Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11837 LG3 6445432 6448308 PREDICTED: TMV resistance protein N-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 6445839 synonymous_variant p.Leu136Leu
G/A 6445872 stop_gained p.Trp147*
G/T 6445994 missense_variant p.Ser188Ile
A/T 6446332 upstream_gene_variant
C/T 6446841 upstream_gene_variant
C/A 6447114 synonymous_variant p.Pro319Pro
C/A 6447150 missense_variant p.Phe331Leu
A/C 6447151 missense_variant p.Ile332Leu
G/A 6447171 synonymous_variant p.Glu338Glu
T/A 6447446 stop_gained p.Leu430*
C/G 6447457 missense_variant p.Leu434Val
T/C 6447559 missense_variant p.Tyr468His
C/G 6447614 missense_variant p.Ser486Trp
C/T 6447726 upstream_gene_variant
G/C 6447756 upstream_gene_variant
A/G 6447815 missense_variant p.Glu521Gly
T/A 6447819 synonymous_variant p.Ala522Ala
T/C 6448048 missense_variant p.Phe599Leu
C/G 6448061 missense_variant p.Thr603Arg
T/A 6448296 synonymous_variant p.Val681Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11837.1
MVGIHGLGGVGKTTLALAVYNSIADHFEGLCFLENVRENSNKHGLQHLQRILLSQMIGENNVNITSARQGISMMEHRLRQKKILLILDDVDKHEQLQAIVGRPDWFGPGSRVIITTRDKHLLSCHLIEKLYKVKKLEKNNALRLLSWKAFRTEEVDTSYLNVMDRVLAYASGHPLALEVIGSKLFRKSVKEWESAIKQYEKIPNNQILEVLKISFDALEEVEKSVFLDISCCFKAYALSEVEDILRAHYGPEYLPNSLRVLEWLKYPSQGLPPDFRSKQLSLCKLPSSCFGSLGLAEFSKASKLNSLNAVGCSKLRSFPPLKLTSLENLELSYCYSLERFPEILGKMGQITELVLEDCHIKELPISFQNLTELQTLQLRLCPRLRLPSSIVMMPKLANIIAWESKGWLFPKQVEGEEKIGSMVSSNVDCLYLPGCKLSDDFFPIILEWFANVKDLDLSRNNFTVLPECIANCHLLCKLTLDACDSLREIRGIPPNIRQLLARNCKSFTSSCGRTLLNQKLHEAGNTMFSFSGARFPEWFDHHSRGPSCSFWVGKKFPSIALCIAIGPTHLEHVEIVGPIMIINSIECSFDGEENPYLYMFPHHTYIFDLQHIVFSDYLDRFVSENEWNHVEITYSVEQRFKEKDKHAVTPISIENGIYVFKQRSNMEDIQFTDPHKKRRLDVDPE*


CDS Sequence:
>Vu_11837.1
ATGGTAGGGATCCATGGACTCGGTGGAGTTGGTAAAACCACACTTGCTCTTGCAGTGTACAATTCCATCGCTGACCATTTTGAAGGCTTGTGTTTCCTCGAAAATGTGAGAGAGAATTCAAACAAACATGGCCTACAGCATCTTCAAAGAATCCTTCTTTCTCAAATGATTGGAGAAAATAATGTCAACATAACTAGTGCGAGACAAGGGATTTCAATGATGGAGCATAGGCTACGACAGAAGAAGATTCTCTTGATTCTAGATGATGTTGACAAACATGAACAGTTACAAGCAATTGTTGGAAGACCTGATTGGTTTGGTCCCGGCAGTAGAGTCATCATCACAACTAGGGACAAACATTTGTTATCATGTCACTTGATCGAAAAATTATATAAAGTGAAGAAGTTGGAAAAGAACAATGCTCTTCGACTGCTTAGTTGGAAAGCTTTCAGAACAGAAGAAGTTGATACAAGTTATTTGAATGTAATGGATCGTGTACTAGCTTATGCTTCTGGCCATCCATTGGCTTTGGAAGTAATCGGTTCGAAGTTGTTTAGAAAAAGTGTAAAGGAATGGGAATCTGCCATCAAACAGTACGAGAAAATTCCTAACAATCAAATCCTTGAGGTGCTTAAAATAAGTTTTGATGCTTTAGAGGAAGTAGAGAAGAGTGTTTTTCTTGACATTTCTTGTTGCTTCAAAGCATATGCATTGTCAGAGGTGGAAGATATACTTCGTGCTCATTATGGTCCTGAATATCTTCCGAATAGTTTAAGAGTACTGGAATGGTTGAAATATCCTTCACAAGGGCTACCGCCAGATTTTCGTTCAAAGCAACTTTCCTTATGCAAATTACCTTCAAGTTGTTTTGGGTCACTCGGATTGGCTGAGTTTTCAAAGGCAAGTAAGCTTAACTCCTTGAATGCTGTTGGTTGCAGCAAGCTTAGGAGTTTCCCCCCCCTCAAATTGACTTCTCTGGAAAATCTTGAACTTTCATATTGTTACAGTCTTGAGAGGTTCCCAGAAATATTAGGAAAAATGGGACAGATAACAGAACTTGTCTTGGAGGACTGTCACATAAAGGAATTGCCAATTTCATTTCAAAATCTCACCGAGCTTCAAACATTACAGTTGCGTTTGTGTCCAAGGTTAAGGTTACCTAGTAGTATAGTCATGATGCCAAAACTGGCCAACATTATTGCTTGGGAATCTAAAGGGTGGCTATTTCCAAAACAGGTCGAGGGGGAAGAGAAAATAGGCTCAATGGTGTCTTCAAACGTAGATTGTCTTTATCTCCCAGGCTGCAAACTCTCAGATGATTTTTTCCCAATAATTCTTGAATGGTTTGCTAATGTAAAAGATTTAGACCTATCAAGGAATAATTTCACGGTTCTTCCTGAATGTATCGCCAATTGTCACTTGTTATGCAAGCTTACTTTGGATGCCTGTGATAGTCTTCGAGAGATTAGAGGGATTCCACCAAACATACGACAGTTATTAGCAAGAAATTGTAAATCCTTCACTTCTTCTTGCGGAAGAACTTTACTGAATCAGAAACTGCATGAGGCTGGAAACACCATGTTTTCGTTTTCAGGAGCAAGGTTTCCAGAATGGTTCGATCACCACAGTCGGGGACCATCTTGTTCTTTCTGGGTTGGCAAAAAATTCCCTTCCATTGCTCTTTGTATTGCTATTGGACCAACTCATTTGGAACACGTTGAAATTGTTGGACCTATCATGATCATCAACAGCATTGAATGTTCATTTGATGGGGAAGAGAATCCTTATTTATATATGTTCCCTCATCACACATATATTTTCGATTTGCAACATATAGTTTTTTCAGATTATCTAGACAGATTTGTTTCAGAAAATGAATGGAACCACGTGGAGATTACATACTCAGTCGAGCAGAGATTCAAGGAAAAAGACAAACATGCGGTGACCCCAATCTCTATAGAAAATGGAATCTATGTGTTCAAACAGAGGAGCAACATGGAGGATATTCAATTCACTGATCCCCACAAAAAGAGAAGATTAGATGTTGATCCAGAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_11837::LG3:6443432-6445432(+)
TTCGCTATGTCTTCGCGAGTTCCTCCTTCTCCATTGACGCAACCTAGCAGTTCGAAACCCTCAACCCTATTGCGCTTAAGAACCACCATGTTTGCGAACCTGCTTCTCCCTCGTGCTTTCGTGCTTTCATCAACCTGCAACGAAACATAATCAACCCAAAAATTCCCAAATTAGAAACCCACAAAACCCTAATATTTCACATCCACCTAGTGCAAGACCACCAACATCCATCACAAGGGCAAGGCTGCAACGTCTTCATCTTCATTGAGACACCATCGCCGCGAGAAAGAACAAGAATCGTGACCACCACTGCTGCGCATCCATCATCACAACAGCGAATGACCCTTCTCGATTAGGACACCTGGCAGCTCCACGTGGGCAGTTAAATACCATCTCATTTGGGTATTGCACATCTGGATAATTGGCCATTAACGATTTAGTCTGCAAAAAGGACTAAATTGAACATAAATTACATTCTTTAGGACAACATTGAACAGAAAAAAAAAATTAGGACCATTTCGAACAAACCTAACGAAACAGGAACCATAAGTGCTATTAAGCCAAGTTTTAAAGTGATAGAAACAATTTTTTACCTTGAAAAATTTTAAGCTTTACTCTGTATCAATTTTTTAGGATAAGTTTTAGAAGAAACTTAATATTTTTAAAGTTATAAAAGTAATTTGATAATCTAACATTAAAGAATTTCAAATTCTATTTAAAGAAAAGACAAAATTGAAACATCTTCTATGATATCCCTTCCTTTCTCAAAGTGATGCTGCTTCTCTTTATATTTTTTAGACTTTATAAGCTCAATTAAGGTATCCACCGTTAACTTGATATTGTTTTTTTTGACTTTCCTGAAAGTTTCTTTCATATTAAAATGGATCATGGTTATTTTGAGTTATCTTCATCAAGTTTTCATTTTTTTATATAGGTCAATATTATTTTTGAGTTGGCATTAGTTAGAATTTCTTTTGTCAATATCAATAGTTTTTTTTTTACTTACATTAAATACAATTTTTTAAAGTAATGTCAATGTTTATTATTTTTAGTTTATATTATTAATGGTGTTCTTTTCTACCGATACCAAAAGTCGAGATTATTTATTCATGATGAAATTGAATAAAAGAATTCAACTTGACATTAGCAAAACTATTTTTCAACCGATGTTAGGTATGGCTTTTTATTTCATGATGAAATTGAATAAAAGAATTCAACTTGACATTAGCAAAACTATTTTTCAACCGATGTTAGGTATGACTTTTTATTTCATGATGAAATTGAATAAAAGAATTCAACTTGACATTAGCAAAACTATTTTTCAACCGATGTTAGGTATGACTTTTTATTTCACACCAATTAATTTATTCTTCTTCGAGTGACGCAAATCAGATTTTTTTTTCAGGGAAAATTGATACGAGTTATTTTCTAGTTAATATTATTGAAGCTATTTATTCATCATTGGTGACTAATTAGTTTGAGAGCATTATTTAGTGGTGGTTGTTAGTTATTGATTGAAAATTTGTTTGATTGAAGTATGTAGTGTGTATTTTTTTGTTGTTGTCCATATTTGCAAAGTTTCAATGATGAGTTTTATATTTAGTACTAATTGAAATACTTTATAAAATTTAATAAATTTAAATTATCTTAAAACAAAATTTATAATGAAAGGAATCCAAATTCAATGTATATAAATGTAAAATTTCAAAGTTTTTTTATAAGGTGTAGAATAATAATAAATATATTTTTTCTGAGATAATTTTACTAAAATAATTGTATTACTTTTGGTGAGAAAAAACATAATTTGAAGGGATATATAATTTGAAACTGATTGAACAGGGAGGAATATGAATACGAGTTTATCAAGAGGATAGTTGACTTGGTCTCCAACAAGATTAACCGTGCTCCTTTACACGTTGCGGATTATCCAGTTGGACTAGAGACTCGAGTGCTAGAAGTAAAGTTGCTTCTAGACATAGGATCTGATGATGGTGTCCACA


Gene Sequence:
>Vu_11837(+)
ATGGTAGGGATCCATGGACTCGGTGGAGTTGGTAAAACCACACTTGCTCTTGCAGTGTACAATTCCATCGCTGACCATTTTGAAGGCTTGTGTTTCCTCGAAAATGTGAGAGAGAATTCAAACAAACATGGCCTACAGCATCTTCAAAGAATCCTTCTTTCTCAAATGATTGGAGAAAATAATGTCAACATAACTAGTGCGAGACAAGGGATTTCAATGATGGAGCATAGGCTACGACAGAAGAAGATTCTCTTGATTCTAGATGATGTTGACAAACATGAACAGTTACAAGCAATTGTTGGAAGACCTGATTGGTTTGGTCCCGGCAGTAGAGTCATCATCACAACTAGGGACAAACATTTGTTATCATGTCACTTGATCGAAAAATTATATAAAGTGAAGAAGTTGGAAAAGAACAATGCTCTTCGACTGCTTAGTTGGAAAGCTTTCAGAACAGAAGAAGTTGATACAAGTTATTTGAATGTAATGGATCGTGTACTAGCTTATGCTTCTGGCCATCCATTGGCTTTGGAAGTAATCGGTTCGAAGTTGTTTAGAAAAAGTGTAAAGGAATGGGAATCTGCCATCAAACAGTACGAGAAAATTCCTAACAATCAAATCCTTGAGGTGCTTAAAATAAGTTTTGATGCTTTAGAGGAAGTAGAGAAGAGTGTTTTTCTTGACATTTCTTGTTGCTTCAAAGCATATGCATTGTCAGAGGTGGAAGATATACTTCGTGCTCATTATGGTGATTGCATGAAATATCATATTGGGGTGTTGGTTGAAAAATCTCTGATAAAATATGGTTATAATTCTGTAGTTACAATGCATGACTTGATAGAAGACATGGGTAAAGAAATTGTCCGGCAGAAATCTCCAGATAAGCCAGGGAAGCGCAGTAGATTATGGTCACCAGAAGAGATAATTAAAGTTTTGGAAGACAACTTGGTAAGACTCATGAATGGTTTGTTTCGTTCTTTGATTTATCTTTTTCTTACTATTATGTAATATTTAAATTTAACTAAGCATTTGTACTGCAGACTAACATATATCTGCACTATGCTTGATTGGTGCCTTTTCTGTCATCAGGGAAGTGGAGAAATTGAAATCATATGTTTAAATTCCTCCTTACCTGACAAAGAAGAAATAGTGGAATGGAACAGAAAGGCCTTCAAAAAGATGAAAAACCTCAAAACACTTATCATTAAAAATGGTAATTTTTCGGAAGGTCCTGAATATCTTCCGAATAGTTTAAGAGTACTGGAATGGTTGAAATATCCTTCACAAGGGCTACCGCCAGATTTTCGTTCAAAGCAACTTTCCTTATGCAAATTACCTTCAAGTTGTTTTGGGTCACTCGGATTGGCTGAGTTTTCAAAGGCAAGTATGGACGGTTGATTTTCCAAACCCAATATATAAATAAACTCCCATCCGCATTGTTAATTTTTGTTTCCTTGTTTGTCCTTTTTGGTTGCTGCAGAAGTTCATGAATATGACTCTTCTGAATTTTGACGAATGTGAAGGTTTAACACAGATACCTGATCTATCTGGGCTGCCAAATTTAGAAAGATTTTCATTCAAGAATTGTAAGAGTTTAATTACAATCCATGACTCCATTGGCTTCCTAGGTAAGCTTAACTCCTTGAATGCTGTTGGTTGCAGCAAGCTTAGGAGTTTCCCCCCCCTCAAATTGACTTCTCTGGAAAATCTTGAACTTTCATATTGTTACAGTCTTGAGAGGTTCCCAGAAATATTAGGAAAAATGGGACAGATAACAGAACTTGTCTTGGAGGACTGTCACATAAAGGAATTGCCAATTTCATTTCAAAATCTCACCGAGCTTCAAACATTACAGTTGCGTTTGTGTCCAAGGTTAAGGTTACCTAGTAGTATAGTCATGATGCCAAAACTGGCCAACATTATTGCTTGGGAATCTAAAGGGTGGCTATTTCCAAAACAGGTCGAGGGGGAAGAGAAAATAGGCTCAATGGTGTCTTCAAACGTAGATTGTCTTTATCTCCCAGGCTGCAAACTCTCAGATGATTTTTTCCCAATAATTCTTGAATGGTTTGCTAATGTAAAAGATTTAGACCTATCAAGGAATAATTTCACGGTTCTTCCTGAATGTATCGCCAATTGTCACTTGTTATGCAAGCTTACTTTGGATGCCTGTGATAGTCTTCGAGAGATTAGAGGGATTCCACCAAACATACGACAGTTATTAGCAAGAAATTGTAAATCCTTCACTTCTTCTTGCGGAAGAACTTTACTGAATCAGGTTTTGTCTTGTTTTTCTTTTGTTACGTATTTGATTTGATGTTGAGGACAGTGTACGCAATGGTGCTAAACTTATTGATCATTTGTGACTAACAGAAACTGCATGAGGCTGGAAACACCATGTTTTCGTTTTCAGGAGCAAGGTTTCCAGAATGGTTCGATCACCACAGTCGGGGACCATCTTGTTCTTTCTGGGTTGGCAAAAAATTCCCTTCCATTGCTCTTTGTATTGCTATTGGACCAACTCATTTGGAACACGTTGAAATTGTTGGACCTATCATGATCATCAACAGCATTGAATGTTCATTTGATGGGGAAGAGAATCCTTATTTATATATGTTCCCTCATCACACATATATTTTCGATTTGCAACATATAGTTTTTTCAGATTATCTAGACAGATTTGTTTCAGAAAATGAATGGAACCACGTGGAGATTACATACTCAGTCGAGCAGAGATTCAAGGAAAAAGACAAACATGCGGTGACCCCAATCTCTATAGAAAATGGAATCTATGTGTTCAAACAGAGGAGCAACATGGAGGATATTCAATTCACTGATCCCCACAAAAAGAGAAGATTAGATGTTGATCCAGAGTAG