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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12096 LG3 10576849 10580021 PREDICTED: TMV resistance protein N-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12096.1
MGGIGKTTLVRALYERICRQYNYRCFIDDVSQIYRDSNSLGIQKHLISQCLNEKNLEICNVIEGTCLVRSRLNNARALIVLDNVDQVQQLRIFSGNRVNLLRECLGGGSRIIIVSRDQQILKIHGVDDIYQVQPLNWEDAIQLFYRNAFIKGNYILSDYEKLAPKILSHVEGHPLAIEVIGSSLVGRSLSQWKSVLAALKENKSKNIMDILRISYIQLDEKDQQTFLDIACFFNSYYDEDAKEILDFRGFHPEDSIEVLKDKSLITEDPYGFIHMHSLLVDLGRCIVREESPKEPIKWSRLWALKDLHDAMSENEATRNLEAIVCNSNWEWDNAEIPDETIKADGLSKIKHLKLLYVGDVEFSGSLSHLSNELGYLIWKRYPFECLPQSFQPHKLVELILSGDSIQRLWEGTKPLPNLKRLDLSFCKSLVEMPDVAEALNLERINLEGCIQLEKLNPSIQSLRKLVLLNLRNCIKLVILPNTILGLNSLKCLDVRDCSIDSKCLLDEARNAEHLISCLSPSSLFPCLRELDLSFCNLVKIPEDIGKLHCLERLSLEGNNFVELPNLKDLFRLYFLNLGHCKRLKYLPDLPLQTVLPSEPFILPRLPSSKFDSLDFWNDDEVSDYQSAGLIIFSCPGLVEIEQCMRKSFSWTIQILKATYSMPFFGSIMPGSQIPSWFNNEGVKVEKDVLTIGPSPDPHDDNLLGVFSMTNGGGISKCWVMRMLGYENVVQADVKKCKYRWVNEQDLIDFDSDLTSRKRKFSLFEENGRGTIEAEAALHSNSP*


CDS Sequence:
>Vu_12096.1
ATGGGTGGCATAGGAAAGACAACTCTTGTTCGGGCTTTATATGAAAGAATTTGTCGTCAATATAATTATCGTTGTTTTATTGATGATGTAAGCCAAATATATCGAGATTCTAATTCGTTAGGCATACAAAAGCATTTAATTTCTCAGTGTCTGAATGAGAAAAATCTAGAGATTTGCAATGTTATTGAGGGAACATGTTTGGTGAGGTCCAGACTGAACAATGCAAGGGCACTTATAGTTCTTGACAACGTTGATCAAGTTCAACAACTGAGGATATTTAGTGGAAACAGAGTCAATTTGTTGCGAGAATGCTTAGGTGGAGGAAGCAGAATCATCATAGTTTCTAGGGATCAACAAATATTGAAGATCCATGGAGTGGATGATATTTATCAAGTTCAACCGTTGAATTGGGAAGATGCTATCCAACTATTTTATAGAAATGCTTTCATCAAAGGTAATTATATTTTGAGCGATTATGAAAAGTTGGCACCTAAGATACTATCACATGTTGAAGGCCATCCCTTGGCAATTGAAGTAATTGGATCATCTTTGGTTGGCCGAAGTTTGTCACAATGGAAAAGTGTATTGGCTGCGCTAAAAGAAAATAAAAGTAAAAATATTATGGATATTTTGCGCATAAGTTATATTCAACTGGATGAAAAAGACCAACAAACATTTTTGGATATTGCTTGCTTCTTCAATTCTTATTATGATGAAGATGCGAAGGAAATTCTAGATTTCCGTGGATTTCATCCTGAAGATAGCATAGAAGTGCTCAAAGATAAATCACTCATTACCGAAGATCCCTATGGATTCATACATATGCATAGCTTGCTAGTGGATTTGGGCAGGTGTATTGTTAGGGAAGAATCACCCAAAGAGCCTATAAAGTGGAGTAGGTTGTGGGCACTCAAAGATCTCCATGATGCTATGTCAGAGAACGAGGCAACTCGAAACCTTGAAGCAATAGTTTGTAATTCTAACTGGGAGTGGGATAATGCTGAAATCCCAGATGAAACCATCAAGGCAGATGGTCTATCAAAAATTAAACACCTGAAATTGCTTTATGTTGGGGACGTGGAGTTTTCGGGAAGTCTCAGTCATCTTTCGAATGAACTAGGGTATCTTATTTGGAAGAGATATCCGTTTGAGTGTTTGCCTCAAAGTTTTCAGCCACACAAACTGGTTGAGTTAATCCTGAGTGGGGACAGTATTCAACGACTGTGGGAAGGCACAAAGCCGTTACCCAATTTGAAGCGTCTGGATCTCTCTTTTTGCAAAAGTTTAGTTGAGATGCCCGATGTAGCAGAGGCCCTAAATCTTGAAAGGATAAATCTTGAAGGATGCATACAGCTCGAAAAACTCAATCCATCGATTCAGAGTCTGAGAAAGCTTGTTCTTTTGAATTTGAGAAACTGCATAAAACTAGTAATCTTACCCAATACTATATTGGGCCTGAATTCTCTTAAATGTCTGGATGTCCGTGATTGTTCAATAGATAGTAAATGCTTACTAGATGAGGCAAGGAACGCAGAGCACTTGATCAGCTGTTTGTCGCCCTCCTCTCTTTTCCCTTGTTTGCGTGAACTCGATCTAAGCTTCTGTAACTTAGTTAAAATTCCTGAGGACATTGGAAAGTTACATTGCTTAGAAAGACTAAGTTTAGAGGGAAACAATTTTGTTGAATTGCCTAACCTCAAGGACCTTTTCAGACTGTATTTTTTAAACTTAGGGCATTGCAAGCGATTGAAATACTTGCCTGATCTCCCTTTACAAACTGTCCTGCCCTCAGAACCTTTCATACTGCCGAGATTACCATCTTCAAAATTTGATTCACTTGATTTTTGGAATGACGATGAGGTAAGTGATTATCAAAGTGCAGGATTAATCATTTTCAGCTGCCCAGGATTAGTTGAGATTGAACAGTGCATGAGAAAGAGTTTTTCATGGACAATACAAATTCTTAAGGCGACCTACTCCATGCCATTCTTTGGAAGTATTATGCCTGGAAGTCAAATACCGAGTTGGTTCAACAATGAGGGTGTGAAGGTGGAGAAAGATGTTCTAACCATTGGTCCATCTCCCGATCCGCACGACGATAATTTGCTTGGTGTTTTCTCCATGACGAATGGAGGTGGAATTTCGAAATGTTGGGTTATGAGAATGTTGGGTTATGAGAATGTTGTTCAGGCGGATGTGAAGAAATGTAAGTATCGCTGGGTAAATGAACAAGACCTAATTGACTTTGATTCAGATTTGACATCTCGGAAGCGCAAGTTTTCCTTATTTGAAGAAAACGGGAGAGGCACAATAGAAGCAGAAGCAGCACTGCATTCAAATTCCCCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_12096::LG3:10580021-10582021(-)
GTTCGCAATGAAAAAACCGTCGTTCTGCAAGGTTCAATAAAACGAAAACGAACAAGGGCATATAAAATACCTTGCGATTAACACTCACCCCAACCCTCCAACGAACAACGGCGACGTTAAAAAACCGCTCCTTTGAAGAAAATGACAACGCTTGCCCCTTCAACACACTTCCTCCCAACACTTCAATGGTGGACGGAGACAGAGGACTTCAATGCCGGACTTCAATACTTCCAAACACGATTTCGCTGGCGTGCACAAACTTCAGAGTGGACGCAAAGTTTCGGACAAACTTCAGAGTGGACGCAGAGTTTCGGACTTCTTTTGGTGGAAGGCTTCGTTTTCGAATGGGAAAATGTTTAGAGAGAGTGTCCGGAATTGTAAGGGCGCCAATGACTCATTCCGAAACTACCCTCCAAAGCACGTTATTTACTTTTCAAATCTCCAATTAAAACAGCAAATCACACAACGACACGTGTCGTTGTTAATTTGTTGTCAAATGGGCGTTGTCGAACAAACATTTTCCCTTCATTTTACCTCTCTTTCTTTTCTCCTTAAGGTCACGCCACTCACTTTCCTGCTCTAATAACAACTATCTCTCACTTTCCCACTAAAATCTACGATCCGGGCTTCATTCTTCAGTGAACAAAGTTTCGGACTTTGTGGGATTCGGCTTGTTCCACTGCTCTCAAGGGCAAGGTCGCAGTGTGTCCTGCCGTTGTCTGCGGCGCGGCGCCGCTGGTGGTCATACTGAAAAGAGTTCGAGGTATTGAGTGCGACTCCATTTGGTTTCCGATTTCCTTAATAAATTTGAGTCGCGTGTCTTGAACATTCTCCGGCGTATCCTCCGGTGTGCCAAAGAACTGGACCTTATCATCTCCGGCATGTCCGAGTGTATGACCGCGTCCGACGCCATCATCCATCACACCCCTTCTTCATCTCATGCAATTAACACATACGATGTATTTGTGAGCTTTCGTGGTGAAGACACGCGCAACAACTTCACTAGTTCTTTCTTTGGAGCTCTCCGTCGAGAAGGCATTGATGCCTTCAAAGATGACGAATATCTCAAAAAAGGTGAATCCATAGCACCCGAGCTGCTGCAAGCCATTCAAGGCTCTCGAGTTTTCGTTGTTGTCTTCTCAAAGAACTATGCTTTCTCCACTTGGTGCTTACGTGAACTGTCAGAGATACTTAACTGCGTTAATACTTCAACAAGACGTGTTTTACCTATATTTTACGATGTTGATCCTTCGGTGGTGCGCAAACAGAGTGGATGTTATGAGAAAGCATTTGCAGAACACAAAAATAGATTCAGAGAGGATAAGGTGAAGACGGAGGAAGCTCAAAGATGGAGAGAAGCTCTCACACAAGTGGCCAATCTCTCCGGTTGGGATATCCGAAATAAGTGAGTACTCTTCTCTCTCAATTCAATAATTAGTAACCTGGACATGATAGAAGTATCAATTGATTTGATGACAAATCTAGCTTTATTGATATTTGGAAGTGCTTCACAAAAATTAAACTGCGGTTGCCTATATATACGGTATTCTGCATCTTTTTAACTAGTTTTGCTCATAGGCTAATCACAATATCTTATAGCTTTCTACGACTTTCTTTATGCTAATTATGATTTGTCTTATGTCATTATCTAAAAACAGAGGTTCAGGAGGAAACCTGCACATTGAGTACAAATATATACTAGTTTAATAATAATAATAGTTTGACGGTTAAAATTTTTTACGTCATTATTTTATCCTAAAAATGTATATACTCTTTTCATGTTGTGTTGCGTGATGTTTTGCATTCATTTCATTTAAATTTTCAGGCCACAAGATGAACAGATTAAAGAAATTGTTCAAACCATAATAAATATTTTGGGACCAAATATTTTAAATCTTCCAAGGGATGAACTAGTTGGAATAGAGTCTCGAGTTCAAAACTTAAGAAATATTTTGCGTTTTGATCTCCTTAATGATGTTCGAGTTGTCGGAATAAGTGGA


Gene Sequence:
>Vu_12096(-)
ATGGGTGGCATAGGAAAGACAACTCTTGTTCGGGCTTTATATGAAAGAATTTGTCGTCAATATAATTATCGTTGTTTTATTGATGATGTAAGCCAAATATATCGAGATTCTAATTCGTTAGGCATACAAAAGCATTTAATTTCTCAGTGTCTGAATGAGAAAAATCTAGAGATTTGCAATGTTATTGAGGGAACATGTTTGGTGAGGTCCAGACTGAACAATGCAAGGGCACTTATAGTTCTTGACAACGTTGATCAAGTTCAACAACTGAGGATATTTAGTGGAAACAGAGTCAATTTGTTGCGAGAATGCTTAGGTGGAGGAAGCAGAATCATCATAGTTTCTAGGGATCAACAAATATTGAAGATCCATGGAGTGGATGATATTTATCAAGTTCAACCGTTGAATTGGGAAGATGCTATCCAACTATTTTATAGAAATGCTTTCATCAAAGGTAATTATATTTTGAGCGATTATGAAAAGTTGGCACCTAAGATACTATCACATGTTGAAGGCCATCCCTTGGCAATTGAAGTAATTGGATCATCTTTGGTTGGCCGAAGTTTGTCACAATGGAAAAGTGTATTGGCTGCGCTAAAAGAAAATAAAAGTAAAAATATTATGGATATTTTGCGCATAAGTTATATTCAACTGGATGAAAAAGACCAACAAACATTTTTGGATATTGCTTGCTTCTTCAATTCTTATTATGATGAAGATGCGAAGGAAATTCTAGATTTCCGTGGATTTCATCCTGAAGATAGCATAGAAGTGCTCAAAGATAAATCACTCATTACCGAAGATCCCTATGGATTCATACATATGCATAGCTTGCTAGTGGATTTGGGCAGGTGTATTGTTAGGGAAGAATCACCCAAAGAGCCTATAAAGTGGAGTAGGTTGTGGGCACTCAAAGATCTCCATGATGCTATGTCAGAGAACGAGGTAAAGTTAAATGTTTGATTATAAATTTTAGATTGCAATTATTTTAGAATTTAAATACTTCAAAACATACATCTAACAATGTGCGATGTTATAGGCAACTCGAAACCTTGAAGCAATAGTTTGTAATTCTAACTGGGAGTGGGATAATGCTGAAATCCCAGGTATGTAAACGTTGTATTGTGACAAGAAATTCCTCTGTTTTATTGAATGAGAAACTGGCTAATATATAGCCTCACCTAAGGTTAAAGAACTGAAAAGAAAAAACTGTCCACGCATGTAACCTGCAACTTCCTAATATTATCATAGACTATTCAACAATTACAAAACTGCTCCTAAATTTACGGAATCATGCAACTGATTTACAGATGAAACCATCAAGGCAGATGGTCTATCAAAAATTAAACACCTGAAATTGCTTTATGTTGGGGACGTGGAGTTTTCGGGAAGTCTCAGTCATCTTTCGAATGAACTAGGGTATCTTATTTGGAAGAGATATCCGTTTGAGTGTTTGCCTCAAAGTTTTCAGCCACACAAACTGGTTGAGTTAATCCTGAGTGGGGACAGTATTCAACGACTGTGGGAAGGCACAAAGGTAGTGTAAATTAATTTTTTTATTTGTACTTCTTTTAAAAATAAACAAAATAAATGACAAACTTTTTATTTTTAATTCCTTTATTCTTTGATTAATTTATGGAAAAAAAGAAATTAAAGAAAACCCAAGTGTCACTATTAATTTTGTTTTTTTTTTGCCAATCTCTGTAGCCGTTACCCAATTTGAAGCGTCTGGATCTCTCTTTTTGCAAAAGTTTAGTTGAGATGCCCGATGTAGCAGAGGCCCTAAATCTTGAAAGGATAAATCTTGAAGGATGCATACAGCTCGAAAAACTCAATCCATCGATTCAGAGTCTGAGAAAGCTTGTTCTTTTGAATTTGAGAAACTGCATAAAACTAGTAATCTTACCCAATACTATATTGGGCCTGAATTCTCTTAAATGTCTGGATGTCCGTGATTGTTCAATAGATAGTAAATGCTTACTAGATGAGGCAAGGAACGCAGAGCACTTGATCAGCTGTTTGTCGCCCTCCTCTCTTTTCCCTTGTTTGCGTGAACTCGATCTAAGCTTCTGTAACTTAGTTAAAATTCCTGAGGACATTGGAAAGTTACATTGCTTAGAAAGACTAAGTTTAGAGGGAAACAATTTTGTTGAATTGCCTAACCTCAAGGACCTTTTCAGACTGTATTTTTTAAACTTAGGGCATTGCAAGCGATTGAAATACTTGCCTGATCTCCCTTTACAAACTGTCCTGCCCTCAGAACCTTTCATACTGCCGAGATTACCATCTTCAAAATTTGATTCACTTGATTTTTGGAATGACGATGAGGTAAGTGATTATCAAAGTGCAGGATTAATCATTTTCAGCTGCCCAGGATTAGTTGAGATTGAACAGTGCATGAGAAAGAGTTTTTCATGGACAATACAAATTCTTAAGGTGTGGATGCTCTTTCCTTCCTCTTGCCTTTGAATTTTTGATTTATTTATTTTTGTCTAGAGAACAACTACTAACGAATAACTCTGCTAGTACCAGGCGACCTACTCCATGCCATTCTTTGGAAGTATTATGCCTGGAAGTCAAATACCGAGTTGGTTCAACAATGAGGGTGTGAAGGTGGAGAAAGATGTTCTAACCATTGGTCCATCTCCCGATCCGCACGACGATAATTTGCTTGGTGTTTTGTATTGTGTAATATTTCGTCTAGACAATGAAACCAAAGTGAAATATTCAAGAACAAAAAAATTTCGAAACAAACAAATTCCAACGGATTTTAGAAGAGATCTAGTCATTGACCAGTCAGATCACATGTTGATACACTATATTGAATGTTCTGTGCAGCCCGGATTTCGTATAAATGGTTTTCAGCTCCATGACGAATGGAGGTGGAATTTCGAAATGTTGGGTTATGAGAATGTTGGGTTATGAGAATGTTGTTCAGGCGGATGTGAAGAAATGTAAGTATCGCTGGGTAAATGAACAAGACCTAATTGACTTTGATTCAGATTTGACATCTCGGAAGCGCAAGTTTTCCTTATTTGAAGAAAACGGTTAGCATCAAAGTGAAGAATTGAAGCCTTTATTGAATGTGGAATGTGGAAGTATGATTTGCTACCATCTAACCAGGGAGAGGCACAATAGAAGCAGAAGCAGCACTGCATTCAAATTCCCCTTGA

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