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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12124 LG3 11638742 11640959 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 70
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 11638874 missense_variant p.Leu288Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12124.1
MWNKTYGICLFGGHNMNSVMPRRKMENQIPNSKRAMEEELNRGRDMANQLLEVLAYDKSITHLQKEEEGSKSVLPFVEDLVRKVLCSFTNTLLLLNSTNDVSHELVASITLRDVFSSTTTSPKKLESVDETCKNRSILTTQNPRRGYKRKSIAPSWEKDSSILVEDGYVWRKYGQKMTLNAKYLRSYYRCTHKNDQGCQAIKQVQRIQDVPPLYRTTYYGHHTCKSRMNSEIVLEPLSPSASSTLLSFNSSFHCKQENPFPSSLLASTKHELVEVIHDEHSAQNQLSSLEDLLLHDCEVDCDYSRRVASMLSSAESVEFENVFMSSLDFVG*


CDS Sequence:
>Vu_12124.1
ATGTGGAATAAAACCTATGGTATCTGTCTGTTTGGCGGCCATAACATGAATAGTGTTATGCCAAGAAGGAAAATGGAGAATCAGATTCCAAATAGCAAAAGGGCAATGGAAGAAGAGCTGAACAGAGGGCGTGACATGGCAAATCAGTTGCTCGAAGTTCTTGCTTATGACAAATCAATCACTCATCTTCAAAAGGAAGAAGAAGGGTCAAAGTCAGTGTTACCATTTGTTGAAGATCTTGTGCGCAAGGTTCTGTGTTCATTCACAAACACCCTTCTGCTTTTGAACTCCACCAACGATGTTTCCCATGAGCTGGTGGCTTCCATCACTCTCAGAGATGTCTTTTCTTCCACCACCACTTCCCCAAAGAAGTTGGAATCTGTGGATGAAACTTGCAAGAATCGCAGTATTCTCACCACTCAAAACCCAAGAAGAGGCTACAAGAGAAAATCAATTGCTCCAAGTTGGGAGAAGGACAGCTCCATACTGGTTGAAGATGGCTATGTATGGAGAAAATATGGACAGAAAATGACATTGAACGCCAAATACCTCAGGAGCTACTACAGATGTACTCACAAGAATGATCAGGGATGCCAAGCAATCAAACAGGTGCAGAGAATTCAAGATGTTCCTCCTTTGTACCGAACAACCTATTACGGCCATCATACTTGTAAAAGCCGTATGAATTCTGAGATTGTTTTGGAACCTCTTTCTCCCTCTGCATCTTCCACGTTACTTAGCTTTAATAGCAGCTTTCATTGCAAACAAGAAAACCCGTTTCCCTCATCACTACTTGCTTCAACCAAACATGAGCTCGTGGAAGTGATTCATGATGAACATAGTGCTCAGAATCAATTATCCTCTCTTGAAGACCTCTTATTACATGATTGTGAAGTTGATTGCGATTATTCAAGGCGTGTGGCTAGTATGCTTTCATCCGCTGAATCCGTTGAATTTGAGAATGTTTTTATGAGCAGTTTGGATTTTGTTGGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_12124::LG3:11640959-11642959(-)
ATTGAAACTTTTCCTTATAAACCCATTTTATAGAATAGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATTCATATACATATACTCAAAACTCAAATCGTAATCAATACATTGTAATTTTATCATGATATATTATATTTATATAAAATGAGTATGGCTAATCTCCACTTACAAGGAAACTAACCAGTTTTTCGCAATCGAAGTATTAAATGAGTAATCAAACCGACAATTCAAAGATTACTGTATTAGTTACATTTAAAATATGCCACCTATATTGTATGGAAATTTTTGGTTTAATCATTGGCATTAAATTTAAATCCATATTGATGCAACCATGTTTTTCTAAGAAGTAACAAAAGTTATTTATTGTTTTTATTAATCATAAATTTTATACTAATCATAAAATTTGAGATATTTTCTAACAAATAAATAAAATGATGGGCTAAGGTAGTAATCATGTGATCAAATTTTAAAACAATAGAGTAAATAACAGGTATTCAATTAAATATAAATTTTTTAAATATTTCAATAAACAAAATATTAATATAAATTAAATAAAAAAATATTAAATTTACCAAGAACTTAGACCTTAATTCTACCTAATTATTTGTATATAACATTTTTTATAACATTTTTTTAAAATATTTATACATCACCTAGAGAAATGATGGTAACGGTAATAGTTTCTAGATCATTCTAGATAATAACCTAAAAGTGATTACAATATAAAATATAAAAAGAACTAAGAATTTTATATTAATTTTTATTTTAATAAACAAAATAATGAAATAAAATAATTGAAAATTGATTTTAATGTATCGTTATAAGAAAACATGAAATTATTAACGGATTTATACCAATAGATCGTAATTTGTCAGTAATAGTATATCATCGAAAAATTGAATGACTAGTTTATTGATAGAAATACTTGTTAGTAACAACATCGATAAAGTACATTTATCAAAAATTTTGTCGATAAATTGTATGTGCCATTATCAACGTATAAGAATCATAAGAAATTTTTTAAGTACATTAGAAATTTGAAAACTCATTTTTCTTTCTTTTGCACGAAGACATGAAAAAAGAAATAGAATATAAATCTTGTCGAGGAGAGTAGAGCAAAACCTAATTTGAAAAACGTTTTACAAAACAATACTAACAGGTAATGACCGTCAGTGATTTTTTCTAATAAAAACATTATCGATAAATTTTAGTCCATCAAAAAAACTTATATTATTGATAAATTTTGGTATTTATCGACCGATATTTTCCATCTTTAATTGGTAAATCTAGTTTTTTTTAGTGTACATCTAAAATTTAATTAAGCTTAGAAAAATATAAACGTAAAAATTGATTTTAACTAACTGAAAAAAAAAAGTATTATAATTTTCATAATATAAGATTATCTACAAAATTTATGAAAAAAAAATGCAAATATAGATGCCTCTCTCTCACGGTCACAACATGCAAAGGCGAAGGGCAACATTGTCTAACAGATTACTATGTTCTCAGCATGAAGATAGCATACTGAGCTCAGCCTCAATCTCCAAGAAAACAAACACACTCTTTCTCTTCCCACGCTCTGGACCTCTCCAATGGGAGAAAACCCTCTTACGTACGTGGCATATTTTAAGTAGTGCGTGTTCTTCACGTAAAACATTAACTCGTGAGCCAAACTTGACGATTTTTATCAGGAATTTTTATGAGCGGCTACATTTTTTAAATACGCAAGTGGAAAGTGTACC


Gene Sequence:
>Vu_12124(-)
ATGTGGAATAAAACCTATGGTATCTGTCTGTTTGGCGGCCATAACATGAATAGTGTTATGCCAAGAAGGAAAATGGAGAATCAGATTCCAAATAGCAAAAGGGCAATGGAAGAAGAGCTGAACAGAGGGCGTGACATGGCAAATCAGTTGCTCGAAGTTCTTGCTTATGACAAATCAATCACTCATCTTCAAAAGGAAGAAGAAGGGTCAAAGTCAGTGTTACCATTTGTTGAAGATCTTGTGCGCAAGGTTCTGTGTTCATTCACAAACACCCTTCTGCTTTTGAACTCCACCAACGATGTTTCCCATGAGCTGGTGGCTTCCATCACTCTCAGAGATGTCTTTTCTTCCACCACCACTTCCCCAAAGAAGTTGGAATCTGTGGATGAAACTTGCAAGAATCGCAGTATTCTCACCACTCAAAACCCAAGAAGAGGCTACAAGAGAAAGTGAGCATCATAATCCATGTTTTCCTAGTTAATTATATATGTGTGTGATTATGGTTGTTATTTTGGATTTGGATCTGATTGTTTTTTTTTCTTTAAGAAAATATGACATACAGAAGCTAGATCAATCACTATTTGTAAAGGGATTAAGTCAACCAATCATCCACAGAAGATAGTATTTTTTTTATCAGAAATTATAATTCTATAAAATAAAACTTGAGTAATATTTGAAAGTGCAGTAAAACAAGAAGATATATCTTTGTAGTGCATGTCGATCATGAAAAACAAGAGTAATGTGTCTTCTCTGTGACATCATCAGTGCATTTATTATGCTTTTTCTTAACCAAATTCATTCATTTCTCAGCATTTTAATATTTCAATTTAATTTTCTGTGTTTTATAGCTCTCCATAGTCATATATATTTTTTATTTTTAAACGATTAAATATTCTAATTAAATTATGTTTAAGATAATAAAGAACAGTGTTATTAGACGATCAGGTGCATTTTTATTTAGAATCAAACGCGAGGAACATGAAGAATAATGAAGTTTATCCACAGCAATTGTTAATTAATTTTCTTGATATTTATGTATTTAATTAAGAACCTCATTACAGGGACTTTTTTAACAATAACATTTTTAAATTTAATTCTTATATGAAGCTATGTCAAGTGCATGCTTGAATGAAAACTACTAGATTCTCTACCCTAATAATTGAAATGTGAAAATAGTTTATTTTCAATCTAAAATTAGAATCAATTATAAAATAATTGAATCTAATCCAATCATATCCCTAATATTCAATAAAAAAAAATCATAATTCAACTAAGTTGATAGTCTCTTGTAAAAGGCTTATGTGATAATGAAGAAAATTCAGTAAAAATAATATAAGAAGAATTACAAAGGCTTTGAATTCGGAAAGAGAAAGGCTATATTTGTCAAATGCATCTTGGCTAAAGGCTCTAGAAATAAACGATAATGATTACACAATTATTAGGATTAATTATCACAATTCCAATTTTAAATATTATGGTCAATTGATAAATATTGGATTAGTTGGGAAAACATTTAAATAGAAGAATTCTAACATTGGTATTTTGTCTTCTTATATGAAGATCAATTGCTCCAAGTTGGGAGAAGGACAGCTCCATACTGGTTGAAGATGGCTATGTATGGAGAAAATATGGACAGAAAATGACATTGAACGCCAAATACCTCAGGTATGTTCATCGATCTTCAGTTTCTCATGAATAATCCTTCTTCAGTTGTTCATGTGTCCAACCCTTGATTTCTAACCATGATTCCAAAAATGGTTGAAAATGTGTTTGTAGGAGCTACTACAGATGTACTCACAAGAATGATCAGGGATGCCAAGCAATCAAACAGGTGCAGAGAATTCAAGATGTTCCTCCTTTGTACCGAACAACCTATTACGGCCATCATACTTGTAAAAGCCGTATGAATTCTGAGATTGTTTTGGAACCTCTTTCTCCCTCTGCATCTTCCACGTTACTTAGCTTTAATAGCAGCTTTCATTGCAAACAAGAAAACCCGTTTCCCTCATCACTACTTGCTTCAACCAAACATGAGCTCGTGGAAGTGATTCATGATGAACATAGTGCTCAGAATCAATTATCCTCTCTTGAAGACCTCTTATTACATGATTGTGAAGTTGATTGCGATTATTCAAGGCGTGTGGCTAGTATGCTTTCATCCGCTGAATCCGTTGAATTTGAGAATGTTTTTATGAGCAGTTTGGATTTTGTTGGCTAG

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