Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13734 LG3 34516782 34519035 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 34516998 stop_gained p.Lys73*
C/A 34517598 missense_variant p.Ala226Asp
A/T 34517758 synonymous_variant p.Ser279Ser
A/G 34517768 missense_variant p.Asn283Asp
T/A 34517850 missense_variant p.Leu310His
A/G 34518201 missense_variant p.His427Arg
T/C 34518233 stop_lost p.Ter438Glnext*?
T/G 34518292 missense_variant p.His457Gln
A/T 34518294 missense_variant p.Gln458Leu
A/T 34518360 stop_lost p.Ter480Leuext*?
A/G 34518855 missense_variant p.Lys645Arg
G/T 34518937 missense_variant p.Gln672His
G/A 34518956 missense_variant p.Gly679Arg
G/T 34518958 synonymous_variant p.Gly679Gly
C/A 34518997 synonymous_variant p.Leu692Leu
G/T,A 34519017 missense_variant p.Arg699Lys
T/C 34519033 splice_region_variant&synonymous_variant p.His704His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13734.1
MDCMDDDSMSGANYGILDDPSRRNADEETMRVEEEEEEEEDEEEEEEEVVTVEELETRMWRDGMMLRKLKEEKRDKEKGETVEMMKKKALIRAQDTVLKNMVKMMEICGVRGFVYGIIPEKGKPVSGASDNLRGWWKDRVKFDHNGPAAMLRYEEETGFEDMVSDGFNGQPLTAYSLNDLPDTTLGSLLSCLMQNCDPPRRRYPLDKGIAPPWWPTGQEWWWAQMGFTIDPGPPPYKKPHDLKKVWKMCVLTAVIKHISPDIAKIRNIVRHSRTLQDKLNARESAIWSAILKREEYFARRSYPNFFQTLPPRAGPSVPYDNNVTNFIRGQQSNSLGGTLNLLGGLNNTPQHHNVANGRAWSFLDGHNNPSTSTSAATILLGNPPPTTDLITDDGATSFHGVQIDTAPATNGGARNFFVGQFDPPTPTPTSNLVHSGFIRAFLDGQYNPPPTSTTITTSRSSVGIGNGNNITMMNNIVMSLDHAANKRKPGDDVQGITFPHEAYSCNSSECPYHETGFGFSDRNARNDHQLTCQYRSKNPLQGVGVGGLMPSQLGCGNSIVNMPLVQSRNFTSSVTNQNQTFTVGDMGMHNMNVPCLAGQNQHLQTVQTQVYNDSFFDGRICLDKDVFGNNMYVCSLESKNQQQVQNVGGTSGHGLNAEVSNVVHGNLSTSITVDSPFAWDSNNSQAEFLDSPLLTTADQDLLWP*


CDS Sequence:
>Vu_13734.1
ATGGATTGTATGGATGATGACAGCATGAGTGGTGCTAACTATGGTATTCTTGATGACCCTTCAAGGAGAAATGCTGACGAAGAAACGATGAGGGTGGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGTGACAGTGGAGGAACTGGAGACAAGGATGTGGAGAGATGGCATGATGTTGAGGAAGCTGAAGGAAGAGAAGAGGGATAAGGAGAAAGGAGAAACGGTGGAGATGATGAAGAAGAAGGCACTGATTCGTGCACAAGACACAGTGCTGAAGAACATGGTGAAGATGATGGAGATTTGTGGTGTTCGTGGCTTCGTTTATGGCATCATTCCTGAGAAGGGAAAACCAGTCAGTGGAGCTTCTGATAACCTCAGAGGTTGGTGGAAGGATAGGGTCAAGTTTGATCACAATGGTCCTGCTGCTATGCTCAGGTACGAGGAAGAAACAGGGTTTGAAGACATGGTTAGTGATGGATTCAATGGACAGCCATTAACAGCATACAGTTTAAATGATCTCCCAGACACAACTCTTGGCTCACTCTTGTCATGTCTCATGCAGAACTGTGATCCTCCCCGGAGAAGGTACCCTTTGGACAAGGGCATTGCCCCTCCTTGGTGGCCCACTGGGCAGGAATGGTGGTGGGCCCAGATGGGCTTTACCATAGATCCAGGCCCACCACCCTACAAGAAGCCCCATGACCTGAAGAAGGTGTGGAAAATGTGTGTGCTCACTGCAGTCATCAAGCACATATCCCCAGACATAGCAAAGATCAGAAACATTGTTCGTCATTCTAGGACCCTTCAGGACAAGCTCAATGCAAGAGAATCTGCCATTTGGAGTGCTATTCTGAAGCGTGAAGAGTACTTTGCTAGGAGATCATACCCTAATTTCTTCCAAACCCTCCCTCCAAGAGCAGGACCTAGTGTCCCTTATGATAATAATGTTACAAATTTTATTAGGGGGCAACAAAGTAATAGCCTTGGTGGTACATTGAATCTTCTTGGGGGGCTGAATAACACACCACAACACCACAATGTTGCTAACGGTCGTGCTTGGAGCTTTCTCGATGGCCACAATAACCCTTCAACTTCCACCAGTGCTGCTACAATTCTTCTTGGGAACCCTCCACCAACCACCGATTTGATCACTGATGATGGTGCTACCAGTTTTCATGGAGTGCAGATTGATACAGCACCAGCCACAAATGGTGGAGCTAGAAATTTCTTTGTGGGGCAGTTCGATCCACCAACACCAACACCAACCAGCAATTTGGTTCATAGTGGATTCATAAGAGCTTTTCTGGATGGCCAATATAACCCACCACCAACATCCACAACTATAACAACATCAAGAAGCAGTGTTGGTATTGGTAATGGCAATAACATTACAATGATGAACAACATTGTTATGTCACTAGACCATGCTGCTAATAAGAGAAAGCCTGGGGATGATGTTCAAGGTATTACATTTCCTCATGAGGCCTATTCTTGCAACAGCTCAGAGTGCCCTTATCATGAGACTGGCTTTGGATTCAGTGACAGAAACGCGAGGAACGATCATCAGCTGACATGCCAATACAGAAGCAAAAATCCTTTGCAAGGGGTTGGAGTTGGAGGGTTAATGCCTTCTCAGCTTGGATGTGGGAATTCTATTGTAAATATGCCTCTTGTTCAATCCAGGAACTTTACCTCATCAGTCACTAATCAAAATCAGACTTTTACTGTTGGGGACATGGGGATGCACAACATGAATGTTCCATGTCTTGCAGGCCAAAACCAGCATTTGCAAACTGTTCAGACTCAGGTGTACAATGATAGTTTCTTTGATGGAAGGATTTGTTTGGACAAGGATGTCTTTGGCAACAACATGTATGTGTGTTCTCTAGAAAGCAAAAACCAGCAGCAGGTGCAAAATGTTGGTGGTACCAGTGGCCACGGTTTGAATGCTGAAGTGTCCAATGTTGTCCATGGCAATTTGTCAACATCGATAACAGTGGATTCCCCCTTTGCATGGGATTCAAACAATTCCCAAGCTGAATTTTTGGACTCTCCTCTGTTGACAACAGCAGACCAGGATCTCCTTTGGCCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_13734::LG3:34514782-34516782(+)
TTTTTCTTTTTTTACCAAAATAGTACAATAATTAATCTTTTTTTTTCCACTTGGTTATATATCATTTTACTGAAAGGTCAACCCGGTTGCACCTTTTTACAATTGAAAAATTATTTTTATAAAATTGTTGTCTGTATTTAGTATAAAAATTAAGCACTTTTTTCTTGTGAAAAATACATGTTTTGTGGTTTAGCAAACATATATAATTTGTTTTGTGGAAGCCTTTCATCATCCAAACCCAAGTTTTCATCAAATTTTTATGATAATAAAAATTGTAACACAATTTATTTTGGTTTTAAGCTTAACTTTCCATATATATTGTTTTGTAATGTCTATATAAGATTAAGTGTTCTTGTGACAATTTTATCTATTTGAAAAATATCTTTTTGTTTTCTGTGTCCTAATTATCTCACTTTCCTTTGTGACACTCTCTTGATTCCATTTTCAATTCAACCTCTACCCTTTATCCTCCTTTTTGCCCTACAAGGACTTTTGGTATGATTCAATTTATATATATGTTTTAGATTACTTTGCTTAATTTTTTGCATAATTGTTTATATTTAGTGTTTTATTCCATGCTTGATTAATTTCAAATAGAATAGGAGGAAGAATCACTAAATTATTTTCCTATTGCCAAATATTTCATAATTTTTCTGCATCTAGTTTATGCTTTCATTTATTTATTTTTTATTTGAGTTACCACAATTTTGAGAGTGATTATATATATTTTCCTCCAATTTTCCTTTCTTTTGATTCGTTTTGATGTGTTTTTCCAAAATCTCCATATCCAATTTTGCAAGCTTTGCATTAAATAAATTAAATATGTTTTTTCTCCAAAACCATTTTCAAAAGGTGTTTTTATCTTTTTTAGCTAAACTTTATACTGTAAACTTGAAGAATGTCAACATTTTCTTCAATAAATAACACATGGATTACTTTCATAAAGTAGAAACAAAATATGTATATATAGCTTAATTTAAAGATAAAGCATACTTTTTAAAAATAGTTTAAAGGAAAAAGATATATTTAACATGAACAAAAATATACAAACACTTTTTAAAACATAAATATCCATCAAGTACTCATAAAAAATTGTTTACCATCTTATCTATATAGATTTTTTTTTTCAAAATTTGATCGTTTTATTTATTTTTTATTTTCTTTCTATTCAGGCTAAATTTTATCACTCCCTTCATTTTAAAAAATATAAACAAGTCACTATATGTTTATGTTTAAAGAAATAAAAACGAATTTATGAGTCTAATTTTGTACAAATACATTGTTTACACAATCTATATTCTATAACTATATAACAAACTTTTAATAACATCTTTGTATATACTAAATTTTACCAATTTTTTCAAAAATTACTTAAATAATCAGATTTATTACCATTTTAATCAGATAAACAAACTATTTTTCAGTGACAGCGTATCAAACTTTTAGCATAATTTTCTTCTTCTAATTTATCATTAAGTGAATTTTACATATATAATATCACTTCCAATTTTTTTTAATTCAGTTTCATAATTCAAAAATCAAATAATTAAATCACACAACTATACATATAGTTTTCACTATTACTCTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTTCTTCTTTACATATTTTCTTCAAAATTTTAAAGATCAATACTACTAACCAAACCCTATACCTTAACTTTTTATCCAAACCCTAACCTAGTACAATCGACAAACACAACATGTTCTACGTCATCAAAGCAGGCATTATTACATCACAGTAGCTTACAGGTATACAAGTTTTATATTTTACCGTGATAAAATGGACTAAGAAAATCACGTTTCCCAAGAGCTTATCCACCTCTTTTTTCTTTGAACGATGATTTTATGGGGTTAAAAAATTATATATAGATTTTTCAATCTGTCTTCAAAAGGAGCTTTCTGAATGAATGGAATGATGATACATTGAATAAGCTTTTTCTTCTGTACACATTGTTTTTTCAGAGAACAAGAAAAGCCACAGGCAA


Gene Sequence:
>Vu_13734(+)
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