Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12541 LG3 17949845 17955188 PREDICTED: telomere repeat-binding protein 5-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   is active in   cellular_component
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 17950597 downstream_gene_variant
T/A 17950663 downstream_gene_variant
T/C 17950666 downstream_gene_variant
T/A 17950668 downstream_gene_variant
A/T 17950675 downstream_gene_variant
T/C 17951221 downstream_gene_variant
C/A 17951227 downstream_gene_variant
T/C 17951683 synonymous_variant p.Asp165Asp
A/T 17951692 synonymous_variant p.Thr168Thr
T/C 17951730 missense_variant p.Ile181Thr
T/A 17951941 synonymous_variant p.Thr251Thr
T/C 17952121 intron_variant
T/A 17952124 intron_variant
G/T 17953562 missense_variant p.Lys550Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12541.1
MVLHNRIEYGFNGYQAPAMPRASRSVRRRAIFQRAEDKQKCSFDLLATVAGKLLQERENAAISSDTLSNKDQCRFVKDCHDANKPSKSELSDEGNCDKKSLNEFPHPSIDVHAKIASTVTSSSCIERFIAKKSVDGNSHIKMENVTSEVNLDSSGYPKESQFKIDGDTGKGKDGMHELEKIPIGSGIEMYSFGDTLDVNPPALISLGGSAKLSGYNDRIPCSLLSKGCDNVPVVSRDDDENSSGCTHPVNTKTKAFRPKNCIDDSGISKRLACNFQKGAQKPKYDTLSNRDGIWKKTYHNQRKCNKRQISQMNIPFKKRKLFNYKSVSNSSGFTRSGGIYYSPKNCSNPDACDSIPGMRRDPGIPSLEACQHQMSRRIGSHVKLRIKSFRVPELFIEVPETATIGSLKRTVMDAVTAVLGGELHIGVFLQGKKVRDDSKTLLQTGISHHNQFDALGFTLEPNSSQSLPIVCAAHSPCPGADVTPPVLRCPSSPVVIHQSIQGNSDTLPEHQVTSFGSQFESDNDSAPSPANTSVDKGMEDSKELVTVLEKGREELAMVSVPQKPRRSEMVQRRIRRPFSVDEVEALVQAVEKLGTGRWRDVKLCAFDNAKHRTYVDLKDKWKTLVHTARISPQQRRGEPVPQELLDRVLVAHAYWSHQQNKQQQKQHQETETVFSFNRKGQGLSSASGHVDESVLVSDFCC*


CDS Sequence:
>Vu_12541.1
ATGGTCTTACATAACAGGATAGAGTACGGATTTAATGGTTACCAGGCTCCTGCCATGCCCCGAGCTTCTCGCTCAGTTAGGAGGAGGGCTATATTTCAAAGAGCGGAAGACAAGCAAAAGTGTTCATTTGACTTATTGGCCACCGTAGCTGGTAAACTATTACAAGAGAGAGAGAATGCAGCCATTTCTAGTGATACATTATCAAATAAGGATCAGTGTAGATTTGTCAAAGATTGCCATGATGCAAATAAACCATCCAAATCCGAGCTTTCTGACGAAGGAAATTGTGACAAAAAAAGTTTGAATGAATTCCCACATCCTTCAATTGATGTCCATGCAAAGATTGCTTCTACAGTAACAAGTTCTAGTTGCATAGAGAGGTTCATTGCAAAAAAATCGGTGGATGGAAATAGCCATATAAAAATGGAAAATGTTACTAGCGAAGTCAACTTAGATTCTTCGGGTTATCCAAAGGAAAGTCAGTTCAAGATAGATGGCGATACAGGTAAAGGAAAGGATGGGATGCATGAGTTGGAGAAGATACCCATTGGCAGTGGGATTGAGATGTACAGTTTTGGGGATACGCTGGATGTAAACCCTCCTGCGTTGATCAGTTTAGGTGGCAGTGCCAAATTGTCTGGGTATAATGATAGGATTCCCTGTAGCTTGTTGTCCAAAGGTTGTGACAATGTACCAGTAGTTAGTAGAGATGATGACGAAAACTCTTCTGGGTGTACTCACCCTGTTAATACTAAAACCAAGGCTTTTAGGCCGAAGAATTGTATAGATGATAGTGGAATAAGTAAAAGACTGGCTTGTAACTTTCAGAAAGGTGCTCAAAAGCCGAAGTATGACACACTTTCTAACCGTGATGGAATTTGGAAGAAAACTTACCACAATCAGAGGAAATGCAATAAACGCCAAATTTCTCAGATGAATATTCCTTTCAAAAAGAGGAAGCTTTTTAATTATAAGTCTGTCTCAAATTCTAGTGGATTTACCAGAAGTGGGGGAATTTATTATTCACCCAAGAATTGTAGTAATCCGGATGCTTGTGACTCAATTCCCGGGATGCGCAGAGACCCTGGAATTCCATCCTTGGAAGCATGTCAACACCAGATGTCTCGACGAATAGGTTCTCATGTGAAGCTTAGGATCAAGTCATTTAGAGTGCCAGAGCTTTTTATAGAGGTTCCAGAAACTGCAACAATTGGGTCCTTGAAGAGGACAGTAATGGATGCAGTGACTGCTGTACTCGGAGGTGAATTGCATATTGGTGTTTTTCTCCAGGGAAAGAAAGTTAGGGATGATAGTAAAACACTACTTCAAACTGGAATTTCTCATCATAACCAGTTTGATGCTTTGGGTTTCACCTTGGAGCCTAATTCTTCACAAAGCCTACCGATTGTATGTGCTGCACATTCTCCCTGTCCCGGTGCTGACGTAACTCCGCCTGTATTAAGGTGTCCCTCTAGTCCAGTTGTAATTCATCAGAGCATTCAAGGCAATTCTGACACGTTACCTGAGCATCAAGTAACAAGTTTTGGTAGCCAATTTGAAAGTGATAATGATTCGGCACCTTCTCCTGCTAACACTTCTGTTGACAAAGGTATGGAAGATTCCAAAGAATTGGTTACTGTTCTTGAAAAGGGTAGGGAGGAACTAGCTATGGTATCTGTACCCCAGAAGCCAAGGCGATCAGAAATGGTACAGCGCCGAATCCGTAGGCCTTTCTCTGTAGATGAAGTAGAAGCACTGGTTCAAGCAGTTGAAAAACTAGGAACCGGAAGGTGGCGTGATGTTAAGCTTTGTGCTTTCGATAATGCTAAGCATCGGACATATGTGGATTTGAAGGATAAATGGAAAACACTAGTGCACACGGCCAGAATATCCCCACAGCAAAGAAGGGGTGAACCTGTTCCCCAAGAACTTTTGGACAGGGTTCTAGTGGCCCACGCATATTGGTCCCATCAGCAGAATAAGCAGCAGCAGAAGCAGCATCAGGAAACTGAAACCGTCTTCTCCTTCAATCGTAAGGGGCAAGGGTTGTCATCAGCCAGTGGCCATGTGGATGAGAGTGTTTTGGTTTCTGACTTTTGTTGTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_12541::LG3:17947845-17949845(+)
TCACACTTTTGACTGTCCTTCCTGTACTCATTTTCTGACTTCTTAAAATCAATAATTTTTATAGACAACTCCCATCATCATTATCTTACTCAATTTTATTTATATTTTTAATACACTTTTTCATGTTCAATATATATTTTCAATACACTTTATTTTGGTTGTCTTCTCTGGGACATGAGTTATTCTTTGGATTCAAATTTCACACAGATCTGTAACTAATGATTCAACTGTGGCATGAACATGATGTTTAATACAAGACAAAAACACAGAGGTTTTTTGTTTTCCAGCTTTCTTGGGGAAGGAGGAATATGGATTCCTTTGCCTTCAATCAAATTAGCAAGAAGTGGCATAACACACGCCATCTCTTTCGTGGGCCACCTTGCATTTCCTCTCATCACGTGCCCTTACCCTTTTCCAACCCAATTCAATTCCTAAAGGACAAATCCTTTTCAGTTTTTTCCTTCTTTTTTTTTTCTAACACACAATTCTTTGCTAAGGATAATGTTTACACTAACGTCGTAGAATTACTTCAACAAAGTATAATACTATTGTTTTCTTTGAAATGAAAGAATGAACCTTAAAACTTGTCAAAACTTAACATGGTTGGTGCATTGAGAGAAATATCAATTTGTTATGTACTTGAATTCAAATCTTATTGACGTTGTATTATTTTAGTAAATTTCTTCTCACTAAACCTAACAAATCAAAAACTAAATTTTTATATATGTTATGCACAAATATTTGATTGGTTAAGAATAATAACTTGTTGTGTTATATTGTAAGACAGGAACATGTGTTGCATTGCAAGTTTGCTTGTTTGGTTGAACTAACTTTCTCCAAAGTTATCAATGCTTGGTTTGGTTTTGCATCTGTTTCTGACTTAACCATTTCTAATGTAACTCACAACACCACCTATCTCATACTTGTAAGAGAAAAATAAAACTATATTTAGCTACATTATATGTAAATATGGTTGTTTAACCTTTTTTTCTGTACCTACCTGATTTTCAATGACTCTACCATCTTACCTTGAAAGGGATCTTGCGAGTGTGTTACAAAACAGAGATAAACTCAAATTTTTCCTAAACAAGTTTGTCCATTATGACACTGACGTCACATTATCTCTAAAACATAAAAAATACAGATGACAAAAAGAAAATAGAGATGGTGACGTGGATGATATGATATGAGACACTTTTTTGGCTAGAATGAAACAAAGGACGTGGTTCGGCCACTGCCACGCTGCCACGTGTAACGATAACCCAGGTCTTTCTCTTGAGACCTACACGTGTCCACATCACGGAGCAATAATATTTAATATTTTGTCACATTTTGTCACCCTAGTTTTTCTTATATTCTGCTACAGTCAAAATCATCACTTTTAATATCATTAAATAATACATTGTATTTGAAACAGTACAAAGCATTATTACACTATAAGGACGTATTGACAGAGATTCCTTAAACGCCGTTTATCACCCAGAACGCCTTCTTATTGGTGTTGAAATTGAAAATGATATAAATGATAACGAGTGTACCAAATCTCTACCCTCTACATTACATTACTTAGTTTCTTAATTTATATTCCATGGATTATCAGAAATGAATATAATAAAAGGTTTGTTTTTTGTCCATACAAATACTATCTTTAGCACAGAAAACCGGATAATAATATGCATGACAAAAAAGTATGAGTATCACGCTTCTCTCACCCACTCACTAAATCTCATTATTATATATATCTATAATATTATATGCAACATATTAATACATTACTAATTAATTTATTATTATTATTATTATTACACTGTAAAGTTTAATTCAAATGACAGACATAATAATGGAAATAAATAATTAAGTTGTGGAATTTTGCAATTACTTACTTACCTTCCCAAAGCTTTTCACCTTTAACCTGCGATATCCCGTGGAGTTAACTGCGCTAACCGGCACACCCGGTGGACGGGTTGGTCATATAGTGCTTGGGGGGTTTAAGCAAAGGA


Gene Sequence:
>Vu_12541(+)
ATGGAAAACTTTATCAGAGGGTTTTGGGATTCAAAGCAACAAATTGTTTTCTTTTTCTTTTCAATTTAGTTTCTTGAGACAAAAACAAACTGAATCATGAGATAAATTGCTTCTGTGATGAAAAACTAGTGTTAGTTGATTTGTTGGTTCACTTCGAAATTCGGAATTCGCCGATCTTACATTCGCCGGAATTTCGCTTCTTCCGGTGGAAATTCGGTTCTGTGAAGGAAAACAGGTAAGGATGTTTTGTTTCACCGAAAGTTTTTATGACAGTGATTTTGATTGCCGGACGATGAAATTAATGGGAGATTATGTCGTATGGTTATGTTGAAATATCTTTACTCGAGTTGAATTTCCGTTTTTCTTTGGGATTTGGGTTTTGCTTGTTTCTTTAAGATCGGTCTTGCTTCGTTGTTTCAGATCCCTACTACGGTATCCTTTTTGAAATTTTCTGACTTTTCCCGTGAACCTATCTGAAATCTCTGAAATATCGTTTGGTTTTGCTTCTTCTTTGATTTTAGCGTATGGTGTCTTAATATGAGCTGAATTGTTTTGTAAAGATTATATATATCTTCTTCTGAATCTGTTTTCGTTGTGTGATCATCTGTATTTCTTCCTTTATCATCAACGTGCCCGGATCTGGTGAAAGTTACTTAATTGACTTTCTCTGGGTTTGGCATATGAAGGGAGTAATTTTTTACTCTGAAAGATTGCGTTGCAATTAATGGTATTTACCGAATCTAGTTTTTTGTTATTGCAATTATTCTGTTATCTCTCTATGATATGTTCCCAAATCTTGGAAGGGAAACGCGCACTCTTTTTTTTTTTTAATTACTTTTAATGACTATGGTCTTCAAAGTTTTTTTTTTTAATTTTTCCTTTTTAAAGAAACGAACCTGTTTTTGAGATGCCCCACCGGATATACCCTCACACCTAAGCATTGTGTAGTTATAAGGGAACGGTGGGACTATTTAATTCGTAGTCTTTCTCTTAGATGTTTACTCTATCATTCTAGACGAAATTCAGTAATGTAAAACCTTGTACAATACTTATTTTTTACTTTTACAGGTAGTGAAACTGCAATGCATCTGATCTTTTACTTATAAGGGAAGGGTTTCCTCAGGCTTTCAAACTGTGGCTGGTTTAATCGAGCAAGAAGAAAACTGCTCATTTATCAAATAGTGGGTCTTGGATTGCTGAATATCTGTGCTTGATCAGTCGGTTTTGGCATGGTTTCTAAGATATGGTCTTACATAACAGGATAGAGTACGGATTTAATGGTTACCAGGCTCCTGCCATGCCCCGAGCTTCTCGCTCAGTTAGGGTAAATTTGTTCTGCTTCTTATGGGGGCCTGGTTAATACTTCAATTTACTTGTGATTTCATGAATCAATATTTATATTTGTTTTGTTAAAATGTTTCGTAGAGGAGGGCTATATTTCAAAGAGCGGAAGACAAGCAAAAGTGTTCATTTGACTTATTGGCCACCGTAGCTGGTAAACTATTACAAGAGAGAGAGAATGCAGCCATTTCTAGTGATACATTATCAAATAAGGATCAGTGTAGATTTGTCAAAGATTGCCATGATGCAAATAAACCATCCAAATCCGAGCTTTCTGACGAAGGAAATTGTGACAAAAAAAGTTTGAATGAATTCCCACATCCTTCAATTGATGTCCATGCAAAGATTGCTTCTACAGTAACAAGTTCTAGTTGCATAGAGAGGTTCATTGCAAAAAAATCGGTGGATGGAAATAGCCATATAAAAATGGAAAATGTTACTAGCGAAGTCAACTTAGATTCTTCGGGTTATCCAAAGGAAAGTCAGTTCAAGATAGATGGCGATACAGGTAAAGGAAAGGATGGGATGCATGAGTTGGAGAAGATACCCATTGGCAGTGGGATTGAGATGTACAGTTTTGGGGATACGCTGGATGTAAACCCTCCTGCGTTGATCAGTTTAGGTGGCAGTGCCAAATTGTCTGGGTATAATGATAGGATTCCCTGTAGCTTGTTGTCCAAAGGTTGTGACAATGTACCAGTAGTTAGTAGAGATGATGACGAAAACTCTTCTGGGTGTACTCACCCTGTTAATACTAAAACCAAGGCTTTTAGGCCGAAGAATTGTATAGATGATAGTGGAATAAGTAAAAGACTGGCTTGTAACTTTCAGAAAGGTGCTCAAAAGCCGAAGTATGACACACTTTCTAACCGTGGTGAGTTCATGCTTATGGCATGAGATTAATTTAACCTTTATCTTTCTTTGCTTGTTCACTGTTTTTTTAATTGGAAACGTGCTAATTTTAGATGGAATTTGGAAGAAAACTTACCACAATCAGAGGAAATGCAATAAACGCCAAATTTCTCAGATGAATATTCCTTTCAAAAAGAGGAAGCTTTTTAATTATAAGTCTGTCTCAAATTCTAGTGGATTTACCAGAAGTGGGGGAATTTATTATTCACCCAAGAATTGTAGTAATCCGGATGCTTGTGACTCAATTCCCGGGATGCGCAGAGGTTTTACACATTCCCTCTATGTGGCTTCCTACTTACAGTTTGATTTTTGCTTCACCACTGTATTTAAGGATCTCGTGGAATATTTGTTTAAATAAGATTCAAATCTTTGATGCAGACCCTGGAATTCCATCCTTGGAAGCATGTCAACACCAGATGTCTCGACGAATAGGTTCTCATGGTATGAGAAGATTGAGGGAGCAGTTCTTTATGTATTCTTTGACTTGATCAGTATCTTCAAAGCGGTTCTTACATGTAAACTTCTTTCTTTTAACCAGTGAAGCTTAGGATCAAGTCATTTAGAGTGCCAGAGCTTTTTATAGAGGTTCCAGAAACTGCAACAATTGGGTCCTTGAAGGTGTAATAATTTATGTATTTGGCCATCTACATACCATTCTCGCATTTCTAGATGTTCGCGAGGAATGGCATCTGTGTAATTTATAAGTGGCATTTACATTTTAGGAATCCATTCCAGTTGCATGTTTCTTCCATCACAAGCTCAGTTTGCTGTATTTCTTATAGCATTTTGGTCTGCAGAGGACAGTAATGGATGCAGTGACTGCTGTACTCGGAGGTGAATTGCATATTGGTGTTTTTCTCCAGGGAAAGAAAGTTAGGGATGATAGTAAAACACTACTTCAAACTGGAATTTCTCATCATAACCAGTTTGATGCTTTGGGTTTCACCTTGGAGCCTAATTCTTCACAAAGCCTACCGATTGTATGTGCTGCACATTCTCCCTGTCCCGGTGCTGACGTAACTCCGCCTGTATTAAGGTAGTGATAAACGTTCAAATGAAGTTGTATGGTAGGAACTGGGATTGTCCGTTAGGTTCCTAAGTATTTGTGCTCGAACACACTTCACTCCAGTGGACTTTGTATTTTCTCTTAGAAATGAGGTGTTTATATACTTGATTCAATTATTCTAGTACCATTGGCATGTTTTTGTATGAACTGTTATTCATACTGTCATCGTATAAATATTATTTAGTTTTATGTTTCTGAAAATTATTGTTCAGGTGTCCCTCTAGTCCAGTTGTAATTCATCAGAGCATTCAAGGCAATTCTGACACGTTACCTGAGCATCAAGTAACAAGTTTTGGTAGCCAATTTGAAAGTGATAATGATTCGGCACCTTCTCCTGCTAACACTTCTGTTGACAAAGGTATGGAAGATTCCAAAGAATTGGTTACTGTTCTTGAAAAGGGTAGGGAGGAACTAGCTATGGTATCTGTACCCCAGAAGCCAAGGCGATCAGAAATGGTACAGCGCCGAATCCGTAGGCCTTTCTCTGTAGATGAAGTAGAAGCACTGGTTCAAGCAGTTGAAAAACTAGGAACCGGAAGGTAAGATATACATGAGACTTTGTCTTGACAATAATATTTTCTTTTCCATAAGCTGGCCAGACAATAATATTTAGTGGGTTTGTTCTAGTAATCCATCCTGTTGCTAGTGTGAGGGCGTGCGGATAATAGTCGTCTGTATTTTCAGTGACTGGATTCTGGGAGAAATTTCCTCTTACAATCCCTATTTGTTGTGTTTCTTTTTTTCTTTTGAAAAAATATAATCAGGTGGCGTGATGTTAAGCTTTGTGCTTTCGATAATGCTAAGCATCGGACATATGTGGATTTGAAGGTAAAAGCATGTGATCCTTTTTTGCTTGGAAACTGGAGTACTGTACATGCTATGTAAATGACTCTTAAAACATGTTTAACCAGACATTACCTGCTTGTGTAGTGCTCTTTCCCGATAGCATCTCTTATCTTTTAAATAGATTTTTGATGTATAAAAGCTTGAGGCTTTTAAATGTTTTGGGCCCTATAATTTCTACACATTCAGGTTTTGATTCTTAATTAATCCCCATAGTTTATTATTTGATGTTTAATCCTAGATCCTTGGAAGTTTCATTCGTTTGGACTTTATTTCATATACAAGTTGTTATCTTCTTAGGTATTGGTCTTTATTTCCACTAAAAAACTAATCCCGTATAGTTTCCGTGTATTTTAGGTAGCAAGACCCACAAAACTAAAAATATGGCTACTGATATTCAGAAAAGTTAATCATAAAAATCAAAACCTAATGAGATACAAACTATAGCGTCCAAAATCCTAATCTAACCATAACTTTGTTATTCCTCATGTTTCTGCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAAGCTACTGCAAGATATTGATAGAATCTAAGAAAAGATGAAGACCATTTTGATAATGATGGACTTTTGGTTTCCTTACTGAGCAGGCATGGCAGAAAAATATTTTACACGTGATTTTGGGGTTGTTGCAGGATAAATGGAAAACACTAGTGCACACGGCCAGAATATCCCCACAGCAAAGAAGGGGTGAACCTGTTCCCCAAGAACTTTTGGACAGGGTTCTAGTGGCCCACGCATATTGGTCCCATCAGCAGAATAAGCAGCAGCAGAAGCAGCATCAGGAAACTGAAACCGTCTTCTCCTTCAATCGTAAGGGGCAAGGGTTGTCATCAGCCAGTGGCCATGTGGATGAGAGTGTTTTGGTTTCTGACTTTTGTTGTTAGTGTCCTTTTCTTTTTGCTTTCAATAAATATTTATGAAGTCTACCTGTTAATAAACCATGTAAAAAGTGATGATGTCAAGGTACAAAAGAACAGGTCTCGGTTCCTGTAAAATTATCTCTGCTCCTCATGTGGATCTTTCCCTGCGTGGAGATTGCTTCTTGTAAATGCTTGATGTAATAAAGTGCTCCCTAACACAATTCTTTTCACTGTAAATTTTTAATTGCTGTTGTGCAAAATAGTTATGCTTTTACTTCTTGATAGATGAAGTTCACTTTTGC