Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13447 LG3 28643857 28647183 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G,T 28643947 missense_variant p.Ile985Thr
T/G 28643979 missense_variant p.Arg974Ser
A/T 28644109 splice_region_variant&intron_variant
C/T 28644239 intron_variant
C/A 28644401 missense_variant p.Cys928Phe
G/A 28644479 missense_variant p.Thr902Ile
A/G 28644488 missense_variant p.Met899Thr
T/G 28644502 synonymous_variant p.Ser894Ser
A/G 28644550 synonymous_variant p.Thr878Thr
T/C 28644557 missense_variant p.Tyr876Cys
C/T 28644970 synonymous_variant p.Gln738Gln
T/A 28644971 missense_variant p.Gln738Leu
A/T 28645072 synonymous_variant p.Gly704Gly
T/C 28645158 missense_variant p.Ser676Gly
G/T 28646038 synonymous_variant p.Leu382Leu
G/T 28646472 missense_variant p.Leu238Met
G/A 28646510 missense_variant p.Ser225Phe
A/T 28646561 missense_variant p.Met208Lys
C/T 28646696 missense_variant p.Arg163His
A/T 28646839 synonymous_variant p.Ser115Ser
G/A 28646843 missense_variant p.Ser114Phe
T/A 28646872 missense_variant p.Gln104His
C/T 28646933 missense_variant p.Gly84Glu
G/A 28646968 synonymous_variant p.Cys72Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13447.1
MRIHQIFFNIFIPFCLICLNFNTHIVTCHCLHHDQFLLLQLKQNLVFNPNTSNKLVHWNQSSDCCQWNGVTCSMGHVTGLDLSGESISGKLHNSTLFHLQYLLQLNLAYNDFNSSIPFKFDKLKNLRSLNLSNAGFHGQIPSQISQLTNLTTLDLSTSLVSQRFFKLQKPNISMFLQNLTKLSELYLDGVRVSAVGKEWCHALSSLQMLKVLSMSSCGITGPIDSSLATLKGLTVIRLNQNSVSSSVPEFFANFSNLNVLELSSCRLSGHFPKGILQIQTLNVLDISNNKDLHGALPNFQEDAVLLHTMNLSNTNFSGKLPSSISNLKQLSVLDLSNCQFIETLPISMSELTQLVYLDLSFNKFTGSLPSFTMVKNLRYLSLSHNRLNGTISTHFEGLENLLVINLGDNSLKGKIPVSLFTLPSLQELTLSHNGFNGPLDEFSNVSSSKLQLIDLSSNSLQGPFPVSLFHLEGLRFLQLSANEFSGTIALDRIQRLQTLHTLGLSHNNLSVDITLIDEHDISSFPNMKYLLLGSCNLRKIPGFLRNHPQLHALDLSNNQIHGIIPNWIWRFDSLVYLNLSNNFLTTMEGPFDDLHSKLYILDLHSNQLLGSIPTFTEYAVHLDYSSNNFSTSPLDLENYIPFVHFLSLSNNNFQGKIHEAFCNFSYLRLLDLSYNSFNGFIPKCLMTRNSTLRVLNLARNKLQGFLSDTISSSCNLRFLNLNENLLGGAIPNSLANCQSLQVLNLGNNLFSDRFPCFLRNISTLRVLILRSNKLNGSISCPHSTTNWEMLHIVDLSYNNFTGTLPGALLRSWTKMIGNQTESQEEQGTLYFDMFDNHDNMRYNNLFSVISQFLVIKLYKLLSTEPYTVADHIFAYYVTSNQFGGRYLDSVTIVSRAQQMQWTKIPSALTSLDLSWNHFQGPIPQELSCLTALVGDPLPTPVYEMHGSIEINFLSVELGFIFGFGIFILPLMLLKSWRLLYWQTVDNFLQRVVPQLDFVYDHYEGKRYKSLRWMG*


CDS Sequence:
>Vu_13447.1
ATGAGAATCCATCAAATCTTCTTCAATATCTTCATACCCTTTTGCCTGATATGCTTGAATTTCAACACCCACATAGTAACATGCCACTGTCTACACCATGACCAATTCTTGTTACTCCAATTAAAGCAAAATCTTGTATTCAACCCAAACACTTCCAACAAATTGGTTCACTGGAACCAAAGTAGTGATTGCTGTCAATGGAATGGAGTAACATGCAGCATGGGCCATGTAACTGGTCTTGACTTGAGTGGGGAGTCTATTTCTGGAAAACTACATAATTCCACTCTATTTCACTTGCAATATTTGCTGCAATTGAATCTAGCTTACAATGATTTCAACTCTTCTATTCCTTTCAAGTTTGACAAGCTCAAGAATTTGAGGTCTTTGAATTTGTCAAATGCTGGATTTCATGGACAGATTCCTTCCCAGATTTCTCAACTGACAAATTTGACGACACTTGACTTGTCTACATCACTTGTCTCGCAACGTTTTTTCAAACTGCAGAAGCCAAATATCAGCATGTTCTTGCAGAATCTTACCAAACTCTCAGAACTATATCTTGATGGTGTAAGGGTATCTGCTGTGGGAAAGGAGTGGTGTCATGCTTTGTCTTCTCTTCAAATGCTTAAAGTGTTGAGCATGTCATCATGTGGTATCACAGGGCCAATTGATTCTTCATTGGCAACTCTTAAGGGACTCACTGTCATTAGACTGAATCAAAACAGTGTCTCAAGCTCTGTGCCAGAATTTTTTGCAAATTTCTCCAATTTGAATGTTTTGGAGCTTAGCAGTTGCAGGTTGAGTGGCCATTTTCCAAAGGGTATCTTACAAATACAAACTCTTAATGTTCTTGATATATCAAATAACAAGGATCTTCATGGAGCTTTGCCAAACTTCCAAGAAGATGCAGTTCTTCTTCACACCATGAATCTCAGTAATACAAATTTCTCAGGGAAATTACCAAGTTCTATTTCCAATCTAAAGCAGCTGTCTGTGTTAGATCTATCTAACTGCCAATTCATTGAAACACTGCCAATTTCAATGTCAGAACTCACTCAACTTGTTTACTTGGACTTGTCTTTTAACAAGTTTACCGGTTCACTCCCCTCTTTCACGATGGTGAAGAATCTCAGATATTTATCTCTCTCTCACAATAGATTGAATGGAACCATTTCAACTCATTTTGAGGGACTTGAAAATCTCCTCGTCATCAATTTAGGAGATAATTCTCTCAAGGGAAAAATTCCTGTGTCACTTTTTACACTTCCATCTTTACAAGAACTCACCCTTTCTCATAATGGATTTAACGGTCCATTGGATGAATTCTCAAATGTTTCTTCCTCTAAATTACAGTTGATTGACTTGAGCAGCAACAGCTTGCAGGGCCCTTTTCCTGTATCTCTGTTTCATCTTGAAGGACTTCGTTTCCTACAACTTTCTGCAAATGAATTCAGTGGCACCATAGCACTTGATAGGATCCAGAGACTACAAACTTTACATACTTTAGGTCTTTCACACAACAACTTGTCAGTTGATATAACTTTAATTGATGAACATGACATTTCATCCTTTCCTAACATGAAATATTTATTGTTGGGATCTTGCAATCTGAGAAAAATTCCAGGATTCTTGAGAAATCACCCTCAATTGCATGCTTTAGACCTATCCAACAACCAGATTCATGGAATAATACCTAACTGGATTTGGAGATTTGACTCTCTGGTTTATCTAAATCTTTCCAACAATTTTCTCACAACTATGGAAGGACCCTTCGATGATCTGCATTCCAAGCTATACATTCTTGATCTTCATTCCAATCAACTTCTTGGATCAATTCCTACTTTCACAGAATATGCTGTCCATTTGGACTACTCAAGCAATAATTTCAGCACTTCCCCACTTGACTTGGAAAACTACATCCCTTTTGTTCACTTTCTCTCCCTTTCAAACAACAACTTTCAAGGTAAAATCCATGAAGCCTTTTGTAATTTTTCATATCTCCGCTTGCTTGATCTTTCCTACAACAGCTTCAACGGCTTCATTCCCAAGTGTTTGATGACAAGGAACAGTACCCTCAGAGTACTAAATCTTGCACGAAACAAACTCCAGGGTTTTCTTTCTGATACCATTTCAAGTTCATGTAATCTAAGGTTCCTTAACCTCAATGAAAATCTCTTGGGTGGTGCTATCCCAAATTCTCTAGCCAACTGTCAGAGTTTACAAGTCTTAAATCTTGGAAACAATCTCTTCAGCGACAGATTTCCATGCTTCTTAAGGAACATTTCCACCCTACGAGTGCTAATCTTGAGGTCAAATAAACTCAATGGTTCCATTTCATGCCCACATAGCACTACCAATTGGGAGATGCTTCATATAGTGGATCTATCCTACAATAACTTCACAGGTACACTACCAGGAGCATTATTGAGAAGCTGGACAAAAATGATTGGTAATCAAACAGAATCCCAGGAAGAGCAGGGGACATTATATTTTGACATGTTTGATAATCATGACAACATGCGTTACAATAATTTGTTCTCTGTTATCAGCCAGTTTCTGGTAATAAAATTATACAAACTGTTGTCAACTGAACCTTACACTGTGGCTGACCACATATTTGCTTACTATGTTACTTCTAACCAATTTGGTGGTCGCTATTTGGATTCAGTTACAATTGTGTCAAGAGCACAACAAATGCAGTGGACCAAAATTCCTTCAGCCTTGACTTCCTTGGATCTCTCATGGAACCATTTTCAAGGTCCAATACCTCAAGAACTTTCTTGTTTGACAGCACTAGTGGGAGATCCACTTCCAACACCAGTATATGAAATGCATGGATCAATTGAGATAAATTTCTTGAGTGTGGAGTTGGGATTCATTTTTGGCTTTGGAATCTTCATCCTTCCCCTTATGTTGTTGAAGAGTTGGAGGCTTTTGTATTGGCAAACAGTGGATAATTTCCTTCAAAGGGTTGTGCCTCAACTTGATTTTGTCTATGATCACTACGAAGGAAAAAGGTACAAGTCTCTAAGATGGATGGGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13447::LG3:28647183-28649183(-)
GATTGAGTTGACATAGGGTGGGGGTGCAACTGTTGCACTCAGGGAATATGAATAAGGTAAAATTAGGGTTTGGAAAATAAATTAAAAATTTGTGGTAAAAGTAAAAAAAGTTTTAACCTTTGAGGAGGTATAGGAGCATGTCGTGGTGGTGGAGGGAGCAACGCTCATTCACTTATTAGCGAGCCCAAAAAATTCATCCAGCCTAGCCTACCATGGGTTGGTAGATTAAACGGATTGGTTCACTTCATTACAATTTTTTGGGTGTTGCTCCCTCCACCACCCCAAGTACTTCTGCACCTCCTCACTATTTTCTTTTATTCCAAAAATACTATACATCTCTCAACTATTTTCTTTTTCAAAAATACCCTACACCTCCCCACTATCCTCAACAATTTTTCTCTTTCTCTCTCTGCATTAATGGAGCATTATCTTTCTCTCTCTACATTAATGGAGCATTTATATGGCTTAGATTTAAACTTGTGATATATTGCAAAATATAAAATTGAGAGGAAACTTCAATATTAGTGTTTCTACCACTTCCATTTTATAAACTTAAAGGTTATATGCAAATACAAAATAATAAACATAATAATATTAATAGTAAATAATATATTATTATTATTATTATATACTAACTTTATAATGACGAAAGAACTAAATAAATACCAAATCTTTAACAAATAACTTTTCTTTTATATTTTAAGTATTTAATAATATTTTTATATTATTTATCTAATAAAGTAAATACTTAATTCAAGTTATTTGAGTCAAACATGTCGGTAAGTTAAAACATAATATAATGTTAAAAGTTATAGATATTAAATGTAAAAAAACACACACACATATATAAACATTTTTCTAAAAATTTAGACAAATTTTTACCATTTATTAAGTGATTTGAAGAAAAAAAAATATATTGAACAGTGAAAATAAGATTGAATCAAGCTTATCACAAGTTTAAATATGAACCTTGTGAATGCTCCATTAATGTAGAGAGAGAAAGAGAATGATTATTGAATATAGTGGAGAGATGTAGGGTAATTTTGGAATAAAAGAAAATAGTGTGGAGGTGTAGAGTATTTTTGAAATAAAAGAAAATAGTGGGGAGGTGCAGGAGCACTTTGGGGTGGTGGAGGGAGCAACACCCCAATTTTTTTTCTTCAATCCCCAAAAAATTTATCATTTTTTTCTAATTGAAATCTAAATAAAATTCATTAAACTCCAAATATAATAAAAAATAACAAAAATGCAATACAATCCAAATACATTTAGATATAAAAACATATTTAGAGTTTTCATTTTTTTAATATAATTTAATATTTAAAATTTATGGGTGTGTTAGTAAGTCAACCTGAGTTGACTAAGTTAAACCCTTGGTGAGTTAGATTTTTAGTTAACCTGATTCATTTTTATTATGAACCAAAATTAAAAAAAAAAAATTACCTCAATCTAACTCCATTTTGTGATAGACTGAATTAGATCGCGAATTTTAACCCGTAAAAAGTAGAGTAATATCAACCAAAGGATAACCCTTTATCATTATTGACTAAAAATATCCTTAGCGATAAAATTAGTCCTATTGGCAGAGAAAATTTTAATTAATGTTTGGAGAAATACTATTTCCGTTTTTCGATTTTATATTACATGCTTGTTAACTTGTATCACCCGCCAATAATAGCCAAAGCCACGCATTATTCTGTCCTTGTTTAAAACTTATTGAAATTCATTCATAATTGATACATCCTGTTAATAATCCTTATAATATACTTTTTCTTTGGACAAAAAATAGTCATTCTTTAATTTTATGAGTGTATCAATCACGTAAATCATAGAAATTAAAAGAATAATAATGGTAAGTTAAGAACTTTCACTCTGGTGCAATGCTTATGTAATACATAATATAGTCAACAATGAGTGAGTTTCAGTGTCTATAAATGGAGTATGTGTTTTCAAACTTCAAACACCAAATCTATACCATCTGGTTCTAATACTCATCTTCA


Gene Sequence:
>Vu_13447(-)
ATGAGAATCCATCAAATCTTCTTCAATATCTTCATACCCTTTTGCCTGATATGCTTGAATTTCAACACCCACATAGTAACATGCCACTGTCTACACCATGACCAATTCTTGTTACTCCAATTAAAGCAAAATCTTGTATTCAACCCAAACACTTCCAACAAATTGGTTCACTGGAACCAAAGTAGTGATTGCTGTCAATGGAATGGAGTAACATGCAGCATGGGCCATGTAACTGGTCTTGACTTGAGTGGGGAGTCTATTTCTGGAAAACTACATAATTCCACTCTATTTCACTTGCAATATTTGCTGCAATTGAATCTAGCTTACAATGATTTCAACTCTTCTATTCCTTTCAAGTTTGACAAGCTCAAGAATTTGAGGTCTTTGAATTTGTCAAATGCTGGATTTCATGGACAGATTCCTTCCCAGATTTCTCAACTGACAAATTTGACGACACTTGACTTGTCTACATCACTTGTCTCGCAACGTTTTTTCAAACTGCAGAAGCCAAATATCAGCATGTTCTTGCAGAATCTTACCAAACTCTCAGAACTATATCTTGATGGTGTAAGGGTATCTGCTGTGGGAAAGGAGTGGTGTCATGCTTTGTCTTCTCTTCAAATGCTTAAAGTGTTGAGCATGTCATCATGTGGTATCACAGGGCCAATTGATTCTTCATTGGCAACTCTTAAGGGACTCACTGTCATTAGACTGAATCAAAACAGTGTCTCAAGCTCTGTGCCAGAATTTTTTGCAAATTTCTCCAATTTGAATGTTTTGGAGCTTAGCAGTTGCAGGTTGAGTGGCCATTTTCCAAAGGGTATCTTACAAATACAAACTCTTAATGTTCTTGATATATCAAATAACAAGGATCTTCATGGAGCTTTGCCAAACTTCCAAGAAGATGCAGTTCTTCTTCACACCATGAATCTCAGTAATACAAATTTCTCAGGGAAATTACCAAGTTCTATTTCCAATCTAAAGCAGCTGTCTGTGTTAGATCTATCTAACTGCCAATTCATTGAAACACTGCCAATTTCAATGTCAGAACTCACTCAACTTGTTTACTTGGACTTGTCTTTTAACAAGTTTACCGGTTCACTCCCCTCTTTCACGATGGTGAAGAATCTCAGATATTTATCTCTCTCTCACAATAGATTGAATGGAACCATTTCAACTCATTTTGAGGGACTTGAAAATCTCCTCGTCATCAATTTAGGAGATAATTCTCTCAAGGGAAAAATTCCTGTGTCACTTTTTACACTTCCATCTTTACAAGAACTCACCCTTTCTCATAATGGATTTAACGGTCCATTGGATGAATTCTCAAATGTTTCTTCCTCTAAATTACAGTTGATTGACTTGAGCAGCAACAGCTTGCAGGGCCCTTTTCCTGTATCTCTGTTTCATCTTGAAGGACTTCGTTTCCTACAACTTTCTGCAAATGAATTCAGTGGCACCATAGCACTTGATAGGATCCAGAGACTACAAACTTTACATACTTTAGGTCTTTCACACAACAACTTGTCAGTTGATATAACTTTAATTGATGAACATGACATTTCATCCTTTCCTAACATGAAATATTTATTGTTGGGATCTTGCAATCTGAGAAAAATTCCAGGATTCTTGAGAAATCACCCTCAATTGCATGCTTTAGACCTATCCAACAACCAGATTCATGGAATAATACCTAACTGGATTTGGAGATTTGACTCTCTGGTTTATCTAAATCTTTCCAACAATTTTCTCACAACTATGGAAGGACCCTTCGATGATCTGCATTCCAAGCTATACATTCTTGATCTTCATTCCAATCAACTTCTTGGATCAATTCCTACTTTCACAGAATATGCTGTCCATTTGGACTACTCAAGCAATAATTTCAGCACTTCCCCACTTGACTTGGAAAACTACATCCCTTTTGTTCACTTTCTCTCCCTTTCAAACAACAACTTTCAAGGTAAAATCCATGAAGCCTTTTGTAATTTTTCATATCTCCGCTTGCTTGATCTTTCCTACAACAGCTTCAACGGCTTCATTCCCAAGTGTTTGATGACAAGGAACAGTACCCTCAGAGTACTAAATCTTGCACGAAACAAACTCCAGGGTTTTCTTTCTGATACCATTTCAAGTTCATGTAATCTAAGGTTCCTTAACCTCAATGAAAATCTCTTGGGTGGTGCTATCCCAAATTCTCTAGCCAACTGTCAGAGTTTACAAGTCTTAAATCTTGGAAACAATCTCTTCAGCGACAGATTTCCATGCTTCTTAAGGAACATTTCCACCCTACGAGTGCTAATCTTGAGGTCAAATAAACTCAATGGTTCCATTTCATGCCCACATAGCACTACCAATTGGGAGATGCTTCATATAGTGGATCTATCCTACAATAACTTCACAGGTACACTACCAGGAGCATTATTGAGAAGCTGGACAAAAATGATTGGTAATCAAACAGAATCCCAGGAAGAGCAGGGGACATTATATTTTGACATGTTTGATAATCATGACAACATGCGTTACAATAATTTGTTCTCTGTTATCAGCCAGTTTCTGGTAATAAAATTATACAAACTGTTGTCAACTGAACCTTACACTGTGGCTGACCACATATTTGCTTACTATGTTACTTCTAACCAATTTGGTGGTCGCTATTTGGATTCAGTTACAATTGTGTCAAGAGCACAACAAATGCAGTGGACCAAAATTCCTTCAGCCTTGACTTCCTTGGATCTCTCATGGAACCATTTTCAAGGTCCAATACCTCAAGAACTTTCTTGTTTGACAGCACTGTATGCTCTTAACTTGTCCCATAATGGTTTCTCAAGCAATATTCCCTCATCAATTGGAAATTTGAGGAATCTTGAATCCATGGACTTGTCAAATAACAGACTGGGTGGAGAAATCCCAGTTGAGCTTCTGAACTTGAATTTTCTAGCATGCTTGAATCTCTCGTTTAATCATTTGAGGGGTAGAATCCCAAGTGGTGGTCAAATGTACACATTTGAAGCGAGTTCTTTTAAGGGCAATGAAGGATTATGTGGGCCACCCCTGAAAGATTGCAGCAATGGTAGAGTGGGAGATCCACTTCCAACACCAGTATATGAAATGCATGGATCAATTGAGATAAATTTCTTGAGTGTGGAGTTGGGATTCATTTTTGGCTTTGGAATCTTCATCCTTCCCCTTATGTTGTTGAAGAGTTGGAGGCTTTTGTATTGGCAAACAGTGGATAATTTCCTTCAAAGGGTTGTGCCTCAACTTGATTTTGTCTATGATCACTACGAAGGAAAAAGGTACAAGTCTCTAAGATGGATGGGGTAG