Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13323 LG3 26179700 26180147 receptor-like protein kinase 1 precursor
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 26179741 synonymous_variant p.Phe14Phe
G/A 26179746 missense_variant p.Gly16Asp
T/C 26179807 synonymous_variant p.Pro36Pro
G/A 26179827 missense_variant p.Cys43Tyr
C/T 26179833 missense_variant p.Ser45Leu
G/T 26179872 missense_variant p.Arg58Leu
G/A 26179917 missense_variant p.Arg73Gln
C/T 26179954 intron_variant
A/G 26179956 intron_variant
C/T 26179992 splice_region_variant&intron_variant
G/A 26180106 missense_variant p.Val112Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13323.1
MPLLRHLHLGSNFFSGQISPKYGTWQHLTNSWETSPGAWKPHCASRALHWLLQRLLRRHPARDWKPVPACPFRRRVNALSGSLTPKLGNLESLKLMDLSNKVLSGEVPTSFVELKNLTMLLLQL*


CDS Sequence:
>Vu_13323.1
ATGCCCCTCCTCCGTCATCTCCACCTCGGCAGCAACTTTTTCTCCGGCCAGATCTCTCCCAAGTATGGCACCTGGCAACACCTAACGAACTCATGGGAAACATCTCCTGGAGCTTGGAAACCTCACTGCGCTTCGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGACGGCATCCCGCCAGAGATTGGAAACCTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGACGCCGCGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTAAGTTGGGGAACTTGGAGAGTCTCAAGTTGATGGATCTGTCCAACAAAGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGACGAGCTTTGTGGAGCTCAAGAATCTAACTATGCTCCTGCTCCAACTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13323::LG3:26177700-26179700(+)
TATGGGAGAGTTAAATTGCTTTTGATCTTGTATCTTGTTGTTCTATGAATTGTAATGGTGTCTTTGGATTCTGGAAATTTTATAATATTGTTGATAATAACTGAAATAAGTGTATGAATGTATTTATTCTGAGAAATAGATGTGTATGGGTGTTGTTATCTTTGCTTGGGCTGCAGTTAGTGACATGTATGAGTCTGAAAAAGTAAGTATATGATGTATGCTCTGTTTTGGGAATGAAATATTAGAATGGGTTTTCTTTATGGGATGGTTATATGTCAAGAATAAAGGAGTGTATGAACGTGTATATATTTGAACTGAATTAGTTAGACTGCTGAAAAACTGTTTTGATTCAAATGCTGCAGAAAATTATTTGCTGTTTTGATAAAATTGTTGCAGGAAATTATTTGATGTTTGGATATAAAAATGCTGCAGAAAATTGTTTGTTGTGTTGATTCAAATGCTACATAAATATTTTATTGTATTAGTTGGTTAAAATCTTGTTTAATATATATTTGTATAGTGTGGATGCAGGGCATATATATTTATTGTATGGGATGTTAGTCTTGATTGATATATTGTTATATATATTACATTTATTACGTTATATATTATATACCAAGCTAAGATAAGTTTTCGTTTCAAATTTTGGGTGTAAAATATTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAGATGGTTTGTAATAAACTTTTTCCTTTGGGATTATTAGTATATTATATTAAAAGTATTAACTGTATTGCTGCAAAATTAATTATATTTGGATGTATGAACGTGTGAATGTACCAAGAGGTTTGAACTAATATTATGCACCATACCTTGTGATTTTAGTATAATCTTGTTGCAAATTTGGATTCAATTGTTATTAATTAGTTGACTTCTTTTTCATAATATTTTAGATAAAAACTCTTAAGAAAAGAAAATAAGAAAAAAGTCTTCCTCGCAAAAAGTGACATAATTTCTATTAATTTAATGAGTTAAGTGTAGAATCTTTTAATTAATTTTTTAAAAGTATTAATTGTATTTCTTTTTTTCCTTATTATTGTAGGTCGGGGCAAAGTGATGGTATTGGAGCAGTTTGCTTTGACAACTATTGACACGGTGATAGCTTTTTACCCTATAACATTTCACATTATGCGAAACTGAGCAATGGACTAGACATCATGTTTGGAAAAGAATAGCGCAAGGCGACATCTTTTTCTATCTAGAGAAGATATTGTAGTTGTTGTAAACATCTTTCTCTGCCTTTAGACTTTGATATTTTACCATTTTGGACAGATATTTTATTTATTCATTCAAGTATAGGATCCTTATATATTTTCTTGTACAACTTTTTTACTTTTGCATTGTCTTTTCTTGGATATAGAAACCATTTAGCTCGAAACCTATGTCTTATTTTTGATAAATGTTGAAAGTTTTAGTGAATTATATCTTTTATTAAATAGTTATAAATGTTTATCTATATTAGATGATTTTTGGCAATTTGTTAGTTATGTTGACTTTTATCAGCTATTGAAACTCATAACTATTAAATGCAGATGCAGAATCACTTATTTTTTTTTTTTATAAAATCATAAATTATATACGGATTTTTCCGTATATAATTATATACGGATTTTATATACGGATTTTCCGTATATAATTATATACGGATTTTATATACGGATTTTCCGTATGTAAATTATATACGGATTTTTCCGTATGTAAATTATATACGGATATATCCGTATGTAACTTACCTACGCTTCTTTTATATACGGATTTTTGTCCGTATATAATCCGTATGTAATATCATTTTATATACGGATTTTGGAGGTTATATACGGATTTTGACCGTATGTAACTGTGATTTTTCTTGTAGTGCACCCTCCAACCTCGCCCGCCTTGCCAATCTCCAAGTCCTTGATATCTACAACAGCAACATGACCGGTCCCTTCCCCTTCGCCATCGCCGCCA


Gene Sequence:
>Vu_13323(+)
ATGCCCCTCCTCCGTCATCTCCACCTCGGCAGCAACTTTTTCTCCGGCCAGATCTCTCCCAAGTATGGCACCTGGCAACACCTAACGAACTCATGGGAAACATCTCCTGGAGCTTGGAAACCTCACTGCGCTTCGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGACGGCATCCCGCCAGAGATTGGAAACCTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGACGCCGCGTATTGCAGACTCTCCGGCGATATTCCGGCTAACCTTGGAAGGCTTCAGAATATGGACATGCTCTTTCTTCAGGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTAAGTTGGGGAACTTGGAGAGTCTCAAGTTGATGGATCTGTCCAACAAAGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGACGAGCTTTGTGGAGCTCAAGAATCTAACTATGCTCCTGCTCCAACTCTAG