Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12340 LG3 15681669 15683093 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 15681783 missense_variant p.Ile39Phe
T/A 15681784 missense_variant p.Ile39Asn
C/T 15681872 intron_variant
T/C 15682107 intron_variant
A/T 15682111 intron_variant
T/A 15682225 intron_variant
G/A 15682265 intron_variant
G/A 15682298 intron_variant
C/T 15682598 missense_variant p.Ser131Phe
G/A 15682608 synonymous_variant p.Leu134Leu
T/A 15682715 missense_variant p.Phe170Tyr
G/T 15683072 missense_variant p.Arg289Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12340.1
MGRAPCCDKASVKKGPWSPEEDTKLKDYIDKNGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFSDEEDRIICSLYVNIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLIGLLPLSHHTKQPSFPSSALQNPPPSPSSHQLYGEYGNYIPVTASFTGMEHLSLPSANYESTTPSVSQTFYQNQDSMVSVSPMQCYYPVADSMLMFGSEGSCSSSDGSCTQGREMNHNLMLSYNTNDGDKSCVGGCFDQTLTTLDYDLEDIKQLISSSLNNNNVDENKREEKAMYCCYY*


CDS Sequence:
>Vu_12340.1
ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAGGCAAGTGTTAAGAAAGGGCCATGGTCACCAGAAGAAGACACAAAGCTCAAGGACTACATAGACAAGAATGGAACTGGAGGAAATTGGATTGCTCTTCCTCAGAAAGCTGGTCTTAAGAGATGTGGGAAGAGTTGCAGATTGAGATGGCTCAATTATCTCAGACCCAACATTAAGCATGGAGATTTCTCAGATGAAGAAGACAGAATAATTTGCAGCCTCTATGTTAACATTGGAAGCAGGTGGTCAATTATAGCTGCTCAGTTGCCAGGAAGAACTGACAATGATATCAAGAACTACTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTCATTGGGTTGCTTCCTCTTTCTCATCACACAAAACAACCTTCATTCCCATCATCTGCCCTTCAAAACCCTCCACCCTCTCCTTCGTCTCACCAACTGTACGGAGAATACGGCAACTACATCCCTGTAACAGCATCTTTCACAGGCATGGAACATCTTTCTCTTCCTTCAGCTAACTATGAAAGCACGACACCCTCAGTTTCTCAAACTTTCTACCAAAACCAAGACTCCATGGTCAGCGTTAGTCCCATGCAATGCTATTACCCTGTCGCCGACAGCATGCTCATGTTTGGAAGCGAAGGAAGTTGCAGCTCCTCCGACGGAAGCTGCACTCAGGGAAGAGAGATGAACCATAACTTGATGCTCAGTTACAACACTAACGATGGAGATAAGTCATGTGTTGGAGGGTGCTTCGACCAAACGCTAACAACGTTGGATTATGATCTCGAGGATATTAAGCAACTGATTAGCAGCAGCTTGAATAATAATAATGTTGATGAAAACAAGAGAGAAGAGAAGGCGATGTACTGCTGCTATTACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_12340::LG3:15679669-15681669(+)
TTACAAGTAACTCAATCTTAGAAAAGTATCTTAATTAAAATGAAACTTATATATTTTATTTTATTTATAAAATTTCATATAAATGAGGATGAAAAATTCTGATTATTTGGTTGGAGAAGTCCCAAATATTAGGAGGATCCATATTGGTATAGGACGTAGGGTGATGAATAATATGAAGCATTGGGAGGGTGTAGGGTACTAGGGTGTTTTAGGTCTCTATTCCTATTATGTGTCGCCAAGTAACGTGAGGTTCCCCAGTGGGAATGATACAATGTGGCAGAAAATATCTCAGACAATGGTTTTGCCTAATTTTCACAATAATATTATTGCTCCTCAAAACCATGCCTACCTATCATCTTTCGTCACTCCAAAAAATGGTGTACAAGCTACTACCTACAACTCCCTTCATTAGTCAATCCAAAACACCTCGTAAATGAATCTAATGCCAAACAATCTCATTCATTTGGTTGGCCCCATGCAACTCTCAAATAGTATAAATTCATGTTTCAAAAGTATTTATTCTAACTCCAACTCATTTAGCTTTCAATACACAAAAGTTCAAAACAGCACATTATGTTTCAAAAATATTTCACTAGTTAGTATCTTTATTTAGCAAACTAATTTTTTTTTATTCATTTTATATGATTTCATAATTTAGAATGTAAATTGCCATTAGATTAGGGCTTGAAATTTAATTAATGGTTATTTATAATTTTATTATTTTTTTAATAACCTTTACTGAAACTAGAGTATCAAAAAGTTGTAGTTAATTATAGGAATACCTAAAGAAAGGTTTTGTCCTATTAATGTCTACCTTAGGTTTTTTACATCCACTCAATAATATCTTTTATATAAGAAGTGTAGGAATTTTCCAAATTTTAAAATTTAAACTGGTGTGATATGTTTTTATTTAGATTTTTTCACTGTATCCTTCCATGGATTTGAGTCTCTATTTATTGTTTATTTTATTTCTTTGAATTTCAATTCCACCTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTAATTTATTGGCTGCTGCAGTAGTGTGGAAGCCAGAGAGAATCCAGTCTGATCCATCCATGCACCAAGACTCTGACCCTAATTTTCCAAATACAGTTAATTATAAGTGAGAAATCTGAGTTTTATAATTTTTTCTTTCAAACATAATAATCTTAAAATGAAATTCAAACGGAACGTGTTTTGAAGGGTCCAAATTCCTTTTATTCAATCAACTCATGTTTATTTAATTCAAACCCATAATTTCATGAATATTCAGGTGTTGTCCAAATCATATGGGGTTTAATAATATTTTGATTTAATTAATCGATTCCAAATTCTTTGCATCCCATTAATTAGCTAAATGCTTTTACCTTTTTGAAAAGTGTCAATGCAAAATAGTATGAAATAAATAAGATTAAAAAATATTAAATAATGAAATAATAAAAGCACAAGAAAACCAAGACAATCTTAACATTGGTCCAAGTGTTTGGAAAGTGTCACAATTCTGGTAGCTGTACCCATCAACTCACTAGTCCTGTTCTGTGTTGTCTTTCTTTCTGTATCGCAAACATTGGATGCTTTCTCTTTAGAGAAGACGAACGACAGAATGTGTGAGCCTTTCTATGCCTCCCAGGTCTTCAACGTTGAACATTTGAAACCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTACCCTTCTTCCATATTAATTATTTATCAACACAGCGTGGAAATTTAAACTAAACTGTATTTTAATTTTAATCTTCTCTCCATGCTTTCATTTGACTTCTGTACCTGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCACACGGTGTTTCAGATGATAAAATAATATTTTTCTTCAACTGTACAAAACCAGGGTCTCTTATTTATAAGGCACAAGCGCTACACACCAAATTATCATTCAGATGAGAAAGTGAGAGTTTGGATCCTCCGAGAGACAGATAGAGGTTTTTCAGGGAATACTCAAAGAGAGACAGAGATA


Gene Sequence:
>Vu_12340(+)
ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAGGCAAGTGTTAAGAAAGGGCCATGGTCACCAGAAGAAGACACAAAGCTCAAGGACTACATAGACAAGAATGGAACTGGAGGAAATTGGATTGCTCTTCCTCAGAAAGCTGGTAAAAGAACAAATGTTATGATTTTATGAAAACAATGCTTGAATGTGTTTGTATATTTGTACACCCTCTTTCTCATGAGCTTTTCTTTGATTCCAAAATAGGTCTTAAGAGATGTGGGAAGAGTTGCAGATTGAGATGGCTCAATTATCTCAGACCCAACATTAAGCATGGAGATTTCTCAGATGAAGAAGACAGAATAATTTGCAGCCTCTATGTTAACATTGGAAGCAGGTATAGTGCTTGCTAACATTTTAATGTAACCACACTATCAATAATGCTGAAAACAGTTACTTTAACCATTTTCCGACCAATCTAATCTGCAATCAATGACCTACATGTTGTTCAGAATATTTTTATGTGACATCTTTTTAAGAAATGGGAGAAAAAGGGCAACATAAACTGGTCCATTTCTTTATGTTTTTTTTTTCAGAAAACCATGGTTGTTGTTCATAATCTGCCTGTGGTAATACTTGGATAGCACTTCCACATGCATGCCAAGTTTTGATCCAACACTGTCATCCACTATGTCTAATTAAGATATTAATTGAGTAAATAATTTTCTTCAGTGGAAACTTGATAACATAATCCACTAGAGTTGGTCTACTGTGAGAGATTTGATTTTAGTCATTTGTACCAAAATTTAACTTAATGTATTTATCAACAGGTGGTCAATTATAGCTGCTCAGTTGCCAGGAAGAACTGACAATGATATCAAGAACTACTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTCATTGGGTTGCTTCCTCTTTCTCATCACACAAAACAACCTTCATTCCCATCATCTGCCCTTCAAAACCCTCCACCCTCTCCTTCGTCTCACCAACTGTACGGAGAATACGGCAACTACATCCCTGTAACAGCATCTTTCACAGGCATGGAACATCTTTCTCTTCCTTCAGCTAACTATGAAAGCACGACACCCTCAGTTTCTCAAACTTTCTACCAAAACCAAGACTCCATGGTCAGCGTTAGTCCCATGCAATGCTATTACCCTGTCGCCGACAGCATGCTCATGTTTGGAAGCGAAGGAAGTTGCAGCTCCTCCGACGGAAGCTGCACTCAGGGAAGAGAGATGAACCATAACTTGATGCTCAGTTACAACACTAACGATGGAGATAAGTCATGTGTTGGAGGGTGCTTCGACCAAACGCTAACAACGTTGGATTATGATCTCGAGGATATTAAGCAACTGATTAGCAGCAGCTTGAATAATAATAATGTTGATGAAAACAAGAGAGAAGAGAAGGCGATGTACTGCTGCTATTACTAG