Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12061 LG3 9848454 9851844 cysteine-rich receptor-like protein kinase 10
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 9849457 intron_variant
G/T 9849509 synonymous_variant p.Val270Val
A/T 9849656 intron_variant
G/A 9849690 intron_variant
T/G 9849746 intron_variant
T/A 9849753 intron_variant
G/T 9849799 intron_variant
A/T 9849851 intron_variant
C/A 9849890 intron_variant
T/A 9850135 intron_variant
C/A 9850195 intron_variant
T/A 9850204 intron_variant
G/A 9850214 intron_variant
G/A 9850258 intron_variant
A/G 9850284 intron_variant
A/T 9850301 intron_variant
T/C 9850312 intron_variant
T/A 9850821 intron_variant
A/T 9851290 intron_variant
C/G 9851301 intron_variant
A/C 9851306 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12061.1
MIYQWLFIIKLVYLVVCFVAAQNSSNSQQPLDYRYACLDQSSAPPSASYQTNLDNLFTSLSSDSATSNGFGNRTSGVNQDMVYGLYLCRGDVNTSLCNTCVQNSSILLMQHCPNNASAILWYPYCLLRYSNQNFFGNLTLTPRIPMFDATQNSTSAGEFDSDAQVLMNGLIQIGSEASLKFGTHMFNINGTQRRYGWVQCSRDITAEECRTCLSNMLEDVDNCCQEKKVWRIFSPSCIVMYETQPFFLNGTDSAPPPQQDNAATDGNNRRWWPIVIIVIAGIVVLALLAISIYYCYLKRKKDKQTIQEEGLKSIFSQEQTEKEESMNTDLPMIPLKYAMEGLFSVKSDVFSFGVLLLEIISGKMSSKFYQSDKGQSLLVYAWNLWCESKGLELMDPSIEKSSVHSEVVKCMHIGLLCVQEDAADRPTMSSVVHMLASDTMSLPCPTRPAFSVGRAAIERESSSNTSMHYSLNEITVSEVIPR*


CDS Sequence:
>Vu_12061.1
ATGATCTATCAGTGGTTATTCATCATCAAACTGGTATACCTCGTTGTTTGCTTTGTTGCTGCTCAGAACAGCAGCAACTCACAGCAACCACTTGATTATAGATATGCTTGTTTGGACCAATCTTCTGCTCCTCCCTCTGCTTCTTACCAAACCAACCTCGACAATTTGTTCACTTCCCTCTCATCTGATTCTGCTACCAGCAATGGTTTTGGGAATAGAACTTCAGGTGTTAATCAAGACATGGTTTATGGACTCTACCTTTGCCGTGGTGATGTGAACACCAGCCTTTGCAACACTTGTGTCCAAAACTCTAGCATCTTGCTCATGCAGCACTGCCCCAACAATGCCTCTGCTATTCTCTGGTATCCCTATTGTCTTCTGAGGTACTCAAACCAGAATTTCTTTGGAAATCTCACCCTTACGCCAAGGATTCCCATGTTTGATGCCACGCAGAATTCTACTAGTGCTGGAGAGTTTGACAGTGATGCTCAGGTTTTGATGAATGGTTTGATACAAATAGGGTCAGAGGCATCCTTGAAGTTTGGAACACATATGTTCAACATAAATGGCACTCAGAGAAGGTATGGTTGGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTACAGCTGAGGAATGCAGAACATGTTTGAGCAATATGCTTGAGGATGTTGACAATTGCTGTCAGGAGAAGAAGGTGTGGCGTATCTTTTCTCCAAGTTGTATAGTTATGTATGAAACTCAGCCTTTCTTTTTGAATGGTACTGATTCTGCACCACCACCTCAGCAAGATAATGCAGCCACAGATGGGAATAACAGAAGGTGGTGGCCTATAGTAATCATTGTCATAGCTGGAATTGTAGTACTAGCTCTATTGGCTATCAGCATATACTACTGCTACTTGAAAAGGAAAAAAGACAAACAAACTATACAAGAGGAGGGACTAAAGTCAATATTTTCACAAGAACAAACAGAAAAGGAGGAGAGTATGAACACTGACCTTCCTATGATACCTCTGAAGTATGCTATGGAAGGTTTGTTTTCAGTGAAGTCAGATGTTTTCAGCTTTGGTGTTCTTTTGCTAGAGATCATCAGTGGAAAAATGAGCAGTAAATTCTATCAGTCAGACAAAGGCCAAAGCCTTCTCGTATATGCATGGAACCTCTGGTGTGAAAGCAAAGGGTTGGAATTGATGGATCCATCAATAGAAAAATCAAGTGTACACAGTGAAGTTGTGAAGTGTATGCACATTGGACTGTTGTGTGTGCAAGAAGATGCAGCAGATAGACCAACAATGTCAAGTGTTGTTCATATGCTTGCAAGTGACACAATGAGTCTTCCCTGCCCCACACGCCCTGCATTTTCTGTTGGAAGAGCAGCCATTGAAAGAGAATCTTCATCAAACACTTCTATGCATTACTCTCTCAATGAAATAACAGTCTCTGAAGTGATACCAAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_12061::LG3:9846454-9848454(+)
TGTTAGATCTATAGTGTATATAGTTTTGTACTAGGCGCGCTGTTTATAAAATTTAAATTCTATGGTTATTTTAGATAATTGTAAAGTTTATACTTATATTATAATTTCTAACTATTGTATCATATTAGATATGTGATAACTCTTCTATATAGTTCATTACTATATTTTTGAGATGTTACACAAATAATTATAAAATAAATAATTTATATACTTTTTTATTATTAAATATTCTTTATTATAAATAATTATTTGAATTAAAAAATAATTATTAAAAAGATAAAATAATAAAATATTAGTTTTAATTTATAACACATGTAAATTTATACCAATAGTTATTTAAAGGATAAAAATAGTAATGTAATTATTTTTATTTAAAATAACGATTAATTAAGATATAAAATTGAAAAAAGTATGTACAAAAAAAAATGTTACAGATAAATAAAAAATAAAGTAATTAATTAATTTTTATATTTTAACAATAATAATTTATAAATAATATTTGAATATTTAATTAAAAAATATTTATTAATTTTTAGATAATTTATTAACAAAAGTTAATTTACATTGTTATCAAATAATCACACAAACTAATGCATTATTCTCCTTATTTCTTTAAAAGGTGAATTGAATGACATATTTTTTTGAAAAAAGTACGAATGACACGACGTAGCATTTGGTTTATCCTATTTCATAAATAAACCTTTCCAACACTCTATACTCTATTATGTTGTAATTAAGTTTGACTTATAATTCCATCCTAACATGACAATTTTTACATTCATTTAAAATATAATATACAAATAAAATAATTATAAAAAAATAAATTTTTATATTTTAAAAAAGTATATATATATATATATATATCATATAAATATAAAATTTTATATATATCAAAATATTATATCTCTTGTAAGATTGAGACAAATTTATAATTTGGTTATTTTTCCTTGATCTTAGCCAAATTATACTTTAATCATTTATTTTTCTTTTATGTCTCATTCAGTATACTCCTAATCTGCCAGAAAAAATTAAAATAAAAAAATTATAAATTATAAAGTGTTTGGATCATCAATCCAAAGACATATACTTTCAACATTTATGAATATCTTAACCAAACATGATGAAGACATTGGATGGTGTATTACCTCAATTATTTGTATGCCAAACATGGTTTTAACTTTATCAGAGGTACCAATGTTGACCATGATTATGTTTTTAATATTAAACTATTTGTTCATTGGTTATAAACACCAACCCTCTGCTATTTGATTTTTCAATCTCACAAATTTCTATCTTATCTGGCTAAGCCTCACCAACGCGCTTCCAAATATGAACCAAACTAGACGAAATTCAAAAATGAACATAAGAATAAGATTTTATTAAATAATACTTTTACACTCTGTCTAATAATCTTACATTATTTAAAAAGTTGATATTTAAAACAGTTTAAACATTATTTTTTATATTTTTTGAAATACTTTTTAAGAATAAAATTGTACGGAATGCTAAGTTCCAAAACAGATAAATTTTCTATTGTTATTTTTTTATTTGTTTTTAAAATATAAATTGTGATTAGTATAAAATGATATAAATTTTATGATTAATATTAAATAATATTACTCTTAATGTATTAAGAGTGATTTTTATTATTTTGACTTTTACCAGTGTGAATGTAATAAAAATATAAAAAACATAAAATATAATAAAAATTCAATTGAAAATACATAAATTATAAAATTTGATACTTAATTAAGCCCGAACAATTTCTATAAAGTTAATTTAGTATTAACCAATTTTTGAATTTTTCTAATACTATATGGGTTTCACACTTTGCGTTTTGGAGGGTCAAAAAGTTGATGCTACAAGCTAAGAACATGAAAATGAGCAAATGTCAAACGGTTGACAAATTGATGATGTATAACTTCGAAATCTAGGCCTCTGAAGCACTCCTCACATAATTATGCTGATGATACACAGTGGTGATTGCAGCAAAAGAAGAA


Gene Sequence:
>Vu_12061(+)
ATGATCTATCAGTGGTTATTCATCATCAAACTGGTATACCTCGTTGTTTGCTTTGTTGCTGCTCAGAACAGCAGCAACTCACAGCAACCACTTGATTATAGATATGCTTGTTTGGACCAATCTTCTGCTCCTCCCTCTGCTTCTTACCAAACCAACCTCGACAATTTGTTCACTTCCCTCTCATCTGATTCTGCTACCAGCAATGGTTTTGGGAATAGAACTTCAGGTGTTAATCAAGACATGGTTTATGGACTCTACCTTTGCCGTGGTGATGTGAACACCAGCCTTTGCAACACTTGTGTCCAAAACTCTAGCATCTTGCTCATGCAGCACTGCCCCAACAATGCCTCTGCTATTCTCTGGTATCCCTATTGTCTTCTGAGGTACTCAAACCAGAATTTCTTTGGAAATCTCACCCTTACGCCAAGGATTCCCATGTTTGATGCCACGCAGAATTCTACTAGTGCTGGAGAGTTTGACAGTGATGCTCAGGTTTTGATGAATGGTTTGATACAAATAGGGTCAGAGGCATCCTTGAAGTTTGGAACACATATGTTCAACATAAATGGCACTCAGAGAAGGTATGGTTGGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTACAGCTGAGGAATGCAGAACATGTTTGAGCAATATGCTTGAGGATGTTGACAATTGCTGTCAGGAGAAGAAGGTGTGGCGTATCTTTTCTCCAAGTTGTATAGTTATGTATGAAACTCAGCCTTTCTTTTTGAATGGTACTGATTCTGCACCACCACCTCAGCAAGGTATGAGTTCAGTTTTTTTCACCTTCATTCTGAGACATTCATTTGCTACGGTTTATAAGATCAGTGAAAATTCATTCCCCTAAATTTGGATTGATGGTTAAAGTGTTGTCTTGTCACAGATTTCAAAATTCATACCCCTTGCTCCCCAACAACTTGGGCTAGTTTGATCCTGAGTTTTTATAAGGCCTGAAATAAAAATATTCACTTCTCATCATTTTACACGTTAAACTTTCTTTTTCTCTAGATAATGCAGCCACAGATGGGAATAACAGAAGGTGGTGGCCTATAGTAATCATTGTCATAGCTGGAATTGTAGTACTAGCTCTATTGGCTATCAGCATATACTACTGCTACTTGAAAAGGAAAAAAGGTAAGCATAAAGAACGTTGGATAAACCTCTTCAGAAACTCTTGTAGGAGAAGAAAATTGATATAAGAAATATGAGATAAAGCTTTTCCGCAAACTAGAATTAGTTTATGTACATATGTTAAACTAATTTGTAAAAGCTTTCTCCTGTTAACTACTCCAAAAAAAGTTGATGTTTAACTTATTTATAAGCTAATTTTAGTCTGTGGAAAAGATTTTTGATTTCTTATTTTCTTCTTTTGCAAGTGTTTCTAGAAATAAAGTCCAATCATATCATAACTCTAAAAGTGTTCTCTCAGCCAAGGCTATCTATCAATTCCTGTTTGTCTGATAATTTCATCTTTGCAGACAAACAAACTATACAAGAGGAGGGACTAAAGTCAATATTTTCACAAGAACAAACAGAAAAGGAGGAGAGTATGAACACTGACCTTCCTATGATACCTCTGAGTACTATTCTAAAATGTACAAACAATTTTTCTGATGAACAAAAACTGGGGAAAGGTGGATTTGGACCTGTCTATAAGGTAGTGAATTTGGATATCAGACATGATGTATATTTGTTTGGTTTCTCCACTTGCAACATTCTTACTTATACATTTGAAATATATTCTAGGGTATATTACCAGATGGAAGACAAATTGCTGTTAAAAGGCTTTCGAAAACATCAGTTCAAGGTGGGGAGGAATTCAAGAATGAAGTAATATTGATTGCTAAATTGCAGCATCGCAACCTTGTGAGACTGTTGGCTGGCTGCATTGAGCAAAATGAAAAGCTGCTAGTCTATGAATTCATGTCAAATTCAAGCCTTGATTTCCACCTATTTGGTATGACTCCAAAACAATGACCCAGTTGTTCATTATTTCATTTCTCATCGTTGAAATAAATCAGCAATTTGGCAGAAGATCTTGATATATATTCCGATATAAATTTCTGAGTTTGATTACATATAATAGAAGTTAGTTCATGCACAAACACCAACACAACATTTTGCTACCTAGTTCATATTTGCTGTGGATGTAGTCATATTTCTCACTTTGAATGGCATGTTTTTGAATATTGTGATCATATTTCTTAGAATTGCGTTTCAGATACCAAGAAGGGTGTCCATCTGGATTGGAAAAATCGATTAAACATTATAAATGGGATTGCAAAAGGGCTTTTATATCTACATGAAGACTCAAGATTAAGGGTTATTCACAGAGACCTGAAAGCTAGCAACATTTTGCTAGATCATGAAATGAATCCTAAAATCTCAGACTTTGGATTGGCAAGAACATTTGGAGGAGACCAGAGGCAGGCCAACACAATTAGAGTTGTTGGAACATAGTATGAACCATTCTCCTTCTTTCAATTGTGTACCAAATTCTTCACATGAATATGTAACTATGAATTGCCACATAGCATCACAATTCATTTTCTAGCCTTCTCCTCTTGCTGAATTTACATGATATTGATAAAGCTTACCGTTACATTGATTTTGAGCAGTGGATACATGGCTCCAGAGTATGCTATGGAAGGTTTGTTTTCAGTGAAGTCAGATGTTTTCAGCTTTGGTGTTCTTTTGCTAGAGATCATCAGTGGAAAAATGAGCAGTAAATTCTATCAGTCAGACAAAGGCCAAAGCCTTCTCGTATATGTATGTTTCCAACTTATGTTTATGTTCAAATATCTTCATGGTACATGCACATGATATGCTTTTACTCCCAAAATGTTTGTTGTCACCTACTCTAGCATAAGACAAATGTTTTGTGTTGGTTTTACCTGTGTTTTAAGTCTTAAAGCTTCCTTATATATCCATTATTAGAAGAGTACTAATAATACTTTTGCTCTTGGTTGAAACAAATTCATTCATAGAATTTCTCTATTGTTTAACCTTATGTTCTCTTCATTTTCTTCAAGTGGTTCTATCTAAATCATCTGCATTTACTATCGTAGGCATGGAACCTCTGGTGTGAAAGCAAAGGGTTGGAATTGATGGATCCATCAATAGAAAAATCAAGTGTACACAGTGAAGTTGTGAAGTGTATGCACATTGGACTGTTGTGTGTGCAAGAAGATGCAGCAGATAGACCAACAATGTCAAGTGTTGTTCATATGCTTGCAAGTGACACAATGAGTCTTCCCTGCCCCACACGCCCTGCATTTTCTGTTGGAAGAGCAGCCATTGAAAGAGAATCTTCATCAAACACTTCTATGCATTACTCTCTCAATGAAATAACAGTCTCTGAAGTGATACCAAGGTGA