Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13351 LG3 26728278 26733786 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 26728683 intron_variant
G/A 26729565 upstream_gene_variant
A/T 26729633 upstream_gene_variant
C/A 26729778 upstream_gene_variant
C/A 26729785 upstream_gene_variant
G/C 26729791 upstream_gene_variant
T/G 26729797 upstream_gene_variant
G/A 26729856 upstream_gene_variant
T/A 26729928 upstream_gene_variant
G/T 26729955 upstream_gene_variant
A/G 26730039 missense_variant p.Phe269Leu
C/T 26730049 synonymous_variant p.Arg265Arg
C/A 26730175 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/A 26730232 upstream_gene_variant
A/G 26730258 upstream_gene_variant
T/C 26730619 upstream_gene_variant
C/G 26730656 upstream_gene_variant
G/T 26731026 upstream_gene_variant
T/C 26731044 upstream_gene_variant
C/A 26731190 upstream_gene_variant
A/G 26731224 upstream_gene_variant
A/C 26731242 upstream_gene_variant
A/G 26731354 upstream_gene_variant
T/A 26731428 upstream_gene_variant
G/A 26731770 missense_variant p.Ser162Leu
A/T 26731913 upstream_gene_variant
T/C 26732017 upstream_gene_variant
C/A 26732161 stop_gained p.Glu102*
T/A 26732164 missense_variant p.Thr101Ser
T/G 26732167 missense_variant p.Met100Leu
T/A 26732351 missense_variant p.Arg67Trp
C/T 26732356 stop_gained p.Trp65*
C/T 26732364 synonymous_variant p.Ala62Ala
G/A 26732367 synonymous_variant p.Ile61Ile
A/G 26732698 upstream_gene_variant
A/T 26732700 upstream_gene_variant
T/A 26732726 upstream_gene_variant
A/C 26732769 upstream_gene_variant
T/A 26732878 upstream_gene_variant
G/A 26732885 upstream_gene_variant
T/A 26732989 upstream_gene_variant
C/T 26733132 upstream_gene_variant
G/A 26733209 upstream_gene_variant
T/C 26733604 stop_lost p.Ter14Trpext*?
A/C 26733645 splice_region_variant&intron_variant
G/A 26733652 upstream_gene_variant
A/T 26733691 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13351.1
MLFNGSLGDWSWGIAMFCNCFGALNCFGRRDDPADQPHEQAVATKKFSYNSLRSATNDFHPSRKIGGGGYGVVHKGVLRDGTRVAIKSLSVESKQGAHEFMTEIDLISNIRHPNLVELIGCCIEGSNRILVYEFMENNSLASSLLGSKSKYVALDWPKRAAICRGTASGLRFLHEEAQPNIVHRDIKASNILLDGNFNPKIGDFGLAKLFPDNVTHVSTRVAGTVGYLAPEYALLGQLTKKADVYSFGILMLEVISGKSSSIAAFDEDYLVLVEWAWKLKEENRLLDLVDSELSEYDESEVYRFLVVALFCTQSAAQHRPSMKQVLEMLSKEVHLNEKALTEPGIYRWHSTGKRGGSLNETSSQAIKPRKTGNPHEAASAHFSGTDIVTEMLPR*


CDS Sequence:
>Vu_13351.1
ATGCTGTTTAATGGGAGCCTAGGAGACTGGAGCTGGGGCATAGCCATGTTTTGTAATTGTTTTGGTGCTTTGAATTGTTTTGGAAGGAGGGATGATCCTGCGGACCAGCCACATGAACAAGCTGTTGCAACTAAAAAGTTTAGCTATAACTCATTGAGATCAGCAACAAACGATTTTCACCCATCGCGCAAAATTGGTGGAGGAGGTTATGGAGTTGTCCACAAGGGAGTTTTAAGGGATGGTACTCGGGTTGCTATCAAGTCTCTTTCTGTTGAGTCTAAACAAGGGGCTCATGAATTTATGACAGAAATTGATTTGATATCAAATATACGACATCCAAATCTTGTGGAACTGATTGGCTGCTGTATTGAGGGTAGTAATCGAATACTGGTTTATGAGTTTATGGAGAACAATAGCCTTGCAAGCTCTTTGCTTGGTTCAAAAAGTAAATATGTTGCTCTGGATTGGCCAAAGAGGGCTGCTATTTGTCGTGGCACAGCTTCTGGTCTACGTTTTCTTCATGAAGAGGCTCAACCAAACATTGTTCATAGGGATATCAAGGCCAGTAACATATTGTTGGATGGGAATTTTAATCCGAAAATTGGGGACTTTGGTCTTGCAAAACTTTTTCCTGACAATGTCACCCATGTTAGTACTCGAGTTGCAGGAACTGTGGGATATCTTGCACCAGAATATGCACTTCTGGGACAACTTACAAAGAAGGCAGACGTTTACAGTTTTGGGATTCTCATGCTTGAAGTAATCAGTGGGAAAAGTAGTAGCATAGCTGCATTTGATGAGGACTATTTGGTTTTGGTGGAATGGGCTTGGAAGCTGAAAGAAGAAAATAGGCTTCTAGACCTTGTTGATTCAGAACTAAGTGAGTATGATGAGAGTGAGGTGTATCGGTTCCTTGTGGTGGCTCTATTTTGCACCCAATCAGCTGCTCAGCATAGACCAAGCATGAAACAAGTATTGGAAATGCTTTCCAAAGAAGTTCATCTTAATGAGAAGGCTTTGACTGAGCCTGGAATATACAGATGGCACAGCACTGGAAAAAGGGGTGGTTCTTTGAATGAGACATCATCTCAGGCAATCAAGCCCAGAAAAACTGGAAATCCACATGAAGCAGCTTCAGCTCACTTCAGTGGTACAGATATTGTGACAGAGATGCTTCCAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_13351::LG3:26733786-26735786(-)
TAACAAACAGTTCACAAGCCCCATCCTCCATGTTCTCTCGCAAAACAGCAACCACAGAATCTTCATCGAACCACTAAGAAGCTTACCCCAAAACGCAAAAGCCAAATCGCATAAGTCACAACGAGTTTCCAAATCGTGTTGCCATGGGAACCACTTGTAGAAAACCAGAAACCAACAAATTTTCTTAATCAATCCTCAATTTCATTCAATCAATCCCCAATTTAGAGGATAGAACCTGAAAGGGTATAAGTGAACCCTAATTTCACAAAATGCAAATTCCTTCCAAATTCCCAATTTGATTTTAATTATATTTTACTAATTTTTTAATGTTTAAAATATCAAAATTCACATCACTGCCCCATGTAAAATGCTCTAAGTTTGCGACGTATTTTAATTAAATCATGTCATTGTGCAACGTCAGCTGATATTTAATGTCGTTCAGCCAATTTAATGTCAGAGGTCCAATTGCATGAAATTTTCATAATTAGGGACCTAATTGAGACAAAAAATAACTGCGACCTATTTGAGAAAAATTGTCAGGGACCAATTGTTTATGATTAAACCTTACTGAAACTCTTTAAAAATTATTAAAGAAGAACTAGACGTAACTCAATTAGAGTGAACCAATATAAAAACGAGTTTTCATCTCAGCTATCCCTTTACTTCATTTCTAAAAGCTTTAAAAAATCTATAAGTGATAAACTATAACCCCTAAACGTTTAACATAAATTGCAAAAAGTTTTCCAAACTCTTTTAATCATTTCAATAGTTAAACAATTTTAGACTCTACGTGCGTCTTGTACCAAACTTAGCGCCGCTTAGTATAAAAGTTTAATTTCTTGTTTTGCTTACTTTGATTTTACCTAATACCTTAGTGTGTCATCTTAGTCTTTAACTTAAGAAGTCTATATACCACATTTCCTACTTCACAACCTTCTTGTCCTATTAACATGGAAGCCTTCCTTACTCCATGGACTTACCGTCCTTCATACCAATTCACACCATTCATAGAATACCTTAATCTTCCATCCAACACTATTATCTGTGATCCCCTTCTCACTTAGACTAGACTCGTTTACCTTCACACCCTTGCCACATGAGTTCCAGTAGCCACAGAACTTGTTAACGTGAGGAAGAACAAGAAGGCTCGTTGCAGCTGCAGTGTGATAAGGGAGAACAAAGACTCAGATAGCTAGAAGCAAGAATTGTAAGGTATTCATCACGGGTTAGAACTATGTTGTAAATGGTTGTGTGCTTTGATCAATGAGGATAGCTAGAAGGAACGTATGTACATGATAAAAGTAGTGTTTGTGAATAAATCCAAAATTAATAAATACATCAACCCAAATACTTTTACAATTGAAGGAAGGGAAATTTTGAAACACGAGTCATCTGTGCTTTCATGCAAAACGCATAGTTTCATATGGTGGATGTTAGCCATATGGTCCCACCAACTATTTTTACATTTATTACCAAATCACATAAGTTTTCAACCATCACCGTCTCTCTTTATGAAAGAAAGTAAGAAACGCAGTCTTTATGTTTTCTCTCTGATTTTTTTTTTGTCTTTCTCTCATTTTCTTCTTTTCTCTGAATTCTGACTTAGTCATTTCTTGTCTTCGTAATCTTAGTCATTTTATAATCCATTATGGTTCATTTTGTCAAGGAAATATATCAATAGGAAAAAAAAAAATAAGAAAGCAAGGAAAAAAAATTGGACAGTTACATGTCTCTTTCATAGTTTAACCCCTACTTCTTTAGATCTTTGTTGTCGCTCCTTGCCGTTGATAGCTTCCTTGACCCTTCATTCATTTTCCATTTCCTAAGCATTTATGGATTCACACGTTCCTTCCAACCCGGTAATACTACTGCCTCTAATAAACTATAAACGCTTTACCTTTCTCTTTGTGAGACTAAAAACCTTAGCTTTTCAACCCTTTTAAGCCCCCATCAGTTGGAAAATTCAGGGTAGGATTTTGGGTCTAAGAGTGATTCAAATC


Gene Sequence:
>Vu_13351(-)
ATGCTGTGAAGTCTTTTGCCCCTGCTTTGTATTCAAGTTTGCAACTTGTTTCAATGTTTTCCAAGGTAGTTGGCTTGAGTGTTTTGTTTTCATACTTGGTGGCGTTGGTGTGTGAGATAAATTTGAAGGATAAACGGTGTTTGAAGGTTTAATGGGAGCCTAGGAGACTGGAGCTGGGGCATAGCCATGTTTTGTAATTGTTTTGGTGCTTTGAATTGTTTTGGAAGGAGGGATGATCCTGCGGACCAGCCACATGAACAAGGTACTAAAAAGGATTATAGCTGTGAATTGTGATAATAATTGCCTATAACAAATTGCAGCATGGGTCAATTGTTTGTGTCAAATTGAATAGGTTGCTGAATTTGTACTTGTCATTATTCATGCCTGCTGGTCATCCTTCTCTCGCTTTCACCTTTCTATATATTTCCTGCTGAAAGGGCAACATATGTGTTCTTACGAAGGTTTCAATTGCCTATTTATTGGTGGGAATGAAGGGATGATTTCTTAATGCAGAGTCTGCATTTTTGTGGAAAGATTTTTCTTTTTTTCTGTCTGTCAATTTCCACAATCGAGAACCCGAAGACAACATTATATAAAATTGTAACAGGTTCTTGTGTGAACTGTGTGGCTAGGTGGAGGATTGGAGGGATGTTGGTAGTAATTACCTTATGCTTTCAAAATTGATTTTGATGTACTGACCGGATAGTTTTATTTAATTCCTCAAGAAAGAAAAGGCGTAAGTCCTGGTTAATGATGTTTTGAATTATTATTATTGCGCATGCAAATAGTGTTAAATTAAAAAAAAAAAACTAAGTGTTAGGATGTCATTTGGTGGCATAATTATTGATACAGTTAGTTTCTTTAGTTCTCACTCCCCTGCAGTCAAAATGGCAAACATGGTCACTTGCAGATTCTATGTTTATAACACGCCAGGATCTATCTATTGCTGAAAATTATTAATTGCAGGTCAAACAAGAGATCTACCAGAAGAATTATCATTGATCTCTCTTAAACCACTTTAGTATCCCCGAGTCATAACTTTATGGGAAGTATTTTACTTAAAATGGTTAGAAGTAATATTGAAATTCTACTACTGAAGATGCTAACATAAGCTCCTGGCAATCGTGTGGTTACATTATTTTTTGTTTATGTAATGTACCTGTATTCTTTTAATACCCTCAAAGAGTATAAATTTTTGCAAATCATATAAGCAAAATATGCATATATATCTGTTTCACGTGAGACACCTTGACTTGGACATACTTTCCCAAATTTGCATTCGTGATTTCTTTGTACTGTCTTTTTGAAAATTTTAAATCCTGTGATTTATCTAAGTTTATGTTTGTGATCCAACAGCTGTTGCAACTAAAAAGTTTAGCTATAACTCATTGAGATCAGCAACAAACGATTTTCACCCATCGCGCAAAATTGGTGGAGGAGGTTATGGAGTTGTCCACAAGGTGAGAGTCATGACTATCAGTTTTGATTTTCGTTCTTTTTGTTTGTTCTAATGCTTACCTGCTGGTTGTCATTAATATTTGCAGGGAGTTTTAAGGGATGGTACTCGGGTTGCTATCAAGTCTCTTTCTGTTGAGTCTAAACAAGGGGCTCATGAATTTATGACAGAAATTGATTTGATATCAAATATACGACATCCAAATCTTGTGGAACTGATTGGCTGCTGTATTGAGGGTAGTAATCGAATACTGGTTTATGAGTTTATGGAGAACAATAGCCTTGCAAGCTCTTTGCTTGGTAAATACTAGTACAATTTAAATATAATGGATATGATTCTTTTATAAGTTTGATTAGTTTGAAAGTTTTTAGTGACTTCCCTGTTTGGTTTGGTTATGAGGAATTAAGGGTTTGATAGTTTCCATGATGTATGATACTGCTTAAATAAACTAATCGAGGGTTTATATATGAATTGGTTTATGCTAATGCAAGGAGAACATTTTTACAGGTTCAAAAAGTAAATATGTTGCTCTGGATTGGCCAAAGAGGGCTGCTATTTGTCGTGGCACAGCTTCTGGTCTACGTTTTCTTCATGAAGAGGCTCAACCAAACATTGTTCATAGGGATATCAAGGCCAGTAACATATTGTTGGATGGGAATTTTAATCCGAAAATTGGGGACTTTGGTCTTGCAAAACTTTTTCCTGACAATGTCACCCATGTTAGTACTCGAGTTGCAGGAACTGTGTAAGCACATATATATCTGTTAATGTTTCCATTTATCTAACTGGTGCCAGATTTTCCCTATATTAGTAATTGCTTGTACGTAAGTTGTTAGGATATAGAGTAAGAGGATATAATGGGTAATGGGTTTAGGATAGAAGGTGGAGAAATTGTATAAATAAGACCTTGTTATGTTGTCAGGGGCATCATTGAGTATTATTTTCTAAATCTGGACTTTGGCCAGAAGAGGGGGATTAGGGCTCTGTTAGGGCTAAGAGGGGGATTAGGCCTCCATTAGCGCTATCAGTGTACATCATTCTCAATTTCAATATAGAAACTCATTCTTTCATTGTTCTTTCTATCTTCTTAGTGTGTTCTTGTTAGGTTCCAAACCCAGGTACCTAACATAAGTTCAGCCTGTCTGCAGTCATTTGAACTCCAATGTTAATCTCCAGACACAGATTTTTGAAGGAAAAAGTTATCAGCATTCTTAACTTATATAATTTCTTATGAATCTTTGTAGACAATATGAATACTATTGAACCGAGATTAACAATGGGAACTGAGTTTGGAGCACCATTGGCTTTGACTGTTATTGTCTGAAAGTGGAGTTCAATGAAGATAAATAACTGTCATGGTTGCAGTTATGAGTAGAAGAGTTATTAGGGATTGTGTATTATCATAACATGCTTAATAATAACTGTCTTGTTGGCAGTTTTGGGTAGAAAGTTAGGAGCAGTTTTACCATTGAAAATGTGGGTGGTAGGGTGTAGTGTGAAATAGGTGTATTATTATTATTTTCAATTTGTGAACATAGAATATTCTCTGTAATAGAGTTTGTCTGGGACAGCAATTGTATTTCTACTGAGTGTGATTTTTATGCTTAGAATAATGTTCGTCTAGTTTATCAATCTGTCAGTATTCTATTAAGTATTAACCAAGCAATTCTGTTTGTCATCCTTGTCACATCATGAAATCACTCTAGACTTCAGTCTTGCTAAAATAGTAATATGCTTCAAATTACTTGAGCATTCGGTTGTTTCATAATCTTTACATACACTGATGATTTCTCTATTATTGTAACATTAATTAAGATAAATTTTAGAAACATTACAGAAAAACTCATGTGATTCTATAATTTATTTAGCAATAAGAATCTGTGCTTGAGATGTTATGTTTGACACAGTAGGATAGCAAAAAGAATGGACAGGGAAAGGAGGTTTAAACCAAAAACTAAGCTGTTCTGTGCAAAACTAGAAGTAACTGTCTGTAATTTCTCATGTTTATTGGGCTAAAGTAGCATCTTTGCAACATGGAAACTTAAGATATTGTATCTTTATCTCCCTCGTTTTATCAGTTTAGTCACATTTTTTATAACTCTTTATAAGAGACTTGGCCATAATATTAAACCAAATTTACCTTTTCTGTTGCAGGGGATATCTTGCACCAGAATATGCACTTCTGGGACAACTTACAAAGAAGGCAGACGTTTACAGTTTTGGGATTCTCATGCTTGAAGTAATCAGTGGGAAAAGTAGTAGCATAGCTGCATTTGATGAGGACTATTTGGTTTTGGTGGAATGGGTATATATATCTTTTTTAATTCTCGAGTATGATTAATATTGATTTGATACAATGCATGCTAGGATCTTCTCTTGGCTTCTTTAATTTCAAGATATATAGGAGCACATAAAGATAAATAAAGTCATAAATACTAGTAGAATGCTTGAAAAGGTGGTTTAATCAAGCCCTTCAAAACGTTATCTTGTATAACAGACTTAAAACTGAAACTTGATTAAGAATTTAGTGCTGATAAAACTTTTAGCAGACAGGTAATTGATAAACCCAGAAAATCAGACGCTTAGCAATATCAATTAAAATAAAGAAGATAGAGAGAAGGATTGTGCAGCTGGTTTTATACTGGTTTGGCCAGGTTGGAACTTGCGTCCAGTCCCCCAACAAGAGGTGAGATTCTCTCTACTCACTACTCAGAAGCAAGTATTCTTTGAGTTTTGGCCTCTTCTGCCTAATTAAAGTATACCAGCTCACACACTCAACACATTGGTTACTTACTAACCTACAATTTAGAACACAAGATAGAAATTTCAGCCTAACAGCATAGTTATCAATAGCAAAATATAGCAATTTAGAGCAGCCATGAGATGCTACACAGTTTGTGAACTGGACCTAGAGAGAGGCTTTATGGAAAACCTAATTTTTCCCTCAAGGTTGAGATTTTCCTACCCTTTAATTTATAAAATTCTTAGTTGTATGTAGCTTTCCTTGTTTCATATCCATACTGTTCGACTAACACCTAGCCGTCTCCTACATTTTGTTTTATCATTGCTTAGAATGGATAAGTAAAGTGGGGATTCTTGAACTAACACTAAATCATCAGAAGTTGAATGTAGTAGCTTTACTATCACATCTTGTTTTCCTAGCCTATTGTGAAGTTGAAATGATGTTGGGTCTTACGTCACCTCCAACCCAAAATTTCAAGGCAATGGATTTGAGAAACTTTCTCTTTATATGTTGTTTATCTCAGTCATGTCTACCCAATGCGAGATTTTCAACTGTATACTTGAATTCCTCGCAGTGTGTGATATTAAACATGGAAAAACATTGCCAGTATCTTGAGTAGCCAAAAAAGCAAAATGCACAACAATGAAAACAACAAAAGTCTTTTCCCACTTAATGAGGTTGGTTACATGGATTGTGAAACACCATTCAGCTCACTTAAAGATCAGATTTTCAGATAAATTATTTATCATGAGATCTCTCTTAATAACTTCCTCCAGAATCTTTCTCAGTCAACCTCCCTTTTCATAGGACTAAATTTCATTCAGTAAATTCCCCTGACGAACATAACTCAAAAAATAAAATAAAACTGATGCATCCCTTTATATTATTATTGATCATAAAAAAGAGCAGAAATATGTTGATTTCTCCTGACTCATCATTCATGAATGCAGGCTTGGAAGCTGAAAGAAGAAAATAGGCTTCTAGACCTTGTTGATTCAGAACTAAGTGAGTATGATGAGAGTGAGGTGTATCGGTTCCTTGTGGTGGCTCTATTTTGCACCCAATCAGCTGCTCAGCATAGACCAAGCATGAAACAAGTATTGGAAATGCTTTCCAAAGAAGTTCATCTTAATGAGAAGGCTTTGACTGAGCCTGGAATATACAGATGGCACAGCACTGGAAAAAGGGGTGGTTCTTTGAATGAGACATCATCTCAGGCAATCAAGCCCAGAAAAACTGGAAATCCACATGAAGCAGCTTCAGCTCACTTCAGTGGTACAGATATTGTGACAGAGATGCTTCCAAGATGA