Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13410 LG3 27968704 27971958 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   extracellular region
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 27968871 missense_variant p.Tyr744Cys
C/T 27968878 missense_variant p.Gly742Arg
G/T 27968880 missense_variant p.Thr741Asn
A/C 27968891 synonymous_variant p.Leu737Leu
A/T 27968895 missense_variant p.Phe736Tyr
A/G 27969562 downstream_gene_variant
G/A 27969631 downstream_gene_variant
G/T 27969975 missense_variant p.Leu662Met
G/A 27970174 synonymous_variant p.Ala595Ala
G/T 27970193 missense_variant p.Pro589His
C/T 27970835 missense_variant p.Gly375Glu
T/G 27971129 missense_variant p.Gln277Pro
A/T 27971464 synonymous_variant p.Leu165Leu
A/G 27971767 synonymous_variant p.Cys64Cys
T/G 27971900 missense_variant p.Asn20Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13410.1
MRIHQIFFHIFIPLCMIYLNININVATCHSLDHQQFLLLHLKDSLLFNPATSKKLVYWNQSSDCCQWNGVTCSKGGVIGLDLSEEFIFGGLDNSSLFELEYLQRLNLAYNDFNSSIPVNFGKLKSLRYLNLSNAGFHGQIPKEISHLTDLTTLDLSTPLTSQPILKLQNPNIAMFLQNLAKITELYLDGVMVSAEGKEWCHALSSLQNLEVLSMSSCNISGPIDSSLATLEKLSIVRLSLNDISSSVPEFFANFSNLNVFEISSCSLNGLFPKGIFQLQTLKVLDISNNRDLHGVLPNFLPHAALHTMNLSNTDFSGKLPGSISNLTQLVQLDLSFNRFTGPLPSFKMVKNLRYLSISNNNLTGVITTTHFEGLGNLLYINLGDNYLSGNIPMSLFTLLSLQELTLSHNGLNGLLYELTNASSSKLELIDLSSNRLNGPIPVSLFHIKGLRFLQLSDNEFNGTMRLDMVEGLQNLHTLGLSHNKLSVDATLNDDHAISSLPSMKYLFLGACNLGEFPGFLRNQNQINALDLSNNQIEGEIPNWIWRFQSLVYLNLSNNFLTNMEGPFDDLNSNLFILDLHSNKLTGLVPTFTKFAVHLDYSNNSFIGAPLDLDKHVPFVYFFSLSNNNFQGKIPKSFCNLSSLRLLDLSYNRFNGLIPKCLLRRNSTLRVLNLAQNKLQDYVSDTISSAQMQTFDPSSFEGNEGLCGPPLRDCSSDSGGHSSPTPVYEMHGSIDWSFLSLELGFIFGFGIVILPLFLFNCWRILYWKHVDDLLYMLVPQLGFLYEYHKGQRYRSLRWIG*


CDS Sequence:
>Vu_13410.1
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Promoter Sequence:
>Vu_13410::LG3:27971958-27973958(-)
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Gene Sequence:
>Vu_13410(-)
ATGAGAATCCATCAAATCTTCTTCCATATCTTCATACCCTTGTGCATGATATACTTGAATATCAACATCAACGTAGCAACATGCCACAGTCTTGACCATCAACAATTCTTATTACTTCACTTGAAAGACAGCCTTCTATTCAACCCAGCCACATCCAAAAAATTGGTTTACTGGAACCAAAGTAGCGATTGTTGTCAATGGAATGGAGTAACATGCAGCAAGGGCGGTGTCATTGGTCTTGACTTGAGTGAGGAGTTTATTTTTGGAGGACTAGATAATTCCAGTCTCTTTGAACTGGAATATTTGCAGAGGTTGAATCTGGCTTACAATGATTTCAATTCTTCCATTCCTGTGAACTTTGGCAAGCTAAAGAGTTTGAGGTATTTGAATTTATCAAATGCTGGATTTCATGGCCAGATTCCAAAGGAGATTTCTCATCTGACAGATTTGACAACACTTGACTTGTCAACACCACTTACCTCACAACCTATTCTTAAACTCCAGAATCCAAATATTGCAATGTTTTTGCAGAATCTTGCAAAAATCACAGAACTATACCTTGATGGTGTAATGGTATCTGCTGAGGGAAAGGAGTGGTGTCATGCTCTATCTTCTCTTCAAAATCTTGAAGTGTTGAGTATGTCATCATGCAATATCTCTGGACCAATTGATTCTTCGCTAGCAACACTTGAGAAACTCTCAATAGTTAGATTGAGTCTGAATGACATCTCAAGTTCGGTGCCAGAATTCTTTGCAAATTTCTCCAATTTGAATGTCTTCGAGATCAGCAGTTGCTCGCTGAATGGTCTCTTTCCAAAGGGCATCTTTCAACTTCAAACCCTAAAGGTTCTTGATATATCAAACAACAGGGATCTTCATGGAGTTTTGCCAAACTTCTTACCACATGCTGCTCTTCACACCATGAATCTTAGTAATACAGATTTCTCTGGTAAGTTACCAGGTTCTATTTCAAATCTTACTCAGCTTGTTCAATTGGACTTGTCTTTTAATAGGTTTACTGGTCCGCTTCCCTCTTTCAAGATGGTAAAAAATCTCAGATATTTATCAATCTCGAACAATAATCTGACAGGAGTTATTACTACAACTCATTTTGAGGGACTTGGAAATCTCCTCTATATCAATTTAGGAGATAATTACCTTAGTGGAAACATTCCAATGTCTCTTTTTACACTTCTATCTTTGCAAGAGCTTACACTTTCTCATAATGGACTTAATGGTTTATTATATGAACTTACCAATGCTTCTTCCTCAAAATTAGAGTTGATTGACTTGAGCAGCAATAGATTGAATGGCCCTATTCCCGTATCTCTCTTTCATATTAAAGGACTTCGTTTCCTACAACTTTCTGACAATGAATTCAATGGCACCATGCGGCTTGATATGGTTGAAGGGCTTCAAAATTTGCATACATTAGGTCTTTCTCACAATAAATTATCAGTTGATGCAACTCTTAATGATGATCATGCCATTTCATCCCTTCCGAGCATGAAATATTTATTTTTGGGTGCTTGCAATTTAGGAGAATTTCCGGGGTTCTTGAGAAACCAAAACCAAATAAATGCTTTAGACCTATCCAACAACCAGATTGAAGGAGAAATACCAAACTGGATCTGGAGATTTCAATCTCTGGTTTATTTAAACCTTTCCAACAATTTTCTCACAAATATGGAAGGACCCTTTGATGATCTGAATTCCAACCTATTCATTCTTGATCTTCATTCCAATAAACTTACTGGATTAGTTCCCACTTTCACAAAATTTGCCGTCCATTTGGACTACTCAAACAATAGTTTCATTGGTGCCCCACTCGACCTGGATAAGCATGTTCCTTTTGTATACTTTTTCTCCCTTTCAAATAACAACTTTCAAGGAAAAATCCCTAAGTCCTTTTGTAATCTGTCTTCTCTCCGGTTACTTGATCTTTCTTATAATCGCTTCAATGGCCTCATCCCCAAGTGCTTGCTGAGAAGGAACAGTACCCTCCGAGTACTAAATCTTGCTCAAAACAAACTCCAGGATTATGTTTCTGACACCATTTCAAGTTCATGCAGTTTAAGATTCCTCAATCTCAATGGAAATCTCTTGGAAGGTGTTATCCCAAGCACACTTGCAAATTGCAAGAGTCTACAAGTCTTAAATCTTGGAAACAATATGTTTGACGATAGATTTCCTTGCTTCTTGATGAAAATTTCCACCCTGCGAGTGCTGATTTTGAGGTCAAACAAACTCAATGGTCCTATTGCATGCCCACGTAGCACTAGCAATTGGGAGGTGCTCCACATTGTTGATCTAGCCTTCAATAACTTCACTGGTATTCTCCCTGGACCAGTTTTGAGAAGCTTGAAACAAATGATGCGACGTGATACCAAATCCCATGAGAAGTACGGGAATCTATTTTTTGATATGTTTGATAATGGTGACATCATGGTTTACAATAATTTGTCGTCGTGTGTCAACAAATTTCTAGTAATAAAATTGTACGGATTGTTGGAAACTGAACCTTATGATGTGCTTGTCCACATATTTAATTATTATAGCGTTACAAACGAATATGGAGGTCGCTACTTGGATTCAGTTACAGTTGTGGACAAAGCTTTGCAAATGAAGTTGATCAAAATTCCCACTATCTTTGCTTCCTTGGATCTCTCCTCCAACCATTTTGAAGGTCCAATACCTCAAGAACTTGTGAATTTGAGTGCACTGAATGTTCTTAACTTGTCACATAATACTTTCTCAAGCCACATCCCCTCATCAATTGGAAATTTGATGAATATAGAATCCTTGGACTTGTCAAACAATAGGTTGAGCGGAAAAATCCCTTCTGAGTTTGCTGGTTTAAACTTTCTAGCATACTTGAATCTCTCATTTAATCGTTTGTGGGGGGGAATTCCCACAGGTGCTCAAATGCAAACATTTGATCCAAGTTCTTTTGAAGGCAATGAAGGATTATGTGGGCCACCACTAAGAGATTGCAGCAGTGATAGTGGGGGACATTCATCTCCTACACCAGTATATGAAATGCATGGATCAATTGACTGGAGTTTCTTAAGTCTGGAACTGGGATTTATCTTTGGCTTTGGAATTGTTATCCTCCCCCTTTTTTTGTTTAACTGTTGGAGGATTTTGTATTGGAAGCATGTCGATGACCTACTTTACATGCTTGTTCCTCAACTTGGTTTCCTTTATGAATACCATAAAGGACAAAGGTACAGGTCTTTAAGGTGGATCGGATAG