Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12544 LG3 17966448 17969389 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 17967453 missense_variant p.Glu234Lys
A/T 17967469 missense_variant p.Glu239Val
A/G 17967571 missense_variant p.Gln273Arg
A/G 17967587 synonymous_variant p.Pro278Pro
A/T 17967601 missense_variant p.Lys283Met
G/A 17967906 missense_variant p.Ala385Thr
G/T 17967914 missense_variant p.Gln387His
T/C 17967918 missense_variant p.Phe389Leu
C/A 17967932 synonymous_variant p.Ser393Ser
G/T 17968265 missense_variant p.Glu504Asp
T/A 17969185 3_prime_UTR_variant
T/G 17969190 3_prime_UTR_variant
A/T 17969198 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12544.1
MEHPNFFFGEEEDDMAHLTDPLVFPTLDPSSRDPSLEDNDFSETAKFISQILMEENVEHKPFYDSLTLQVTEKSFYDALAGNLPPSPNQHPLAFSPEAETTTTTTTASTSSNSSNNNFSDENSSELKLPSPDSVFKFNSRALSQPSPSITANHGLQDLDFSIAKLLSQNIFNDVDSVSQFRRGLEEASKFLPPGPNLVTGLGSNGEQAFNKFGDTSYGLSGKNHKRDERYAIEEEEEEEGRSNKQTALSHVDESDLSDAFDRVLLHEGNMCSQINSLPGGAVKVDEADGGKSRSRKKERNKETVDLRNLLLMCSQSVYANDNRTANELLKQIRQHSSPFGDASQRLAHYFANGLEARLVGDGTVAQGMYSFLTSKRSSAAEFLKAYQVFLSASPFKKFTYFFANKMIMKAAAKAETIHIIDFGILYGFHWPILIKFLSDREGGPPKLRITGIEFPQPGFRPSERIEETGHRLANYCKRYKVPFEYHAIASRNWETIQVEALKIESNEFVAVNCHMRFENLLDESIEVDSPRNAVLHLIKKINPNIFTQSITNGSYNAPFFATRFREALFHYSAIYDMCDTVMPRENEWRLMIERELLGREAMNVIACEGSERIERPETYKQWQARNTRAGFKQLPLNPELMTKFRTKLKEWYHRDFVFDEDNNWMLQGWKGRILYASTCWVPA*


CDS Sequence:
>Vu_12544.1
ATGGAGCACCCAAACTTCTTCTTCGGTGAAGAAGAGGATGACATGGCCCATCTCACAGACCCGCTTGTTTTTCCGACTTTGGATCCTTCTTCCAGAGACCCTTCGCTCGAAGACAACGACTTCTCAGAAACTGCAAAGTTCATCAGCCAGATCCTCATGGAAGAGAACGTCGAACACAAGCCATTCTACGACTCACTCACCTTGCAAGTTACCGAGAAATCCTTCTACGACGCTCTCGCCGGTAACCTACCTCCTTCCCCCAATCAACACCCCCTTGCTTTCAGTCCTGAAGCTGAAACCACCACCACCACCACCACCGCCAGCACCAGCAGCAACAGCAGTAACAACAATTTTTCAGATGAAAATTCCAGTGAGTTGAAGCTTCCTTCTCCAGATTCTGTTTTTAAGTTTAACTCCCGCGCCCTTTCTCAACCGTCTCCCTCAATTACCGCCAACCATGGACTCCAAGATTTGGATTTTTCTATTGCCAAACTCTTATCACAGAATATTTTCAATGATGTGGACTCCGTTTCCCAGTTTAGGCGGGGCCTGGAGGAAGCTAGCAAGTTTCTTCCTCCGGGACCTAACCTTGTGACTGGTCTAGGTTCAAACGGAGAACAAGCGTTCAATAAGTTTGGAGATACCTCGTATGGGTTGAGTGGGAAAAATCACAAGAGGGACGAGAGATACGCTATAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGGGAGAAGTAACAAGCAGACAGCACTTTCCCATGTCGATGAAAGTGACTTGTCTGATGCTTTCGATCGGGTGTTGCTTCATGAGGGAAACATGTGTAGCCAAATCAATTCTTTGCCAGGTGGAGCAGTGAAGGTTGATGAAGCAGATGGAGGGAAGAGTCGTTCAAGGAAAAAAGAGAGGAACAAGGAAACAGTTGATTTGAGGAATCTTTTGCTGATGTGCTCTCAATCTGTCTATGCCAATGACAACAGGACGGCCAATGAATTGCTAAAGCAGATTAGGCAACACTCTTCTCCCTTTGGAGATGCATCACAGAGGTTGGCTCATTACTTTGCCAACGGCCTTGAGGCACGCTTGGTTGGGGATGGTACAGTTGCACAGGGCATGTATTCTTTTCTGACCTCTAAGAGGAGCTCTGCTGCTGAGTTTCTCAAGGCATACCAGGTTTTCCTTTCCGCTTCCCCTTTCAAGAAGTTTACATATTTCTTTGCGAATAAAATGATTATGAAAGCAGCTGCAAAGGCAGAAACCATCCATATTATTGATTTTGGCATCCTATATGGTTTCCACTGGCCAATTCTTATTAAGTTTTTATCAGATAGAGAAGGTGGTCCTCCCAAACTGAGGATCACAGGGATAGAGTTTCCCCAACCAGGCTTTCGTCCCTCTGAAAGGATTGAGGAGACGGGTCACCGTCTTGCTAACTATTGTAAGCGTTACAAGGTTCCCTTTGAATACCATGCCATAGCATCAAGGAACTGGGAAACTATTCAGGTGGAAGCCCTTAAAATTGAGAGCAATGAGTTTGTTGCTGTCAATTGTCATATGAGGTTTGAGAATTTACTGGATGAGTCTATTGAAGTGGACAGTCCTAGGAATGCAGTCTTGCATTTGATCAAGAAGATAAATCCAAATATTTTTACTCAGTCCATCACTAATGGATCATATAATGCCCCCTTCTTTGCCACAAGATTTAGGGAGGCTTTGTTTCATTATTCTGCTATTTATGATATGTGTGACACTGTCATGCCTCGAGAAAACGAATGGAGGTTGATGATTGAGAGAGAGCTTTTGGGCCGGGAGGCTATGAATGTTATAGCATGCGAAGGTTCTGAGAGAATTGAAAGGCCCGAGACATACAAACAATGGCAGGCTAGGAATACAAGGGCTGGCTTCAAGCAGCTCCCACTGAATCCGGAATTGATGACCAAGTTTAGGACCAAGTTAAAGGAATGGTACCACAGAGATTTTGTCTTTGATGAAGATAACAATTGGATGCTTCAAGGTTGGAAGGGCCGCATTTTGTATGCTTCCACTTGTTGGGTGCCCGCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_12544::LG3:17964448-17966448(+)
ACTAATGTGAGTCGTGAAGATCCAATGAGGTTGATGTTTGAGAAAGAGTTCTTTGGTCGGAGGGTAATGAATGCTTTAGCTTGTGAGGGTTGTGAGAGGGTTGAGAGACCCGAGACATACAAGCAATGGCAGGTTAGGAACATGAGAGCTGGATTTAGGCAACTGCCCTTGGATAAACATCTCATCAACAAATTAAGATCCAAGTTGAAAGATATTTACCATAGTGATTTCATGCTTCTTGAAGATGCCAACTTTATGCTGCAAGGTTGGAAGGGCAGAGTAGTTTATGCTTCATCTTGTTGGGTGCCTGCATAGGCCTTGACAGTGATCTTCTCAGGGTAGTTTATTAGGAGCAATGTTTCATGTGTTTGTAGGTAGACATGAACTTCCACAAGTTTATTTATATGGCTTAAACTTCACTTATTCTAGAAGCTTATCCCTGCTAATGGAATCACACAAGTTTTAAATGATCAAGTCATGAGCATGACACATTCAAATGTTGAACTCTTCCTTGTTGAGTTCTTGTGATAGGTAAGCCTAAGCTGCAGAATCCTGCAGAATCCTGAGATTGTAGAAGTTGAAATGCTGCCAAATACATCCTTCACTCCACCTGAATTTTAGATTTTTGTGTATTGTCCTTGTATTTTTCAAAAAATTTCACGTCAATGTACTTTAAAAAAAAAAAAACTTATAAATGAATCTGGAATCTCCTTCATTCTTTTCTTATCCTTCAATGTACTATTACAGTGTAGCCTTCGTAATTAAGAAGATATAACTGGTATGCATATTCTCTTTCTCATGTAACCATGTATTTTCTTTATGACACATCTTTTTTCGAAGTTTGTATGATAAGATAATATGCTATTCCTTTTAATCAGTCATTTAACTAAAGGAAATTTCACTCTTATTTTTTCTGAATTTCTTAATGAATGTCTAAGTTTTATTTCTTCCTAGATTGCAATGTTGAAAATCATTTTTTTAACTTTTCACTTAACTAAATTGATTTCTTAATTACTTTTTTAAAAAAGAAATTGGTGGTATTTTATTATAATTTAAGCAGTTAGTGATGTAGCGAAATTCTTAAATAAACTATGCCATATATTATCATGATGGATTTTCACAAAAAAATTATTTAAATACTATCATAGGCTAATATTATTTATTAAACATTTAATAATCTACTTAATTTTTAAAATTGAGTAAAAATGTTTGAAAAACTTAAAATGAAGATTTATTCGCTTTAATGTTGACAGTATCTAATAAATAATAACATTTTATTATTATTTTAACTATTTTCAGTAGTTTATAACATCTAAAAATTTGAATGCTCTACCTATTCAAGAAGAGAACAAACTTCTATGAAAAGTCTCAAAACAGGAGACACGTGAACCGTGTCGGTCAAATATTGGCCTTTTGGTTCAAATACTTTTTGTTTTAATTTATATGTTCAAATACATTTATTTGTTGAAGATTTTTTAATTATAATATAATTTCTATATTTTAAAACTTATTGATTATTTATTTATTTTGGGAAATATGATTGCTAAAGTACCAGATTAATTTAACTTAATTTTTAGTCAGTAAATTAGTTTTCCAATCCCATTTGAAAAATTGAAATAACTATCTTTTTTCAATTAGCTTAAAAAAAGTAACACATTTTTTTAATTTAATGACAATTGGTTATAATAAGTTTGTTAAATTTATAATAATTATTTTAAAAAATATTTTTATTATAATTTCTTGTTAGTTGTGACTTTTAGTTTAATAGTTTTCGTTACATTGAAACTAAAAAGAGGATCTAGATCAGACGTTCAGAAATATAGGTTTTTATATATAGAAAGAATTCATTTTTCTTACATTTTGAAGCAGAATAATTTAAAAAAAATCTTACACTGTTTGAGAATGAAGACAAAAAGTACTTTCTAAATAGTTTCATTCCTTAAACGATACAGATATTTTAAAAAAATAAATAAATATCAAGAACAATAATAGATGAAATG


Gene Sequence:
>Vu_12544(+)
GATTCGGGAACATGTCTTTTGCTAAAAAAAAGTGTTGGGAAAGTGGATTAGAGCATCTTACATACCTAAATCAAGAAGTAGCAGTTTGTATGCAGTTTTAAGATTGTAGAGACATATACTTGTGATGTTCTTCTGTTCTTTGACTACAAAAGCACCCTCCTTTCAGCTCCGAACATTCGCGGCGGCATCCCTAAACTAAGGTTTTTGTCATAATAGTCAAAAAGGTTCCTTTGCCTCTGTTTTTCTTCTTCCATTTTCGATCAATTTTGTTTCTCAACACGAAAGCATAAATCTTTCACTCTTACCATGGAGCACCCAAACTTCTTCTTCGGTGAAGAAGAGGATGACATGGCCCATCTCACAGACCCGCTTGTTTTTCCGACTTTGGATCCTTCTTCCAGAGACCCTTCGCTCGAAGACAACGACTTCTCAGAAACTGCAAAGTTCATCAGCCAGATCCTCATGGAAGAGAACGTCGAACACAAGCCATTCTACGACTCACTCACCTTGCAAGTTACCGAGAAATCCTTCTACGACGCTCTCGCCGGTAACCTACCTCCTTCCCCCAATCAACACCCCCTTGCTTTCAGTCCTGAAGCTGAAACCACCACCACCACCACCACCGCCAGCACCAGCAGCAACAGCAGTAACAACAATTTTTCAGATGAAAATTCCAGTGAGTTGAAGCTTCCTTCTCCAGATTCTGTTTTTAAGTTTAACTCCCGCGCCCTTTCTCAACCGTCTCCCTCAATTACCGCCAACCATGGACTCCAAGATTTGGATTTTTCTATTGCCAAACTCTTATCACAGAATATTTTCAATGATGTGGACTCCGTTTCCCAGTTTAGGCGGGGCCTGGAGGAAGCTAGCAAGTTTCTTCCTCCGGGACCTAACCTTGTGACTGGTCTAGGTTCAAACGGAGAACAAGCGTTCAATAAGTTTGGAGATACCTCGTATGGGTTGAGTGGGAAAAATCACAAGAGGGACGAGAGATACGCTATAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGGGAGAAGTAACAAGCAGACAGCACTTTCCCATGTCGATGAAAGTGACTTGTCTGATGCTTTCGATCGGGTGTTGCTTCATGAGGGAAACATGTGTAGCCAAATCAATTCTTTGCCAGGTGGAGCAGTGAAGGTTGATGAAGCAGATGGAGGGAAGAGTCGTTCAAGGAAAAAAGAGAGGAACAAGGAAACAGTTGATTTGAGGAATCTTTTGCTGATGTGCTCTCAATCTGTCTATGCCAATGACAACAGGACGGCCAATGAATTGCTAAAGCAGATTAGGCAACACTCTTCTCCCTTTGGAGATGCATCACAGAGGTTGGCTCATTACTTTGCCAACGGCCTTGAGGCACGCTTGGTTGGGGATGGTACAGTTGCACAGGGCATGTATTCTTTTCTGACCTCTAAGAGGAGCTCTGCTGCTGAGTTTCTCAAGGCATACCAGGTTTTCCTTTCCGCTTCCCCTTTCAAGAAGTTTACATATTTCTTTGCGAATAAAATGATTATGAAAGCAGCTGCAAAGGCAGAAACCATCCATATTATTGATTTTGGCATCCTATATGGTTTCCACTGGCCAATTCTTATTAAGTTTTTATCAGATAGAGAAGGTGGTCCTCCCAAACTGAGGATCACAGGGATAGAGTTTCCCCAACCAGGCTTTCGTCCCTCTGAAAGGATTGAGGAGACGGGTCACCGTCTTGCTAACTATTGTAAGCGTTACAAGGTTCCCTTTGAATACCATGCCATAGCATCAAGGAACTGGGAAACTATTCAGGTGGAAGCCCTTAAAATTGAGAGCAATGAGTTTGTTGCTGTCAATTGTCATATGAGGTTTGAGAATTTACTGGATGAGTCTATTGAAGTGGACAGTCCTAGGAATGCAGTCTTGCATTTGATCAAGAAGATAAATCCAAATATTTTTACTCAGTCCATCACTAATGGATCATATAATGCCCCCTTCTTTGCCACAAGATTTAGGGAGGCTTTGTTTCATTATTCTGCTATTTATGATATGTGTGACACTGTCATGCCTCGAGAAAACGAATGGAGGTTGATGATTGAGAGAGAGCTTTTGGGCCGGGAGGCTATGAATGTTATAGCATGCGAAGGTTCTGAGAGAATTGAAAGGCCCGAGACATACAAACAATGGCAGGCTAGGAATACAAGGGCTGGCTTCAAGCAGCTCCCACTGAATCCGGAATTGATGACCAAGTTTAGGACCAAGTTAAAGGAATGGTACCACAGAGATTTTGTCTTTGATGAAGATAACAATTGGATGCTTCAAGGTTGGAAGGGCCGCATTTTGTATGCTTCCACTTGTTGGGTGCCCGCATAATGTATGTTACTGAAGTGGGTTCAGAACTCATGCTAGACTAAAGGTGTGATTCTAAGAATCAGTCACTGGCTTTTACTCTCTCCATTTCTTGTTTTCCCTGTCAAAGATTCGAGTTATAGTCTGCTAACATTTGCTTGTGCTTGAGCTTTGAGATATTTCAGGCTGTTGTTATGGTGAAGCTTATTTTTGCTCGTTACACTGTTTCAGGTTCTGGTACCTACTTGCTTCACCTTCAGGTGCTGTTATGAAGATTGTACCAAAATTTGCACCGTTTTACTTGGTAAAACTATGGCTTGACTTTGCTTGTAGGATAGAGACTTGTGAAAATAATGCAATTTCTTAATGGTAAGGAAGGTGTACTAGAGTAGGAGAATCCTTGTAAAATGTTTGCTAGAGTACTTGTGATCAAAATATCGAGTTATTTTCTTTCTAACCAACATGTATTAGCCATTTCACATCCTTCTATTTAAATCTGTAACACGCTGTCTCTTGAACCAAATTAGCTACTGAATTGACATGATGTAACAGATGACAATGTTCAGTTTGTTTTTCCGGTGATGCTTGCAATTTTGTTTTGTTGCAGT