Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12362 LG3 16000928 16002820 PREDICTED: lysM domain receptor-like kinase 4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 16000928 splice_region_variant&stop_retained_variant p.Ter631Ter
T/A 16001101 missense_variant p.Ser574Cys
C/A 16001226 missense_variant p.Gly532Val
C/G 16001267 missense_variant p.Glu518Asp
G/A 16001714 synonymous_variant p.Ile369Ile
T/A 16001939 synonymous_variant p.Ile294Ile
A/T 16001940 missense_variant p.Ile294Lys
T/G 16002159 missense_variant p.Lys221Thr
T/A 16002221 missense_variant p.Lys200Asn
C/G 16002401 synonymous_variant p.Gly140Gly
C/G 16002612 missense_variant p.Ser70Thr
C/A 16002765 missense_variant p.Trp19Leu
G/A 16002768 missense_variant p.Ala18Val
A/T 16002778 missense_variant p.Trp15Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12362.1
MGSLVLVHKIMLYLWFVAWICLGLCSAYNENNCTSNEIGLGTRYSCKSTQDSCETFVVYRANKNFNTISSVSKLFNKSSDEVLLKNNLVSSSLSLVLRQGKEVLIPVNCTCSGTYYQTSLSYRVLDNTTFSEVACGVFEGLLSRLTLAEENLSQGNEPEAGSELHVPLMCVCPDSENSTWSKKVKYLVTYPLIAEDDPDKVSQKFQISPGEFCAVNNLNSKSTVYPNTVVLVPLEDGPIRILDLPDSPSPPPGFLPTNPVNKSQQYIKPSHLYIAGCVIGFLLLITLLASGFYIKRLRKIEVVHSFSPTNSLTLWSPTRSSQISTQTGKSNTTWCLSPDLLVGIKYYLLNYTIEELQKGTKNFSQENNISSEGDFVYKGRVNDVEVMVKRMRLEDTRKVIDLHSKINHINIVNLLGVCYGESNDSWSYLVFELPKNGCLRDCLSDRCNPLNWYKRTQIAFDIATCLYYLHCCSFPSYAHMNVSSRNIFITADCRGKLADVGRALAASATLSKSNNGVEIPKGLVAPEFLSHGSVSEKVDIFAFGVVLLELISGRENFDGKAMKDSLGFLLGEASEGGCFEGLWSFMDPNLKDYSLPEALCLSFLAKDCVADDPLHRPSMDDIMKVLAKMV*


CDS Sequence:
>Vu_12362.1
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Promoter Sequence:
>Vu_12362::LG3:16002820-16004820(-)
CCCGGAAAAGCCAGAAAAACTTTTCTGAAGAACCTAATACTATGGGTTTCTAAAACGAGGAGAAGGGCATTTTAAACTATTTACACTCGTGTCAACTAATTGTTTAGGGAACGAAAAAAAATACTATGTAACCGATAAACACAAGGAATCTGTTGTGTAGTATGTATGTAAAATTAGGGGTGTTACAACTATTCCATTCGACCAGTTTAACTCCCATATCATATTATTGGATTGGATGATTGAATTTCCGTCTGGCATGCTATTGGACTCGTGTGTCTATTTTTGGAAATAAAACGGATTAATTTTTTTTATATTTTACGTGAAAACTGACGTCCCTCGCGCTAAAATGAATTACCGTTCAAATTATTTCAGATTTTGGTCCGAGTATCAAATTCTTTTATAATCACTTTTTTAATGTAGAAAGGAAAAAGTCAGTAATATAAAATCTTTTATAATATCTTTTTTAAACTTTAAAACTTGTCATTGTTGAATGCTTTTGTCATTGATTTAATATAACTAAGGAACAGATTCTTTTTTAAGGTTTTGTTTATACTTATATGTACGTCATTTTTTGTTTTTGAATGTTTTTTTGTTAAATATGTATTTTCTATTTTACGAAACTAACTCTTTAACGATACAAAGAAATTTTATTATATAAATAAATTTATGTTTTCTAGCAAAATTATGTTATTATATGATTATAATTTTAGACTTTTTAAAAAATAAATTGCTATTTCATTTTGATTGATTCTGTTTATTCTCTAAAATTTGTTTTTTTTTTTTCATTTTAAAAAGTTATTTTACTTAAAGTGGTTGATATTGATGTTCAAGTATTTTACTACCAACTTATTATTTAATATAAACAGATAAAATCTATGAAATATTTTAATGCAATTAAATTATCGGAATTAATACAGGAGTTTATTTATTATAATATATCTTTTATTCAATACAACTAAATATATACATAAAAGATAATACAACTAAATTCTCATTGTTATTAAGGAATTAGTTATATAAATAACTATAATTGAAGCTATAAAATTGTGTTATTCCAAAGTTGAATTAGTTATAAAATTGTAACTATAGTCTTTTCAACTATGATTATAAAGAGAATTATGTTCATTTCTCCGTTTTTATGACAAAACCAAAAGTTCGCTATTTCAAAATTAAATTAATTATAAAATTATTATCAATGTCTTTTTTATTATTGTTCTTCTTATAATCATCATTTCTTCGCTCTCAATGATGATTGACCATTGACGATAGAAAAAGTTAATATTAAAATCTGAAAATTGACACTATATCATTAATCATTAAAATAAATATTATAAATAAATACGTTTAAAAACTAACTCAATCCATTAAAATCAATTAATGAGACATGCACTGAACTACTTCCAACCAAATATATTTAGGCCAGTAATTATTTCAATACTTTCCATCATAAAGAGATATCATAACCTGTATTTATAATGTTGTGCAATTTTTAGTTGATCTGATAAGAATAAAATCACTGTGCAGTTAGTATTTTTCTGGCAATTGGGTTTTGGTTTGGCATATTTAAAGTATTATTGATTGGCTGATTGATAATCTGCAACGTGTGTGAATGAGAGGAAGGGCCAAGTTTCTGACATAGTGACAAACAACACATAAGATATTGAATACGTTTGGTAAGAAACAAGTAGAAAGGAATAGAACAAAGAACATGAAACAACTACACAAAATATTAAAGTTTAGTCTGAAGTAGCCATTTGATTTTTCTGCCGGCTTCTTCCACATTTATGCATTTGACCACGCATGTTGACAAACTCTAATGTCATATTCATTTGGAGGCTAGCCAAGTAATTCATTCATTGATCATAGTCATAAGAATACCCTTAATGAATCAAGCTCAAGAGTGATCTAATATATTATCACTTTGATTTTGCATGTCTTCTTTTGTTCCACTGCATTTTTCTTTTGTAACATTATACCAGTGACGACTGAGAAATCTCTTC


Gene Sequence:
>Vu_12362(-)
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