCGTTAGAAGCACCGAGGCCTGGAACCGTTCCGGAGGACGAGATCACGTGTTTGTGCTGACGGGTGGGTTTTGGAAACAGTTTTTGTTTTTCTTTTTTTGCGTTGAATGTGAGGGTGTTTCGGCTTATGAATTTCTAGTCTTTGGATTCTCAGGGTATTAAAACTGAAGCGTTGTTTGGCAGACCCGGTGGCCATGTGGCATGTCAAAGATGAGATTGCCCCTGCTATTTTGCTCGTTGTGGATTTTGGCGGTTGGTATAGGCTTGACTCCAGAGGTTCTAACTCTATTGAGAGTGGTGTGGTTCCTCATACTCAAGTTTCTGTGATTAAAGATGTGATTGTGCCTTACACGCATTTGCTTCCGAGGTTGGATTTGTCACAAAACAAGGAGCGTCACCAACTTCTGTATTTCAAAGGAGCTAAACATAGGCACCGGGTAAGTATTGGACTATCCGTGTTAACTTTGGTACGTTTCGTGTGTTTTATGTTGTGCTTGCTGTTACCATCATTGGAATTGTGAGACATTGCGAACAAATGTCGCTGATGCAGCAACAATTCTAG