Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12756 LG3 19996280 19997355 PREDICTED: B-box zinc finger protein 20-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 19996368 missense_variant p.Arg30His
G/A 19996389 missense_variant p.Arg37Lys
G/A 19996421 missense_variant p.Gly48Ser
A/G 19996582 intron_variant
C/G 19996781 missense_variant p.Thr123Ser
C/G 19996814 missense_variant p.Ala134Gly
T/C 19996830 synonymous_variant p.Leu139Leu
G/A 19996839 synonymous_variant p.Ser142Ser
A/G 19996893 synonymous_variant p.Ser160Ser
T/C 19996920 synonymous_variant p.Phe169Phe
G/A 19996953 synonymous_variant p.Ser180Ser
G/A 19997220 synonymous_variant p.Ser241Ser
C/T 19997253 synonymous_variant p.Ala252Ala
G/T 19997255 missense_variant p.Gly253Val
C/T 19997292 synonymous_variant p.Ser265Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12756.1
MKIQCDVCHKEVASFFCPADEAALCHACDRTIHHANRLAHKHKRLSLGHPTSIAATLCDICHEKRAYVFCRQDRALLCRQCDVSIHDVNEHTKTHDRFLFTGITLEEKTRTTSTSSTSNPAQTSLSNENIDSFASSRTLNNSSSVLTGITLEEKTTSTSSTSNENIDPFGSSRTVYNSNSVSTSSLSEYLIQTIPGYCMEDLLDASFAASNAFSKDYEFPNEDVQVSMCSIPLQTQFNTASNVYPEMPKAKAGEGYSDWIHNSDSAAYKVPSITSPLVKKIKRSR*


CDS Sequence:
>Vu_12756.1
ATGAAGATCCAGTGTGATGTCTGTCACAAAGAAGTCGCCTCCTTCTTCTGCCCTGCAGACGAAGCAGCTCTCTGCCATGCTTGTGATCGCACCATCCACCATGCCAACAGGCTCGCTCACAAACACAAACGCCTCTCTCTCGGCCACCCCACCTCCATAGCCGCCACTCTCTGTGATATCTGTCATGAGAAGCGCGCCTATGTCTTCTGCAGACAAGACAGAGCTCTCCTTTGCAGACAATGTGATGTTTCCATCCATGATGTCAACGAACATACCAAGACGCACGACAGGTTTCTTTTCACTGGAATAACGCTTGAAGAAAAAACCAGAACAACCTCAACCTCGTCAACCTCAAACCCCGCACAAACTTCACTCTCGAACGAGAACATTGATTCTTTTGCTTCTTCTCGCACACTTAATAACTCGAGTTCGGTTCTCACTGGAATAACGCTTGAAGAAAAAACAACCTCAACCTCATCAACCTCGAACGAAAACATCGATCCTTTTGGTTCTTCTCGCACAGTTTATAACTCGAATTCGGTTTCAACAAGTAGCTTATCCGAGTACTTGATTCAGACCATTCCCGGTTACTGCATGGAAGACCTTTTAGATGCTTCGTTTGCTGCATCAAATGCTTTCTCTAAGGATTATGAGTTTCCGAATGAAGATGTTCAAGTTAGCATGTGCTCCATCCCACTGCAAACTCAATTTAACACTGCTTCGAATGTTTATCCTGAAATGCCAAAAGCTAAAGCCGGTGAAGGATACTCAGATTGGATTCATAATTCTGATTCCGCAGCCTATAAAGTTCCATCGATTACTTCTCCTTTAGTAAAAAAAATTAAACGCTCTCGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_12756::LG3:19994280-19996280(+)
CACATTAGGAGTTAAGATTTTAGAAAATTAAATTTTGTAATATAAATTATATCATTATGTCAAATGTTGAAAACATATTAAAAAAAAAGTGTTCTATGAGAAAACGAGTTACGTAAAGTTTTTCAATTTTGTCTTATATACAAAAGTGATATATACATATTTACTAACTTTAAAAATTTTAAATATTAATTAGATATGTTCAGAAATGAAAAAGTTAAACATATTATAAAAAAAAAATACTTAATATTTTGGATTTGAGTTAATCTAAGTATAAGTCTCTTAGGTAAATTCTACTTATTTTTAATTTCTAGAATAAATCTATGTAAAGATCTATCATTATAACTTGTGGTTTATTTTGGTAATTGATTTCCATAGAGAATGTTATATATGAAGATTCTATATATAAGTTTTTTTTTGTGACAATAATTTTATCAACCTTAATATATTATTTTGACAAAATAATAGTATATAAAAGTCACAATTAAAGTACTAATGATTGGTATATGGAAATATGAAAATGACATATCTTAACAAAAAGATGATTAAGAATGGAATATAGATCTAAGTCTAGTGTTAATCAAATATATAATTTATAAATAATTTAAAGAAAAAAAATAATATAAATTTGTTACATTAAATTTATCTAATTCTTTTAATATTTATACCCAATTCAAAAAATTATAAATTATTTATATCTATATTTAATTTTAAAAAATATTACTCATACTCTATTACAGTATTTTGCGAATACGAAAATTAAAATAAAACGAGATAATAACTTGAAATAAGATTCTAAAAAGATAAAATAAAAACTTATATTTCCAAAATCTGACAACGCTGCAGTATCCCCGTTCCCTGCTGTATATCTATGTAGCTGGCAAATGCATAAAGATGTACCATGATTTTCATAAAATAATAATATTGTAAAATAATTCATATTAACAATAAAAAAAAGAGACATAATAATTTAGATTACTTTAATAATTTTTTAATTATTCATCGACTATAACATTATTTTATATTTTTATATTTCCTTAGGTGGTTGAATTTTCTTAAAATAAAAAACTTATATTTTTATTTTATTTTTGTAAAATAAAAAAAACATTTATTTTACTAATAAGTGAGTAAATTATTTTTTATTTATTAAATAAAAAATATTTTTAGCATATGCTAATTTAGAAAATAATTAAATATACTTTTATTCTTTAATTTCAAGAAAAAATAAAATTAGTTCTTCTTCAAAATTTTGAATTATTACAGTATTTAGTTTTTTTAACCAAATTCTATTAATTTTATTAAAAATTTTAAAAATATTTCTCAACTAACATTTGAAAAACATGTCAAACGATTAAAATATTATCATAAATATATTTAAAAGTTAAATAAATTGAACAAAATTTAATTAAATTAACATATTTATAAAAGTTTGATATTATAAATACATTTAAATATCAAACAAATTTAATAAAATTTGGTTAAAAAAATAAACTCACATATTTAAAAATTAAGAAAATAAATTAGTCAATTTTTTAGTAATATTTGTAATAGTTTTATACGAAAGTTTGGTATAACTTTGAAAATCAGATATTTTATTTATTTTAATTCACAAAAATAGTTTTACGAGAGAGACAGTAAATTATTACATACTCCACCTTAAAGTTGTACCCGAATAATAATAGGTCCGAATCAAAGAAACTGAGAAAATTTTTGCTATAAAAAATAAAAAAAGAAATTAGGTCAAGTTGCTTCCTTGAACTTTACTCAAAGAAAGAGAAAAGAAGAGACAGTCATGGATACATCCATGTCTTTATCTCTTAAGGCATTCATCCAGAGATGTTCAGAAAATACACACTTAATACCCTTACCTGTTTTTCCTGGACCACGCGAAAACCCCATCATTTTTTTGTCTTTATTATAATTCTCTTCACCTCATACTCAAAACAAACCAAACCAAACCCATCAAACATTCAACAACATAAACACAACACAAAGCAGAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_12756(+)
ATGAAGATCCAGTGTGATGTCTGTCACAAAGAAGTCGCCTCCTTCTTCTGCCCTGCAGACGAAGCAGCTCTCTGCCATGCTTGTGATCGCACCATCCACCATGCCAACAGGCTCGCTCACAAACACAAACGCCTCTCTCTCGGCCACCCCACCTCCATAGCCGCCACTCTCTGTGATATCTGTCATGTACCTCCTTTTTTCTTTCCCTTCTCTGTCACTGTGTTTTTAAGCTTTAAACTAGTCCCATATTGATCAAGAATCAAATCTGCAGAGAAGACATACAGCATAAAACATCTCACGTTATTTAAATTCTTTGGCAGGAGAAGCGCGCCTATGTCTTCTGCAGACAAGACAGAGCTCTCCTTTGCAGACAATGTGATGTTTCCATCCATGATGTCAACGAACATACCAAGACGCACGACAGGTTTCTTTTCACTGGAATAACGCTTGAAGAAAAAACCAGAACAACCTCAACCTCGTCAACCTCAAACCCCGCACAAACTTCACTCTCGAACGAGAACATTGATTCTTTTGCTTCTTCTCGCACACTTAATAACTCGAGTTCGGTTCTCACTGGAATAACGCTTGAAGAAAAAACAACCTCAACCTCATCAACCTCGAACGAAAACATCGATCCTTTTGGTTCTTCTCGCACAGTTTATAACTCGAATTCGGTTTCAACAAGTAGCTTATCCGAGTACTTGATTCAGACCATTCCCGGTTACTGCATGGAAGACCTTTTAGATGCTTCGTTTGCTGCATCAAATGCTTTCTCTAAGGTATCATATTTAGTTGCAATTTAATTAATAATACTCATTAATTACGGTTAACTTTAATTAAGTGTTTATTTTTGTTTCATTCAGGATTATGAGTTTCCGAATGAAGATGTTCAAGTTAGCATGTGCTCCATCCCACTGCAAACTCAATTTAACACTGCTTCGAATGTTTATCCTGAAATGCCAAAAGCTAAAGCCGGTGAAGGATACTCAGATTGGATTCATAATTCTGATTCCGCAGCCTATAAAGTTCCATCGATTACTTCTCCTTTAGTAAAAAAAATTAAACGCTCTCGTTGA