Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13627 LG3 31783491 31785191 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 70 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 31783517 5_prime_UTR_variant
A/C 31783685 synonymous_variant p.Val30Val
T/G 31784167 intron_variant
T/A 31784378 missense_variant p.Leu133His
A/G 31784405 intron_variant
C/T 31784408 intron_variant
A/T 31784604 missense_variant p.Gln152Leu
G/T 31784618 missense_variant p.Val157Leu
A/G 31784812 synonymous_variant p.Ser221Ser
T/C 31784881 synonymous_variant p.Ser244Ser
A/T 31785120 3_prime_UTR_variant
A/T 31785127 3_prime_UTR_variant
T/A 31785130 3_prime_UTR_variant
A/T 31785133 3_prime_UTR_variant
A/T 31785140 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13627.1
MDNLGGSTIRMKAIEELLRGRDSATQLRSVINGNGEDSPSAEKLVKEVLMSLTNSLLLLNDNPTSEFHDASNVQLWASPKLEDSQESNCKNSRVKARRGCYKRRRTEQTREKESEAPIDDGHQWRKYGQKEILNAKFPRNYFRCTHRDQGCQATKQVQRVQEDPILYKTIYYGEHSCKNMGNPEIILDMSPSSSSKFLSFNNSFSTQSQQECPFLSSSFPSSVKRECKEEIPPSTSSNDYLISSDLTFDGSPRHVALSSSTPDSEYKAVDFPDLFDDVFEDLLEFR*


CDS Sequence:
>Vu_13627.1
ATGGACAACCTTGGCGGTTCTACTATTCGTATGAAAGCAATTGAGGAGCTTCTCAGAGGTCGTGATTCTGCCACACAGCTCAGGAGTGTAATCAATGGGAATGGTGAAGATTCTCCTTCAGCGGAGAAACTCGTGAAGGAGGTGCTCATGTCCTTAACCAACTCCCTCTTGCTCTTGAACGACAACCCCACTTCTGAATTTCACGATGCCTCCAATGTTCAACTTTGGGCCTCTCCCAAACTCGAGGACTCTCAAGAGAGCAATTGCAAGAACTCCAGGGTTAAAGCTCGAAGAGGGTGTTACAAGAGAAGAAGAACTGAACAAACAAGAGAGAAGGAGTCTGAAGCTCCAATCGATGATGGCCACCAATGGAGGAAGTATGGTCAAAAGGAGATTCTCAATGCCAAATTCCCAAGGAACTACTTTAGGTGCACTCACAGAGACCAGGGTTGCCAAGCGACAAAGCAGGTGCAAAGAGTTCAGGAGGATCCAATCTTGTACAAGACAATCTACTACGGTGAGCACAGTTGCAAGAACATGGGAAACCCCGAGATCATACTCGACATGTCTCCTTCATCTTCTTCCAAGTTTCTTAGCTTCAACAACTCCTTCTCTACCCAATCACAACAAGAGTGTCCCTTTCTCTCATCTTCTTTCCCTTCATCTGTCAAAAGGGAGTGCAAGGAGGAGATTCCACCCTCAACTTCCTCCAATGATTACCTCATCTCTTCTGACCTCACCTTTGATGGTTCACCAAGACATGTCGCTCTATCATCTTCAACACCTGACTCAGAGTACAAGGCTGTCGACTTTCCAGATCTCTTTGATGATGTCTTTGAAGACTTGCTTGAATTTAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_13627::LG3:31781491-31783491(+)
GTCCAAACGAAAATATGATCGATTCAAAAGGAAGCCTTCGGTGTGGTGAACGTCTGAGCACCTTCCAACCCAAGATTGAACGGTTCAGAGAGCTGGAAATTTAGAGAGAAGGCAGAGAAGAGTTTAGGGCAAAGAGTCTTAGAGAGAGAAGAGCTTAGAAAATGAAAAATTCTGAGGAGCTCTTCCTAAGGTTAAGTTGGCCTTAGTCTGATGGGCCTGGCTGTCCCACATAGGGCCCAATGGCCTTAAACTTTTTCAGGCTATTACCGTTAACATATTAATTTGTTTTAATTAATAAGCAGATATTATTATTTTCGGTTAAGATTATCAATCATAAACTAAAATGATGAAAACAATAATTTTAGAGATTTAAAAGAATTTTGAAGATTTATTTTAGTTTTCTATGTTTTAATAAAATATAACTTTCTGAGGTTTAAGGGACAATTTACTTACTTTTTTCATAAAAAAAATAATTATATTTTAGGATATAATTTTGCTTAGAACATCCATAACGTAAGATTGCTAATGAATTTTTTATTTTAATTTGATGGGACCTAGAATGCGCATAAATTTATGCATTCACACCAATTTTCAGTAGAATGAGTGCGTAATTTAAATCTTATAACTTCTGTCCAATTAAGAAGTAAAAAAATTAAAATATGAACATTGTTTTTAAAGTTTGAGTTTTAAAATACAATTTATTCACTTATAAAATACAAATTAAAACATGAACAATGTTTTTATAGTTTGAATCTTATAACTTCATCTACGGAATGAAAAAAAAAATTATACACAATAATTAAAGTTTGAGGTTTAAATTACAACTTTTTCACTTAATATAAATATTACTTAACCAAACTATAATTTTTTTAATTTAACGTTATATAACCAGTATTATATGTGATTTTCCTAGAAATTATTATGTGTAATCTTTCATAATATTTATACCTTTAATTATAAACATAATTTAGATGATCATTAACAATATTAATCTACAAATTTGGTAATTATTAATGTTTACAGTTATAGTAAGATTTTATTTTAACATAATTGATTTTTTTTATCGTCTTTAATTTCATTTTAGAACATATATATTACAATAGATATTTTAGTTTAATTAATATTGTTCTACATTTATTTCTTTAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATTATTGTATGTGTTAATTTAATTTAATATTTTTAATTGTTAATTAATACATGAAGATAGGAAGATAAATAACAATGAATTTATATATTTTTTCTTTCTTACTCATTGTAAAATTATAAGTTTTTTTTCCGTAATTTTGAGACTTAAAATTAAATTATATTGAATCATAATGTTAGTGTCGATAATTTAAATTATATTAAATTCTAAATAGTCAAATTTATAATAAGTTAAGTCATTACATATAAAAAGTTTTTTAAAATAAATATATTTTTAAACTCTTTTTTGAAGAAAATTTATTATTAAAAAATAATGACCCATCATGGCCCATTTGAGTGGGATGAAAACCCTAACAGATACTTCTCATCATCATTCAACGTTATCTTAATAAATGCTAACTGTGATCCTTATCCAATGGATTAATTTTTTCCACAAAAACTACTCACTAAGGGTATAACAGTCTTTCCATCTTCACTCAGGACCACTCAAATTCCGCCACCCGTTTTATGACGTCTCGCCAACGCAATTCCATGACGTCACTTCCTGCTCCTAAGAGTAACCCACGCACTATCCCCTTTCCCACGTTCCACCCCGAAGCCCCATTCTTGATTAGTCACAGGTGGCATAACTCTAGTCGCTGTGCTTGACACGCGCATACATTGCGGTTGGATTTATGTTGATGTCGAAAGGTGTTGGAATTTTCGTGCTAAGGTTCCTTTGAACATCAGGCATGTGGGCATTGCGACAACTTGTTGCCTCTTTTGATATTTAATTGATCGCATATATAATGCTCACCCGTGTATAATATGTA


Gene Sequence:
>Vu_13627(+)
AGTTGAGTTGAGCATGAATGTGTGAGTGATAAAACAAAATCTAACCAAGAAACAAGGCCCAATTTGTGAGCGTGTTCCATCAAAGTTTCAGAGATCGGTAGGAACATGGACAACCTTGGCGGTTCTACTATTCGTATGAAAGCAATTGAGGAGCTTCTCAGAGGTCGTGATTCTGCCACACAGCTCAGGAGTGTAATCAATGGGAATGGTGAAGATTCTCCTTCAGCGGAGAAACTCGTGAAGGAGGTGCTCATGTCCTTAACCAACTCCCTCTTGCTCTTGAACGACAACCCCACTTCTGAATTTCACGATGCCTCCAATGTTCAACTTTGGGCCTCTCCCAAACTCGAGGACTCTCAAGAGAGCAATTGCAAGAACTCCAGGGTTAAAGCTCGAAGAGGGTGTTACAAGAGAAGGTAATTAGTTAATTAATTAGCTAATCAAAACCTTTAATTTATGTTCCCTTTTCCCATTTTTCATTTCACCAACACGATCGTGTTAAGTGCTGAATTGTGAATGATTAGATTTGCTAATTTGGTGTCTCTTTAATTTGATAACGTGTGACTTTATCCTTTACGTGTGCCTAACATTGGACCCCGTGAATTATTGTTCATATATATAAAAACATGTGGTGAAGTACTGTGGTGTTGTTGGGTAGACCCTGTCTAATAGTCTTTGTTTCTTTGTCTTTAGTACCTTTGGTTATTATGTCATTTTGGCACAGTAAAAAATGATTGTTGCAGACACTGCGATTGGTTTTGGTTTATGAGAACCAATTAAAAAGTTTATCTGAATTTGCAGAAGAACTGAACAAACAAGAGAGAAGGAGTCTGAAGCTCCAATCGATGATGGCCACCAATGGAGGAAGTATGGTCAAAAGGAGATTCTCAATGCCAAATTCCCAAGGTATATATATACATATATGATCATATTTGAATATTTAACGTGTCTTAGCATTTGAAAAATCTTCTGAATAGATGTTTACGCAGAATGAATTAAGCTTTTCTAACTTGATATCAGTCTATATTTTGTGTTTCCATAGGAGAAATTGATGTGTTGTGGTTTGAATTTTCAGGAACTACTTTAGGTGCACTCACAGAGACCAGGGTTGCCAAGCGACAAAGCAGGTGCAAAGAGTTCAGGAGGATCCAATCTTGTACAAGACAATCTACTACGGTGAGCACAGTTGCAAGAACATGGGAAACCCCGAGATCATACTCGACATGTCTCCTTCATCTTCTTCCAAGTTTCTTAGCTTCAACAACTCCTTCTCTACCCAATCACAACAAGAGTGTCCCTTTCTCTCATCTTCTTTCCCTTCATCTGTCAAAAGGGAGTGCAAGGAGGAGATTCCACCCTCAACTTCCTCCAATGATTACCTCATCTCTTCTGACCTCACCTTTGATGGTTCACCAAGACATGTCGCTCTATCATCTTCAACACCTGACTCAGAGTACAAGGCTGTCGACTTTCCAGATCTCTTTGATGATGTCTTTGAAGACTTGCTTGAATTTAGATAGTTTCCCACTTTCTTCTATTTTAAGTTTTATTTGAAGCTATGCGAAAACAAACTGTGTAATATACATATATATTACTTTTCTAAGAAATTTGTAGTAGTATCCATCTTTTATTCTCAATATTAATGAGAAAAAAAAAACAATGGTGTTTTGACTGGTTCAGCCAACAAAAGTTAATTTAATT