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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13038 LG3 22447105 22449834 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13038.1
MAERVVTFVLDHLAQLAAREVNLLYGVEDRVQSLQYELQMIKELLNTTKKKKGMEHTVFNHIRDVAHLAEDVIDTFVAKVSIYKRRTIMGRMLCGFGQARLLHNVTDKIDKLKTTLNEIRDNKDKYDAFKETTNQSTAEAEEEEEKKRLQSLQKLRRDVEEEHVVGFVQDSKDVVKRLVGGGSTRKVVSIVGMGGLGKTTLARKVYNSSQVKNHFDCRAWVYVSNECRVHDLLIDLLKHLMPNFEQQRRGNKRGKKSVGDINDLSNEELKKLVRNCLEWKRYLVVVDDLWKKQDWDEVQDAFPDNNKGSIILITSRLKEVALHAGDDVPHYLQFLSEEESWELFGRKVFRGENLPSDLEPLGKQMVQSCRGLPLSIIVLAGLLANKEKSHREWSKVVDHVNWYLTRDETQVKDIVLKLSYDNLPSRLKPCFLYLGLFPEDFEIPVTPLLQKWVAEGFIQDTGNRDPDDVAEDYLYELINRSLVQVTGVKFNGGLEMCKVHDLLRDLCISESKEDKVFEVCTNNNILIPTKPRRLSIHSDIGHYISSSNNDHSCIRSLFFFGPHYEVHGREWKWLLDDFKLVRVLEFGPNSCHKIPSNLGNFIHLRYLRIDLMFGTFVPDSILNLWNLQTIDVETQIFKSTITSFPVQMWKLKHLRHLNTGGPIELRGRCSESDEKMWNLQTISPLILNKQAISLIKKGTFPNIKNMGLDVQAHGCEGELPNLQQLKHLNKLVILIGRHKPQELVQSLGQLSCLTILVIGNVLDLLTSEVIFPPNITELSLSGIKCITDEGMNSLGNHSKLKILRLWGNILQSGDSIDLNCMDGSFPQLEVLEIKYMRLRKWEIGNGAMRRLQNVIIHKCPLLDNLPTELFFLNELRKVNITESPSEQMAHILQILETNNRVEVVIGTTS*


CDS Sequence:
>Vu_13038.1
ATGGCAGAAAGGGTAGTTACCTTTGTTTTAGATCACTTAGCCCAGCTTGCCGCACGCGAAGTTAACTTGCTGTATGGCGTGGAGGATAGAGTCCAGTCCCTCCAGTACGAACTTCAGATGATCAAAGAGCTCCTCAATACCACAAAGAAAAAGAAGGGAATGGAACATACTGTATTCAACCACATCAGAGATGTGGCCCACTTAGCTGAGGATGTCATCGACACTTTCGTAGCCAAAGTTTCCATTTACAAGAGGAGAACCATTATGGGGAGGATGCTCTGTGGCTTTGGCCAAGCAAGGTTGCTCCACAACGTAACCGACAAAATTGACAAGCTCAAAACCACTCTCAATGAGATACGCGACAACAAGGACAAATATGACGCTTTCAAAGAAACCACTAATCAATCCACAGCAGAAGCAGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAGGTTGCAATCGCTACAGAAGCTAAGAAGAGATGTGGAGGAAGAACATGTGGTTGGCTTTGTCCAAGACTCCAAGGATGTCGTCAAGAGACTCGTGGGAGGTGGTTCAACTCGTAAAGTTGTCTCTATCGTTGGCATGGGGGGATTGGGGAAGACCACCCTTGCCCGAAAGGTCTATAATAGCAGCCAGGTGAAGAACCACTTCGATTGTCGTGCATGGGTTTATGTCTCAAACGAGTGTAGAGTTCATGATCTTTTGATTGACCTTCTTAAGCATTTGATGCCAAATTTTGAACAGCAACGTAGAGGCAACAAAAGAGGTAAGAAAAGCGTAGGAGACATTAACGACCTTAGTAACGAGGAACTGAAGAAATTGGTGCGAAACTGCTTGGAGTGGAAAAGGTATCTTGTGGTGGTAGATGACCTGTGGAAAAAACAAGATTGGGATGAGGTGCAAGATGCTTTTCCGGACAACAACAAAGGCAGCATAATATTGATCACTAGTCGTTTGAAAGAGGTGGCCTTGCATGCTGGTGATGATGTTCCTCACTATCTTCAATTCCTGAGTGAAGAAGAAAGTTGGGAGTTGTTTGGCAGGAAAGTGTTCAGAGGTGAAAACTTGCCTTCTGATTTGGAGCCTCTAGGAAAGCAAATGGTTCAAAGTTGTCGTGGTTTGCCGCTCTCCATCATTGTTTTAGCAGGGCTGCTAGCCAACAAGGAAAAGTCACATAGAGAATGGTCTAAAGTGGTGGATCATGTTAATTGGTATCTCACTCGAGATGAGACTCAGGTGAAAGATATAGTTCTCAAACTCAGTTACGACAACTTGCCAAGTAGACTAAAACCATGTTTTCTCTATCTTGGGTTATTTCCTGAAGACTTTGAAATACCTGTTACGCCATTATTGCAAAAATGGGTTGCGGAGGGTTTTATACAAGATACAGGAAATAGAGATCCAGATGATGTTGCGGAAGACTACTTGTATGAACTCATCAATCGCAGTTTGGTCCAAGTAACAGGAGTGAAATTTAATGGAGGTTTAGAGATGTGTAAGGTTCATGATCTTCTTCGAGATCTTTGCATATCAGAGAGCAAAGAGGACAAAGTGTTTGAAGTTTGCACAAACAATAACATTCTAATCCCTACCAAACCTCGCAGACTCTCCATTCACAGTGACATAGGTCATTACATTTCTTCAAGCAACAATGACCATTCATGTATTCGTTCCCTGTTTTTCTTTGGGCCACATTATGAGGTTCATGGCAGAGAGTGGAAATGGCTTTTGGACGACTTCAAATTGGTTCGAGTGTTAGAGTTTGGACCTAACAGTTGCCACAAGATCCCTTCCAATTTAGGAAACTTCATCCACTTAAGGTACTTGAGAATAGACTTAATGTTTGGTACATTTGTTCCAGATTCAATACTTAACCTTTGGAATCTACAAACCATAGATGTGGAAACTCAAATATTTAAGAGTACAATAACGTCATTCCCTGTTCAAATGTGGAAACTCAAACATTTAAGGCATTTGAATACAGGAGGTCCTATCGAGTTGCGAGGAAGATGTTCAGAATCAGATGAGAAGATGTGGAATCTTCAAACCATCTCTCCCCTTATACTCAATAAGCAAGCAATATCTTTAATAAAGAAAGGAACATTCCCCAACATTAAGAATATGGGGTTGGACGTGCAGGCTCATGGTTGTGAAGGTGAATTACCGAACCTACAACAATTAAAGCATTTGAATAAATTAGTGATTTTGATCGGACGTCACAAGCCGCAAGAACTGGTTCAAAGCCTAGGACAATTAAGTTGTCTGACTATCTTAGTGATTGGTAATGTTTTGGACCTTCTAACCTCTGAGGTAATATTTCCCCCTAACATTACAGAGTTATCGTTGTCAGGTATTAAGTGCATTACTGATGAGGGGATGAACAGTCTGGGAAATCACTCCAAACTCAAAATTTTGAGACTTTGGGGAAATATACTTCAGTCTGGGGATTCCATTGACCTTAATTGTATGGATGGCAGCTTCCCACAGCTGGAAGTGTTGGAAATTAAATATATGCGACTTCGAAAGTGGGAAATAGGCAATGGTGCAATGCGGAGGCTTCAAAATGTGATTATCCACAAATGTCCACTGTTAGATAATCTCCCAACTGAACTATTTTTTTTGAATGAATTGAGAAAAGTGAATATAACGGAATCTCCCTCAGAACAAATGGCGCACATCTTACAAATTTTAGAAACAAATAATAGAGTTGAAGTTGTTATAGGGACTACCTCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_13038::LG3:22449834-22451834(-)
TCTTAAAATATTTGTTTAAGATCATTAATTATTGTAGTACATAAGAACTTATGTCAAAAGGTTAAGAACTGTCACATAATTACTAGATGAAACTAATTCTAGTAAACTCTTCAAATGATTGACAACTAAAAGTGACATCTATACGGGTAATTAAAGAACTCGTTTAATTTACATTAGTGATGTTATTTTTTGCTGTCACAATATTAAGGCAACTATTTCATATAGTATTATATATATTATGAAAAATAATTTTTATATAAATATTTAATAGAAAGTTTCTTCCACTCTAGCATGTTTCAACACTCTTTTATATAAAATAAGAATGTATTCGCATAGACAAATTATTTATTGTTTTTCATATAATTATACTAGTTGCGTTTTCAACTTATTGATTATAAATTGTGCCCATATCATTTAGCTTAAATTCAATCATGACATTGGTATATTTAGAGAAAAGTGTTTAAAAGGGTTAAATATATTTTTGGTCCCTTAACTTTCGGTGAAAATTGGAATTAGTCCCTCTTCGAAACTTTGGACTAATTTAGTCCCAAACTTTAGAAATGTGTGAATTTAATCCTTTTAACCAAATTTTGTTAACTTTATTTGATGTTTCAAACGCATTTTTCAGTTAACATTGAAGCAAAAATGTGTCAAACAGTGTAAATAACTCAAATGCTATCATGAAACGCACTTGAAACATCAAATAAACTTAACAAAATTTAGTTAAAAAGGACTAAATTCACACATTTCTAAAGTTTAGGGACTAAATTAGGCCAAAATTTTGAAGAAGGACTAATTCCAATTTTCACTAAAAGTTAAGGGACCAAAAACATATTTAACCCGTTTAAAATTCAATAACTTAAAAGACAAACATGTTGATTTAACATTATGCGTATAAGCTAAATTAAAAAAAAAACATTATTTTTATTTATTGAACAGTGATATATAATAATAACAAAAATAATGTAAAAATTGTTTGAAGAAAACCCTAATTCAGAAAAATAACGCAAAACAATTACTTATATGCGTAAAAAAAAATTGAAACTGGAAGAGAAAATTGTACTGTATTATCAGAGTTGGAATTGAGAAAAGGTTTGGTTGAGTATATAAATGGAATTGTTTTATAGAACGACAGTTATATGTATATATATAAAAAATCATACAAATTTTGTAAAAATTAAATAAACAAAACTAATTCATTAAAATTTGTATTTATTTTTCGTTTAAACCTTTTAATGAATTTAGTTTGACCTTACAAATTAAGCAAAATAAAGTAATTGACATATTTAGTATATGAATAAGTTCTTCTATTTTATTTAGTGAATATGAGATATTAGTGTTTAGAAATTGTTAGAATATATATTAAGTCAATTTGATCCAATCAGAAGCGATGGAGTGCCGTGGATTCAGTTTGAATACGTTGGGCGATAACGTTGATATATAAAGACGAAATAAAACAAATGAATCTCTTACATATATATTATTCTATGCCATCTAATAACCACCAAACAACACACAGAACTGTCATAAATATAAGAATAATGAGAATAACATATATTTACATTCATTTAATACATATTATTTTTCTAATGATGATAAAAAAATAAAAAATAAGGAAGAATAATGTCTTAAAAAATTTGTGTTTGAAAAAATATCATTTCTCAATATGAATATTCTAGGCCCAATGCGTAGAAGGTACAATGCATATGGCAGGAAGGTGCTACGCTACTCACATTATGCATTCAATGGGAAGGTTTACTTCAAAAGTAGTAATGGTTGACGCACAGTCAATGGACCAATAAAACCACAACCCAAGTCTTTATAAATTCTTAATTGCAGCCACTTTGCAAAGTATGCATTTCGATATTCTTTTCTATGCGATTGAAAGCTATACTGGATTGCTTTTTCTGGTGCCTTAGTAAATCCCTATTACTTCCATCACCAACCACAAACCCAGTATCCAAGCACAGATCGAAATCAACACGCTCGTCCACGCTGTA


Gene Sequence:
>Vu_13038(-)
ATGGCAGAAAGGGTAGTTACCTTTGTTTTAGATCACTTAGCCCAGCTTGCCGCACGCGAAGTTAACTTGCTGTATGGCGTGGAGGATAGAGTCCAGTCCCTCCAGTACGAACTTCAGATGATCAAAGAGCTCCTCAATACCACAAAGAAAAAGAAGGGAATGGAACATACTGTATTCAACCACATCAGAGATGTGGCCCACTTAGCTGAGGATGTCATCGACACTTTCGTAGCCAAAGTTTCCATTTACAAGAGGAGAACCATTATGGGGAGGATGCTCTGTGGCTTTGGCCAAGCAAGGTTGCTCCACAACGTAACCGACAAAATTGACAAGCTCAAAACCACTCTCAATGAGATACGCGACAACAAGGACAAATATGACGCTTTCAAAGAAACCACTAATCAATCCACAGCAGAAGCAGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAGGTTGCAATCGCTACAGAAGCTAAGAAGAGATGTGGAGGAAGAACATGTGGTTGGCTTTGTCCAAGACTCCAAGGATGTCGTCAAGAGACTCGTGGGAGGTGGTTCAACTCGTAAAGTTGTCTCTATCGTTGGCATGGGGGGATTGGGGAAGACCACCCTTGCCCGAAAGGTCTATAATAGCAGCCAGGTGAAGAACCACTTCGATTGTCGTGCATGGGTTTATGTCTCAAACGAGTGTAGAGTTCATGATCTTTTGATTGACCTTCTTAAGCATTTGATGCCAAATTTTGAACAGCAACGTAGAGGCAACAAAAGAGGTAAGAAAAGCGTAGGAGACATTAACGACCTTAGTAACGAGGAACTGAAGAAATTGGTGCGAAACTGCTTGGAGTGGAAAAGGTATCTTGTGGTGGTAGATGACCTGTGGAAAAAACAAGATTGGGATGAGGTGCAAGATGCTTTTCCGGACAACAACAAAGGCAGCATAATATTGATCACTAGTCGTTTGAAAGAGGTGGCCTTGCATGCTGGTGATGATGTTCCTCACTATCTTCAATTCCTGAGTGAAGAAGAAAGTTGGGAGTTGTTTGGCAGGAAAGTGTTCAGAGGTGAAAACTTGCCTTCTGATTTGGAGCCTCTAGGAAAGCAAATGGTTCAAAGTTGTCGTGGTTTGCCGCTCTCCATCATTGTTTTAGCAGGGCTGCTAGCCAACAAGGAAAAGTCACATAGAGAATGGTCTAAAGTGGTGGATCATGTTAATTGGTATCTCACTCGAGATGAGACTCAGGTGAAAGATATAGTTCTCAAACTCAGTTACGACAACTTGCCAAGTAGACTAAAACCATGTTTTCTCTATCTTGGGTTATTTCCTGAAGACTTTGAAATACCTGTTACGCCATTATTGCAAAAATGGGTTGCGGAGGGTTTTATACAAGATACAGGAAATAGAGATCCAGATGATGTTGCGGAAGACTACTTGTATGAACTCATCAATCGCAGTTTGGTCCAAGTAACAGGAGTGAAATTTAATGGAGGTTTAGAGATGTGTAAGGTTCATGATCTTCTTCGAGATCTTTGCATATCAGAGAGCAAAGAGGACAAAGTGTTTGAAGTTTGCACAAACAATAACATTCTAATCCCTACCAAACCTCGCAGACTCTCCATTCACAGTGACATAGGTCATTACATTTCTTCAAGCAACAATGACCATTCATGTATTCGTTCCCTGTTTTTCTTTGGGCCACATTATGAGGTTCATGGCAGAGAGTGGAAATGGCTTTTGGACGACTTCAAATTGGTTCGAGTGTTAGAGTTTGGACCTAACAGTTGCCACAAGATCCCTTCCAATTTAGGAAACTTCATCCACTTAAGGTACTTGAGAATAGACTTAATGTTTGGTACATTTGTTCCAGATTCAATACTTAACCTTTGGAATCTACAAACCATAGATGTGGAAACTCAAATATTTAAGAGTACAATAACGTCATTCCCTGTTCAAATGTGGAAACTCAAACATTTAAGGCATTTGAATACAGGAGGTCCTATCGAGTTGCGAGGAAGATGTTCAGAATCAGATGAGAAGATGTGGAATCTTCAAACCATCTCTCCCCTTATACTCAATAAGCAAGCAATATCTTTAATAAAGAAAGGAACATTCCCCAACATTAAGAATATGGGGTTGGACGTGCAGGCTCATGGTTGTGAAGGTGAATTACCGAACCTACAACAATTAAAGCATTTGAATAAATTAGTGATTTTGATCGGACGTCACAAGCCGCAAGAACTGGTTCAAAGCCTAGGACAATTAAGTTGTCTGACTATCTTAGTGATTGGTAATGTTTTGGACCTTCTAACCTCTGAGGTAATATTTCCCCCTAACATTACAGAGTTATCGTTGTCAGGTATTAAGTGCATTACTGATGAGGGGATGAACAGTCTGGGAAATCACTCCAAACTCAAAATTTTGAGACTTTGGGGAAATATACTTCAGTCTGGGGATTCCATTGACCTTAATTGTATGGATGGCAGCTTCCCACAGCTGGAAGTGTTGGAAATTAAATATATGCGACTTCGAAAGTGGGAAATAGGCAATGGTGCAATGCGGAGGCTTCAAAATGTGATTATCCACAAATGTCCACTGTTAGATAATCTCCCAACTGAACTATTTTTTTTGAATGAATTGAGAAAAGTGAATATAACGGAATCTCCCTCAGAACAAATGGCGCACATCTTACAAATTTTAGAAACAAATAATAGAGTTGAAGTTGTTATAGGGACTACCTCTTGA

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