Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12122 LG3 11619539 11621362 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 11619781 synonymous_variant p.Arg218Arg
T/A 11620383 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12122.1
MENQASNGRKAMEEELNKGRDTANQLLEILVHKSNTSHTDAEVEGLVLPSAEDLARKVLRSFSNTLLLLSTQSDVSDALVMPVTVNDVSSSLICPNLEDKDGVCKSSINAKRRRISHKRNAPTWEKNSSHLIEDGYIWRKYGQKMTINAKYLRTYYRCTHKYDQGCPATKQVQRIQENPPLYRTTYYGHHNCKSPEIMLEPASSSDSCMFLSFSTTFPTKEKYQFSSSVFSSTKQEPMEVIPDDCGIHNQLPSSDYNLLSDYELDFNCLRHDTVQSMPSSTESFLFDQVYGSDMDFDG*


CDS Sequence:
>Vu_12122.1
ATGGAGAATCAGGCTTCGAATGGAAGAAAAGCAATGGAAGAAGAGCTCAACAAAGGGCGTGACACAGCAAACCAGTTACTTGAAATACTTGTTCATAAATCCAACACTAGTCATACAGATGCAGAAGTAGAAGGGTTAGTGCTACCATCTGCTGAGGATCTTGCTCGCAAGGTACTCAGATCGTTCTCAAATACCCTTTTGCTGTTGAGCACTCAAAGTGATGTTTCCGATGCTCTTGTTATGCCTGTCACTGTCAATGATGTCTCTTCGTCCCTCATATGCCCTAATCTTGAGGATAAGGATGGGGTTTGCAAGAGTTCCATCAATGCTAAAAGACGAAGAATATCCCACAAAAGAAATGCACCAACATGGGAGAAGAACAGCTCACACCTGATTGAAGATGGCTATATATGGAGAAAGTATGGACAGAAAATGACCATCAATGCAAAATACCTCAGGACCTACTACAGATGCACTCACAAGTATGATCAGGGTTGTCCAGCAACCAAACAGGTTCAAAGGATTCAAGAGAACCCTCCATTGTACCGAACAACTTATTATGGTCATCACAATTGCAAAAGTCCAGAAATAATGTTGGAACCAGCTTCTTCTTCTGACTCTTGTATGTTCCTTAGCTTCAGTACCACCTTCCCGACCAAAGAAAAATACCAGTTTTCATCATCAGTTTTTTCATCCACGAAACAGGAGCCTATGGAAGTGATTCCGGATGACTGTGGTATACACAACCAATTACCCTCTTCAGATTACAATCTGTTAAGTGACTATGAACTTGATTTCAATTGTTTGAGGCATGACACTGTGCAGTCTATGCCATCCTCCACTGAATCTTTTCTATTTGATCAAGTTTATGGGAGCGATATGGATTTTGATGGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_12122::LG3:11621362-11623362(-)
TTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGTTTTATTCTAGAAAGTCTGAAATCTATTATAAGAATTAAAAAAGTTGACATTTTCAATATGATTCAATATGTAATATCCCAATTGTAGAAGTCAATGAAGAAGTTGTAAATGAGTTGACTTGCGTATTGTTAAGTGCTAATAAGCTTTGTCAATCTTTCGCAACAAACAACCTTTTTGACGTGGATTATATGAATAAGTAAAATTTACTTTTTCTTTATCTTTAAAGGTAATGAAATACTTATGCAGACAATGATAACATAAATTTAAGTTCAGTTATAAAATTTACTTAATAAATTCTAATTTCATATAAAAAAAGTTGTCACCGCATAATTTATATTTGAATATCATTTAAATTTTCCTTCGTATAAATTTTTATCAAACATCAAATTACAAAATTTAAAACATATAAATAATAGGTTTGTTTAATGCAAAACAAATATATTGAGTAGTTAAGGAATCAAACTCAATGTTAGACAACTAGTGCCCAAATTTTAAATTTACCTCATTTAAAGCTAAACTTGAGTTCTATATTATTTTTTATAAGTCCACCTGTATGAGTTTTAAGTACTTATCAGATTAACTAATTGGAGTTTCCATGTATAATTAATATAGGCAAAGGCTAAGTAAACTTTTTCAGAAGGGCTAAAATAAGGTGTGTCAATTCCTATCCAAGAGTACAATATAGTATCAAAGGAAAATTAATCTCCAGAATTATATAAGTGAACCTAAACCAGAATAGATAATTAATGCTGTATTCACATGTACAATTTCGCCTCAGCCAGGTAATTAGAGTTAATATAATTCCAAGATAAATGGATTAGTAATTTCTTGTGTTTGAATCCCTGCTAAAGGTAAAGTTAAGGTAGTTTGGAGAAAAAACTAACGTATTTCAGAATCAAGACATCACAAAAAAAAAAAAAACTTATTAGGTATGTTATAGATATATCTTTTGCCTTCTCCTTGGACAGTAGCTAATTAATTAGTTCCATCCTTGTAAATAGAAAACGTAAGATCATCAAATGTTGGCTGCATGCAGTATGACTACAAACAAATTGCATTCGATGCATGCAAATCGTTTAATTTACTGGAGTTTAAATCCTCTATAATTATAGTAATTGAGAAATTTATGTTACTGGGCATTATCTACTGGCACTCAATTGAGCCATATACATGAATAACAGAAAGATATAGGAAATTTTTTCTCTTTTTTCTGAGCAATGAAGACGCAGTAATTAATAACTGTCACAAAGGAGTGATTTTTTACATAAATCACAGTGAGAAAAGAATGGAAAAAGTGACGCAGAGTTTCTCATTTCGATCAGTAAATTCAGTGAGTACAATGTATAGAGTGGAGCAAAGTTAAAATTTGAAAATGCTAAAATGTGAGTATGTAACATTATCAATCCCTTCGATTGGGAGGTTTTCCCATTGACAAACATTGTTGGAGCTTAATTTTAGAGAAAGGGGAGATATTCGCATATTCAGAGGTTTTATTGTCACACCAATTTCAATAAATAATACTCTAACCCTTACACAAAGAACCAATTGAGATACAAGTCAATGAATTAGTGCACTAATATAAACATTAAAGGACAAGAGAATTTGTCTCTATATATAATATTAGCTTAGAACCTTGTTAATCCATTAAAACAGATGAACTTAACTACAGAAGAAATTATAAACTATAATCCGTTCCTTGCAACAACCAATCATAAATTTTTCCAACCTAATGTACTTCTGGATAGAATCCTATGATTCCCTCCCACAGCTCCAGAATGCATAAAACCGAAAGGTCAAGGTTGCCCCTTGTGATGTCAGAATAAGAGCTCATACTGCCAGGGATGTTTTTGTCTGGAGTCTGAAGAGCAAACAATTTTAAATTTGCTAGTGGGGGCATTGCTGTTTTCAATAAAAGACAGTGTTTGTGTCTCCAATCTGTACTCCATTTCATATATCAGCA


Gene Sequence:
>Vu_12122(-)
ATGGAGAATCAGGCTTCGAATGGAAGAAAAGCAATGGAAGAAGAGCTCAACAAAGGGCGTGACACAGCAAACCAGTTACTTGAAATACTTGTTCATAAATCCAACACTAGTCATACAGATGCAGAAGTAGAAGGGTTAGTGCTACCATCTGCTGAGGATCTTGCTCGCAAGGTACTCAGATCGTTCTCAAATACCCTTTTGCTGTTGAGCACTCAAAGTGATGTTTCCGATGCTCTTGTTATGCCTGTCACTGTCAATGATGTCTCTTCGTCCCTCATATGCCCTAATCTTGAGGATAAGGATGGGGTTTGCAAGAGTTCCATCAATGCTAAAAGACGAAGAATATCCCACAAAAGAAAGTAAGAACATATCATTTAGGTCTGATTAGCAAATTATTTGCGATGATTGTTGTTAATTTTCTTAATTGGATCGTTTAATTAGTTCTGTTATCATTTTATGTTTAGAAAGATATATATCGCTTTTGCCTAATCAAAGTGGGATTTTATTTCTCGTTGGAGATAGAGTTCTCAAATTCATTGCATCGTCTCTTTAGATCTAAACTTCTCTGTAGCTGATCTCAATAATCATGCATCCTTTTTCTACCTAATTTAATTTAGAGGTTATGTTAAATTTTGTAGCTTGAATATCATAAAGTTACTTTTATTTTAAAATATTCTAATTGTTTTGGCCCACTCTATCTATATATGGTTTCAGTTTTGAAATTAATTTCCAAAGCTTGTTCTTTCTCTCAGTTTTATTAATATTAACTGTATATTTTGTTGAAAATATTTCCTGGACTTATTTACTGTTAATATTTCTTTAGAAGATAACGTGTTTCCTTAATATAGTCCTTCAAATGAGCTCAGTGCTGTGAAAGATTTGTTCCTAAGTTCTATCAAAGGATATGCTGTACTAGTTGTATATATATACAGTGCAAAGAAGATACTTTCCCAGTAAAATTAACCGAGACTAAACCTTTAGTTATAATCACAATTTGCTTCATTACAGTGTTAACAGATAGAATGACAATGATTGTACTGGTTAATTGTTATATACCTTGCAATTGATTGCCTAAATATTTGTAGTTATACATTAGATTTCAGGATTAGTTGAGTAGGTAAATAATCTCTTTAATCATTGGAATTTTCCCCCTTGTGACATCAAGTGCACCAACATGGGAGAAGAACAGCTCACACCTGATTGAAGATGGCTATATATGGAGAAAGTATGGACAGAAAATGACCATCAATGCAAAATACCTCAGGTATATATATATTCTTCAATTTCAAGCAACAAAAATTCCCTTTCTCTCTATATAGGTTTTCTCTTATGATCTTATATATACTTATCCAATATAATTCAATTCTGGTAATCTATATGTGTAGGACCTACTACAGATGCACTCACAAGTATGATCAGGGTTGTCCAGCAACCAAACAGGTTCAAAGGATTCAAGAGAACCCTCCATTGTACCGAACAACTTATTATGGTCATCACAATTGCAAAAGTCCAGAAATAATGTTGGAACCAGCTTCTTCTTCTGACTCTTGTATGTTCCTTAGCTTCAGTACCACCTTCCCGACCAAAGAAAAATACCAGTTTTCATCATCAGTTTTTTCATCCACGAAACAGGAGCCTATGGAAGTGATTCCGGATGACTGTGGTATACACAACCAATTACCCTCTTCAGATTACAATCTGTTAAGTGACTATGAACTTGATTTCAATTGTTTGAGGCATGACACTGTGCAGTCTATGCCATCCTCCACTGAATCTTTTCTATTTGATCAAGTTTATGGGAGCGATATGGATTTTGATGGCTAG