Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13326 LG3 26281812 26285163 PREDICTED: MDIS1-interacting receptor like kinase 2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 26281938 missense_variant p.Gly852Cys
C/G 26282151 splice_region_variant&intron_variant
G/A 26282542 stop_gained p.Arg701*
T/C 26282547 missense_variant p.Lys699Arg
T/G 26282630 missense_variant p.Glu671Asp
T/C 26282968 missense_variant p.Ser559Gly
T/A 26283486 missense_variant p.Asn451Ile
A/G 26283552 missense_variant p.Leu429Pro
C/A 26283706 stop_gained p.Glu378*
C/T 26283790 missense_variant p.Gly350Arg
T/A 26284174 splice_acceptor_variant&intron_variant
A/G 26284203 intron_variant
G/C 26284247 intron_variant
T/C 26284248 intron_variant
T/C 26284266 intron_variant
T/A 26284271 intron_variant
C/T 26284276 intron_variant
C/T 26284378 intron_variant
G/C 26284398 intron_variant
G/T 26284417 intron_variant
A/G 26284418 intron_variant
C/A 26284429 intron_variant
T/C 26284464 intron_variant
T/C 26284611 missense_variant p.Thr185Ala
C/T 26284617 missense_variant p.Asp183Asn
C/T 26284635 missense_variant p.Ala177Thr
G/A 26284752 missense_variant p.His138Tyr
C/A 26284822 missense_variant p.Leu114Phe
A/T 26285086 synonymous_variant p.Ser26Ser
A/G 26285088 missense_variant p.Ser26Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13326.1
MVFLFPKLQPIKLISLWFLLLVMATSLHATLSSSLSLQYTEANALLKWKASFHNSTHTLLSSWHGNTSCNWLGLACDHSGSVSNINLTNIGLSGTLQTLNFSSLPNILTLDISLNSFTGSIPPQIGVLSKLTHLDLSHNHLTGTIPNSLGKLSVLSHISLWNCSLTGSIPKSIGNMASLVYLDFTQNNLYGHIPHEIGNLSNLENLWLAINNLDGSIPQEIENNLSGPIPSSIGNLVNLDSIRLNGNKLSGTIPSTIGNLTKLTTLALFSNKLSGHIPIEMNMLNNLEKLHLYDNNFIGQLPHNVCTSGKLINFTAGRNYFTGPVSKSLKNCTSLIRVRLEQNQLTGNVTEDFGVYPNLDYIDLSDNNFYGHLSPKWGKCHNLTSLKISNNNLSGSIPPELIQATNLHVLELSSNHLVGDIPEDLGNLTYLFKLSLNNNNLSGNVPIQIASMLDLDTLELGANGFSGIIPTQLGDLSGLDEMRSLISIDISYNQLQGPLPNIPAFKMATIEALRNNKGLCGNVSGLEPCPTSPDNYENHHKASRFILVFLPIGLGTSMLALFVFGVSYHYYRSSKKKAHEDEESPGQNLFSIWSFDGKMVYDNIIEATEDFDNKHLIGVGGQASVYKAELQTGQVVAVKKFHSVENGEMSNVKAFASEIQALTEIRHRNIVKLYGYCSHSRFSFLVYELMEKGSIDKILKDDEEAIAFNWKRRVDAIKGVANALCYMHNDCSPPIVHRDISSKNVLLNLEYVAHVSDFGTAKLLNTNSTNWSSFVGTFGYAAPELAYTMEINEKCDVYSFGVLALEIVLGEHPGDRISSLLTSSSNVMESTLDITSLMDKLDERLQHPAKPMAKEIESILRMANACLTENPRSRPTMDQVASYFSKYKSCSFN*


CDS Sequence:
>Vu_13326.1
ATGGTGTTCTTATTTCCAAAGCTTCAGCCCATTAAGCTCATATCATTATGGTTCCTTCTACTTGTAATGGCAACTTCTCTCCATGCAACACTGTCTTCCTCACTCTCACTTCAATACACAGAAGCCAACGCTTTGTTGAAGTGGAAAGCAAGCTTTCACAACTCAACTCATACATTGCTATCTTCATGGCATGGCAATACTTCTTGCAATTGGCTTGGACTTGCTTGTGACCACTCAGGATCAGTCTCCAACATAAATCTCACAAACATTGGATTAAGTGGTACGCTTCAAACTCTAAACTTTTCATCACTTCCAAACATTCTCACTCTTGATATCAGTTTGAACTCCTTCACTGGAAGCATTCCTCCTCAAATTGGAGTGTTGTCCAAACTCACTCATCTTGATTTAAGTCACAATCATCTCACCGGTACTATCCCAAATTCTCTCGGAAAGCTATCAGTCTTGTCACATATTAGCTTGTGGAATTGCAGTCTTACAGGGTCTATTCCAAAATCTATAGGAAATATGGCAAGTCTTGTATATCTAGATTTTACGCAGAACAACCTTTATGGACATATTCCTCACGAAATTGGAAATTTGTCAAACTTAGAGAATTTGTGGTTAGCAATTAATAACTTAGACGGTTCCATTCCTCAAGAAATAGAAAATAATCTCTCTGGACCAATCCCATCTTCCATCGGTAACTTGGTGAACTTGGATTCTATTCGTCTTAATGGAAACAAACTCTCCGGAACAATTCCTTCCACTATTGGTAACTTGACAAAACTTACCACACTTGCTTTATTCTCAAATAAGCTTAGTGGACACATCCCAATAGAAATGAATATGCTTAACAACCTGGAAAAATTGCATTTATATGACAATAATTTCATTGGTCAATTGCCTCACAATGTTTGCACTAGCGGAAAGTTGATAAACTTTACTGCTGGTAGAAACTATTTCACAGGTCCAGTATCCAAGAGTTTGAAGAATTGCACTAGCCTCATAAGAGTGAGGCTTGAACAAAACCAATTGACAGGAAATGTGACGGAGGATTTTGGTGTGTATCCAAACTTGGATTACATAGATCTGAGTGATAATAACTTTTATGGCCATCTTTCTCCAAAATGGGGGAAATGCCATAATCTCACAAGCCTCAAAATCTCCAACAATAATTTATCAGGAAGCATTCCACCAGAACTAATTCAGGCAACCAATTTACATGTACTTGAACTGTCTTCAAATCACCTCGTAGGAGACATTCCCGAAGATTTAGGTAATTTGACCTACTTGTTCAAACTCTCTCTCAATAATAATAATCTTTCAGGGAATGTTCCTATACAGATAGCATCAATGCTAGATCTTGACACTTTAGAGCTCGGAGCAAATGGTTTTTCTGGCATAATTCCAACTCAACTCGGCGATCTCTCCGGCCTTGACGAGATGAGAAGTTTGATATCTATTGATATATCATACAACCAATTACAGGGTCCACTTCCCAACATTCCAGCCTTCAAAATGGCTACAATTGAAGCATTGAGAAATAATAAAGGCTTGTGTGGTAATGTCTCAGGCTTAGAACCATGTCCAACATCACCTGACAATTATGAAAATCATCATAAGGCTAGCAGATTCATATTGGTATTTTTACCCATTGGTTTGGGCACTTCCATGCTAGCGTTATTTGTCTTTGGAGTGTCTTATCATTATTATCGAAGCTCAAAGAAGAAAGCACATGAAGATGAAGAATCACCAGGTCAAAATCTCTTTTCGATATGGAGTTTTGATGGAAAGATGGTGTATGATAACATAATTGAAGCCACAGAAGATTTTGACAATAAACATCTCATTGGAGTTGGAGGACAAGCGAGTGTTTACAAAGCTGAATTGCAAACAGGTCAAGTTGTTGCAGTTAAGAAATTCCATTCAGTAGAAAATGGAGAAATGTCTAACGTTAAAGCTTTCGCAAGTGAAATTCAAGCTTTGACAGAGATTCGACACCGTAACATTGTGAAGTTATACGGGTATTGTTCTCATTCCCGATTCTCGTTTTTGGTGTATGAGTTGATGGAAAAGGGAAGCATTGATAAGATTTTAAAAGACGATGAAGAGGCAATTGCATTTAATTGGAAAAGGAGGGTTGATGCCATTAAAGGTGTGGCAAATGCTTTATGCTATATGCATAATGATTGTTCACCTCCAATTGTTCATCGAGATATATCAAGCAAGAATGTTCTTTTGAATTTGGAGTATGTGGCTCATGTCTCAGATTTTGGAACAGCCAAGCTTCTTAATACTAATTCAACAAATTGGAGTTCATTCGTGGGAACTTTTGGATATGCTGCTCCAGAACTTGCATACACAATGGAAATAAATGAAAAATGCGATGTGTATAGCTTTGGGGTATTAGCACTGGAAATAGTTTTGGGAGAGCATCCTGGAGATCGTATAAGTTCATTGTTGACATCTTCATCGAATGTGATGGAGTCAACACTTGATATTACTTCATTGATGGATAAGTTAGATGAGCGTCTCCAACATCCTGCAAAACCTATGGCTAAGGAGATAGAATCAATTCTAAGGATGGCAAATGCTTGCTTGACTGAAAATCCTCGTTCTCGCCCTACCATGGACCAAGTTGCCAGCTACTTTTCAAAGTACAAGTCATGTTCATTCAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_13326::LG3:26285163-26287163(-)
CTATTGAAACGTAACTTGCTTAAGGCCTAGAAGCATATGAAGAAGAACGATGATCTGAAGCATAGAGAGGTCAGCTTTGATGTTGGTTCATGGGTGTATGTCAAGTTGCAGCCTTACCGCCAAATATTTGTTTCGGGGTCTAAATTCCATAAATTGGATAAACGGTTCTATGGGCCCTTTCAAGTTACAGCAAAGATGGGTCTTGTAGCTTACAAACTTGACTTACCTGACACTTCAAGGATCCACAATGTCTTCCACTACTCTGTTTTGAAGGCATATGATGGGCCACTTCTACCCTCTATTGACACCTTAAATCCTCTCTCATTTGAGAACAATCCGCTAGTCACTCCTCTTATCATCCTTGGATTTAAAACAAATAATGTCAATGGTGTTCCTAAGCGTTTAACTTTGGTTCAATGGCAAGGTTTCCCACCTAATGATACCTCATGGGAGGATTGGATTACTTTACAACAAATTTATGACCTTGAGGACAAGGTCATTGCAGAAGGAGATGGTAATGTTAGATATGAAAGCCCAAATTTTGCAGACACAACCATGGATAATGTCAGGCCCAAAAGAATGACTCACAAAACAAAAGGAATACTTGATTTTATTTATTATTAAGGGAATGTATGGGTTAGCAGATTCTAGAATGAAAGTTGGTTAGGATTTTTTTATTTGTCCTTTTGTGAGGTCGTGTATTAGGTTATATATTACCTACAGAAGGGGAAAAAATCTTATTTACTCCTATTTATCCTTTGTTCTTATAGAGGTTGTGTGTCCTTTAATTCAGTGTAATCACTTAACAATTCGCGTTTCTGTTGAAGTTTGTCTTACTAAAGTTCATGTTTTGTGTTGCTATTCTTGTCTAGAGTATTACATTGTGGAATGGTGTAGCTAGAATTTCGTTGGTTCCAAAAACGTGTTTTGCATTGCCTTCCTTTCAAAAATTTATATGTAATATGAGTATATATTTTTTTAATATGTTGTTAATATATTTTTTTTATATTTAAAATGTTGAACTATTTACTTTTTTTTTTAAATTGGTTAATTATATATTTAAATTTTATTTATTTGAGATTGTTGTTGCATTGAATTAGACTTAATTTTTTATTTAAGATTTGAAAATTATTTACTGTGTCAAAGTTTAATCCTAATTAGCCTTAGCATTGGTAGAAATAAATAGGAATCATAAATTAATTTTTAGCCAATGTTCTAAAATTTGAACCACAAATCTACGCTACATTTTAAACATTTAGTATATAAGGTTGTCTGAGTGGTCAGTGGAATGAAGTAAGGTTGACCTATTGACTTTTAGACTAAGAAATGCCTAGAGTCATATGCACAACAACAAAATTAAGGTCTTGTACAAAATTTGAACCACAATGTTGTACAAAATTTGAAGCACAAGGTTGTGTGAATGTGAATGAAGTAAGGTCTACCTATTCACTTTTAGACTAGGAAATACCTACAGTCATGCACAACAACAAAATTAACGTCTATACAATGCAGAAGACTATAAAAAAGACCATAAATCCACAATGTCTACCTTAAGATTCATTCCACAAATTTCGGATACTTAATTTTAATTATTAATAATGTGATGAATTTCATTTTTATTTTAAAATATTATAGAATTAATATATAATGATATCTCGTAAAGGAATAACTTTTTAACCAATATATAGTTATTTATCATTGATTAATAGTTTGATGTTTTGAAAAATACGAAAGTTAACAACTTTAAACTACAAAAATATAAAGCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGCAAAAAACTTATTAAAAATAAAATGATAGTTAGGAGCTCTTGAAGAAGCATCACTATATATAAACCTCTGAAAGTATAACCATCTTATCAAATTTATCCAATCTTGGGGGGGTTCTGTGAGATTACCAGTGATTGAAGAATTGATTCATAGCAGCC


Gene Sequence:
>Vu_13326(-)
ATGGTGTTCTTATTTCCAAAGCTTCAGCCCATTAAGCTCATATCATTATGGTTCCTTCTACTTGTAATGGCAACTTCTCTCCATGCAACACTGTCTTCCTCACTCTCACTTCAATACACAGAAGCCAACGCTTTGTTGAAGTGGAAAGCAAGCTTTCACAACTCAACTCATACATTGCTATCTTCATGGCATGGCAATACTTCTTGCAATTGGCTTGGACTTGCTTGTGACCACTCAGGATCAGTCTCCAACATAAATCTCACAAACATTGGATTAAGTGGTACGCTTCAAACTCTAAACTTTTCATCACTTCCAAACATTCTCACTCTTGATATCAGTTTGAACTCCTTCACTGGAAGCATTCCTCCTCAAATTGGAGTGTTGTCCAAACTCACTCATCTTGATTTAAGTCACAATCATCTCACCGGTACTATCCCAAATTCTCTCGGAAAGCTATCAGTCTTGTCACATATTAGCTTGTGGAATTGCAGTCTTACAGGGTCTATTCCAAAATCTATAGGAAATATGGCAAGTCTTGTATATCTAGATTTTACGCAGAACAACCTTTATGGACATATTCCTCACGAAATTGGAAATTTGTCAAACTTAGAGAATTTGTGGTTAGCAATTAATAACTTAGACGGTTCCATTCCTCAAGAAATAGGTAAGCTGCAGAACCTAAAGGATTTATATATATATAACAACAATTTATCTGGAAACATTCCCGTGGAAATGGGGAAGTTGGTCAACTTGACCTGGTTATGGCTTTTTAACAATAATCTTTCGGGTTCTATTCCTCGAGAAATTGGAATGATGACAAATTTGCTTCAAGTTGATTTGTCCAGTAACTCTTTGTCAGGTACAATCCCCCCTACAATTGGAAATCTGAGCAAATTAAGGAATTTATACATATATACCAACCATCTCTCTGGTTCCATTCCTAATGAAGTGGGGAAACTCTATTCTCTTATGACAATCCAATTGTTAGAAAATAATCTCTCTGGACCAATCCCATCTTCCATCGGTAACTTGGTGAACTTGGATTCTATTCGTCTTAATGGAAACAAACTCTCCGGAACAATTCCTTCCACTATTGGTAACTTGACAAAACTTACCACACTTGCTTTATTCTCAAATAAGCTTAGTGGACACATCCCAATAGAAATGAATATGCTTAACAACCTGGAAAAATTGCATTTATATGACAATAATTTCATTGGTCAATTGCCTCACAATGTTTGCACTAGCGGAAAGTTGATAAACTTTACTGCTGGTAGAAACTATTTCACAGGTCCAGTATCCAAGAGTTTGAAGAATTGCACTAGCCTCATAAGAGTGAGGCTTGAACAAAACCAATTGACAGGAAATGTGACGGAGGATTTTGGTGTGTATCCAAACTTGGATTACATAGATCTGAGTGATAATAACTTTTATGGCCATCTTTCTCCAAAATGGGGGAAATGCCATAATCTCACAAGCCTCAAAATCTCCAACAATAATTTATCAGGAAGCATTCCACCAGAACTAATTCAGGCAACCAATTTACATGTACTTGAACTGTCTTCAAATCACCTCGTAGGAGACATTCCCGAAGATTTAGGTAATTTGACCTACTTGTTCAAACTCTCTCTCAATAATAATAATCTTTCAGGGAATGTTCCTATACAGATAGCATCAATGCTAGATCTTGACACTTTAGAGCTCGGAGCAAATGGTTTTTCTGGCATAATTCCAACTCAACTCGGTAATTTGGCCAAGTTATTACACTTGAATTTGAGCCGAAATAAATTTACGGAAAATATTCCATCCGAGTTTGGTAAATTAAAATATGTTCAAAGTCTCGATCTTAGCATGAACATTTTGAGTGGAAAAATACCACCCGTGCTTGGACAGTTGAAAAGCTTAGAAACATTAAATCTCTCACACAATCATCTTTCAGGCGATCTCTCCGGCCTTGACGAGATGAGAAGTTTGATATCTATTGATATATCATACAACCAATTACAGGGTCCACTTCCCAACATTCCAGCCTTCAAAATGGCTACAATTGAAGCATTGAGAAATAATAAAGGCTTGTGTGGTAATGTCTCAGGCTTAGAACCATGTCCAACATCACCTGACAATTATGAAAATCATCATAAGGCTAGCAGATTCATATTGGTATTTTTACCCATTGGTTTGGGCACTTCCATGCTAGCGTTATTTGTCTTTGGAGTGTCTTATCATTATTATCGAAGCTCAAAGAAGAAAGCACATGAAGATGAAGAATCACCAGGTCAAAATCTCTTTTCGATATGGAGTTTTGATGGAAAGATGGTGTATGATAACATAATTGAAGCCACAGAAGATTTTGACAATAAACATCTCATTGGAGTTGGAGGACAAGCGAGTGTTTACAAAGCTGAATTGCAAACAGGTCAAGTTGTTGCAGTTAAGAAATTCCATTCAGTAGAAAATGGAGAAATGTCTAACGTTAAAGCTTTCGCAAGTGAAATTCAAGCTTTGACAGAGATTCGACACCGTAACATTGTGAAGTTATACGGGTATTGTTCTCATTCCCGATTCTCGTTTTTGGTGTATGAGTTGATGGAAAAGGGAAGCATTGATAAGATTTTAAAAGACGATGAAGAGGCAATTGCATTTAATTGGAAAAGGAGGGTTGATGCCATTAAAGGTGTGGCAAATGCTTTATGCTATATGCATAATGATTGTTCACCTCCAATTGTTCATCGAGATATATCAAGCAAGAATGTTCTTTTGAATTTGGAGTATGTGGCTCATGTCTCAGATTTTGGAACAGCCAAGCTTCTTAATACTAATTCAACAAATTGGAGTTCATTCGTGGGAACTTTTGGATATGCTGCTCCAGGTTAATTCCTTACTTCTTTTATACTCAGTACATAATAATGATTCTGTAACTTTTCTTTGTTAGTGTTAAACTTGTACCAAAAGATTATGATAGGCTTGTGGCTTGTTTTATTTTTGTGAAATATTATGATAACTCCTTCATCTGGCTACAGAACTTGCATACACAATGGAAATAAATGAAAAATGCGATGTGTATAGCTTTGGGGTATTAGCACTGGAAATAGTTTTGGGAGAGCATCCTGGAGATCGTATAAGTTCATTGTTGACATCTTCATCGAATGTGATGGAGTCAACACTTGATATTACTTCATTGATGGATAAGTTAGATGAGCGTCTCCAACATCCTGCAAAACCTATGGCTAAGGAGATAGAATCAATTCTAAGGATGGCAAATGCTTGCTTGACTGAAAATCCTCGTTCTCGCCCTACCATGGACCAAGTTGCCAGCTACTTTTCAAAGTACAAGTCATGTTCATTCAATTGA