Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13252 LG3 24838489 24840730 PREDICTED: transcription factor bHLH63-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 24838590 synonymous_variant p.His34His
T/A 24838670 missense_variant p.Leu61His
G/A 24838777 missense_variant p.Asp97Asn
A/G 24838844 missense_variant p.Asn119Ser
G/A 24838968 synonymous_variant p.Lys129Lys
C/T 24839024 missense_variant p.Thr148Ile
C/T 24839028 synonymous_variant p.Ser149Ser
G/T 24839642 intron_variant
T/A 24839945 stop_gained p.Tyr248*
G/A 24840114 intron_variant
T/A 24840123 intron_variant
G/T 24840166 intron_variant
C/A 24840259 missense_variant p.Ala327Glu
A/T 24840352 intron_variant
T/A 24840581 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13252.1
MLHCLNGSGNLGASCSDMTVLERQREATTKWQHHHHDNHPPYYSATEFHVNLVFSSSSNNLPQSQGLVMARERDDSALSQVLAHSLKPDPGLCPELDTGFGSSSGFLPKENDKKRKALNYKVAAESDNKDKRVKVSGEEGESRVTNQTSNRNGKSNANKNNRETSADSSKNNSKGSEVRREKISERMKYLQDLVPGCNKIAGKAGMLDEIINYVQSLQRQVEAFPSCGQGLPNIGMVSDMSMCNNPSYVQLNSTQQLVSCCGGLINNVGMSPSNMGLRRNISTTHVPLPEAFVDSSCFTQILPSSNWDGDFQSLYNVAFDQGRAGAASFPSQPFTGVVETSNPKMEM*


CDS Sequence:
>Vu_13252.1
ATGTTGCATTGTCTGAACGGTTCGGGGAATCTAGGAGCCAGTTGTTCGGACATGACAGTGTTGGAAAGACAAAGGGAAGCAACCACGAAGTGGCAACACCACCATCACGACAATCACCCACCTTACTATTCCGCAACGGAGTTTCACGTTAACCTCGTTTTCTCTTCTTCTTCCAACAATCTTCCTCAGAGCCAGGGCTTGGTCATGGCGCGTGAACGTGATGATTCCGCGCTCTCTCAGGTGTTGGCTCATTCTCTCAAACCCGACCCGGGTCTCTGCCCCGAATTGGACACCGGATTCGGATCCTCTTCCGGTTTTTTACCCAAGGAAAACGATAAGAAGAGGAAGGCGCTGAACTACAAGGTTGCTGCGGAGAGTGATAACAAGGACAAGAGAGTCAAAGTAAGTGGTGAGGAAGGAGAATCCCGAGTGACAAACCAAACCAGCAATAGAAACGGCAAATCCAACGCAAATAAGAACAACAGAGAAACATCTGCGGATTCTTCGAAGAATAATTCGAAAGGCTCCGAGGTCAGAAGGGAGAAAATTAGTGAGAGAATGAAGTATTTGCAAGATTTGGTTCCGGGTTGCAACAAAATTGCAGGGAAAGCTGGAATGCTTGATGAAATCATTAATTATGTTCAGTCTCTTCAACGACAAGTCGAGGCGTTTCCTTCATGTGGTCAAGGTTTACCCAACATTGGGATGGTATCAGATATGAGTATGTGTAACAATCCCTCGTATGTTCAGTTGAATTCGACACAGCAACTTGTATCGTGTTGTGGTGGATTAATAAATAACGTGGGGATGAGCCCTTCTAATATGGGACTTCGAAGGAACATCAGTACTACACATGTACCTTTGCCCGAAGCGTTTGTTGACTCGTCCTGTTTCACTCAAATTCTACCCTCTTCCAATTGGGATGGTGATTTTCAAAGCCTTTACAACGTTGCTTTTGATCAAGGGAGAGCGGGAGCAGCATCTTTTCCTTCTCAGCCATTTACAGGTGTAGTCGAAACTAGCAATCCGAAGATGGAGATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13252::LG3:24836489-24838489(+)
AGGATTTATTTTTATTTTGACTCGTAAATAATTAAAACTATAGGATTTATTTGTTTTATGTGAATGAAAATTTAGATTAAGGAAACTTGTATTGATAATTCAAATCTTATTTTTGATAAAAATGACAAAAGAAGCAATATATATAAAGGTAAAAATCATTAATTATTGTCTTAAAGTTTTGGATAGAGAATGATATCAATTATTTATGTGATTGAACTCATATTTTATTAGTGTTGTATCTTCAGTGAACATCCTCTTCTATAAATCTAATTACTTGTTCAAATTTTAAGATCACAAAACTCGCATACTAAATAATTTTAAATTATTGAAAAGATGGATTAAGAAGTGAATTTGGCTGAATGCAAGGAAGTGTGTGGTGGTAGAACTTTTTGTTGCATGAAAAACAAGTTAAGGTAGTGATGTTTTTCATCATTGACACATTAGTTGGAGAAAGAAAACTCTAATGAGGTGTGATGAAACCAAAACATTTGAAGCTATAGAGAGTGTAATAAGGTTGGGTTGATGATATAAATGCAGTGTATGGGGAGAGTTAGTGAAAGAGAATAGAGAATATAAAAAAGATGGAAAGCACTTGAGGAACTAAAAAAAGAAAGAGTGAGTATAGAAAAACAATAGTATTGTGTTGATGTAAACCACAAAAAAAGGTGATATGATAGAGGAAATGAGATTGAGATGGAGGACCCATTTTGAAGTGTATGTATGCAAATGGTACATAGGTAGAGAGATAGAGATGAAAGAGACATGAACCAAAAATAAAGTTAGAGAGATTTTCAAAAGAGGACCCATTTCGTCATAATGGAAGTTGCCTTCATCCTCTCTGGACTTGTTCCTCACCTTTACCTTCCGCTATTGCTTCAAGCTTCAAATCGCAGCATAAATTTGCAAGCAAAGCATGATTTAGACAATGCTGTTAATGTCAACTGCCTGCTTCGAAATGACACTCTTGCTAAACATTCTCCTCACATTTTACCAACAACTCACCTATCCTTAACATTATTTTCACTGCTTAATTTGTCCCATTACAATAACTAAACATCCTCAAAACCCACTAAAACAAAAAAAATCTCTCATGTTTAACAACTAAGCATGTGCTCAATTATGCAGACACCCATCAATCCCTTTCCTTAAAGTGGAACCTCAAATATTATTAGATTATATGGTTTTGTTTATCAAACATAAGTAACTGGTTCGAATAGACCTCTATGACCTATCCATAATTCAACATGCTAGAACTTTCTCTCATCTATTGCTCTTTTTTTAGGTACATTCTTATCCACCGGAATAAACTAAAAACGATAGTTTATTTACTGTTTCTATATCCAATTTAAATAACATGAAGACACATAATTCTGTGTAATTTATGCTTGAATTCAATTTTTTATTTGCCTGTATGTTTGAAGCGAGATGCAAATCATACATTCTTTGACCATACAACCACCAGAAGTACTAATAGAAGAGATTAGAAAGAAACCATCATTATGAAAGTACTGTTATTGTACAGTTTAATTAATTAGAAAGTTGATTAGTTGAGAGAAGAAAGGGAAAAAAGAAAAGAAAAAACACTGCCGTTTCGAAGCGTTGGACACGCCCACGTGGCGGTCATATCAGTGGACCCCAAGGCCACAGCCTCGGTTATGGTTACATCAATAGACCTTATGTCCCACTCTCTCTATCTTAATTATTCCGGTCATATTTTTATTTCCTTGTATTAGTTATTAGTATTATTGAAATAAAATAAATAAATAGAGAAATTAATTTCCCTCCGTTTATATATACCCACCCTATCTCTCTGCACTTCCTTAACACTATTCCAGTGTTTCTCCCACACCGTGTACTCAACTTCCCCGTGACCCTACGTCGTTTTTTCTTTTTGTTTTCCACACACACCGCGTGGCGCGTACTTTCGGATCCACTCCTAGCCCAACAACGTAGCGGTGCCTAATCCTTAGGAATAACGAATAACCTTAACAACCTCAACA


Gene Sequence:
>Vu_13252(+)
ATGTTGCATTGTCTGAACGGTTCGGGGAATCTAGGAGCCAGTTGTTCGGACATGACAGTGTTGGAAAGACAAAGGGAAGCAACCACGAAGTGGCAACACCACCATCACGACAATCACCCACCTTACTATTCCGCAACGGAGTTTCACGTTAACCTCGTTTTCTCTTCTTCTTCCAACAATCTTCCTCAGAGCCAGGGCTTGGTCATGGCGCGTGAACGTGATGATTCCGCGCTCTCTCAGGTGTTGGCTCATTCTCTCAAACCCGACCCGGGTCTCTGCCCCGAATTGGACACCGGATTCGGATCCTCTTCCGGTTTTTTACCCAAGGAAAACGATAAGAAGAGGAAGGCGCTGAACTACAAGGTACTAGGGAATGCTGATAGAGGATTATATAGATTCGGTGTGGTGTGGACTATGGTAAGGCAACCGTGACGTTTTTTTTTCGATTTTGTTTAGGTTGCTGCGGAGAGTGATAACAAGGACAAGAGAGTCAAAGTAAGTGGTGAGGAAGGAGAATCCCGAGTGACAAACCAAACCAGCAATAGAAACGGCAAATCCAACGCAAATAAGAACAACAGAGAAACATCTGCGGATTCTTCGAAGAATAATTCGAAAGGCTCCGAGGTTCAGAACCAGAAGCGGGAGTACATTCATGTCCGAGCGCGTCGTGGTCAAGCCACTGATAGTCATAGCTTAGCTGAAAGAGTGAGTGAAAAAAAGAAGAAGCAAAACCAACTACCATATTAAACGACGCGTTTTGATTCTATTTGTGCTTGTTTAATGCGAGCGTTTTGTTTTGTTTGATGCAGGTCAGAAGGGAGAAAATTAGTGAGAGAATGAAGTATTTGCAAGATTTGGTTCCGGGTTGCAACAAAATTGCAGGGAAAGCTGGAATGCTTGATGAAATCATTAATTATGTTCAGTCTCTTCAACGACAAGTCGAGGTTAGAGTTTGTCGGTCCCTCTGAAATTAATTAGGCTCTTCACTGTTCATGTTGGAATATGTTGAATTTTTTATGCTTCCAAGTCTAAGGACACTTGAATTAAAGTCCGCGTGACTTATTTTATAATGTTTATCACTGCATGCAGTTCCTATCAATGAAATTAGCGGCTGTAAATCCAAGCATTGACGAACTGTTTGCCAGAGAGGTATGCACATGACTCAACTTTTTTCTCCTTTTAGCTGGATTCAATACGGTAACAGCTATTCTTGACATATGTTTTGATATTCGGAAAATGACAAATAATCACAAATACAGCATATATACTAGGAGACTTTACTTGAAAACCTTGGATTATGTCCAGAATATTGGAATTTAATTAGAACTTGCATAAGAAATTATGTTTATGACATAACTCTCTATGTTTGATTCCCACAGGCGTTTCCTTCATGTGGTCAAGGTTTACCCAACATTGGGATGGTATCAGATATGAGTATGTGTAACAATCCCTCGTATGTTCAGTTGAATTCGACACAGCAACTTGTATCGTGTTGTGGTGGATTAATAAATAACGTGGGGATGAGCCCTTCTAATATGGGACTTCGAAGGAACATCAGTACTACACATGTACCTTTGCCCGAAGCGTTTGTTGACTCGTCCTGTTTCACTGTAGGTTTCCCTTATGTAGTGTTGTTCTTGTTCTGTAATGATTACTCTTGTAGTGTCTAATAAATACGTGCACTGCAGCAAATTCTACCCTCTTCCAATTGGGATGGTGATTTTCAAAGCCTTTACAACGTTGCTTTTGATCAAGGGAGAGCGGGAGCAGCATCTTTTCCTTCTCAGCCATTTACAGGTAGCTACAAATTTATGACTTGTCAAATCACTGTTTTTTTTCTAAGCCTGATATCCTTAAAGTAGAAAGTAGAAGCACAGCAGAGTGGATTTTAATGGGTGATCGAGACACGAGAGTCCCACAGACATTGATAAGTCCTTTTTTTTATCAAAATGAAGAAATTTTTTAAAAGGGTATTTTAATCATTCAGCCATCAAGCCAGTTGTCTCTTTTATTTGTTTCTTACATCACTTTCCCACAACATTCACACCTACAGAGTGGTGGCAAAGTTCTTTGCAGCCTGCTCAATAACATTTCATAGATCAATGCTAATTGCTATATATAACAAGTTGTTTTGATACTTTTCGAGATTGTTCTTAGTTGTTTGGATGATGAATTGTTTTAAAGATGGTTTTATGTATCTGCAGGTGTAGTCGAAACTAGCAATCCGAAGATGGAGATGTAA