Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13290 LG3 25399998 25404335 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   plasma membrane, extracellular region, extracellular region, extracellular region
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 25400280 missense_variant p.Asp95Asn
G/A 25400371 upstream_gene_variant
T/G 25400391 upstream_gene_variant
T/C 25400501 missense_variant p.Ser142Pro
T/C 25400618 upstream_gene_variant
C/G 25400634 upstream_gene_variant
T/G 25400675 upstream_gene_variant
G/A 25400726 missense_variant p.Val177Ile
A/G 25400734 synonymous_variant p.Glu179Glu
G/A 25400813 missense_variant p.Val206Ile
A/G 25400820 missense_variant p.Glu208Gly
G/T 25400834 missense_variant p.Val213Phe
C/T 25400854 synonymous_variant p.Leu219Leu
A/T 25400860 stop_lost p.Ter221Tyrext*?
A/T 25400893 upstream_gene_variant
T/A 25401061 missense_variant p.Phe257Ile
C/A 25401067 missense_variant p.Gln259Lys
C/G 25401131 upstream_gene_variant
G/T 25401264 stop_lost p.Ter296Tyrext*?
C/T 25401376 upstream_gene_variant
T/A 25401381 upstream_gene_variant
G/T 25401383 upstream_gene_variant
G/T 25401393 splice_acceptor_variant&intron_variant
A/C 25401450 missense_variant p.Gln320Pro
G/C 25401484 missense_variant p.Trp331Cys
T/C 25401492 missense_variant p.Ile334Thr
T/G 25401493 missense_variant p.Ile334Met
C/A 25401497 missense_variant p.Gln336Lys
T/A 25401506 stop_lost p.Ter339Argext*?
T/C 25401511 synonymous_variant p.Phe340Phe
C/T 25401521 missense_variant p.Pro344Ser
T/G 25401535 missense_variant p.Ile348Met
A/G 25401543 missense_variant p.Tyr351Cys
G/A,T 25401596 upstream_gene_variant
T/A 25401842 upstream_gene_variant
A/G 25402668 upstream_gene_variant
A/T 25402674 upstream_gene_variant
A/G 25403004 stop_retained_variant p.Ter486Ter
C/T 25403005 missense_variant p.His487Tyr
T/G 25403007 missense_variant p.His487Gln
T/G 25403131 missense_variant p.Tyr529Asp
G/T 25403134 missense_variant p.Val530Phe
T/A 25403893 stop_lost p.Ter783Lysext*?
T/G 25403897 stop_gained p.Leu784*
A/T 25404113 missense_variant p.Asn856Ile
C/T 25404235 intron_variant
G/A 25404287 missense_variant p.Met875Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13290.1
MKMKMKNVSVTLLIFVLVEVIWCEGYWKEEREALWGLNSRFGLPLSWQWEGTDCCEWEGVECNPSTGRVAKLDFNDLESDFDGQTDQNLSLSLADLVVFKDLKSLNLSYSDWALDCADSEGLENLEVLDLSVKRELDSFTVILVCLNFLPSLKSLYLSSNRYLSHNRFNVFNDFETLSSKLLRLEVLDISWNYLTNDILPSLEGFTSLKELYLSGNEFDSDNHIQGLCSMLKNLEVLDLSYNNFNDSDIASALSGLSSLKSLNLGYSELTPRSILNISKIRSLEILEMEGNQLNETSFWRLEKDGFTWPPNLQVLKLTSNSFSNEFLSSLSGLQFLKSLDLRSNRLNGLLDISGLLALTSLEILDLSGNEINSFVVPQDSNMINGSKLRESLQPFSSIRVLSMNSNVIVGTITAGDFRDLSSLEHLALDDNFSLDNEFFKTIGELTSLKVLSASFCLINGPLPPAGVLQLPLHPLTSMRRIDVSDNNITGQIPNKNISSVLPNLQYLNLSRNHIQGSISREFGKMSLLHTLDLSNNHLSGEIPKNISRDGSRLKNLKLSHNRLYGPVFPSLKYLEELYLDDNSLYGSIPNSFLNSSLQLLSLGYNNLVGKLPNVIGNFSNLAKLSLSNNLLEGSIPTCLVEHQPLLYLDVSNNNLMGFVPSFVNASLRYIHLSNNMFSGLPKRMFSKRSSIIILDLSHNEIVGSIQDMMEDLAHSRLNILILKGNRFTGHLPEQICQLEDLSILDLSYNNFFGPIPNCLGKMPLENDDPVKFREEINGFFRKNNYYAQILTPNIDEKAIFTTKKRSYTYTGSILAYMSGIDLSKNKLNGSIPSELGNLKRIRALNLSHNNLIGEIPTSFSKLAIHPSKKANLLPLMKVAMKEILFFVDLHC*


CDS Sequence:
>Vu_13290.1
ATGAAGATGAAAATGAAGAACGTTAGTGTGACTTTATTGATTTTTGTTTTGGTGGAAGTGATATGGTGCGAAGGGTATTGGAAGGAAGAGCGAGAAGCTCTTTGGGGTCTAAATTCCCGTTTTGGCTTACCTTTGTCATGGCAGTGGGAAGGAACAGATTGTTGTGAATGGGAAGGAGTGGAGTGCAACCCCTCCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATTTTAATGACCTGGAGAGTGATTTTGATGGCCAAACAGATCAGAATTTAAGTTTAAGTTTGGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCTATAGTGATTGGGCATTAGATTGTGCGGACAGTGAAGGGTTGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTGTGAAGAGAGAGCTGGATAGTTTCACTGTTATTCTAGTTTGTTTGAATTTCCTTCCATCTCTCAAGTCTTTATATTTATCATCCAACAGGTATTTATCACACAACAGGTTCAATGTATTCAACGATTTTGAAACTCTGTCATCGAAGTTGCTTAGATTAGAAGTCCTTGACATAAGTTGGAACTATTTGACTAATGACATTTTGCCATCTCTCGAGGGATTCACGTCTCTGAAAGAACTCTATTTGTCTGGCAATGAATTTGACTCAGATAATCATATCCAAGGTTTATGCTCTATGTTGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTTACAACAACTTCAATGACAGTGATATTGCATCTGCTCTCAGTGGACTTTCTTCTCTCAAGTCTTTAAATTTAGGATACAGTGAATTGACTCCAAGATCAATTCTTAATATATCAAAGATAAGGTCTCTGGAGATTCTTGAGATGGAGGGGAACCAGTTGAATGAGACTAGTTTTTGGCGTTTAGAGAAGGATGGATTTACGTGGCCACCCAATTTACAAGTCCTAAAGCTGACTTCAAACAGTTTCTCCAATGAATTTCTCTCATCTCTAAGTGGGCTTCAATTTCTCAAATCCCTTGATTTAAGATCAAACCGATTAAACGGATTGCTCGATATAAGTGGATTATTGGCTTTAACCAGTTTGGAGATTCTTGATCTAAGTGGTAACGAAATTAACAGTTTTGTTGTCCCTCAAGATAGCAATATGATAAATGGAAGCAAACTGAGGGAATCACTGCAACCTTTCTCATCTATTAGGGTGCTTTCTATGAATAGTAACGTGATAGTAGGAACAATTACTGCAGGAGATTTTCGTGATTTAAGTAGCCTTGAACACTTGGCACTCGACGACAACTTTTCCCTTGACAATGAGTTTTTCAAAACTATTGGGGAATTGACTTCTTTGAAAGTTTTGTCTGCTTCTTTTTGCCTAATAAACGGCCCCCTTCCTCCTGCTGGTGTTCTCCAGCTACCATTACATCCTCTTACAAGCATGAGGAGAATTGATGTGTCTGACAATAACATAACTGGCCAAATCCCTAATAAGAATATTAGTTCAGTATTACCAAATTTGCAATATCTAAATTTGTCTAGAAACCACATCCAAGGTTCGATTTCTCGTGAGTTTGGGAAAATGAGCTTATTGCATACGTTGGATCTATCAAATAATCATTTATCAGGAGAGATTCCAAAAAACATATCCAGAGATGGGTCACGACTGAAAAACTTGAAACTTTCACACAATAGGCTCTATGGACCTGTATTTCCATCTTTGAAATACTTGGAAGAATTGTATTTAGATGACAACAGCCTTTATGGTAGCATACCCAATAGCTTTCTTAACTCATCTCTCCAACTCTTGAGTCTAGGCTATAATAATTTAGTGGGGAAACTACCAAATGTGATTGGAAATTTTTCAAACTTAGCTAAGCTTTCATTGTCCAACAATCTTCTTGAAGGGTCTATTCCGACGTGCCTAGTCGAACATCAACCTCTATTATATCTAGATGTATCAAACAATAATTTGATGGGTTTTGTGCCATCTTTTGTCAATGCTTCCCTGAGATACATTCATTTGAGCAACAACATGTTCAGTGGTTTACCCAAAAGAATGTTCAGCAAAAGATCTTCCATAATAATTCTAGACCTTAGCCACAATGAAATAGTCGGTAGCATTCAAGATATGATGGAAGACCTTGCTCATTCAAGGTTGAATATACTCATTTTGAAAGGTAACCGCTTTACAGGGCACTTACCAGAGCAGATATGCCAATTGGAAGATTTGAGTATATTAGATCTTTCTTATAACAATTTTTTTGGTCCAATACCCAATTGCTTGGGTAAAATGCCTCTTGAGAATGATGACCCTGTCAAGTTTAGGGAAGAAATTAATGGCTTTTTTCGTAAAAATAATTACTATGCACAAATTTTGACACCTAATATAGACGAGAAAGCAATCTTCACTACGAAGAAAAGGTCCTACACTTATACAGGGAGCATCCTTGCTTATATGTCTGGGATTGATTTATCCAAAAATAAACTAAACGGAAGTATTCCATCCGAGCTTGGAAACTTGAAGAGAATTCGAGCATTGAATTTGTCTCACAATAATTTGATTGGAGAAATTCCAACTTCATTTTCCAAATTAGCGATACACCCGAGCAAAAAGGCCAATTTATTACCTTTGATGAAAGTAGCTATGAAGGAAATTCTCTTCTTTGTGGACCTCCATTGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13290::LG3:25397998-25399998(+)
ATAGAGAATTATTGATTTGGTCAGTGTGAGAAGATGAATTGGAATCCTACAGAGCATTCTCTTCAACTCCAATGCACCACTCATTTGCACCGAATACGACCCAAGCAGAGGAAGGAGCATTGGATGATCAGGTTAGAAAGGACCCCTCCGCCAACATCGTGGTAGGAAAGGACCCCTCCGCTAAAGGCGACCGTGATGGTTATTGACGGTGGGGAGCGACGACGATCGGTTCGTGGATGATGGTCGAAATTTTGCCAGCAACTGCAGGAAATGTTGCAAGTGTCGCCCTGGTAACATAATGAAAAATAAAACATTAGATAAATTTGAAAGCTTTGACAAAAATAAAAGGGAAAAAGTGAATTGAATCGGAAAAATGAAGAAAAAAAAGAAAGAGATTGATAAGATGGAAATTAGGAAATGGAAAAGAGGGATTTTGAAATGGAATAGGGAAAAGATGAATCTATATTACGAGACTAACTGCTCCATCGCTTTCAGCCATATGGGTTCTGTCAACTCAAACAAAGAACTCGTGTCAAACACCAAATGACCCAAAATTGATTTTTTTACCTGCTTAGATTGACCATTTCGGCCACCGATATTGGTTCTTATCACGTGCCCGGTCTCAGCACCCACACCATCGATGATGTCAGGCTCACTATCCTGTAGAATATAAACTAGGGGCAAACCTATTGAAACAGAAACAACAAAAAGGGTATAAAAAAGAAATTAAAATTTCAGGAGAAGGTGTTTACAAAACTTGTGTTTTTGTCCCGAGCACATTTGATAGTGGTTAACGAAGAAGAGAATGGAATAGGAAAAAAATGAATTGCGAGATGGTGCTTCTTGAATTAAAAAAAATGAAAAAAAAACATGAAAAAGGGTAATAGTGTACAAACCCTGTCTTCGTCGTGGTCTTTCAATCTCATCTCGAGCATCTCTCTACCAAGCCAATCGACAGAATTGGAAGAACCCCTGAAGGCAGCGTTACCTGGAACTACAGGTGTTGGGTGTTGCAGTGTGGAATGGATTGGGGCTGGTTTGATTTTTCTGTTTTGGAGGTTTCGGTGGAAGTGCTACGCGGTGGCTACCAAGATTCTGATTGTTGGGTTAGGTTCCTTTGTTTGTCTTCTCTTGTGTGTTCGTCTACTATGTTCACTGATCAAATCCCTAATTCCTTTTCTCTAACCCTATTTACTTAAAAAATTTCTAATCATAAGAAATTTTTAACATTACTAATTCAATTTTGTGCCACGTCAAAAATTGTTAATTTAGTTAAGAAATTCAACGTAATATAACAGTTTTACATTAGCAGATTAAGTGTTCACCATGTCACCAAATTTTTAACGAAGTCTATGAAAACTTAACGGACAGGGCTTAATTGGCTCAATTTTTCAAATATTTGGACCTAATTGAGACAATTTTTCAAATATGTGGACCTAATTGAGACAATTACAAATACAAGTATCCACCTGAGATTTCCCAACAAATATAAAGACGATCCGAGGGTTTAAACCTTCATATTTTTACTAATATATTAAATTTCTAAATTTATAAATACTTTTTTACGTTAATTCTATTTTAATTATAAACTTAAAAATATTTTCCTTTTCTTTTCTCAATCTCTAAATTTCTTTTAATAAATACACGAACAAACACCAAATATCAATCAGTAAATAGGGACTAGATTGGTTCCCTCAAACAATTTTAGATAAGAATTTGATATCATTTTGGTATTTTAAGGGTCAGAGTTTGATGAGGACTCAATGGAAGAAAAACAAAATGAAAACTCAGTGGAGAAGACTAGTTGAAGGAAGATTCAAAACAAGAATGATTTATCTACTTCAAGTACATTGCCTGCAGTAGTCATCACGGCCTTTGGGTTGACCCCAAGTCATCCTTCATTATTACCGTGGTCGCCACTAACTTCCACTCAGCCATAAATTAGTTTACTTTAATTGGTCCATTCTTATTTAAACGCCCAAATCCTTTGTTGCAAAATA


Gene Sequence:
>Vu_13290(+)
ATGAAGATGAAAATGAAGAACGTTAGTGTGACTTTATTGATTTTTGTTTTGGTGGAAGTGATATGGTGCGAAGGGTATTGGAAGGAAGAGCGAGAAGCTCTTTGGGGTCTAAATTCCCGTTTTGGCTTACCTTTGTCATGGCAGTGGGAAGGAACAGATTGTTGTGAATGGGAAGGAGTGGAGTGCAACCCCTCCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATTTTAATGACCTGGAGAGTGATTTTGATGGCCAAACAGATCAGAATTTAAGTTTAAGTTTGGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCTATAGTGATTGGGCATTAGATTGTGCGGACAGTGAAGGTTATTCTACACGTTCTATTTCTTGATCACTATGTTAAACATGAATAATTATTTCCATTTAATTTTAATACTTTGCAGGGTTGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTGTGAAGAGAGAGCTGGATAGTTTCACTGTTATTCTAGTTTGTTTGAATTTCCTTCCATCTCTCAAGTCTTTATATTTATCATCCAACAGGTATTTATCACACAACAGGTTCAATGTATTCAACGGTAAGGATATATATTATAATGATGATGATGATGTGTGATAACCATCTTTTTAATTTTTACTTCAAAATTGGTTGGCTTCTTCTACTACCTTTGAGTACTAACACATGTGTATTCCTTTAGATTTTGAAACTCTGTCATCGAAGTTGCTTAGATTAGAAGTCCTTGACATAAGTTGGAACTATTTGACTAATGACATTTTGCCATCTCTCGAGGGATTCACGTCTCTGAAAGAACTCTATTTGTCTGGCAATGAATTTGACTCAGATAATCATATCCAAGGTGGAATAATTTTCCCATTTCATTTGTAAAGCTAAGGATACTGATAATAGCTTCAGGATAATATATATACGTATGTAAGACACTTTACCTTGCAGGTTTATGCTCTATGTTGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTTACAACAACTTCAATGACAGTGATATTGCATCTGCTCTCAGTGGACTTTCTTCTCTCAAGTCTTTAAATTTAGGATACAGTGAATTGACTCCAAGATCAATTCTTAGTATGTTACACTTCCTACATTTCAAATCTTCATCATGCTTTTTGGTTGAAAATATATGAGTGTAATGAGTATGTATATTACTAGATATATCAAAGATAAGGTCTCTGGAGATTCTTGAGATGGAGGGGAACCAGTTGAATGAGACTAGTTTTTGGCGTTTAGGTTAGTTGTGCTTATTCTTTATTTTACCGAAGTAGATTCGAATCAATGCAAATAGCATGCTCCTTATTTAGTGTGTAAACTCATAATTAGATGTTGTCAATTTTGTTTCTATCAGAGAAGGATGGATTTACGTGGCCACCCAATTTACAAGTCCTAAAGCTGACTTCAAACAGTTTCTCCAATGAATTTCTCTCATCTCTAAGTGGGCTTCAATTTCTCAAATCCCTTGATTTAAGATCAAACCGATTAAACGGATTGCTCGATATAAGTGGTTAGTATAACTTATTTTTTTTATGGTGGTTGGACTTAGACTCTGAGGCAGAGAATTTTTTTAATATATTACCTCTGTTGTATGAGCGAAGAAAGAGTAGTACTATATATATTCTATGAATGAGTATAACAATTCATTCTCTATTTGTTTCTAACAGGATTATTGGCTTTAACCAGTTTGGAGATTCTTGATCTAAGTGGTAACGAAATTAACAGTTTTGTTGTCCCTCAAGGTATTCAAACAAAGCAACTGATATAAAAAAGTGATAATTGGTCTGCTTGCTGTGCATAGTTGTTGTATTTGTTTTGTCATGTGTTGGCAAATTAAATATTATTGGCCATGTTTTAGTTTCAGGCTCAAAAAGTCTAAACAAACTGGACGTCCTTATTTTAGATAGCAATATGATAAATGGAAGCAAACTGAGGGAATCACTGCAACCTTTCTCATCTATTAGGGTGCTTTCTATGAATAGTAACGTGATAGTAGGAACAATTACTGCAGGAGGTAGAAACACCTTTTTATTTTACTCTAAGTTAGTTTGCTTGATATATTAAGGTTCATATACCTTCTTTTTCTATTGTGCAGATTTTCGTGATTTAAGTAGCCTTGAACACTTGGCACTCGACGACAACTTTTCCCTTGACAATGAGTTTTTCAAAACTATTGGGGAATTGACTTCTTTGAAAGTTTTGTCTGCTTCTTTTTGCCTAATAAACGGCCCCCTTCCTCCTGCTGGTAATTCGACTTGTCATTATAGTTTTTATATTTCCTTTTATAGTTAATCATCACATTATTTTACACCCTTTTTTTACTTGAAAATTTATATCCTTTGCATCGTGTCATCCATAAGATGATTTTTTTTTCAATACTTCATATTTCAGATTGGTTTAAGCTGAAGAATCTCAAAGAGTTAGATCTAAGTCAAAACCTATTTAATGGATCGCTTCCCTCATCTTTCTTAAACATGACATCTCTTCAGAAGTTGGAACTTTCATATAATCAATTCAGTGGACAATTTGATTCTAGCATTGCTAGCCTTACATCACTTGAATATTTTGGATTTAAAGAAAACCAATTTGAAGTTCCTCTTTCTTTTTCACCATTTGCTAATCATTCAAACCTTAAGTTCATATATGGTAAAGGCAACAAAGTCGTATTGGACTTACAACCTAGTCCGCAAACTTGGATTCCAAAATTTCAATTACAAGTCCTTAGTTTGCCTTCAATGACTTGGAATGATTCTCTTCCACTCCCCATGTTTCTTCTACATCAAAACAGTTTGACTAGCGTAGATTTCTCTAGTTGTAGATTGGAAGGATTGTTTCCTTACTGGTTGTTTGAAAACAACACAAAATTGACTGAACTTCGTGTTAGAAATTGCTCTTTCACAGGTGTTCTCCAGCTACCATTACATCCTCTTACAAGCATGAGGAGAATTGATGTGTCTGACAATAACATAACTGGCCAAATCCCTAATAAGAATATTAGTTCAGTATTACCAAATTTGCAATATCTAAATTTGTCTAGAAACCACATCCAAGGTTCGATTTCTCGTGAGTTTGGGAAAATGAGCTTATTGCATACGTTGGATCTATCAAATAATCATTTATCAGGAGAGATTCCAAAAAACATATCCAGAGATGGGTCACGACTGAAAAACTTGAAACTTTCACACAATAGGCTCTATGGACCTGTATTTCCATCTTTGAAATACTTGGAAGAATTGTATTTAGATGACAACAGCCTTTATGGTAGCATACCCAATAGCTTTCTTAACTCATCTCTCCAACTCTTGAGTCTAGGCTATAATAATTTAGTGGGGAAACTACCAAATGTGATTGGAAATTTTTCAAACTTAGCTAAGCTTTCATTGTCCAACAATCTTCTTGAAGGGTCTATTCCGACGTGCCTAGTCGAACATCAACCTCTATTATATCTAGATGTATCAAACAATAATTTGATGGGTTTTGTGCCATCTTTTGTCAATGCTTCCCTGAGATACATTCATTTGAGCAACAACATGTTCAGTGGTTTACCCAAAAGAATGTTCAGCAAAAGATCTTCCATAATAATTCTAGACCTTAGCCACAATGAAATAGTCGGTAGCATTCAAGATATGATGGAAGACCTTGCTCATTCAAGGTTGAATATACTCATTTTGAAAGGTAACCGCTTTACAGGGCACTTACCAGAGCAGATATGCCAATTGGAAGATTTGAGTATATTAGATCTTTCTTATAACAATTTTTTTGGTCCAATACCCAATTGCTTGGGTAAAATGCCTCTTGAGAATGATGACCCTGTCAAGTTTAGGGAAGAAATTAATGGCTTTTTTCGTAAAAATAATTACTATGCACAAATTTTGACACCTAATATAGACGAGAAAGCAATCTTCACTACGAAGAAAAGGTCCTACACTTATACAGGGAGCATCCTTGCTTATATGTCTGGGATTGATTTATCCAAAAATAAACTAAACGGAAGTATTCCATCCGAGCTTGGAAACTTGAAGAGAATTCGAGCATTGAATTTGTCTCACAATAATTTGATTGGAGAAATTCCAACTTCATTTTCCAAATTAGTACAAATAGAGAGTTTGGATCTTTCTTTCAACATGTTGAGTGGTCAAATTCCTCATCAACTAAATCAGTTGAACTCTCTTGCTGTATTTAGTGTTGCACATAACAACTTATCAGGCGATACACCCGAGCAAAAAGGCCAATTTATTACCTTTGATGAAAGTAGCTATGAAGGAAATTCTCTTCTTTGTGGACCTCCATTGCTAA