Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13631 LG3 31874202 31877605 PREDICTED: receptor-like protein kinase FERONIA
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 31874204 5_prime_UTR_variant
T/C 31874228 5_prime_UTR_variant
T/C 31874260 5_prime_UTR_variant
G/T 31874261 5_prime_UTR_variant
T/G 31874432 5_prime_UTR_variant
T/C 31874451 5_prime_UTR_variant
T/A 31874788 synonymous_variant p.Pro42Pro
C/T 31875106 synonymous_variant p.Leu148Leu
T/C 31875109 synonymous_variant p.Ala149Ala
T/A 31875361 missense_variant p.Asp233Glu
C/T 31875366 missense_variant p.Ser235Phe
C/T 31875368 missense_variant p.Pro236Ser
G/A 31875728 missense_variant p.Glu356Lys
A/G 31875731 missense_variant p.Asn357Asp
T/C 31875963 missense_variant p.Ile434Thr
G/A 31876090 synonymous_variant p.Ser476Ser
G/T 31876111 missense_variant p.Lys483Asn
G/A 31876659 missense_variant p.Arg666His
T/C 31876682 synonymous_variant p.Leu674Leu
A/C 31876684 missense_variant p.Leu674Phe
T/G 31877372 3_prime_UTR_variant
A/G 31877398 3_prime_UTR_variant
G/C 31877468 3_prime_UTR_variant
T/C 31877469 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13631.1
MWSMDRYCVCVPLFVCLVLAIELVVAQDFKPTDNILLDCGGPPSSTDTDDRVWTTDVGSKFGSSSEKSTTVSQAATQDPAVPQVPYMTARVFHAPFSYAFPVASGWKFLRLHFYSASYSNLNASDALFAVTANSYTLLRNFSVAQTTLALNYAYILKEFAIHVDGKTLNVTFTPSTNASNAYAFVNGIEVVSMPDIYTSTDGTTMIVGTNTAYTIDNSTALENVYRLNVGGNDISPSRDTGMFRSWSDDVPFLFGAAFGVTESADSNVKFEYPPGTPSYIAPLDVYTTARSMGPDMQINTNYNLSWIFNIDSGFSYLVRLHFAEVSSNITKINQRVFDIFLNNQTVTQADVIAWAENFGLSHSNGVPVHKDYVVFIPDAGEPRQDLWLALHPNTTDKPMYYDAILNGVEIFKISDTAGNLAGTNPIPAPVQDIIDPSKARAHNHGKSKNHTGIIAGGVVGGVVAVLVIGLFAFSASRRHRQGKDYGASEGPSGWLPLSLYGGTSHSAASAKTNTTGSYASSLPSNLCRHFSFAEIKSATNNFDEALLLGVGGFGKVYKGEIDGGTTKVAIKRGNPLSEQGVHEFQTEIEMLSKLRHRHLVSLIGYCEENTEMILVYDHMAYGTLREHLYKTQKPPLPWKQRLEICIGAARGLHYLHTGAKHTIIHRDVKTTNILLDEKWVAKVSDFGLSKTGPTLDNTHVSTVVKGSFGYLDPEYFRRQQLTDKSDVYSFGVVLFEILCARPALNPALAKEQVSLAEWAAHCYLKGILDQIIDPYLKGKIAPECFKKFAETAMKCVADQGIERPSMGDVLWNLEFALQLQESAEESGNGFGDIHNEEEPTYTDSKGKKDSDAMGGYDGNVTDSRSSGISMSIGGRSLASEDSDGLTPSAVFSQIMNPKGR*


CDS Sequence:
>Vu_13631.1
ATGTGGAGCATGGATCGGTACTGTGTTTGTGTTCCATTGTTCGTGTGCTTGGTATTGGCTATTGAGCTTGTTGTAGCACAGGATTTTAAGCCTACAGATAATATCCTGCTGGATTGTGGAGGTCCTCCATCCAGTACTGATACCGATGACCGTGTATGGACCACTGATGTTGGTTCCAAGTTTGGTTCCTCCTCTGAAAAATCCACCACCGTATCGCAGGCGGCAACTCAAGACCCTGCCGTCCCCCAGGTGCCCTACATGACGGCACGTGTGTTCCATGCCCCGTTTTCCTATGCTTTCCCGGTGGCTTCCGGTTGGAAGTTCCTCCGGCTGCACTTTTACTCCGCTTCTTACTCCAATCTCAATGCATCTGATGCCCTTTTTGCGGTGACGGCGAATTCATACACGCTTCTTAGGAACTTTAGTGTTGCTCAGACCACCCTCGCTTTGAATTATGCCTACATTTTGAAGGAATTTGCCATCCATGTAGATGGGAAGACCTTGAATGTGACTTTCACTCCTTCTACCAATGCATCCAATGCTTACGCGTTTGTTAATGGGATCGAGGTTGTATCCATGCCTGATATTTATACTTCTACTGATGGAACTACCATGATAGTGGGTACAAATACTGCTTACACTATTGATAACAGCACTGCACTTGAGAATGTTTATAGGTTGAATGTGGGTGGGAATGATATCTCTCCTTCCCGTGATACTGGCATGTTTAGGTCATGGTCTGACGATGTTCCCTTCCTATTTGGCGCTGCATTTGGAGTTACAGAGTCTGCTGATTCAAATGTGAAGTTTGAGTATCCACCGGGCACACCAAGCTATATTGCTCCACTTGATGTCTACACTACGGCCAGATCAATGGGCCCGGATATGCAGATCAACACGAATTACAACTTGAGTTGGATCTTCAACATTGATTCTGGGTTTTCCTATCTAGTGAGACTTCATTTTGCTGAGGTATCATCAAATATAACCAAGATTAATCAAAGAGTATTTGATATATTCCTCAATAATCAAACAGTTACCCAGGCTGATGTTATTGCCTGGGCAGAGAATTTTGGCCTTTCACATTCTAATGGGGTGCCTGTGCATAAAGATTATGTTGTCTTTATTCCCGATGCTGGAGAACCACGGCAGGACCTGTGGCTTGCATTGCATCCAAATACAACCGACAAGCCCATGTATTATGATGCTATATTGAATGGAGTGGAGATATTCAAAATTAGTGATACTGCTGGAAATCTGGCAGGGACAAATCCTATTCCTGCCCCTGTGCAAGATATAATTGACCCGTCAAAAGCTAGAGCACATAATCATGGTAAATCAAAGAATCATACAGGTATAATTGCAGGAGGTGTTGTTGGAGGTGTTGTTGCAGTACTTGTTATTGGGCTATTTGCTTTTTCTGCTTCGCGTCGCCATAGGCAAGGAAAGGATTATGGTGCAAGTGAAGGGCCATCTGGCTGGCTTCCACTTTCTCTTTATGGTGGTACCTCACACTCTGCAGCTTCTGCCAAGACCAACACAACAGGAAGTTATGCTTCCTCTCTCCCATCAAACCTTTGTCGTCATTTCTCATTTGCTGAAATCAAGTCGGCCACAAACAACTTTGATGAGGCTTTGCTTCTTGGTGTTGGAGGATTCGGTAAGGTTTACAAGGGAGAAATTGATGGTGGAACAACCAAAGTTGCAATTAAACGTGGGAATCCACTATCTGAGCAGGGGGTGCATGAGTTCCAAACTGAGATTGAAATGCTCTCTAAACTTCGTCACCGCCACCTTGTTTCTCTTATTGGATACTGTGAAGAAAACACTGAAATGATCCTCGTTTATGATCATATGGCCTATGGAACACTCAGGGAGCATTTGTACAAGACCCAGAAACCTCCACTTCCATGGAAGCAAAGGCTTGAGATATGCATTGGAGCTGCTCGGGGTTTACACTATCTACACACTGGAGCTAAACACACAATCATCCACCGTGATGTGAAGACAACAAACATTTTACTGGATGAGAAATGGGTGGCCAAGGTTTCTGATTTTGGATTGTCAAAAACAGGTCCAACATTGGATAATACCCATGTAAGTACTGTGGTAAAGGGTAGCTTTGGGTACTTGGATCCAGAATACTTCAGGAGGCAGCAACTAACTGACAAATCTGATGTTTACTCATTTGGGGTGGTTCTCTTTGAGATATTATGTGCTCGTCCAGCTTTGAACCCAGCCCTTGCTAAGGAGCAAGTGAGTCTGGCTGAGTGGGCAGCTCATTGCTACCTGAAAGGCATTCTTGACCAAATCATTGATCCCTATCTAAAAGGCAAGATAGCTCCAGAATGCTTCAAGAAATTTGCCGAGACTGCGATGAAGTGCGTGGCTGACCAGGGTATTGAAAGGCCATCCATGGGTGATGTCTTGTGGAACCTTGAATTTGCTTTGCAGCTGCAAGAAAGCGCAGAGGAAAGTGGCAACGGCTTTGGCGACATTCACAATGAAGAGGAGCCCACGTATACAGATTCTAAAGGAAAGAAAGACTCTGATGCGATGGGGGGTTATGATGGTAATGTGACTGACTCCAGAAGCAGTGGCATTTCAATGAGCATTGGAGGTAGAAGCTTGGCTAGTGAAGACTCTGATGGGTTAACCCCAAGTGCTGTGTTCTCCCAGATCATGAATCCAAAAGGCCGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13631::LG3:31872202-31874202(+)
GTCTCAATTTGATTCCAGTATTTTTTATTTTGTCTCAATTTAGTCTTTTTAAAAAAAAACAAATTTTTCCTCTCCAAATTCAAACAAAATTTTATTTGTATATAAATCTTTAAAAAAAATTTATACAAATTGATATTTTTTTATTAGAAAAATAAAAAAATTTCAAACTAACAAATGACATTTTTATTTATATAGTATTAAGGAAAATAATTTAGTTGCATTAAAGTTTTTAAAACAAAAATTAAATTGAGACCAATAAAAATAAAGAAACTTATTTAAAATTTTTCTACAAATTAAATAACAAATGAAATCATTTAACCTAGATATTATGAATGAGCAAACTATAAAAGTTAACATTTCAATAATAAATATTTTTGTGAAAGTAATTACACAAAAATAGTCTTAGTACTTCCTCAACAATTCATAAAAAAGTTTCTAGAATTAAATATTTAGATTTGGAAAACAAATTTAAAGATGAGAATTTGCAAAACATACATACAGTTATTTCATTTGGGAATGTACAAAATTATTTAATTTAAAAAAAATTATGACTAAATTGAGACAAAATAAAAATTGAAAGATAAAATTGAAACAAAATAAAATACAGAGATCAAATGAAAACAAATGCAATGACATGTGACACTGGGAGTGTCACGTCACACTGTTATTGTCCCAATGTTAACTTGACATGTCACAAACTTTCTTATTTAAAAAAATAAAAAATAATTAAAAAATTCAAAAAACCAGGAGCTTAACATTTTTTTACAGTATTAATTAAAGAACTAACAGCAAAAATATTTTTCAAAACTAAAAACTCAGTGGAGAAAAAAAAATGAAAGATCATTTGAGAAAAGTCATTTTTTAAACAACATAAGGATGATGTTGGGTATGAGAAACATTTATTTAATTTAGTTTATAGTTAGCAATTAATTAATCATAAGAAAATGACATTGAGAGGAATGAAAGCGCGTTTGGAAGTTGGAAGGTTGCGGTTTGTTTGTCATTTCCATCTTTTCATACTGCGTTCCTCGCACAACTTATCTGTCATCCAATCATCACCGCTTTTCCATTCTATTTTCTTCCACACCCAAACAACCATGCACGTTCCTTCTATCATATAAATGTTCCAATTCAGAAAAAAACTGGTTTTTAAAATCAATGAATAAAGAATTGTTTGAAATTTTATTTTCATTAATGTTTGAATGAGTATAACTTAAACGTAAAACCATAGATAGACTTAAAAGGAAAGTTTTCTTTTGATAAAATTACAGTTTTCTCTTAATAATTCGTGCGATAAAGACTATAAAAATTTAATTATAGATATGACATCTTACAATATTTAAATTTTAATTAAACATAACACACACAAAATCAGGTGCATTAATACTTAGTGCATAATTGTTTTAACTTATTGAATATGGATAAAATATTTCTACAGTCAGTAACTTAATCCAAATTAATATGGTTGTCTCTTCTGAAAAAAAAAATCTTAAACAAGAATCATTCTAAATCTTCAAGAACACCTTCATAGTGTAAGCATTCAATGTATCTATACTATATTAATTATTTTTAGTGAAATATTTTAAATATTTATCATTCGTAGTTGATAAATATAAATACCATCAAAGCAAATTAAATAAAGGAAATTAAGTGAAAAATAGATGATGTATCCCTGTTATTTTAAATTTTATTTTAGAAAACAGCACAAAAACTATCAACAAATTCAATGTTGATGTTACTAAATAAATTGAATATTTTTCATGAATATAAATTAATCAAATAATTTTTTATATAAGAACGAATGTAATTCTTTCAAAATAATAAATATTTTATTTTTATTTAATATAAAATTCTTAGTGCACACTATTATTTAAATAATAAATAAAGTGAAGAAAGTTATAGATTTATTAATTAATTTCAGTTTTGTTTGTGAAATCTTTTTTTTTTCTCTTACAGGTCGGTGTGGTATTTAAGGTAGTTTTTAGTACGTGTGACACCTT


Gene Sequence:
>Vu_13631(+)
TCTCACTCCATTTCCCTCTTCCACCGTTTTCTCTCAACTCCTTCCAGCTGCAAGCAACTGCCAAATCCATTCCATTCAAACCCTCGAGACTCGGGATCGTCGCGCTTTGACTCACCGAGTTGCTTTTCAGCTTCTCTTCCCATTGCACAAGGTAAAATACCTTCTTCCCACATCTTTCATTGTTCAACCTGTTGTTCACTCATCATTCTCCTCCACGTCTGGATTTTACCTGTTTTGTAAAATCTGGGTTCAAGCTGATCTGATCATAACCCACCACCCCACTTCCCTTTCCTGATCTGGGTTCCTAAAATATAAGATCTTCGCATCGAATTTGTGGTCTTTGATTGTTTTTAAATTATGGGTATGTGTGAATTGTAATTCCCTGCAAGAGGTGTTGGCAATTGTATGGTAGAAAACAAAGCACTTTGAGTTTGAGTTTGGGTTTGGAATTTTGTGACGTGATGTGGAGCATGGATCGGTACTGTGTTTGTGTTCCATTGTTCGTGTGCTTGGTATTGGCTATTGAGCTTGTTGTAGCACAGGATTTTAAGCCTACAGATAATATCCTGCTGGATTGTGGAGGTCCTCCATCCAGTACTGATACCGATGACCGTGTATGGACCACTGATGTTGGTTCCAAGTTTGGTTCCTCCTCTGAAAAATCCACCACCGTATCGCAGGCGGCAACTCAAGACCCTGCCGTCCCCCAGGTGCCCTACATGACGGCACGTGTGTTCCATGCCCCGTTTTCCTATGCTTTCCCGGTGGCTTCCGGTTGGAAGTTCCTCCGGCTGCACTTTTACTCCGCTTCTTACTCCAATCTCAATGCATCTGATGCCCTTTTTGCGGTGACGGCGAATTCATACACGCTTCTTAGGAACTTTAGTGTTGCTCAGACCACCCTCGCTTTGAATTATGCCTACATTTTGAAGGAATTTGCCATCCATGTAGATGGGAAGACCTTGAATGTGACTTTCACTCCTTCTACCAATGCATCCAATGCTTACGCGTTTGTTAATGGGATCGAGGTTGTATCCATGCCTGATATTTATACTTCTACTGATGGAACTACCATGATAGTGGGTACAAATACTGCTTACACTATTGATAACAGCACTGCACTTGAGAATGTTTATAGGTTGAATGTGGGTGGGAATGATATCTCTCCTTCCCGTGATACTGGCATGTTTAGGTCATGGTCTGACGATGTTCCCTTCCTATTTGGCGCTGCATTTGGAGTTACAGAGTCTGCTGATTCAAATGTGAAGTTTGAGTATCCACCGGGCACACCAAGCTATATTGCTCCACTTGATGTCTACACTACGGCCAGATCAATGGGCCCGGATATGCAGATCAACACGAATTACAACTTGAGTTGGATCTTCAACATTGATTCTGGGTTTTCCTATCTAGTGAGACTTCATTTTGCTGAGGTATCATCAAATATAACCAAGATTAATCAAAGAGTATTTGATATATTCCTCAATAATCAAACAGTTACCCAGGCTGATGTTATTGCCTGGGCAGAGAATTTTGGCCTTTCACATTCTAATGGGGTGCCTGTGCATAAAGATTATGTTGTCTTTATTCCCGATGCTGGAGAACCACGGCAGGACCTGTGGCTTGCATTGCATCCAAATACAACCGACAAGCCCATGTATTATGATGCTATATTGAATGGAGTGGAGATATTCAAAATTAGTGATACTGCTGGAAATCTGGCAGGGACAAATCCTATTCCTGCCCCTGTGCAAGATATAATTGACCCGTCAAAAGCTAGAGCACATAATCATGGTAAATCAAAGAATCATACAGGTATAATTGCAGGAGGTGTTGTTGGAGGTGTTGTTGCAGTACTTGTTATTGGGCTATTTGCTTTTTCTGCTTCGCGTCGCCATAGGCAAGGAAAGGATTATGGTGCAAGTGAAGGGCCATCTGGCTGGCTTCCACTTTCTCTTTATGGTGGTACCTCACACTCTGCAGCTTCTGCCAAGACCAACACAACAGGAAGTTATGCTTCCTCTCTCCCATCAAACCTTTGTCGTCATTTCTCATTTGCTGAAATCAAGTCGGCCACAAACAACTTTGATGAGGCTTTGCTTCTTGGTGTTGGAGGATTCGGTAAGGTTTACAAGGGAGAAATTGATGGTGGAACAACCAAAGTTGCAATTAAACGTGGGAATCCACTATCTGAGCAGGGGGTGCATGAGTTCCAAACTGAGATTGAAATGCTCTCTAAACTTCGTCACCGCCACCTTGTTTCTCTTATTGGATACTGTGAAGAAAACACTGAAATGATCCTCGTTTATGATCATATGGCCTATGGAACACTCAGGGAGCATTTGTACAAGACCCAGAAACCTCCACTTCCATGGAAGCAAAGGCTTGAGATATGCATTGGAGCTGCTCGGGGTTTACACTATCTACACACTGGAGCTAAACACACAATCATCCACCGTGATGTGAAGACAACAAACATTTTACTGGATGAGAAATGGGTGGCCAAGGTTTCTGATTTTGGATTGTCAAAAACAGGTCCAACATTGGATAATACCCATGTAAGTACTGTGGTAAAGGGTAGCTTTGGGTACTTGGATCCAGAATACTTCAGGAGGCAGCAACTAACTGACAAATCTGATGTTTACTCATTTGGGGTGGTTCTCTTTGAGATATTATGTGCTCGTCCAGCTTTGAACCCAGCCCTTGCTAAGGAGCAAGTGAGTCTGGCTGAGTGGGCAGCTCATTGCTACCTGAAAGGCATTCTTGACCAAATCATTGATCCCTATCTAAAAGGCAAGATAGCTCCAGAATGCTTCAAGAAATTTGCCGAGACTGCGATGAAGTGCGTGGCTGACCAGGGTATTGAAAGGCCATCCATGGGTGATGTCTTGTGGAACCTTGAATTTGCTTTGCAGCTGCAAGAAAGCGCAGAGGAAAGTGGCAACGGCTTTGGCGACATTCACAATGAAGAGGAGCCCACGTATACAGATTCTAAAGGAAAGAAAGACTCTGATGCGATGGGGGGTTATGATGGTAATGTGACTGACTCCAGAAGCAGTGGCATTTCAATGAGCATTGGAGGTAGAAGCTTGGCTAGTGAAGACTCTGATGGGTTAACCCCAAGTGCTGTGTTCTCCCAGATCATGAATCCAAAAGGCCGTTAAGTTCGTTTAGTAACAACACTCTCACTGCATACAGAGCCAATCACTCATTCTGCAGTGCAATCGGCTTTCATCAAATTTGAATGTTACCCGTTATTCATTTTCGTAATATTTTTATTCATTTCTACGGTTGTTTCTAATTTATTATGATTATCTAAGTTGTAATTTGTGACCATGTTATGTAACGATTGAAGAGCGAGCATGTTATAACGAGGTTGCTATATCTGAATTTTTTGAAACCCT