Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13590 LG3 31199979 31203777 PREDICTED: CBL-interacting protein kinase 18-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04371 Apelin signaling pathway [PATH:ko04371]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 31199980 5_prime_UTR_variant
A/G 31200049 5_prime_UTR_variant
T/C 31200132 intron_variant
T/A 31200147 intron_variant
C/G 31200199 intron_variant
G/A 31200216 intron_variant
A/T 31200303 intron_variant
T/C 31200312 intron_variant
C/T 31200316 intron_variant
C/T 31200330 intron_variant
A/T 31200389 intron_variant
G/A 31200517 intron_variant
G/C 31200689 intron_variant
G/C 31201024 intron_variant
T/A 31201226 intron_variant
A/G 31201440 intron_variant
C/G 31201551 intron_variant
C/A 31201672 intron_variant
T/A 31201747 5_prime_UTR_variant
C/G 31201794 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 31202181 missense_variant p.Lys4Asn
A/T 31202355 synonymous_variant p.Ala62Ala
C/G 31203006 synonymous_variant p.Thr279Thr
C/T 31203012 synonymous_variant p.Asn281Asn
C/T 31203023 missense_variant p.Ala285Val
C/G 31203082 missense_variant p.Pro305Ala
C/A 31203083 missense_variant p.Pro305Gln
C/T 31203140 missense_variant p.Ala324Val
G/T 31203327 missense_variant p.Trp386Cys
G/C 31203514 missense_variant p.Glu449Gln
A/T 31203519 missense_variant p.Gln450His
C/A 31203549 missense_variant p.His460Gln
A/T 31203557 stop_lost p.Ter463Leuext*?
A/G 31203771 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13590.1
MEQKGGVLLQKYELGRLLGQGTFAKVYHGRNLITGMSVAIKAIDKEKILKVGLVDQIKREVAVMRLIRHRHVVELYEVMATKTKIFFVMEHAKGGELFNKVLKGRLKVDAARKYFQQLISAVDYCHSRGVCHRDLKPENILLDENDNLMVSDFGLSALTESKRQDGLLHTICGTPAYVAPEVINRKGYDGMKADIWSCGVILFVLLAGYLPFHDSNLMEMYRKISKGVFKFPKWFAPDVRRLLSRILDPNPKARISIARIMKCSWFKVGLENPAMTAATENQEPAAAPAPVNADGILEACENDGPPIAESKHELTKPCNLNAFAIISFSTGFDLSGMFEDSVPMKEMRFMSNKPASSIISKLEEICKRLCLKVRKKDGGLLKLEGWKEGRKGSIGVDAEIFEITPQLHMVELRKSNGDTMEYQKLFTQDIRPALEDIVWTWQGEQPQQEQQHHEVVLEEHQP*


CDS Sequence:
>Vu_13590.1
ATGGAACAGAAGGGAGGTGTGCTTCTGCAAAAATATGAACTTGGTAGGTTATTAGGCCAAGGGACCTTCGCAAAGGTCTACCATGGTAGGAATCTGATAACTGGCATGAGTGTGGCCATTAAGGCAATTGATAAGGAAAAAATTTTGAAAGTTGGATTGGTTGATCAGATTAAGCGTGAAGTTGCAGTGATGAGATTAATCAGACATCGACATGTGGTTGAGCTTTATGAGGTAATGGCCACCAAAACCAAAATTTTCTTTGTCATGGAGCATGCAAAAGGTGGTGAGCTGTTCAACAAGGTACTCAAAGGAAGGCTGAAGGTGGATGCTGCTAGGAAATATTTTCAGCAACTGATTAGCGCTGTTGACTACTGCCATAGCAGGGGTGTGTGTCATCGAGACTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTGGATGAAAATGATAATTTGATGGTTTCAGACTTTGGGTTGAGTGCCCTTACTGAATCCAAACGCCAAGATGGGTTGCTCCATACTATATGTGGTACCCCTGCGTATGTTGCTCCAGAAGTGATAAACAGAAAGGGTTACGATGGGATGAAAGCAGATATATGGTCATGTGGGGTAATCTTGTTTGTTCTGTTGGCTGGTTATCTTCCATTCCATGATTCAAATCTGATGGAGATGTACAGGAAAATCAGTAAAGGGGTATTCAAATTTCCTAAATGGTTTGCACCAGATGTTCGCCGGTTATTATCCAGAATATTGGATCCAAACCCAAAGGCCAGGATATCAATTGCCAGAATTATGAAATGTTCTTGGTTTAAAGTGGGGTTGGAGAATCCTGCTATGACTGCTGCAACCGAAAACCAAGAACCAGCTGCAGCTCCAGCTCCCGTGAATGCTGATGGAATACTTGAAGCGTGCGAGAATGACGGTCCACCTATTGCAGAGTCAAAGCATGAACTGACCAAGCCTTGTAACTTGAATGCTTTTGCTATTATCTCCTTCTCAACTGGTTTTGATTTATCTGGTATGTTTGAGGATAGTGTTCCAATGAAAGAGATGCGGTTCATGTCAAATAAGCCTGCTTCGAGTATAATCTCTAAGTTGGAAGAAATTTGTAAGAGGCTTTGCTTGAAAGTAAGGAAGAAAGATGGAGGCTTGTTGAAGTTGGAGGGTTGGAAGGAAGGCAGAAAAGGGAGTATAGGTGTTGATGCTGAGATTTTTGAGATTACGCCACAGCTCCACATGGTGGAACTTCGAAAGTCCAATGGTGATACCATGGAGTATCAGAAGCTTTTTACACAGGATATCAGACCAGCACTTGAAGACATTGTTTGGACATGGCAAGGAGAACAACCACAGCAAGAGCAACAGCATCATGAAGTAGTTCTGGAAGAGCACCAACCTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13590::LG3:31197979-31199979(+)
GGACCGTCGGGTGGCCCGTTTTGACAGCTCTAATTTCTTAGTATTAATCATGATAGGCATCTTATTGAAGATTTTCTTCATGAAAAAAGAAACATACAAAAGAGATTGATCTTGCTTAAAGACTACCTATCTATGAATGTGAAAAGATCATATTAAAATGTTAACACTAGTTTGTTAGGAAATCCAATACATAAATTCATACAATACATGAAGAATATTAGATAGTTTGGTGGATGAAGTACAATAAAGAAATATGAAAGACACATTGTAATAAGAAAGAATGATATATTCTATAAATAATTTCTTGATAAAAGCATATAATAACAAAATATAATGTTTACAAGGAGTTTACATAACACACACTTAAATAGGAAAGAAAAAATTATAATGAATAATTAATACAAACTATACAAGTATGTATCAATCCAACTCATTGTTCAATTGGATAGATTTGACTGTATCTACAACTACAACTAACTATATAACAAAATAATAGAAAATCAAACTAAATCATCTAAAAGTTATGAGTAGACACTTTGAGCATATGCATTTCATCAAATGATGCACGCTAGTGTTACAAAAGACAAATGACCCTCATCGGACACTATCATTAATCAGTCTCAATACATGAAGAAAAGATAAGATATAAATTAATATCTAAGTTTCACATAATAGATGATATTCAAGATTTTAAAGTTATTGCTATTGTTAACTTTAGTAGGGAGACTTTTCATGATAATGAAAGTAATTAAATTAGTATTAACTTTGTGCTTGGAGCTGAAGTTTTGATAGTTATGCTTTACAAAATATACAAATAGATTTGGTTAGAGTAATATTTATGTTGAATGTGATTCATAGAAAGTTATCAAAGCTTTCATTGGAAGTACATTTGCACTTACATGCGACATGGAAAAAATGTATAGCACTTTGTTCTTCTATTACTTTTTATTCTTAACATATTTTTCAAGAGAGAAACTTCTATGTTGATAAATTACTTCCGTACTAGACTTAACTTTGTTTGGTAGTATAATATTCTTACCTTATTTTGATTTGTTTAGGAATATGTGTGGTTCCTTCCTTTTAAGTTTGTTTAATTTCTTCGTGAGTTTTGACTTATTCCCTTCATAACTTTACGTTATTTTTTTTCTTTTGATGTGCTCCACATAATAAGGGAAACTTGAGGTGTGAAGATTGTTAAGATGATTTAATTAAATAATTATGCTTTTCACGTCAATATTTTAAAAGAGTATATAAGTCCTATTTTTTTTTTCTTAAAACACGTGAATAAAATGAAATATATATTTCATTAAATCATATAGAATGCTATTCTTGGTAAACATGTGAAATAATGTCTTCGAGCATTATCAATGTTAATTTTTATTTTGAATGATTGGTTTATAATAAATTTAACAAATGATTAGTTAGATAAATTTATATAATTTAACTTTTTTTAATGATTTTGCTCAACCTACTCGTGCTAAAATTGTTTTTGTGTACTTAAACTTATATTATTATTATTTTTAACTAAAAACTCTCCATATAAAAGATTCAATAAGAGTGAAAGATAAATATCATCAAATACACAATACAGTACAGGCCATACTTAGCAATTTACTATATGTAAGTATTCTAAACAGAGTTGTCACGATAAAAACAGTCAAAACAACATTAAAGATAAAATTATAAAAAAAAAATATGTAAATAAAAAAGTAAGTATAAAAATGTTTCAGTTTTATAGGTTGTCTTCATTAATGTAAACGTACATAAATAAAAAATTAATAGAAATAGAGAAAAAAAAATATTTTTCTTATTTCAAAGTATAACCTCTTTCAAAAGATTTTTGTGTTAAAATAATATCTTCCTTATTTTTCGGTTATGTTTTAATTTTTAAAATTTAAACTCGTAATAAAAGGTAACAAATTAAAATTAACGAATTCAAAGGTAACAACAAATCAGGTCAAGTGAGTTTATATAAGAAGCTGCGCCCACGGAATTCAACA


Gene Sequence:
>Vu_13590(+)
ATTTGCCAAAAACCTTAAAACGACAGCAAATTTTGTGTTTCTCTTCTTTCCCATCTCTTGGTAATTGTTCAGTTCTCTGTTTCACTCCGATTGCAGAGCCACCTGCAGAAAAACGATAATTCTCAAACCCCTCACAGGTAACACCCTTCTCAGTTCTTTTCTTTTTCTTCTGCATCATTTTGAAATAAATAAATACGTGCTCTTTTCTTCTGCATGAAAGCTTCAAGCTTTTTACATGCTAGCCTTCGGGTTTGAGATCATTTCCATTTTTAACGACATTTTTTTTATTAGTTCTCACTGTTTTGTTCAACATCTTGCAAAGTCAAAAGCTTTTTCACTCTCTCGTTGTACCCCAATCAGTATTCCTATCCGGGCTGATATACAGAGTGTGTTGTTTTCATTTATTTTTCATTTGTTGGTTGGGGTGACGCCTCTGGTGGATCGTTTACTTGTTATCACTGATTTTTCTCTTATTCGTTTGAAGCAATTTTGTTGTTTTAGTATATTTCTTGTGTAGAGACTGTTTTTTCTGTGTTTTGTGTTTTAGTGTGGGATGGTGCAGAGGGTGTTTTATTTTTTATTTTTTGCTGATGGTTTGCTTGTTATTCTGATTCACAATTTCTTAGTTTCTTCCTTGTAAAACCTTTTTTTTTGGTACTTTGTCTCTTCATCGATTAAATTGCTGCATATGGTGGAGGTTTTTGCCAATCGTAAAGCATGGATAATAATTGTGCTTGTTTGGTTTCAAGTTCATCTAAAATCATGTTGAAATGCCATATAATATATTTTTCGGTAATTGTTCACATAAAAGAAATTGATTTTGAATCTAGAACTAATTTTGAGTTGAAACACTCCAAATAGTTTTTGTGCTGTATCGATTTTTTAAATTGAATCTACTTCTTAATTTTTTGTGTTGAAATAACTACAAATGTTTTTCCCTTCAAAATATGATGCCACAAAGACCATTGACAAGTGAAACAAACAAGGAATTAGGTAGACATAATGGAAGAATTATGAAAGTTAGGTCATGATCTGATAGGAAGTAGAAACAAATGCATATGAAAGCTTCTAGTGCCTAATTTCACCATCTGAAATTTCCTACCCTTCTGAGTTTCACCTAATTCTCACGTTTTAAGAAAATCCCATGGATATGTGAATGCTATTTTACTTGTTTGCCTAGCTTGCTTTGGTATGAAATCACTGTTGATCACATTTAAAATATGGTCTCAGGTTAGAATAGTCATTGTTCAAGTGTCAAGCCCATGAGTGTGTTGGTATTGGCAAATGTGTTTACTTATTTAACCAGCTAAATGATTATTTGATTAAATTTCGACGAAGCATACTCACCTCTTAGATGGATCTAATAGTTTTTAATTTGGAATCATATAGGCATGTACTTCTGTCATTGTTAAAACGCGTTTTCTTTGTATGTTTTGAATCACTTATTCCTAATATCTATAGAACAAACTAGTTAACTAGAATCAATTGGCTGATTTGTCCTCCAGGAGTTAAGTCCTGTAAATCTTATGATTAAAAGTCACATGTTGCTGTTTTGTTAGGGAATTTGATTTTCGCTCATTTTCTTAGTTTGTTTTTATGCATCCAGATTGTTAAAACACTAGCATCAGAGAGAAGTCATAAATACTGAAAAGGTTGAAGTTTACGTGTCACAAGAGATTTAAATAATTATTTTCTAAATTTATTTAGCTGGATTGGATGTTTAAGGTTGCCTACTAAATTTTCTGCCTTCTTTTTTTTCAGATGCGCCTTCCTTAAATGTTTTGCTTTTGGGTGGTTGAAAGCTAAGCGGGTGCTCCTTTAAGGAGTTCGTCTTCGGTATTATCTAGTGTCCTTTACCAAAACCAGGGAATGCTGAAAGATGTGGTTGAAAGTTAAGAGTTCCCTCTCTAGTGTTAATGAAGTTGTAGCACCATGTGTGCTAGACTTATTAATCCTTGATGAGATTGGATATATAGACCACTGTGAATATCTGTTTTATGCGCATTTGCCTGAGGAAGCTGGAAATCTGAGCAATTGTGTGAAATCAAAACGTGATGTTTGTGAAGATGGCTGAGCTTTGAGCATCATTGGAATAGTTTACTACTTTCTGATAACGTAAGCACCTGGACTCAGTATATAAATAATACTATCGAAAGTAGCATTAGTCTTATACAAAAAAGAGCTGCAGAAAATGGAACAGAAGGGAGGTGTGCTTCTGCAAAAATATGAACTTGGTAGGTTATTAGGCCAAGGGACCTTCGCAAAGGTCTACCATGGTAGGAATCTGATAACTGGCATGAGTGTGGCCATTAAGGCAATTGATAAGGAAAAAATTTTGAAAGTTGGATTGGTTGATCAGATTAAGCGTGAAGTTGCAGTGATGAGATTAATCAGACATCGACATGTGGTTGAGCTTTATGAGGTAATGGCCACCAAAACCAAAATTTTCTTTGTCATGGAGCATGCAAAAGGTGGTGAGCTGTTCAACAAGGTACTCAAAGGAAGGCTGAAGGTGGATGCTGCTAGGAAATATTTTCAGCAACTGATTAGCGCTGTTGACTACTGCCATAGCAGGGGTGTGTGTCATCGAGACTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTGGATGAAAATGATAATTTGATGGTTTCAGACTTTGGGTTGAGTGCCCTTACTGAATCCAAACGCCAAGATGGGTTGCTCCATACTATATGTGGTACCCCTGCGTATGTTGCTCCAGAAGTGATAAACAGAAAGGGTTACGATGGGATGAAAGCAGATATATGGTCATGTGGGGTAATCTTGTTTGTTCTGTTGGCTGGTTATCTTCCATTCCATGATTCAAATCTGATGGAGATGTACAGGAAAATCAGTAAAGGGGTATTCAAATTTCCTAAATGGTTTGCACCAGATGTTCGCCGGTTATTATCCAGAATATTGGATCCAAACCCAAAGGCCAGGATATCAATTGCCAGAATTATGAAATGTTCTTGGTTTAAAGTGGGGTTGGAGAATCCTGCTATGACTGCTGCAACCGAAAACCAAGAACCAGCTGCAGCTCCAGCTCCCGTGAATGCTGATGGAATACTTGAAGCGTGCGAGAATGACGGTCCACCTATTGCAGAGTCAAAGCATGAACTGACCAAGCCTTGTAACTTGAATGCTTTTGCTATTATCTCCTTCTCAACTGGTTTTGATTTATCTGGTATGTTTGAGGATAGTGTTCCAATGAAAGAGATGCGGTTCATGTCAAATAAGCCTGCTTCGAGTATAATCTCTAAGTTGGAAGAAATTTGTAAGAGGCTTTGCTTGAAAGTAAGGAAGAAAGATGGAGGCTTGTTGAAGTTGGAGGGTTGGAAGGAAGGCAGAAAAGGGAGTATAGGTGTTGATGCTGAGATTTTTGAGATTACGCCACAGCTCCACATGGTGGAACTTCGAAAGTCCAATGGTGATACCATGGAGTATCAGAAGCTTTTTACACAGGATATCAGACCAGCACTTGAAGACATTGTTTGGACATGGCAAGGAGAACAACCACAGCAAGAGCAACAGCATCATGAAGTAGTTCTGGAAGAGCACCAACCTTAGTTTCCTCATCAACATTTCATCCTTTGCTTGTTCATTCTCTCTGCTTCTTTTGTTATTTTTCACAGAATAACATGCCTAGCTAGTTCAGTCTTATTTGATGGATACTTGAATAATTGTCTACACAAATTGCCAAGTTCACCAATTTGGGTGTGCTTTTTTCCATCTTAATAAGATTTTTTTTACTAATTTCCCTACGAATTGATTTGGACATGATATGAT