Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13572 LG3 30920311 30921598 PREDICTED: transcription factor SCREAM2-like
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SNP Position Effect Amino acid change
G/T 30920322 missense_variant p.Arg4Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13572.1
MASRDKRRESLEQTLQQLRDVTNSTALNKASIIADASKYIEELKQKVEGLNSELGINESSSNSQIDELPAVTVKTLKKGFLINVLLENNSPGMLVSVLEAFEELGLDVLDARVSCEDSFQLEAVGRESHKNDSVDAQVVKQAVLQAIKKED*


CDS Sequence:
>Vu_13572.1
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Promoter Sequence:
>Vu_13572::LG3:30918311-30920311(+)
CTCTCAGTAATTTTTCACTCAAATACTCTTCACATCAATTTTCATAGGTTGAACTATTTTTTCTGATATGTTTTTCTCAGTTTTCTGTATAAATGATTCTTAAGATCGAACGTTAAATCACATGCATAAGGTGCTCTTTACCTGTCATTAGTTAATGTGCATTTATGAAGTTGCAACGCGCTATGCCAAGTTAAATTAATGTAGAAAAGATGCTGTATACAGTAAAATTAAGTACACGAAGGTTGATGTTTCATCACGTGAGTGCTGGCTTTGAGAGGAAGATAGAAAATAAAAGAGAATCTGAGGAGTAGTATCACTTCGCATTGTCTGGAAGGCTAAGTGATGAAATATGACAACCACACACAATTTTCTTGGGATCACCACTTCCAAGTTTTACTATTATTGATCATTATATCCAAGATCCACAACAGAAACAAATTCAAGAAAATTTAATCATAAAAAGGGAAATGATAGCATGTCACGGGGGAAGATGAAACTTGTATTTGATTATATCTGTTGTTACTCAATACCTTTATATGAAAATCGAGTTAATGAACAATTTAAATATATTTACCTTTTTCAATATTCGATAACGTATAAAATAAAAGTATGATAAAAGTTCGATTTTTAAAATAAATAATATATTTGACAGAGTCATTTGTCTTAATAATATCATTTCAAGATATTAGAACAATATCATTTATGTTTCATAAAATGACCGATTGTAATTTTGGTTTTCATTTTTTAAATTATTTAATGTTTTAATCTTCAATCAAATAATGGTGTTTTTATATGTGTTTGGATTATTAATGAATATTTTTCAAGTACTTATCTTTTGTTAGTAGAAGAGTTGAATTCAAAACTTCTCATATTCTACATTCCAAATTCTTTAAATTATAACTTTATATTTTTAAAATGTTAGTAAGAAAATTGAATTAATAATTTCTCCCATTTTCCTTTTTAATTTTTATCATTAAATCAACTTTATTCAGATCGGAATTTGTGTCCGACAGTATATGTATTCTTATTTAAAGAAAATAAAGCAAAACTTGGGTAAGTAATTACTTTTTCGTAGTGAACTTATCATGTTATATGCAAACTCTCTTTGCTACTCGAATGATAAAATCATAAGTAGAGGTAAAAACTACAACAAGTTTATGCATATATCTCCATAATCTCTTTTGCATTGGCTTGGTTGATTATTCAATGGATTCAAGATAAGGGTCTATCCACTAATATGATGGTAAATAATTATGTGTGCATTAATGTGTTGGAGGGAGGCAACCAATGAATGTATTTTATTTTATTTTTGTGTATAAAAGTGTTGGGGCAACCCAATTACTTCATTCAATATTTTTTTTGTTAATGAAAAAGATAATGATAGTTTTTCAATTTGTTTCCAAAAAAATTATATTAATATTTTGTATTTGAAGTAGTTTGACAAAATAAGATTATCTTAATAAATATGTTTAAATAAGTGAAATATTTTTCTGTTCTTAATTATGCAAAATTCCTTAAACATTGGTAGGAAACATAAATGTACACGATTAAATTATCAAGAGAAACGCTTGATTATTATGAAATTATAACTATAAATTTGAATAATATACATGAATGATTAAGAATAATGACTATTATATATTTTTATAATAGTACTGTGTATTTACCTAATAATGTAACCATCTTTATGATTACATGGTTACCATTTATGATTATTTATTTCTTATCAAATTTGTCTTGCTTCACCCAAATTATTTATATGTAGGTATCTGAAAATGGCGGGGTCAATTTAGTAAAAGCATAATTTAGTGTAGGGAATATTTAGGTACTCATGCAAACAAACGACATATTACACATATTTTTTAATAGCTCAGCCAATTCTATAAAAAAGGAAAACTTGTCTAAGCAGACAGATGGGAAAGGAAGGGAAGAGAAAACAAACAAAAGGAGAGAAAAGCAAAATCAAAATCAAAACAACAACTGCACAAAAGTGATAAGCA


Gene Sequence:
>Vu_13572(+)
ATGGCTTCTAGGGACAAAAGAAGAGAGTCTCTGGAACAGACTTTGCAACAACTTCGCGATGTCACAAACTCAACTGCTGTAATTTGTTATATATTTTGATGAATTAATCACAGATGAAGCTCCAGCTTCTGATTCGTCTTGAATCAAAGCTTTTAAAAGATTTGACCTAATAATAGTTTCTTTGTTAACTTTTGGCAGCTGAACAAAGCTTCAATCATTGCAGATGCCTCAAAATACATAGAGGAGTTGAAACAAAAAGTGGAGGGACTGAACTCAGAGCTGGGGATCAATGAATCATCATCAAACTCTCAAATTGATGAACTACCTGCGGTGCTTATTAATCTTGTTGCTGCATTTAATTTGTTGTTCATAGATTCTTTTGAGTCGAAATTGATAAAGATCTTGTTTAACATTCAATAATCCGATTTATGTTAGAAAAGAGAATCTGGGAGTGGTAAAACTTTTCGTCTGACTTAGCACAGTTCAATACTGATGAATCTTGTGAAAATGGTACTTTTGCAGGTAACTGTGAAAACCCTAAAGAAGGGTTTCCTCATTAACGTGCTTTTAGAGAACAATAGTCCTGGTATGCTCGTGTCTGTACTCGAAGCCTTCGAAGAACTTGGCCTTGATGTGCTTGATGCTAGGGTTTCTTGTGAAGACAGTTTCCAGCTAGAAGCTGTGGGAAGAGAAGTAAGACAAAATACATAAATATCATACAACTTTATCTTTAACTATTCTCCTCATTTGATTTTCATTTCAAATAATTTTAAACCTATAAAACTAACCTCTTCACACAACTATGTATTAGCTTCTGACTATAAACAATCCAAATATATACATTCATAGAAGTTAGAAACAACTCGAACACTTGTAGTAAAGTTTTGGTGAGAAATTCTTTCATGGTTCTGAGGTTCCAAAGTAACATAAATTAGATACCTGAATGGATCCATACATGTTTTGAAGAAAAACAAACGTTGTACTTAATGATGTGTTATTGATATCGATTCATCGAGACAGAATTTTTTTACCCTAGTTGCTATACACCTCATAGTTATTTAATAGTTTTTCTCCAAAAACCAGAAGTTAAAAACCTTAAATAGGTTCGTTTTTCTACCATTTTTGTTGTTGCATGGAGTATATATAGTAAATAATTAGATAATGTGATACAACCAACAATACTCAAATTTTTTGACAATAACTTGTTTTGCAGAGTCACAAGAACGACAGTGTTGACGCGCAAGTGGTAAAGCAAGCAGTGTTGCAAGCAATCAAGAAGGAGGACTAA