Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13622 LG3 31718054 31723001 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04012 ErbB signaling pathway [PATH:ko04012]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 31718084 3_prime_UTR_variant
T/C 31718115 3_prime_UTR_variant
A/G,* 31718262 3_prime_UTR_variant
A/G 31718275 3_prime_UTR_variant
A/G 31718303 3_prime_UTR_variant
T/C 31718726 upstream_gene_variant
C/G 31718745 upstream_gene_variant
A/C 31718843 upstream_gene_variant
A/G 31718929 upstream_gene_variant
T/C 31719170 upstream_gene_variant
T/A 31719175 upstream_gene_variant
A/T 31719201 upstream_gene_variant
T/A 31719373 synonymous_variant p.Pro367Pro
G/T 31719374 missense_variant p.Pro367Gln
G/A 31719531 upstream_gene_variant
T/C 31719537 upstream_gene_variant
G/A 31719556 upstream_gene_variant
T/A 31719621 upstream_gene_variant
G/A 31720705 missense_variant p.Ala328Val
G/T 31720708 missense_variant p.Ala327Asp
C/T 31720715 missense_variant p.Asp325Asn
T/A 31720722 missense_variant p.Lys322Asn
G/A 31720742 missense_variant p.Pro316Ser
G/A 31720771 missense_variant p.Ser306Leu
C/G 31720780 missense_variant p.Arg303Thr
G/C 31720783 missense_variant p.Thr302Ser
A/T 31720858 upstream_gene_variant
A/T 31720871 upstream_gene_variant
A/T 31720876 upstream_gene_variant
C/T 31720943 missense_variant p.Asp284Asn
G/A 31720947 synonymous_variant p.Asp282Asp
C/T 31720950 synonymous_variant p.Leu281Leu
T/C 31720963 missense_variant p.Glu277Gly
G/A 31720982 missense_variant p.His271Tyr
C/T 31720983 missense_variant p.Met270Ile
C/G 31721001 synonymous_variant p.Leu264Leu
G/A,* 31721029 missense_variant p.Ala255Val
C/T 31721030 missense_variant p.Ala255Thr
T/A 31721055 missense_variant&splice_region_variant p.Arg246Ser
A/*,G 31721062 splice_region_variant&intron_variant
C/*,T 31721068 upstream_gene_variant
C/A,* 31721080 upstream_gene_variant
T/C,* 31721087 upstream_gene_variant
A/G,* 31721089 upstream_gene_variant
T/*,A 31721091 upstream_gene_variant
T/A 31721191 synonymous_variant p.Val230Val
T/A 31721569 missense_variant p.Arg168Trp
C/T 31721638 missense_variant p.Val145Ile
A/T 31721706 missense_variant p.Ile122Asn
C/T 31721710 missense_variant p.Asp121Asn
G/T 31721771 synonymous_variant p.Thr100Thr
C/G 31721898 missense_variant p.Ser58Thr
C/T 31722514 intron_variant
G/A 31722690 intron_variant
C/T 31722735 intron_variant
A/T 31722846 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13622.1
MVSSQFSGFTKGGYKPSQTNLLFPANLPDTVNTEHIELDFSDVFGPVTVDLNNIDSTSGEPVEDVNELVYDDPPVIYTRSHSLVGPSACVSQSLKLSKLTIHETEDSLELVDYADEETFKDIKESSFVEESLKDEDGNISKTQRVSIEDFEILKVVGQGAFAKVYQVRKKGTSEIYAMKVMRKDKIMEKNHTEYMKAERDIWTKIEHPFVVQLRYSFQTKYRLYLVLDFVNGGHLFFQLYHQGLFREDLARIYAAEIVSAVSHLHSNGIMHRDLKPENILLDADGHVMLTDFGLAKQFEESTRSNSMCGTLEYMAPEIILGKGHDKAADWWSVGVLLFEMLTGKPPFCGGSRDKIQQKIVKDKIKLPAFLSSEAHSLLKALLQKEATKRLGCGARGVQEIKGHKWFKQINWRKLEEREIQPSFIPDVAGTHCVANFEKRWTDMPVVDSPAASPNGGNPFKDFSYVRPAPSFLQRNSPAY*


CDS Sequence:
>Vu_13622.1
ATGGTTTCCTCTCAGTTTTCGGGTTTTACGAAGGGTGGTTACAAACCCTCACAGACTAATTTACTCTTTCCTGCAAACCTGCCTGATACTGTGAACACGGAGCATATTGAGCTAGATTTCTCTGATGTATTCGGCCCAGTTACTGTAGATTTGAACAACATTGATTCCACTAGTGGTGAACCTGTAGAAGACGTGAATGAGTTGGTTTATGATGACCCACCAGTCATTTACACCCGATCTCATTCTCTGGTTGGCCCTTCTGCTTGTGTTAGTCAATCACTTAAGCTTAGCAAACTCACCATACATGAGACTGAGGATTCACTGGAACTAGTGGATTATGCTGATGAAGAGACCTTTAAGGACATTAAAGAATCCTCCTTTGTCGAAGAGTCTTTGAAAGATGAAGACGGGAATATCTCAAAAACCCAAAGAGTTAGCATTGAAGATTTTGAGATTTTGAAGGTTGTGGGGCAGGGTGCATTTGCTAAAGTATATCAGGTGAGGAAGAAAGGTACTTCAGAAATTTATGCTATGAAGGTTATGCGGAAGGACAAGATTATGGAGAAGAACCATACTGAATACATGAAAGCTGAGAGGGATATCTGGACAAAGATAGAACACCCTTTTGTTGTTCAACTCAGATACTCTTTTCAGACAAAATACAGACTGTATCTTGTGCTTGATTTTGTAAACGGGGGCCATCTCTTCTTCCAGCTTTATCACCAAGGCCTTTTTAGAGAGGATCTAGCACGCATATATGCTGCGGAGATTGTTTCTGCAGTTTCTCATCTGCATTCAAATGGAATAATGCACAGGGATCTGAAGCCTGAAAATATTCTACTGGACGCTGATGGCCATGTTATGTTGACTGATTTTGGCTTAGCAAAACAATTTGAAGAGAGTACTAGATCAAATTCGATGTGTGGTACATTAGAGTACATGGCACCTGAAATTATTCTTGGCAAAGGCCATGATAAGGCTGCTGATTGGTGGAGCGTAGGTGTTCTACTGTTTGAGATGCTTACTGGAAAGCCCCCTTTCTGTGGTGGTAGCCGTGACAAAATTCAGCAGAAGATAGTTAAAGACAAGATCAAGCTACCAGCATTTTTGTCAAGTGAAGCACATTCACTGTTGAAAGCGCTGCTACAGAAGGAAGCAACGAAGCGCTTAGGTTGTGGAGCCCGGGGAGTTCAGGAAATTAAGGGACACAAGTGGTTTAAACAAATCAATTGGAGAAAGCTGGAAGAACGAGAAATCCAGCCAAGCTTTATCCCAGACGTAGCTGGTACGCACTGTGTTGCCAACTTTGAGAAACGCTGGACTGATATGCCTGTTGTGGACTCGCCAGCTGCCAGCCCAAATGGTGGAAACCCCTTTAAGGACTTCTCTTACGTGAGGCCTGCACCTTCTTTTCTTCAGAGGAATAGCCCTGCGTACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13622::LG3:31723001-31725001(-)
AGATAATGAAGTATGTTATGGATGAAACATATGTGATTTTGAAAGAATATTCCGGGGAGGAATATCTCATGAATGAATATTGGAATTGGTAAAGTATGAATGTGGGCATGCTAAGCTGGTAGTTCATCCTGATATTCCATGATTACTCGTTCTCACTTAGAGAAGGGTAAGTCATGCGTGGGAATGGCAGGAGGTTCTAGTCCTTATGGTTAATTTGGACAGATAGGACTAACCTCGGATGGCAGCTGTTTAGGGTATCACAGTTACTACATCACCAGGGTGCACGAACGTTTTAGCTACACAGAGTTCATACAGTCCGGACAGTGAGAGTCTAGTATTAGGCTTTGCATGAAAGAGTAGTGAATTATCTTGTGTGATTGATTATGTGAAATATATGTTGATACATGAATTAAATTACATAAGCTTACCCTATGTTTCCTGTCTTGTCTGTTTTGTACGTTCGGTTGTCTTTCTGTTGCAATGATCATCCATGTGGATGTGAGCAGAAGTAGACGAGCTGCTGGAAGAAACGCTGGAAGAAGAAAATTTAGTTGAGGTAGAAGTTAAGACCGAACAGTAGAATCCGTTCGGTCAATATATTAGTTTATTTGTAAGATGATCGTTCGATTATCTTTTCCCTTTTCTTTTGTATGACCGTTCGGTATAGGTCTTTTGTAAACCGTTCAGTCGGGATTGCTTATTTTGTACAGTTTTAACTTTCTTGTCATTCTGTAAGGCCGTTTGGCCATAAGTGTACGTTATTTATCTTGTAAGACTGATCTAAAATATTATTAGATGTGATTATTCTATTATATAGTTTTGTATTATATTTTTGGGATGTTAGATGTTGAAAAAGAAAAATATTATAATAGAAAAATTCTTATGATCAATAATAAAAACAACAAATACAATTTTAAAAATCATATTTTATTTCTATTCTTTTTGTTACAAATTATTATAGCAATAACAAAAATTCTAAATATATTACAAAATGAATGTCTTTCAAAGATTCTATAAATAACATATATTTTAAAAAACAAATCTTCAAACAAATTAAGTAAAACATTATTATTTTTTAAATGGATGGAGCTCAAATTTTAACTGATTTTTTTAATGTTCTTATCAGAAATTACTTCGAAATTAGAGTTCCCAAAAATTGAACTGTGAAAAGCTTTTATCAAAACAAGAAAATAATTAAAAATATGAACCATTGAAAATTAAAAAAATTAAAATAATTTCTTAAAAATATTGAAATTAAGTTTTAATTGCTTTGATAGAAAAATAAAAATAGGAATAAATTTTAGTTTTGTAATATAATGTAAAATCAAATTTATTATTATTATAATAGTTTGTAGAAAAAAATGAATAAAAAATAAAATACAAATTTAAAAATTTTAAAAATTATTATAATTGTTATTATATTATTATGTATCATAAATATTTTTTATTATAACATTTTTTTAATAATTAATAATAAAAATTTAATTTTAAATTATATGAAAAAATCCTAAATAGTTTATTTTATGTTATTGAATACTTTAAATTAATTTTTTATAATTTTGATTTTAACATTTAATTTGTTTATTTTTCATTTGATTTTAGAAAAAGGTTTATTTGTTTTGTTAGGTTGGGTGGTAGGTGGCTAAAAACACATTGAGATGAACATACGCATACGCTATAATTAAGTAGAGTGAGAGTTTTGGTACTGTTTGCAAGTATTTTGAATTTAGAACAACATTTGGTAAACTAGGTTATTCTTTTTCTAACACAACTCATGTACTTTCACTTTCGATTCATTTATAATTTTCATTTTAATTCCCTAAAACAGAGAACCAAAAAAAAACACGTGGGCCTAACTCCAAATTCTGAGCCCAAAAATAGTTCACGGAACGGCATATTCGCATCCCCGCGAGGGACGATAAACTACCACTCACGTATCGCCACGTGTCGAAGAGCAAAAGAAAGAGAACCATAAATCGAACAAAGAAGCTATAAGTGGC


Gene Sequence:
>Vu_13622(-)
GACGCGAGTCTCTCACCGCTCGGAATCAAATATTCCTGAAATCATCGCATTCCCTTCGCTGCCCCTTCCCAATTCCCTTCCCTGGTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGTTCTTGGAATTATTGTTTTGAATTTTGATTTCATCGTTTCTGTTTCCTTCAATTTCAATTCCGTTTGTTAATTGTCTTCTCCGGTGGTATGTTTTGTTTGTCGATAACCCTAACCTAATTTCGCGCTCTGTAACCGGTTCGTGATTTAGTGGTTCGAGTTTTTCGGTTAGATCTCGCTGTCTACTGTTGCTTATGTCGATTTCAGTTATTCAAGTCTAAGTATGTTTGTTGGATGACAAAATAGACTTTTTTTTCTTCTTATTTTCCGTTTCTGATGTTGCAACGTTTTGGAATTGGATTTCGTCCTCTTTAGGCGTGTTGAATTTTGATTTGTTATTTATGACAGTGTTGTTTGTGGAGTGTGTTATGATTATGTATTTGGGTTAGGTTATGGTAACGAAATTTTGTGGAATATTTTGGAGTTAATTTTTCTATTGGTGTCATAAATTGTGATTTTAACTCGGGATTTCTCGTTTTTGTTCCGTTTTTGGGTGAATTGAAACGCAGATTGTCAATTGGATCTTCATGAGTTCAGCAACCACTGGAGCATACTTCGTTTCCTGTATTTCGGGAAACAAGAACAACGACCTCCTCTGCTGGGTTTTGCTCTTCTTGCTGCCAAAGTTTTTGGGAACTCCATTTGCCTACATCAACTTTCTCTTGATTCAGGCCATTGACAGGAGTCCATCTGCGGTGGGGGTTTTGGGAAACTTCGGGGTGGTTAATCTATAGTCATTTTTGGTTTGGTCATCAGCAGCAGCATATTTGGATCCCTGATTTCTGAGCGGTGAGAAATGGTTTCCTCTCAGTTTTCGGGTTTTACGAAGGGTGGTTACAAACCCTCACAGACTAATTTACTCTTTCCTGCAAACCTGCCTGATACTGTGAACACGGAGCATATTGAGCTAGATTTCTCTGATGTATTCGGCCCAGTTACTGTAGATTTGAACAACATTGATTCCACTAGTGGTGAACCTGTAGAAGACGTGAATGAGTTGGTTTATGATGACCCACCAGTCATTTACACCCGATCTCATTCTCTGGTTGGCCCTTCTGCTTGTGTTAGTCAATCACTTAAGCTTAGCAAACTCACCATACATGAGACTGAGGATTCACTGGAACTAGTGGATTATGCTGATGAAGAGACCTTTAAGGACATTAAAGAATCCTCCTTTGTCGAAGAGTCTTTGAAAGATGAAGACGGGAATATCTCAAAAACCCAAAGAGTTAGCATTGAAGATTTTGAGATTTTGAAGGTTGTGGGGCAGGGTGCATTTGCTAAAGTATATCAGGTGAGGAAGAAAGGTACTTCAGAAATTTATGCTATGAAGGTTATGCGGAAGGACAAGATTATGGAGAAGAACCATACTGAATACATGAAAGCTGAGAGGGATATCTGGACAAAGATAGAACACCCTTTTGTTGTTCAACTCAGATACTCTTTTCAGGTACTTAATTTCGAAATGGCATGACCCTTTCTTTTCTTCCTGTTTTTACTATCATTGTGTATTTTACGCAAAATCTAAATGAACATTTTATTTCTGTAAATTATGGATATATTTTGAAGTACTTTATATCCAGAATTGTTTTCTTTGTTAGTAAAATGCTAACTCATGTTACATCTATACGCTCTTTCAGACAAAATACAGACTGTATCTTGTGCTTGATTTTGTAAACGGGGGCCATCTCTTCTTCCAGCTTTATCACCAAGGCCTTTTTAGGTGAGTTTAGCTGAGATTTTTTGTTTCTTCTGTTTCTGTTTTTAATTTGCAGAATTAATTTGTGGTTCTATTTTTGTCTACTATTCAGAGAGGATCTAGCACGCATATATGCTGCGGAGATTGTTTCTGCAGTTTCTCATCTGCATTCAAATGGAATAATGCACAGGGATCTGAAGCCTGAAAATATTCTACTGGACGCTGATGGCCATGTACACTGTCCTCCCTCCCTACCTCCCTCATGTTTTTCATTGTGACTTTAAACCGTGCTTTCATACCTGTAATAACTGAACAGTTGTTCTTTTTTGATATACTAGGTTATGTTGACTGATTTTGGCTTAGCAAAACAATTTGAAGAGAGTACTAGATCAAATTCGATGTGTGGTACATTAGAGTACATGGCACCTGAAATTATTCTTGGCAAAGGCCATGATAAGGCTGCTGATTGGTGGAGCGTAGGTGTTCTACTGTTTGAGATGCTTACTGGAAAGGTTTGCATCTCTTTCCTTCTTAAGCTGTGAGGCTGCTTTTTCTTTTGGGTCTTTGTAGTTAGATTGTCTTTTTTTGGAAAGGTTTGCATACTAGTTGAGGAAAAATATATTTTAGTAAATTTAATTGGCTCTAAATTATGATCATGGGGTTTAAGAGGAGTGAAGTCTGTGTCAAACTTATACTTGCATCAAATACTACCTAATCATGGCACAATAATGCACTTTTACTGTGTTTGATGTTTTTTCCTTTTGTTTCCTGGCTGCCTTAGGGTGCAAGAAAACTTATCCAAAACAAGTACCTTCTTTGAAAGCTACATGTTTGTACCTGTTTTGGAAGATATCAAACTACTGTTGGTTGTCTGAAACCAAAACACTAGTCTTAATTATGTCATTTACATGTCAATGTTATATTTTCTTTTCGTTTAAAGATTTTTTTTTGTATAACAACTCTAGGCAGCATAAATGTGGTTTGTTCTAGTTTTCCTCCTCTGTCAGTTCTTGTTGAGTTATAATTGCACGATTTATTAAATGTTTAATTGGCCATAGGATGATAATGTAGCTTCATAATTGATTTTGAAATGCTTAAATATTTTGTATTCAGGAACAGCAGTTTGAATTCAATAACAATAAATATTCAATTTATTGAATTCAATTGAAGTGCTTTCCTGTTCTGTGCCAGTTCTTGTGGAGTTATGATTGTGTGATTTATTAATTGTTTAATCGCCCAGAGGATAAGGATAAGATAAGGATAGTATACTTTAATTGATTGTATAACGGTACATTTTTTTTGTTCAGTAAGACAATGTTCGTATCTTTGCATTTCATGTGTAGAAATGTTCAATTTATTGAACTTAATTGAAGTACTTTCAAGCTTAGAGCTGGGTCTACCGAAGCACCATGGTAGCTTGCTTGTTATTCGAGTTTCAAAGTGCACTCAATTTTGTTTCTTTTAAGCAAGTTAGTCAAGTTTATTTGTGTTTTAGCTTGCAGACAATTTTCCCCCTTTCCTCAAGCTAAAAGGAGAAAATAAAGGAAGGGGAGAACGTCAATTTTGGGAATTTCTAGGACAGTATGACCACAAATATTATTTGGTTCATTGCTTTTGTTATTGTAATACTATATGTCTGTTAGTTGTAATGGCCTGGGAACTGAATAGCTGTTAGGTCTTTTGGAGTTGCTAAATGTTTGTTGATGTTGTCTCACCTCCTCTGCAGCCCCCTTTCTGTGGTGGTAGCCGTGACAAAATTCAGCAGAAGATAGTTAAAGACAAGATCAAGCTACCAGCATTTTTGTCAAGTGAAGCACATTCACTGTTGAAAGCGGTAATCACTACTCCACATAAATTATTTCCTTTGATTATTTTGATATAGTTCATCATCAAAGTCATCATAATCTATATCTTATATATAATTGTTTGATGCAATGATGCTCTGCTTCACCTTTACATCTTAAATTACCGTTGTGAAGATAGGCTTGATATATTTTAAACTGGCTTTCTCTACTTAAGCATGAAGTGAGTGATGAACTGGACCACAAGAATTCTATTTTCTGGTATCTTTGCAGATACCGTAAAATGTTTGAGATAAAAATTGCGATACAATTACTAATTGGATTAACTTGAAGTCTTGAGAACATTGGTCTGGAAAAAGACTTAATTTCCAATGTAGTTGTTTAATCAACCAAACTAACGTATACCGAAGTAAATTAAATACGGAGGTGCAAATACTTATGAGATTGTGAATTGCCCTAAACTGAAGGTTATTAATAAAATCAGTGTTAGTTTTCTTTGGGGCATGATCACTAATGCATCTATTGTGACGCTTTTTTCCATAGACTTTAAAAGGATCGAGTTTGTATCACAAATATGAATTACTCTTTTCCTAAAATGCTGTAGAAAATTCACAACTTTTGTTCGTTGTAAGAGATTTCAATTCCTTGATTCGCATTCTATTGAGTTTTTCTACTATAGCTAATTTACTAGTAGACAGAAGTTGTAACATATATTAAGATGATTATCCCTATTTCAGCTGCTACAGAAGGAAGCAACGAAGCGCTTAGGTTGTGGAGCCCGGGGAGTTCAGGAAATTAAGGGACACAAGTGGTTTAAACAAATCAATTGGAGAAAGCTGGAAGAACGAGAAATCCAGCCAAGCTTTATCCCAGACGTAGCTGGTACGCACTGTGTTGCCAACTTTGAGAAACGCTGGACTGATATGCCTGTTGTGGACTCGCCAGCTGCCAGCCCAAATGGTGGAAACCCCTTTAAGGACTTCTCTTACGTGAGGCCTGCACCTTCTTTTCTTCAGAGGAATAGCCCTGCGTACTAACCAGACAACTTGTAACGGCTTTTACTTAAGATGCATATGTTTTTATAGTTCTCTTATTCTTCTCATTAGTTAGTTGCCTGTATCTGGATGCGTGAACAGTGAGTGATAGACTGTCACAATTGTCAACACTAAAAGAATTTTTTGTGCCCCTAGCTAGGACTTGTGTGTAAAATCTACAGGTTGTGAGTTCAGTCACTTATTTATGTGCCTTGCAGCTCCACAATTCTATTAAGATGTATGTCATGTCTGGAGGAAATAAACTGCTTTTTTTATAC