Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12994 LG3 22091951 22095050 PREDICTED: growth-regulating factor 4-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 22092380 missense_variant&splice_region_variant p.Ile191Thr
A/T 22092435 upstream_gene_variant
A/C 22092518 upstream_gene_variant
A/C 22092519 upstream_gene_variant
A/T 22092593 upstream_gene_variant
A/C 22092741 upstream_gene_variant
C/A 22092755 upstream_gene_variant
T/A 22092756 upstream_gene_variant
A/T 22092761 upstream_gene_variant
G/C 22092772 upstream_gene_variant
A/G 22093280 upstream_gene_variant
A/T 22093507 upstream_gene_variant
C/G 22093725 upstream_gene_variant
A/C 22093762 upstream_gene_variant
T/A 22093765 upstream_gene_variant
G/A 22093805 upstream_gene_variant
A/G 22093810 upstream_gene_variant
C/G 22093818 upstream_gene_variant
C/T 22093869 upstream_gene_variant
G/A 22093876 upstream_gene_variant
G/T 22093896 upstream_gene_variant
A/G 22093992 missense_variant p.Ser176Pro
T/A 22093993 missense_variant p.Leu175Phe
T/C 22094078 missense_variant p.Gln147Arg
C/T 22094118 missense_variant p.Asp134Asn
T/C 22094283 missense_variant p.Lys79Glu
G/A 22094587 upstream_gene_variant
A/T 22094724 upstream_gene_variant
A/G 22094805 intron_variant
C/T 22095038 missense_variant p.Gly5Ser
T/A 22095046 missense_variant p.Asn2Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12994.1
MNNSGGGTLMGLSNGYYGRSPFTVSQWEELEHQALIFKYMLAGLPVPQNLVLPIQKSFNSIPHAFFHHPTLSYCSFYGKKVDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHMHRGRNRSRKPVESQTMTQSSSTVTTLDVTGGSGSSRTVNFQNLPANAVGNLQGTDSGTDHTSYHLDSIPYAIPSKEYRYLQGLKSEGGEHIFFSEASGSSKVLQMESQQLEDTWSLMSNKVASFSTSKSSNDSLLHSDYPQNSFLSGEYASEEHLKEEGQSLRPFFNEWPKGRDSWSGLEDERSNQAAFSTTQLSISIPMSSDISATSSQSPHGENEIQFR*


CDS Sequence:
>Vu_12994.1
ATGAACAACAGTGGTGGAGGGACTTTGATGGGATTGAGCAATGGTTACTATGGGAGGTCGCCATTCACAGTGTCTCAGTGGGAGGAACTGGAGCACCAAGCTTTGATCTTCAAGTACATGCTTGCGGGTCTTCCTGTGCCTCAGAATCTGGTGCTCCCCATTCAGAAGAGCTTCAATTCTATACCACATGCCTTCTTTCACCATCCCACATTGAGTTACTGTTCCTTCTATGGGAAAAAGGTGGACCCAGAGCCAGGGAGATGTAGGAGGACTGATGGAAAAAAGTGGAGGTGCTCCAAGGAAGCATACCCAGACTCCAAGTACTGTGAGCGCCACATGCACCGTGGCCGCAACCGTTCAAGAAAGCCTGTGGAATCACAAACTATGACTCAATCCTCTTCGACTGTCACAACACTTGATGTCACTGGTGGCAGTGGCAGCAGTAGAACTGTAAACTTCCAAAATCTTCCTGCAAATGCTGTTGGTAATCTCCAGGGTACTGATTCTGGAACTGACCATACCAGTTATCATCTAGATTCCATTCCTTATGCCATCCCAAGTAAAGAATACAGGTATCTTCAAGGACTTAAATCTGAGGGTGGTGAACATATCTTCTTTTCTGAAGCTTCAGGAAGCAGCAAAGTTCTCCAAATGGAGTCACAACAGCTGGAAGACACATGGTCTTTGATGTCTAACAAAGTTGCCTCTTTTTCTACGTCAAAATCAAGTAATGATTCCCTGTTGCATAGTGATTATCCTCAAAACTCGTTTTTATCTGGTGAATATGCATCAGAAGAGCACCTGAAGGAGGAGGGTCAGTCTCTTCGACCCTTTTTCAATGAATGGCCAAAAGGCAGGGATTCATGGTCTGGTCTGGAAGATGAGAGATCTAACCAAGCAGCTTTCTCCACAACTCAACTTTCAATATCCATTCCCATGTCTTCTGATATCTCTGCAACGAGCTCTCAGTCCCCACACGGTGAGAATGAGATTCAATTTCGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_12994::LG3:22095050-22097050(-)
CTAGAAATATTTATAAGTTTGCCCATACACTAATAAAAAAAAGTTTAGCAACAAACACTAGACGAGTCTCTCTATACAATGATAAGATAAGTCAGTCAATGTATGTTGCACAAGTTTGTCTGTCCATATATAAATTATATGAGCCTATTAATACATATTAGATCAGTTTGTTCATTAACTGATAAATAAGTATTGCAATACACATTAAACGATTCTACACATACATTGATTGAACAACTATGTTCATACACTGATAAAAGGACTTTAAGAAACAACACTAGACAGACATGTTTATACGCTGATTAGATAAGATTGTCTATATGCAAATAAGGTGGTTTTATTAATACACATTGAACGATTAGACGAGTCTTACGATATACATTACACGAATATAGATATACATTGATTAGACGAATATAGCAATACACGTTATACAAACGTGTTTGTATATTGATTAAAAAAAAATCTAACAATACATATTAGACGAATATGCTGATATATTAATTAGACAAGTATATCAATACACATCATACGAGTGTTTCCATATATATTTAATCTGAAAAGAAATCATGGTATATCTACCTCAGGGAATTGAAGGCAAATACACATACACAAACAAAACATGGCTAAGGGTGTGGTCCATGAATGATGAAGCATGGGTTACCAAACAGTGAATAATTAAACCCTTGGGCATGAGGTGTAAGAGAAGTTGGCAAGTTCTTGTGCTCATTCATTCACTCATCTTCAATAATCCACAAAGGTACAGAGTACATAGGCAATGATACAAGCAAAGAAACACTAAACTGGAATTGCACACATTTGGACTGCTTGGACACATTTACTAATTTGTTTTTAATTTTGGCAAAACGTGGGAGAGAGATTGAGCCCCACATCGAATGTCACCCGCATTCCGCCAAGTAGTGAATGGTTTCCTTTTTCTCTAGCGGTGTAGTATCTGTCAATCGGTGCTATGGGCCACTGGGCCCGGGGTCCACCGTTTCTCCAGCCCATCACGCGTTGTTGCTGTCCGTTCAAGGGTAACATAATAAAACTACATCATCCTCTTTTCCAGCAATCTCAATAAATGACACCAAATCCCAAAAATAAAATTTGCTTTTAGTATTTTTCAACCATATGATATCCTTTAATAGAATACTTTTGTTCTTAGTTAAATAAAAAAATATTTATTTAATTATTAATTAAAATAAATAATAAAATGATTTCTTTTATTTTAAGATAATTAAATAAATGTTTGAATAACGGTTAGATAATTACTTTAACATTAATTTCATAGAATTATATCTATATATATTATTTTAAATATACTCATGAAAACATTCTATAACTACATATAAAAAATATATTTTTTAATTATTATTAAAAGGTAATTACAACAAAGATTGCAAAATCTAAAAATTAAAACAATTAATAAATAATTTATATTATTAAGGTTAAATTTAACTCAAAAAATAATTTTGAACAATTATTTTTATTGATAGTTACAGAATATAACTTTATATTTTTTATTAATTATTGAAAAATAAAAATTATATGTGTTTTGATATGATAAAAATATAAACATACATTTATTGAAAATTTCTCTAGTTAATAATAATAATATATTATTTTGAAACTTCTCTTAGACACTAACACATCTCCACTTTCAAAAGCACCCGATTTATTAACATTTGATTAAGTTTTACAATATTTTTTATATGGTTAAGAGATTATAATAGTTATAAAATTAACTATTTTATTACTGGGTATAATGTAAAATTTGAGAAGAAAACAGAAATTGATTGAAATCAGTGAATGTTATGGATGGCTTACTTGAATGGAGTTTCCTTTATAACTTGGAGCATGACAGAGCAAAACCCAAATGGCTGAGACAAAGCTCGATCTGATCTCATGTTTATGTTCTGACTATGTTTGATTCCGGTGTCTGAGGAGAGAGTGTGGTGTTATTGATAAGAGTGTGAGAAGTGGAAGTAACAGAAAAG


Gene Sequence:
>Vu_12994(-)
ATGAACAACAGTGGTGGAGGGACTTTGATGGGATTGAGCAATGGTTACTATGGGAGGTCGCCATTCACAGTGTCTCAGTGGGAGGAACTGGAGCACCAAGCTTTGATCTTCAAGTACATGCTTGCGGGTCTTCCTGTGCCTCAGAATCTGGTGCTCCCCATTCAGAAGAGCTTCAATTCTATACCACATGCCTTCTTTCACCATCCCACATGTCAGTTTTCCAATCCTGTTTCTTTTCTGTACGATGAGCTCTTTTCAGCAATGGTTACAGTTTTTCCTGTTTTAAACAACTCAAATTTTAAGATTAGGGTGTTTTTGTTTTTGAGTTTTTCTATGTTTTATTATCATAATGGTGGTGTCATGTATGTGAAGGCAACATCAATGTCTTTCTTTCAACCCTAAATGCTTCACATTGCTATATTTACCCTTTGTTCCTGAATGGCTTGGTGAGCTTATTAGGATACTCTCTTTACACTTTTGGAGGGTTTTATTTTGATTTTTGCAATTAAACTCACTAACCAGTGAATTCATAGTCAATTTAGGGATTTTTTAACTTTATGGATGAGATTCTTGAGACAGATTTGTGATTGCTTATGTTATACTATGATATTGGGTATTCAGTTCTGGAGATTTTGAACCTATTAGCTATGTAAAATGTGTGCCAAAACTTCCATTTTTGTCTTTTTTGTTGGGTGTGTTTGGAATGTTGGTAATGAAAAGCTGTGCATGACAAACTTTGCAGTGAGTTACTGTTCCTTCTATGGGAAAAAGGTGGACCCAGAGCCAGGGAGATGTAGGAGGACTGATGGAAAAAAGTGGAGGTGCTCCAAGGAAGCATACCCAGACTCCAAGTACTGTGAGCGCCACATGCACCGTGGCCGCAACCGTTCAAGAAAGCCTGTGGAATCACAAACTATGACTCAATCCTCTTCGACTGTCACAACACTTGATGTCACTGGTGGCAGTGGCAGCAGTAGAACTGTAAACTTCCAAAATCTTCCTGCAAATGCTGTTGGTAATCTCCAGGGTACTGATTCTGGAACTGACCATACCAGTTATCATCTAGATTCCATTCCTTATGCCATCCCAAGTAAAGAATACAGGTATAGAAATCCTTATCATATTTTGCATCTGTTGTTTGCATGGAGTTTGAACTTATTTATGCTACAAAGAACACAATAGCAAATATATCTTTAGTTAAGGTCGTATTGCTTGGTATATTCTATGGAACTGCCTTCACTTCTTCACTTTCTTGAATTTAAATATTTTAGTCTGAATTTGTGGCAGTTTTCTTTGATTAATTTGAGGATAAAATTCTGTATATGGGTGGTGACATATTTATATGGTGGATTTCTAACATTGTCACAGAGATCTGCAGGCATTATGACTAGTTGTTAGAATGTTATACTTCAGAAGTGTCTATTTCTTTCTGTCTGTTGTCAAAATAAAGTCCAGAGCTGTTGGCTGCCTTGCTTTGCTTCAGCTTCTGTATTTTTTTTCAAATATTGATGGGGGAATTGTAGTTTTCATTAATCTGAACTCATACTTTGTTTATTTTCGTTTGTTGTTTTATGTTACCTTTTCTAGTGTTGGATGATGCTCAGACATGTGGAATAGGTACTAGATTTTGGAGACCTTCATGAATCAAGATTGTCTTCAAACTGCGTCTTGTTGGGAACTTTGACAAAAAATGGTCCTCTAGTTGTCTCTTTCTAGTTTTTCATTTTCTTGCACTGATTTATTTCTGACATGCAAAGTGCAAAGTGAAACTGCTTTTAAATAAAATGTTGAGAAACATTTTAGCATGTCTACTGTATCTGTTCGTGTGGGGATGACGAGAAAGGTGTACACGGCATGGGCAGAATAATTACTCCTAATTTTGTTTGGGTAGAAAGGATACACAGTTTTCAATGCTGAACTACACGACTGTATCGTCCTTTCTCTTCATGCCCTATTGAACATAGCTGTGTATTTTGTTCTGTTCCTCGTAGCCATATTGCTTTGTTCTTTCTTAAATTGTAAATTACAGATTATAAGACAAAAGTATTACTGTTCCTCTTAATATTTATGTGAGATTACAATTAAATATCAAATTGATAAAAATTTGCTGATTGTGGCAACCTGGGAATTTGTTCTAAGCTTTAACTTTAGCAGTTTAGCCAAATCTGGTTAGAAAGGGACTGCAGTCACTCACTCAATGAATTCAAAGATTTTATTGTACCCTGTGCAGTTTTAACTACTGGTATTTTTTCAACACCTTTGTTTTCTTATGTTTCAACTAATCCAGCTTAATTAGGATTTTAATTTAGTACTTTCATCATCTAATGGTGTTGTTTTTCTTTAATTCATTGTTCCTTCCACCATATTATTTGAATGTTGCAATGTCAGTTCATTCAAACCAGTGAGTCCTCAAAGCTTTAATTTCATCGATTACTAGAACAATTGTAACCAACCTTGTCCAGGATACGACTCTTTGCATCATTCTTCAATTTGTCCTTGTTTCTAATGTCATGTAATCACCATCGTGATTATTTGTTAGTAAGCACCTTGTTCTACAGTGATGACAAGTTTCTGCATAATTTAACATGACTATTAAACGTTTTAGCAGTGTCAATTATATAATTGCTTATCTCTTGAACTGTGTGCAATTTTTCTTGAACCAAACAGGTATCTTCAAGGACTTAAATCTGAGGGTGGTGAACATATCTTCTTTTCTGAAGCTTCAGGAAGCAGCAAAGTTCTCCAAATGGAGTCACAACAGCTGGAAGACACATGGTCTTTGATGTCTAACAAAGTTGCCTCTTTTTCTACGTCAAAATCAAGTAATGATTCCCTGTTGCATAGTGATTATCCTCAAAACTCGTTTTTATCTGGTGAATATGCATCAGAAGAGCACCTGAAGGAGGAGGGTCAGTCTCTTCGACCCTTTTTCAATGAATGGCCAAAAGGCAGGGATTCATGGTCTGGTCTGGAAGATGAGAGATCTAACCAAGCAGCTTTCTCCACAACTCAACTTTCAATATCCATTCCCATGTCTTCTGATATCTCTGCAACGAGCTCTCAGTCCCCACACGGTGAGAATGAGATTCAATTTCGGTAA