Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12790 LG3 20397712 20400523 basic leucine zipper 23-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 20397716 3_prime_UTR_variant
A/C 20397721 3_prime_UTR_variant
C/G 20397782 3_prime_UTR_variant
C/T 20397807 3_prime_UTR_variant
A/C 20397910 3_prime_UTR_variant
T/C 20398206 3_prime_UTR_variant
A/T 20398207 3_prime_UTR_variant
A/T 20398323 3_prime_UTR_variant
G/A 20398363 3_prime_UTR_variant
G/T 20398686 3_prime_UTR_variant
A/G 20398789 downstream_gene_variant
C/G 20399167 downstream_gene_variant
G/A 20399391 downstream_gene_variant
A/G 20399723 synonymous_variant p.Ile161Ile
C/T 20399729 synonymous_variant p.Gly159Gly
T/A 20400234 splice_region_variant&intron_variant
A/T 20400237 splice_region_variant&intron_variant
C/G 20400253 downstream_gene_variant
T/A 20400267 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12790.1
MDDGELDFSTQEVFSSPNMGELPSSGSMDSFFDELLKDTHACTHTHTCNPPGPDFSHTHTCYHVHTKIVPAPDEDQVATDDTAESAEKKSKKRPLGNKEAVRKYREKKKARAASLEDEVVKLRALNQHLMKKLQNQAALEAEIARLKCLLVDIRGRIEGEIGSFPYQKSPNANPPVVNLPGSYVMNPCNMQCDDRVYCLHPGADGRIVENVSLNGEEFGGCEFENLQCLANQNLGLKELRACGVGQAGSNVNSSASKRKGGSRAATAG*


CDS Sequence:
>Vu_12790.1
ATGGACGACGGCGAGCTCGATTTCTCGACGCAGGAAGTGTTTTCGAGTCCGAACATGGGGGAGCTTCCGAGCAGTGGTTCCATGGACAGTTTCTTCGACGAGCTTCTCAAGGACACGCATGCCTGCACGCACACCCACACATGCAATCCTCCGGGGCCCGATTTTTCGCACACTCATACGTGCTACCACGTGCACACCAAAATCGTGCCGGCACCTGATGAGGACCAGGTGGCCACCGACGACACGGCGGAGTCCGCGGAGAAGAAGTCGAAGAAGCGGCCCCTTGGTAACAAAGAAGCGGTTCGAAAGTACCGTGAGAAGAAGAAGGCTCGCGCGGCCTCGCTGGAGGACGAGGTGGTGAAATTGAGGGCTCTCAATCAGCATTTGATGAAGAAGTTGCAGAACCAGGCTGCTTTGGAAGCTGAAATCGCGAGGCTGAAGTGCTTGCTGGTGGACATAAGGGGCAGGATTGAAGGGGAAATTGGTTCCTTTCCGTATCAGAAATCGCCGAATGCGAACCCTCCGGTGGTTAACCTGCCTGGTTCTTATGTGATGAACCCTTGCAACATGCAGTGTGATGATAGGGTGTATTGCCTTCATCCAGGAGCTGATGGGAGAATCGTGGAGAATGTGTCGTTAAATGGGGAAGAGTTTGGTGGTTGTGAATTTGAGAACCTGCAGTGTCTAGCAAACCAGAATTTGGGGCTCAAGGAGCTGCGTGCATGTGGAGTTGGGCAGGCAGGGTCAAATGTAAATTCTTCTGCGTCAAAAAGAAAAGGGGGATCTCGTGCAGCAACAGCTGGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_12790::LG3:20400523-20402523(-)
CAAGATTTTAGGAAATTAGTTTCTTAACAAATATCTAGATTTTAAGAAACTGATTATTCTCTTAACAAATTTCGAAATTTTAAGAAATTAGTTATTTTCTTTAACAAGACACCTTAAATAAATCTTCTTTCTATATGATATAGTGTTTTAGTATTCTCTTTTGCTTAAATTATCATTTAAACAAAACTACATATATTTTAAAACAAATAACAATACAAAGTTTTTATAATATAATAATATAATATCAAATAATAATAGTAAATGTTTCAGTTATTTGGAGCTAAGTCACCAAATGCCTCCACAATTTGTCTTCTTATACGAAAACCCTTGGAGATTTGATAAAATAGTAGTGAATGTGCAGTAAATGCAACCTATCTACCACTTACCTCTGACCTGTATTTATAGTTTTTGCTATGAGCTTGAGATTAGTGAGAAGTTAATCTTGGTCCAATTCCAACCCAACATATCTAATCACTTTTGACCTTAATCTTCGTCTTAATGACCTGGTTTATTGATTGGCTGGTTTTGCTCCACTCCCACACGGTGAACCATCATAAATATTTATGCAAGTTGCTCATAATGCTGTCAAAGGAGTAAAAAGATAAAAGAAATATTGGCTGTCACAGAAGTTCCAACCCTACTTTCGGACCGTCCGGTTTATATGTTACAGTAAAGATTTCCAATACAAGATTGCATGAAATATATTTTACTTCTCGAAATCTCTTTCAATTTTGGTTTCATTTTTTTACCGTCTCATTTTGTCCAATTTAAAAATACTCAAATTTAAATTTAAAGTGTGGCTGTAATGATTTATAACCGCCTTTAAGTGATAATTATAAATCACATCATGAAATTGAAGTACTTTAAAAATTAGAATAATAAAAATAAAAACACTTGTTTTAAGAAAGAAAACCAACATTAAAAGATTTTAAAATATTCAAAGTACATGTTTTTATACCTAAGATTGAAGAGTGTGTACGTGGGAAGTAACTGGTCTTGGTTTGGTAGGCGGACGAAATCAAAACCTTATTTGAACGACGTAATAAAACATCAAATTAAATGTTTGACTTATAGCTTTTATAATAGAATAATGATATTGATTTAAAATTAATAATAATAATCATAAATATTAATATAGTAAATAACGTTAAAATATTATAAAAAAATATTATGAAGGTATCATTATCTTTATAATATTTCCCTCACATTTCATTTGTTTTCACGTTTCATTTGTTTTCACGTTTCATTTGTTTTCATTTGAATTGTTTTTTACTGAACTTGTTAGAAGTTATTAAATAATTTCCTGGATAAAATTCTCCAAAAGTAATTATAAAAAATAAAATAATAAAGTAAAAAAAAGTTTCCATAAAATAAAATCAATTATATATTAATTAATTTATTTATAAAATCTACTTTTTAACTTTATTTAAAAGAGGTTTCTTAACCTGTACATAAAATTATATTATTCTTCTACTTATTTTTCGTCCCGTACTAGAAATGCGATTTTTCTATTCTACCCACTGTATTTGAAAAGGATTGAAAAGGCGAGAGTAAAAGAAAAAAATATGCTAAAGTCAGCATGTTTTTTCGTGTTTTTTATTTTTGATTTATTCAACTTTTTACTTATACTACATTTTGCTCTAAAAACTAATTTTTGAAATCGAATTTATAGAAAGAAAAAACAAAATCAGAATTAAATGGTGATGGGTGATGATAATTGTGGTATTATTTTAATTAAAATAAAGCTATATGTTAGTGGAAAAGGAATATAGCTATATGTTAGTGGGTACAAGGTAATAGGTGAGAATCTTAAGCCCATTAAAATAAAGTAATCTGAATTACTTTAGTCGAAGATTGATGATTAAGTTTGAATTTGTGTTGGATTAAAACAAAGAATAAAAACTAAACAGAAAAAGGTTTACATAATCACGTTCTCACAAGATTCCTTGTCTCTCCTTAAAAAGGAAATTATAATATTATTATGATATTTATGAACCGCT


Gene Sequence:
>Vu_12790(-)
AATCTCTGAAAGAGTGTTTGGGAAGAGGGTTGTTCTAAGAATCAGAATTTACAGTGGGAAGAGGGTAATAGGTATAAATTTGAACCCATTGAAATTGAAGAGAGAGAAAATCGACAAAGAAAAAGTTGAGGGTAGAATCTGTGAAGCTATCGTTTCTTTCTGGTACGTCCATTTTTTGCTTTTCTTTCTGTTTCCAAATCATGTTAGGGTTTCTACACGATTCGATGTAATCCTCTGTATGCACGATTCCAGGTTCAGTTCAATTTAATTGAAATAGCACATTTTTTTAATAGGTCTGATTTGGGGATTTCCGTTCAAATGGACGACGGCGAGCTCGATTTCTCGACGCAGGAAGTGTTTTCGAGTCCGAACATGGGGGAGCTTCCGAGCAGTGGTTCCATGGACAGTTTCTTCGACGAGCTTCTCAAGGACACGCATGCCTGCACGCACACCCACACATGCAATCCTCCGGGGCCCGATTTTTCGCACACTCATACGTGCTACCACGTGCACACCAAAATCGTGCCGGCACCTGATGAGGACCAGGTGGCCACCGACGACACGGCGGAGTCCGCGGAGAAGAAGTCGAAGAAGCGGCCCCTTGGTAACAAAGAAGCGGTTCGAAAGTACCGTGAGAAGAAGAAGGCTCGCGCGGCCTCGCTGGAGGACGAGGTGGTGAAATTGAGGGCTCTCAATCAGCATTTGATGAAGAAGTTGCAGAACCAGGCTGCTTTGGAAGCTGAAATCGCGAGGCTGAAGTGCTTGCTGGTGGACATAAGGGGCAGGATTGAAGGGGAAATTGGTTCCTTTCCGTATCAGAAATCGCCGAATGCGAACCCTCCGGTGGTTAACCTGCCTGGTTCTTATGTGATGAACCCTTGCAACATGCAGTGTGATGATAGGGTGTATTGCCTTCATCCAGGAGCTGATGGGAGAATCGTGGAGAATGTGTCGTTAAATGGGGAAGAGTTTGGTGGTTGTGAATTTGAGAACCTGCAGTGTCTAGCAAACCAGAATTTGGGGCTCAAGGAGCTGCGTGCATGTGGAGTTGGGCAGGCAGGGTCAAATGTAAATTCTTCTGCGTCAAAAAGAAAAGGTTCGACCGCTTCACATGCACTGTCTTATTCTAGGACGAACTGTTTGATTTGCTGCTTAATTTGTGTTTATTCTTATTTATATTTTAATTGCTGGCTGATGGTATTGTCTAATAGCATAGAAAATCATCGAGATTTGAGAGAATGAAAGAAAGAGTATTGAGATTTGAGCAATGAGAGCGAAAGCATTGGAGATGACTTGCTTTGCAACGTGATCTCCCGCATCTTTTGTCATGAATTGTTGGGAATTCTGATCTCAGATGGTCACGCCGAAACAACCTTTTTGTTTATATTTGGTATTGTTTCTTTGCTAACATTCGTTAGTGTACTCATATTTAGGGCTGAAATTTGATTGCTAAATTTTTTATAAGGTCTTAGTTAGCTTATATGATAGTGCCAAGTGTGGAAAGGGTAGTATTCCTATTTGTAAGATGTGGTAAATTAACTAAAGTTCGCCCATATGTGTACGCATGAGTGATCTCCATCGGGAAGATTAAGCAACTGAAATTTAAAGATTTTAAATACCAAATTATTTTATTGAACATTTTTTACACTCTACTAAGAGTGTTGGAACTAGACTTTCTTTTTCAATTTTGTTATTTAAATCTGTTTCTCCCCGTTTCTCTATGAATTCTCAAGTTCAGTATGATAACTTCGATTTTTATTTTTAGGGGGATCTCGTGCAGCAACAGCTGGTTGAAGAATTAATAGAACGTTGGTTTTCATCCTTGCCATGGTAATATCTCCTTCCAATATCTCGTTACCAGTTGCAGCATCAGCTATCCATCAAGTCATTTTTTAAAATAATTCTCTCTTTTTGACCCTCTGCTGCATTATCGTGGTTCGAATGGCTGTTCTACTATGGAAGATTAGTCATAAATCAATGTTTCTTCTTAAAGTATTATGGTTGATCTGTAAACAGCATAGCTTATGGCTGAGACAGATTGGGCTCTTCTCTGCGCAATTAATTTTCTTGCTTTTTTATGCATGGAACTAGTTAAATTGACATCATAAATGTGTCTATGCTCAGCCACTTTTACATTTCTCAGTTTGTGAGTATTGGTTGCTTTGTTTAACAATAAGAGAATTTTTAGTGGCGATTAATGTTTTCTAAATTCGCAAGTTTTTCCTTGATGGATTACAGAACTTAGGGCAGATGGGGTGTGTTTCATCTTTCAGTACTTAGTGCTGTGGACAGGTGAGACACCGGTGTCACTTTGTGTAATATTAAATGTTGTGTGGGTGAAATAATAAAATTAGCTTGTTTGGTTGCCGGCGTTGTTCTTTTTCCGTCTTTGTTTATCATAATAATATGAGAGGTTTACTTGTGTGTTTAGCATTTTTACTGGACAAGGGTTGACTAATATGTATCCAGAAGGAACTGTAGTCCCCTAAGTGAAGATCTTGCATGCGGGCTTGTCTTCTACAAGTTGAGACATACAAGTGACTTGTTTTGTATTTGAGAACGCTAGTAGCTGTACCTGATTCAATGATGGGAAGCATATCTGCCTTTCTGCACTTAGATAACAAGTCTTCACTAGTTTTTGGTGACCATCTTTTCGGCATTAGATGATTAATAAAACATTATATTATTGTATCTTCTACTTGGATTGTCATTTCTGGACAAATTTTGTAATAATTAACCTCGCATTGGTTTCTCGTTCAACTTATTATATATACATCAGGATTTCGGGACTAAATAAAATTTTAATACTATG