Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12125 LG3 11653506 11657102 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 70
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 11653937 intron_variant
T/C 11656274 intron_variant
C/T 11656863 intron_variant
A/T 11656906 intron_variant
A/T 11657101 splice_region_variant&synonymous_variant p.???378???

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12125.1
METQFSNGKKAMEEELMRGRDMANQLLDALGHGKLNTHLQDEGTSKSVLPFVEDLVRKVLCSFTNTLLLLNSNEITPSLSSSTSFPEMESLHETCKSRNILNTNNRRRCYKRKSIAPTWEKDSSILIEDGYAWRKYGQKMTLHAKYLRSYYRCTYKTDQRCSAMKQVQRIQDDPPLYRTTYYGHHTCRSPVNPEIIMEPFSPSASSTLLSFDNSLHSKQENPFPSPLLASIKREPQKVIHDEHGAQNQLTALENLLLYDCDISFDYSRNATLLSSAESVQFENVFDSLDFDGSVFVFERFGLVFCCLGTKTWSIFRLSEADRQFIVRRRSECLQWRGSDMCSLSHRPLSSIVPPQTCIGLNFTSGLRTPVRDTSLAR*


CDS Sequence:
>Vu_12125.1
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Promoter Sequence:
>Vu_12125::LG3:11651506-11653506(+)
TTGTATGCATGAACAATTGGTAGCCTTATGAATGCTAGGATTTGTATAAGACTAGACATTGCACAAGCAATGAGAGTGGTTAGTAAGTTCAAGACAAATCTAAGTGGAGAGTATTGAAGTACTATTAAGAGGATCCTAAGATACATCAAACGAATCTCGAGTGTTGCAATATAGTGACAAAGAATAAACCATAGTATTTCATCAAAATCTTCAAATAGATATTGTAAGAAGAGAAGTCTCTCATAAGTGAAAACTTTGGGGCTTAATTTTCAGAGTTTAATGTTTACTTGGGAGCACATCCCAAAGTCTCTTCCTTTTCATTCTTCTTTTATTATTTGAGAGAAAAATTAAAAGAGAAAATTAGTTTTTCCTTTAAGAAAGAGAATATTAGTTTTTCTTTTAAAAGAATATGTTAATTTCTTCTTTAAGTCCTCCTTATATTTATTTTTCCAATTTTGAAGAGAAAGATGGTTATTGTTCTCTTCTTATAACTAAAGAGAATGATATATAATTTTTCGTTTTTGTTTTTTTTATATATATTTTATTTTAGTTTTGAGTAGTTGTTGTCTGACACCAACATTTTAAAAGTGGTTATTTCTTAGGTTTAATCATTCACTAAGTCCCTATTTTCGCATGGAATCTCAATTTCGTCCCTTTCTTTCTGAAAATCTCAATTGGGTCCCAATTTTAGGAAAATTGCAACAAATCGATCCTTTCCGTTAAAAAGTGTCAAACGGCGTTAAAAAAATTGATGAGTGAATGCTGAGATGACGAACGAGCGCTCGTCCAGCAGCGAACGAGCGCTCGTCCAGCAGCGAACGAGCGCTCGACCACCGAACGAACGGTCGTCCAGTGTGGAACGAACGGTTGTCCACCAGAGAACGGACGCTCGTCGACCTCTTACTGCTGGACAACCGTTCGTTCCACACTGGACGACCGTTCGTTCGGTGGTCGAGCGCTCGTTCGCTGCTGGACGAGCGTTCGTTCGCTCCTGGACGAGCGCTCGTTCGCTGCTGGACGAGCGCTCGTTCGTCATCTCAGCATTCACTCATCAATTTTTTTAACGCCGTCCAGCCAAATTAACGGAAAGGATCGATTTGTTGCAATTTTCATAAAATTGGGACCCAATTGAGATTTTCAGAAAGAAAGGGACGAAATTGAGATTCCATGCGAAAATAGGGACTTAGTGAATGATTAAACCTATTTCTTAATTTAAAATAGCACAGTATCTAAGGGTTTCCTTCCAAAAGTTGAACCCTCGAGCCATCACCAACAAACCAACCAACCATTATTTTCCAACATTTTTGTTTTAAATTTTCTGGGATTAATTTTCTTATATTGGATGTTCGATAACATAGAAACTAACCCGTTCTTTCCAAATTACACACGTTCACATAGAATAATCAAATTGACCATTCAAATTTCAAAAGATAACAGCTTTACCAAATTTAAAACGTATCAACAAAACTTTCAAACAAATGAAACACATCAACCATCGACAACGATAGCTATAATAATAGAATTCATAATATAATCTACAATTCTAAATCTTAACAAGAAAAGGAATCAACCCTCCTACCTCAGTCTTGTCCATACATGCATATATCCCTAAGTACCCTTAACTTATACATAAACTACCACGCAAAAGCAAATGGTATTATTGTCTAATCCCTTACTGTTATCTCAGCATGAAGCTACCATTCTGAGCTCACCATGCAATCCCTTGAAAACAACCACACTGCGTCTCCTTCCTCATTTCTTCACACTTCCAATCAGACAAAACCATTGCTTACGTTGCACATTTTCATCGGTGCGTGTTCTTCACGTAAAGCATTAGCTTGTGTCCTAAAGCTATGAATCTTGTGCTGTGGAAGTTTTGTCTACACTATCTAATGTAACATTTTAAAATGTGCAAGTGGAGGAAGAAGTGCTGCGTTGAATAAAAGGCAGCGTCCATCTGTTTTTGCAGTGTCAAACTTAACCTAAACCTGAAAGGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_12125(+)
ATGGAGACTCAGTTTTCAAATGGAAAAAAGGCAATGGAAGAAGAATTGATGAGAGGGCGTGACATGGCAAACCAGTTACTTGATGCACTTGGTCATGGTAAATTGAACACTCATCTTCAAGATGAGGGTACGTCCAAGTCAGTGTTACCATTTGTTGAAGATCTTGTGCGCAAGGTCTTGTGCTCATTCACAAATACTCTTTTGCTTTTGAACTCCAATGAAATCACACCGTCTCTCTCATCATCAACCAGTTTCCCTGAGATGGAGTCTCTGCATGAAACCTGCAAGAGTCGCAACATTCTCAACACTAATAACCGAAGAAGGTGCTACAAGAGAAAGTAAGAACTTTATAATTCAAGTCATTCATAGCAATATTATAGTTACTGAGCCAATAAGCTCTTTCTAGTGCAACATTCTCTATTTTAATTTATCAAAAAACACAAAAATATTAGGGAAACTCGACACTAACAAATTTTTGTAACTTTCGATCAAATTGAGCTTAAAATGGTATATTTAAAGGAGTGAACTAAATAGTAAAATGATTTTTGAGATTTTTTTTTCTATACAATAACATTAATGAAGTTCAAGTTTAAGATTTTATGAAAAATACATAATTTATCAGCACTAGATCAACCCGAATGAATAATATGATTACTAAGAACATTATAGTATAATGATATATTAGTAAAAAATATCAGAGATTATTAAAAGAGGCTGGGTGTATCTTGGCTAAATGTTTAAGACACAAATAACTATGATTACACTCTTATTGGGATTCTTATTTTTGTCCCAATATTTCTTAACAATTCTAACGATTTGATAATTGGATTAGTTGTGAAAATACTTAAATATAGGAATTCTTAAATTGATAATTTTGTATCTTATATAAAGATCAATTGCGCCAACTTGGGAGAAGGACAGCTCCATACTGATTGAAGATGGCTATGCATGGAGAAAGTACGGACAAAAAATGACATTGCACGCAAAATACCTAAGGTATATTCTTCAGTTTCAAATCAAATTAACTATAATTTTCTCTTTCTTTTGATTTTGGAGTGATGAATCCAATATGGTTTTGCAGGAGCTACTACAGGTGCACTTACAAGACTGATCAGAGATGCTCAGCAATGAAACAGGTGCAGAGGATTCAAGATGATCCTCCTTTGTACCGAACAACCTATTATGGGCATCACACTTGTCGAAGCCCTGTGAATCCCGAGATTATTATGGAACCTTTTTCTCCTTCTGCATCTTCCACGTTACTTAGCTTTGATAACAGCCTTCATAGCAAACAAGAAAACCCGTTTCCTTCACCACTGCTTGCATCAATCAAGCGGGAGCCTCAGAAAGTGATTCACGATGAACATGGTGCTCAAAACCAGTTGACTGCGTTAGAGAACCTCCTATTATACGATTGTGATATTTCTTTTGATTATTCGAGGAATGCCACTTTGCTGTCGTCGGCTGAATCCGTTCAATTTGAGAATGTTTTTGACAGTTTGGATTTTGATGGCTCGGTATTTGTTTTCGAGAGGTACTTAGAATTGTACAGTTACATCTCAGTGTTGTATTATATAGTTTCTTCAATAAAACATCTGTAACTTCAATCTTGTCAAAGTATTATCACTGGGTATTTTATGAGGGTTAATTTCCGGCGGGTTGGGAAACCCCGGAAAATTAATGGCAGTTATGATCAAACCGCTCCTAGAATTTAATTTTTTTCTCTTTATAATCATTTTCTGGAAAATATTCTTCCCCAAATTAGCTCCTTCTACTCCTCATGCCTTCATTTTCCAGTCTTTCTAATTTTCTCAAACCCAAGCGTTGTTCCCTCCCTCCCTACGCCTTCATCTTGCATCGGATTTTCTCGCATATCCTAGTTCTCTCCCTTCCTCCTTACGCGTTCATCTCTGCATTTGATTTTCTAGCAAGCCCGGCGGTTCTCTCCCTTCCTCGCACCACATTCTTGAAACCCTAGTTGTTCCCTCCCTTCCCCGCAAGCCCTAACTCTTATTGTTTGTGGAACTCTTCGGTCTAGGTTCGGCTTGGTCTTCTGTTGCTTAGGAACGAAAACCTGGAGCATTTTTAGGTTGAGCGAGGCCGACCGTCAATTTATTGTTCGTCGGAGGTCCGAGTGCCTTCAATGGAGGGGCTCTGACATGTGTTCGCTCTCGCACCGACCATTAAGGTAAACCGACATTTAATTATTGTGTTCATCGCTCTCTCTACTTTTGCCTCTCTGAGATGTTATCACAGTAGAATTTCATTGGTTCATCACAATCAATCTTCAAGTTATTTCAACACAGGAATTGACAAATAACTTATGATGTTGCTTGAAACTTAACTACTACGCTAGATTAAGCTACACCACTTTTTTGTTTTACTTCTCTATGTTAGGAAGTCTCTCTAGTTATAATATCCAGATTATTGTTGGCATATGAAAATAACTTGTAGTGGGCCACTTGAATACTAAAAGAATATTTCAACCTGAGTTTTATCTCAAACTACTTTTCTAAATGTTGACTCACGAGTTGTTGTTCCTTCCAATCATCCCAGTAACATTGATGTCCAGGTACATTAAGAATATAGTTACTCCCGTTGAAGTTTATGTTTAATATATATATTTCCTGCTTAGGATTGCCATGCTAGAAATGATTTTTCTCATCAAACCATTGTTTAGTTTTTCTTTGACGAACTGTCGATCTATCTCTATATGCTTTATCCTATAATACTGAATTTGATTGTGAGTAATACTAATAATTGACTTATATCATAATAAAGATTCATAGTTCTTCACAGTTTTCTTTTAGATCATTCAAAATAATTTTCAACCACAGTACACGAAATTCATGGATTGCCGGCGGGCTATTACCGACAACCCTTAGGCCTTCGGTAAATTTTGTTTACCGAAGGATTTTTCGACGATCTCTAAAGTAGTACATAATTAGAGGATTTCGGCCTTCGGTAATCGACATGGGACATTACTGAAGGAACTTGACCTTCGGTAAATGGTTGGTGTATAAGAAAATTTTTCCCTCCCCCTCATTTCGCGAAAGCTCTTCTTCCCCCCAATATTCAGAATCTCCCAACACTTTCTTCCCCTAAGTCCTTCTCCTAACTCTCTCTACTGCTTGTGCACACTGTTCCCTCCACCATCATTGCGCTCTAGCCTTGTCGTTCAATCAAGGAAGCCATCTTCGTCCTTCGGCCGACCATTCCAAGAATGTCCTTAGAGTAATTTTCTCGAAGGATCTTGGTCGTTGGCTACCGGTGTTCGCCTGCGTTAGTTGCCGGAGTTCGCCGCTCACATTATCATTAGGGCGAAAATCAGGTATTCCCTCTCACATTTTCATTTCGCATTGAAACACATTTTCCCTCCCTTCTTTGATTTCCCCAATCTAAGAACCGTCACAATTATTTTGTCCAAGGGCCGTAGGCGTGGGGTACTGGAGTTCGCCTCCCTCCATTGTTCTTTAACCGCAACATGAGCTCGTGAACCACCATTGCAGTTCAATCGTGCCTCCGCAAACCTGTATTGGCCTGAACTTCACTTCCGGTTTGAGGACTCCTGTTCGAGACACTTCACTTGCGAGGTAA