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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13618 LG3 31685018 31688537 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 31685027 3_prime_UTR_variant
T/C 31685074 3_prime_UTR_variant
C/G 31685238 3_prime_UTR_variant
A/G 31685277 3_prime_UTR_variant
T/C 31685278 3_prime_UTR_variant
A/T 31685279 3_prime_UTR_variant
G/A 31685362 synonymous_variant p.Ser882Ser
T/A 31685501 missense_variant p.Glu836Val
A/T 31685950 missense_variant p.Phe686Leu
T/C 31686283 synonymous_variant p.Pro575Pro
A/G 31686319 synonymous_variant p.Gly563Gly
G/T 31687064 missense_variant p.Ser315Tyr
T/A 31687135 synonymous_variant p.Ser291Ser
C/G 31687403 missense_variant p.Gly202Ala
C/T 31687404 missense_variant p.Gly202Arg
G/A 31688170 5_prime_UTR_variant
G/T 31688195 5_prime_UTR_variant
A/T 31688363 5_prime_UTR_variant
G/T 31688483 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13618.1
MWSMDRYCVCVPLFVCLVLAIELVVAQDFKPTDNILLDCGGPPSSTDTDDRVWTTDVGSKFGSSSEKSTTVSQAATQDPAVPQVPYMTARVFHAPFTYAFPVASGWKFLRLHFYPASYSNLNASDALFAVTANSYTLLRNFSVAQTTLALNYAYILKEFAIHVDGKTLNVTFTPSTNASNAYAFVNGIEVVSMPDIYTSTDGTTMIVGTNTAYTIDNSTALENVYRLNVGGNDISPSRDTGMFRSWSDDVPFLFGAAFGVTEPADSNVKFEYPPDTPSYIAPLDVYTTARSMGPNPEINTNYNLTWIFNIDSGFSYLVRLHFAEVSSNITKTNQRVFDIFLNNQTATPQADVIAWAKDSGLSHSNGVPVHKDYVVFIPDAREPRQDLWLALHPDPTDKPMYYDAILNGVEIFKISDTAGNLAGTNPIPPPVQDIIDPSTARAHNHGKSKNHTGIIAGGVAGGVVLVLVIGLCALAASRRRRQGKDSDASEGPSGWLPLSLYGPSHSAVSAKTNTTGSYASSLPSNLCRHFSFAEIKSATNNFDEALLLGVGGFGKVYKGEIDGGTTKVAIKRGNPLSEQGVHEFQTEIEMLSKLRHRHLVSLIGYCEENTEMILVYDYMAYGTLREHLYKTQKPPLPWKQRLEICIGAARGLHYLHTGAKHTIIHRDVKTTNILLDEKWVAKVSDFGLSKTGPTLDNTHVSTVVKGSFGYLDPEYFRRQQLTDKSDVYSFGVVLFEILCARPALNPALAKEQVSLAEWAAHCYLKGILDQIIDPYLKGKIAPECFKKFAETAMKCVADQGIERPSMGDVLWNLEFALQLQESAEESGNGFGDIHNEEEPTYTDSKGKKESDAMGGYDGNVTDSRSSGISMSIGGRSLASEDSDGLTPSAVFSQIMNPKGR*


CDS Sequence:
>Vu_13618.1
ATGTGGAGCATGGATCGGTACTGTGTTTGTGTTCCATTGTTCGTGTGCTTGGTATTGGCTATTGAGCTTGTTGTAGCACAGGATTTTAAGCCTACAGATAATATCCTGCTGGATTGTGGAGGTCCTCCATCCAGTACTGATACCGATGACCGTGTATGGACCACTGATGTTGGTTCCAAGTTTGGTTCCTCCTCTGAAAAATCCACCACCGTATCGCAGGCGGCAACTCAAGACCCTGCCGTCCCCCAGGTGCCCTACATGACAGCACGTGTGTTCCACGCGCCGTTTACCTATGCTTTCCCGGTGGCTTCCGGTTGGAAGTTCCTCCGGCTGCACTTTTACCCGGCTTCTTACTCTAATCTCAATGCATCTGATGCCCTTTTTGCGGTGACGGCGAATTCATACACGCTTCTTAGGAACTTTAGTGTTGCTCAGACCACCCTGGCTTTGAATTATGCCTACATTTTGAAGGAATTTGCCATCCATGTAGATGGGAAGACCTTGAATGTGACTTTCACTCCTTCTACCAATGCATCCAATGCTTACGCGTTTGTCAATGGGATCGAGGTTGTGTCCATGCCTGATATTTATACTTCTACCGATGGAACTACCATGATAGTGGGTACAAATACTGCTTACACTATTGATAACAGCACTGCACTTGAGAATGTTTATAGGTTGAACGTGGGTGGGAATGATATCTCTCCCTCCCGTGATACTGGTATGTTTAGGTCATGGTCTGATGATGTTCCCTTCCTCTTTGGCGCTGCATTTGGAGTTACAGAGCCTGCTGATTCAAATGTGAAGTTTGAGTATCCTCCGGACACACCAAGTTATATTGCCCCACTTGATGTCTATACTACGGCCAGATCAATGGGCCCGAATCCGGAGATCAACACGAATTACAACTTGACTTGGATCTTCAACATTGATTCGGGGTTTTCCTATCTAGTGAGACTTCATTTTGCTGAGGTATCATCAAATATAACCAAGACTAATCAAAGAGTATTTGATATATTCCTCAATAATCAAACAGCTACTCCCCAGGCTGATGTTATTGCCTGGGCAAAAGATTCTGGCCTTTCACATTCTAATGGGGTGCCTGTGCATAAAGATTATGTTGTCTTTATACCCGATGCTAGAGAACCACGGCAGGACCTGTGGCTTGCATTGCATCCAGATCCAACTGACAAGCCCATGTATTATGATGCTATATTGAATGGAGTGGAGATATTCAAAATTAGTGATACTGCTGGAAATCTGGCAGGGACAAATCCTATTCCTCCCCCTGTGCAAGATATAATTGACCCGTCAACAGCTAGAGCACATAATCATGGGAAATCAAAGAATCATACAGGCATAATTGCAGGAGGTGTTGCTGGAGGTGTTGTTTTAGTACTTGTCATTGGGCTATGTGCTTTAGCTGCATCTCGTCGCCGTAGGCAAGGAAAGGATTCTGATGCAAGTGAAGGGCCATCGGGCTGGCTTCCACTTTCTCTTTATGGTCCTTCACACTCTGCAGTTTCTGCCAAGACCAACACAACAGGAAGTTATGCTTCCTCCCTCCCATCAAACCTTTGCCGTCATTTCTCATTTGCTGAAATCAAGTCTGCCACAAACAACTTTGATGAGGCTTTGCTTCTTGGTGTGGGAGGATTCGGTAAGGTTTACAAGGGAGAAATTGATGGTGGAACAACCAAAGTAGCAATTAAACGTGGGAATCCACTGTCTGAGCAGGGGGTGCATGAGTTCCAAACTGAGATTGAAATGCTCTCTAAACTTCGTCACCGCCACCTTGTTTCTCTGATTGGATACTGTGAAGAAAACACTGAAATGATCCTTGTTTATGATTATATGGCCTATGGAACACTCAGGGAGCATTTGTACAAGACCCAGAAACCTCCACTTCCATGGAAGCAAAGGCTTGAGATATGCATTGGAGCTGCTCGGGGTTTACACTATCTACACACTGGAGCTAAACACACAATCATCCACCGTGATGTGAAGACAACAAACATTTTACTGGACGAGAAATGGGTGGCCAAGGTTTCTGATTTTGGATTGTCAAAAACAGGTCCAACATTGGATAATACCCATGTAAGTACTGTGGTAAAGGGTAGCTTTGGGTACTTGGATCCAGAATACTTCAGGAGGCAGCAACTAACTGACAAATCTGATGTTTACTCATTTGGGGTGGTTCTCTTTGAGATATTATGTGCTCGTCCAGCTTTGAACCCAGCCCTTGCTAAGGAGCAAGTGAGTCTGGCTGAGTGGGCAGCTCATTGCTACCTGAAAGGCATTCTTGACCAAATCATTGATCCCTATCTAAAAGGCAAGATAGCTCCAGAATGCTTCAAGAAATTTGCCGAGACTGCGATGAAGTGCGTGGCTGACCAGGGTATTGAAAGGCCATCCATGGGTGATGTCTTGTGGAACCTTGAATTTGCTTTGCAGCTGCAAGAAAGCGCAGAGGAAAGTGGCAACGGCTTTGGCGACATTCACAATGAAGAGGAGCCCACGTATACAGATTCTAAAGGAAAGAAAGAGTCTGATGCGATGGGGGGTTATGATGGTAATGTGACTGACTCCAGAAGCAGTGGCATTTCAATGAGCATTGGAGGTAGAAGCTTGGCTAGTGAAGACTCCGATGGGTTAACCCCAAGTGCTGTGTTCTCCCAGATCATGAATCCAAAAGGCCGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13618::LG3:31688537-31690537(-)
ACTGTTGACATGCAGAATCATTCCAGCATTGCCAAATTTAAACATAATCTCTTAAAATGTTGTTTGATATGTTACAAGTATTTAATTCAGTTAAACTAAAAGGATTATATTTATTTACTTTAAATTTGTTAACTAAACAGGATCAAAGTATGTGATAAATTTTAATTTCATATCAAATTTTAAAGACTAAACATATATTTAATCATATTTTATTTAAAGATTAAAAATATATTTATTTTATAAGTTAATTTTATAAAATTAAATTAAATTTAAAATTCACTTTAATATAATACTAAAATCATTTAAAAGTCTATTTTATCAGTGTTTGAGTTATGGTGTTTAGATTGGAGTATATAAGATCTGAAGTTCATATTCCAAATCAGTTAGACTTATTATTAATTTTTAGAACAGAAAATTAATTTAAATGCAAATTTAAATCTAATTCATTATTTTAAAATCAATTCTAGCTTACTTTCAACCAAATATGGTAATATGTTATTTTCCTGAGTGAGTAAACAAAATAAAGTAGATTATGTCTTTTTGTTAATTAATAAAAGGCCGTTTCTGATAGGTACCCAAGAGCTGTCATGGTCATATTGCTATTGTCTCTGTCAGTAATTTGAGATTAAGGACTTCTAAATGTCTCAACATATCTGTCATTTCCATGTTAGATACTCTTCCTAGCAACAATTATTCTGAGCAATTAATTAAGCATAAGAAAGTGACCTGAGAAGTATGAAAACGCGTTTTTGCAAGTTGGAAGCTCATATCTGTCATCCAATCATCACAGCTTTTGAATTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTGGAACACCCAAGTGGGTGGTTTACAGCCAAACAACCATGGACATTCTGTGCATTATTATAAAAAAAAAATTATTAATTCAAAAACTTGATTTTAGGAAAGTATTCTTCTAATAGAATTACAGTTTTCTCTTAATAGCTCGTGTAATAAAAATCGTAGTAAAATTAGTTATAATTGCCATGAGTAGCATTTCCATTTTAATTAAAGGTCACACAAAAATTGTGTTTATAAACCGAATAGTTAATTATAATTTAGATTATTTAACGATGTTTAGAAAGCAAACTGGTCAGTCATGAATTAGATTACATTAATTTTAATTTCTAATAGGTAAAGTCTATTTGCAATTGGGATAATTAGTTTGATTCAACACTTAAACTTTAAAACATCTTTAAAATTTTAAATGAAAAAACACCGCTTAAACCGTTGACATTGTACTTATAACAGAAACAATATACGCTAATAATTAATACAACATTATTTAACTTACAAATCATCCTCAGTTATGGATAAAATATTTTTACGGTCCACCACACTAACCTATCCAAAGGCTCTTCTGAGAAATTCTCAAACAAGAATCATTCTAAATCTTCAAGACCATCTTCACATAGTGTAAGCATTCAATGTATCTATGTTCTGTTATATTATTGTATTAATTATTTTTTATTCAAATTTAAACATTATTATTTTTAGTTAATAAATTATAAATACCATAAATTAGTAAGAAAATTTCTCAAAAAGATCGGAAGAGGATGTTATATTAACACAAGAATTACTTAGATAAAATATAATTAAGTGAAAAATAGATAATGTATCCCAATTATTTTAAAGTTAATTTTAAAAGGAAAATATAACACAGAAACCAACAACGAATTCAATTTTGACGTTACTAATTAAATTGAATATTTTTTTATGAATATAAATTAATAAAATAATTTTATATATAAGAACGGATGTAATGCTTATAAAATACTGAATATTTTTTATTTAATGTTTTTGTTTTCAGATGATCGATTTGTCTTAGTACATATTACTAGTTAAATAATAAATAAAAGTTATACATATTAAGGAAATGACCGAAAGTTATCGGTTTATTAATTAATTTCAGTTTTGTTTGTGAAATGTTTTTTTTTCCTATTACAGGTAGGTGTTGTATTTAATGTAGTTTCCAGTCATTGTTGCACTT


Gene Sequence:
>Vu_13618(-)
TCTCACTCCATTTCCCTCTTCCACCATTTTCTCTCTGCTCCTTCCAGCTGCAACCAACTGCCAAATACATTCCAATTCAACTCTCAAAACTCGGGATTGTCCCGCTTTGACTCACCGAGTTGCTTTTCAGCTCCTCTTCCCATGGCATAAGGTAAAATACCTTCTTTCTCAAACTTCAGTTTTCTTCAATATTCAAACCACGTTCACCCGTATTAGTGATTTTCCCTCACCTTTCATTGTCCATCCTGTTGTTCACTGAAAACCTAGTTCGCCATCCCCCCTCTGCATTTTGCCGATTTTAGAAAATCTGGGTCCAAGCTGAGCTGATCATAATCCCTCACCCCACTTCCCTTTTCTGATCTGGGTTCCTAGAATATAAGATCTTCGCATCAAAGTTGTGGTCTTTCATTGTTTTAAATTCTGGGTATGAGTGAATTGTAGTTCCCTGCAAGAGGTGTTGGCAGTTGTATGGTACAAGACAAAGCATTTTGAGTTTGAGTTTGAGTTTGGGTTTGGAATTTTGTGTCGGGATGTGGAGCATGGATCGGTACTGTGTTTGTGTTCCATTGTTCGTGTGCTTGGTATTGGCTATTGAGCTTGTTGTAGCACAGGATTTTAAGCCTACAGATAATATCCTGCTGGATTGTGGAGGTCCTCCATCCAGTACTGATACCGATGACCGTGTATGGACCACTGATGTTGGTTCCAAGTTTGGTTCCTCCTCTGAAAAATCCACCACCGTATCGCAGGCGGCAACTCAAGACCCTGCCGTCCCCCAGGTGCCCTACATGACAGCACGTGTGTTCCACGCGCCGTTTACCTATGCTTTCCCGGTGGCTTCCGGTTGGAAGTTCCTCCGGCTGCACTTTTACCCGGCTTCTTACTCTAATCTCAATGCATCTGATGCCCTTTTTGCGGTGACGGCGAATTCATACACGCTTCTTAGGAACTTTAGTGTTGCTCAGACCACCCTGGCTTTGAATTATGCCTACATTTTGAAGGAATTTGCCATCCATGTAGATGGGAAGACCTTGAATGTGACTTTCACTCCTTCTACCAATGCATCCAATGCTTACGCGTTTGTCAATGGGATCGAGGTTGTGTCCATGCCTGATATTTATACTTCTACCGATGGAACTACCATGATAGTGGGTACAAATACTGCTTACACTATTGATAACAGCACTGCACTTGAGAATGTTTATAGGTTGAACGTGGGTGGGAATGATATCTCTCCCTCCCGTGATACTGGTATGTTTAGGTCATGGTCTGATGATGTTCCCTTCCTCTTTGGCGCTGCATTTGGAGTTACAGAGCCTGCTGATTCAAATGTGAAGTTTGAGTATCCTCCGGACACACCAAGTTATATTGCCCCACTTGATGTCTATACTACGGCCAGATCAATGGGCCCGAATCCGGAGATCAACACGAATTACAACTTGACTTGGATCTTCAACATTGATTCGGGGTTTTCCTATCTAGTGAGACTTCATTTTGCTGAGGTATCATCAAATATAACCAAGACTAATCAAAGAGTATTTGATATATTCCTCAATAATCAAACAGCTACTCCCCAGGCTGATGTTATTGCCTGGGCAAAAGATTCTGGCCTTTCACATTCTAATGGGGTGCCTGTGCATAAAGATTATGTTGTCTTTATACCCGATGCTAGAGAACCACGGCAGGACCTGTGGCTTGCATTGCATCCAGATCCAACTGACAAGCCCATGTATTATGATGCTATATTGAATGGAGTGGAGATATTCAAAATTAGTGATACTGCTGGAAATCTGGCAGGGACAAATCCTATTCCTCCCCCTGTGCAAGATATAATTGACCCGTCAACAGCTAGAGCACATAATCATGGGAAATCAAAGAATCATACAGGCATAATTGCAGGAGGTGTTGCTGGAGGTGTTGTTTTAGTACTTGTCATTGGGCTATGTGCTTTAGCTGCATCTCGTCGCCGTAGGCAAGGAAAGGATTCTGATGCAAGTGAAGGGCCATCGGGCTGGCTTCCACTTTCTCTTTATGGTCCTTCACACTCTGCAGTTTCTGCCAAGACCAACACAACAGGAAGTTATGCTTCCTCCCTCCCATCAAACCTTTGCCGTCATTTCTCATTTGCTGAAATCAAGTCTGCCACAAACAACTTTGATGAGGCTTTGCTTCTTGGTGTGGGAGGATTCGGTAAGGTTTACAAGGGAGAAATTGATGGTGGAACAACCAAAGTAGCAATTAAACGTGGGAATCCACTGTCTGAGCAGGGGGTGCATGAGTTCCAAACTGAGATTGAAATGCTCTCTAAACTTCGTCACCGCCACCTTGTTTCTCTGATTGGATACTGTGAAGAAAACACTGAAATGATCCTTGTTTATGATTATATGGCCTATGGAACACTCAGGGAGCATTTGTACAAGACCCAGAAACCTCCACTTCCATGGAAGCAAAGGCTTGAGATATGCATTGGAGCTGCTCGGGGTTTACACTATCTACACACTGGAGCTAAACACACAATCATCCACCGTGATGTGAAGACAACAAACATTTTACTGGACGAGAAATGGGTGGCCAAGGTTTCTGATTTTGGATTGTCAAAAACAGGTCCAACATTGGATAATACCCATGTAAGTACTGTGGTAAAGGGTAGCTTTGGGTACTTGGATCCAGAATACTTCAGGAGGCAGCAACTAACTGACAAATCTGATGTTTACTCATTTGGGGTGGTTCTCTTTGAGATATTATGTGCTCGTCCAGCTTTGAACCCAGCCCTTGCTAAGGAGCAAGTGAGTCTGGCTGAGTGGGCAGCTCATTGCTACCTGAAAGGCATTCTTGACCAAATCATTGATCCCTATCTAAAAGGCAAGATAGCTCCAGAATGCTTCAAGAAATTTGCCGAGACTGCGATGAAGTGCGTGGCTGACCAGGGTATTGAAAGGCCATCCATGGGTGATGTCTTGTGGAACCTTGAATTTGCTTTGCAGCTGCAAGAAAGCGCAGAGGAAAGTGGCAACGGCTTTGGCGACATTCACAATGAAGAGGAGCCCACGTATACAGATTCTAAAGGAAAGAAAGAGTCTGATGCGATGGGGGGTTATGATGGTAATGTGACTGACTCCAGAAGCAGTGGCATTTCAATGAGCATTGGAGGTAGAAGCTTGGCTAGTGAAGACTCCGATGGGTTAACCCCAAGTGCTGTGTTCTCCCAGATCATGAATCCAAAAGGCCGTTAAAGTTGGGTGGTAACAGTACTCTCACTATAGACAGAATCAACCACTAAAATTCTGTAGTGCAATCGGGTTTCACCAAATTTGAATGGTACTCATTATTCATTTTCTGATATTTCTATTCATTTCTATGGTTGTTTCTAATTTATTATGATTATGTAAGTTGTAATTTGTAATTTGTGACCATGTTATGTAAAGATTGAAGAAGAACAAACATGTTGTAACGAGGTTGCTATATCTGAATCTTTTGAAACCCTCACTCTCTTCCCAAGATTGACAAAGAAGGGCAGAAC

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