Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11830 LG3 6383381 6384319 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6383598 missense_variant p.Glu241Val
C/A 6383600 missense_variant p.Trp240Cys
A/G 6383610 missense_variant p.Leu237Pro
G/C 6383915 missense_variant p.Asn135Lys
T/A 6384005 synonymous_variant p.Leu105Leu
G/A 6384014 synonymous_variant p.Val102Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11830.1
MGKLSIMLQGKCKNRKESSSWPLTKCFHHTNTRDTATRIAEEWNVDFSDLFIGNRFSHGAHSKIYHGIYKQQQVAIKIFQVGECEEDGNLRSLLETQFLREVAHLPRLHHQNVVSFIAACRDSDSYYILTEYQQNGSLRAHLNTLESKPISLRKVILFALDIARGMEYVHAQGIIHRDLKPENVLVDNNCNLRIADFGVACVASKCDSLRGTYRWMAPEMIKGKCYGRKVDVYSFGLILWELVSGTLPFEDMNPVQVAVAVVHRNSRPVIPTHCPQSLRDLINQCWALKPQKRLEFCQIVRVLEQMIKDILL*


CDS Sequence:
>Vu_11830.1
ATGGGAAAGTTATCAATCATGTTGCAGGGTAAGTGCAAGAACCGCAAGGAATCATCATCATGGCCATTGACAAAATGCTTTCACCACACCAATACAAGAGATACTGCCACGAGAATTGCAGAAGAATGGAACGTTGATTTTTCTGATCTCTTCATCGGGAACAGGTTTTCTCACGGTGCTCACAGTAAAATTTACCATGGCATATACAAGCAGCAACAAGTTGCTATAAAAATTTTCCAGGTAGGAGAATGTGAGGAAGATGGAAACCTTAGATCTCTTTTGGAGACACAGTTTTTGAGAGAAGTCGCACATCTACCTCGTCTGCACCATCAGAATGTGGTGAGTTTCATAGCAGCATGCAGAGATTCTGATTCTTATTACATTCTCACGGAGTATCAACAAAACGGTTCTTTGAGGGCACATTTGAACACGTTGGAGTCGAAGCCAATCTCTCTCAGGAAGGTCATACTTTTTGCTTTGGATATTGCTCGTGGAATGGAATATGTGCATGCACAAGGCATCATTCACAGAGACCTTAAACCTGAGAATGTGCTTGTAGATAATAACTGTAACCTCAGAATTGCTGATTTTGGCGTTGCTTGTGTGGCTTCAAAGTGTGACTCATTGAGGGGAACATATCGTTGGATGGCACCAGAGATGATCAAAGGAAAATGCTATGGGAGGAAGGTTGATGTGTATAGTTTTGGGCTTATTTTGTGGGAGTTGGTGAGTGGAACACTGCCATTTGAGGACATGAATCCAGTTCAGGTTGCTGTTGCAGTAGTTCATAGGAATTCAAGGCCTGTTATTCCCACACATTGCCCACAAAGTTTGAGAGATTTGATCAATCAATGTTGGGCATTGAAACCACAGAAGAGACTTGAATTCTGTCAGATTGTTCGAGTTTTGGAGCAAATGATCAAAGACATTCTTCTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_11830::LG3:6384319-6386319(-)
GAATTCTTAAGAGAGAAGATTGGAATTTGCAGTTCAAAAAACAAGGAGGAGTGTTAAAACTTGTTTTTTATAACTGCCTTAATTTATTTCAATTTATTTTAATTTATTAGTTGCTACACTTTAGGAGCAAGTCTCGTTTCTGGAAACTGCTACTGCTACGTGGTTTCTGAAAACTGCTATTGCTACGTGGATGCTTTCAATTTTATCATTATAAATGTATCTGAGATATATTGAATAAAATATCCTTTTCCAGAATTAAGGAATTCTCCACAGTCTTCCTTCTTCATTTTCTCGTTGCCTCTTTTTTCTTCTATTAATCCAACACTGTCCCTGCAGTGAACATTTAAAAGATAATAACGTTAATAGTTTTTGAGAAAAAATTATAGGGCTGAGAGGTAGAATTCCTCTTCCATCCTTTATTTGGTAAAGGATCCTGCAATGTCAAAGGCTTGGTTGGCGTGGAACTGTGTCTTCCACGTTATACCCCTAGGGTTATTGATTTTATTTGGGGAATGTTAGATGCCGATGTTGGTGGAGGACGACGGCGAGGCTGAACCGACCGGCGCGACGGATGACGCGGAGGCTGGTGCATCCGTCAATGACACCAATAATTGGCAACTCCCTTGTGGAGAAAAGATCGTGATTTGAATAGAGTTGTGACCTTTATGGGGGAATTGAGGTTCTGAGAGCACCCTTGAAAGATGATAATGGAAGAGTGTTTGTGTGGTGCTCACATTGGTCGAGCTTGCTGACGCAGAGATGGTGAACAAGAAGAAAAAATGACACAGTGCTCAGCGGAGGAACCTGGATGACGGGGCAAAGCTTCCAAAGCAGTTATATAACTATTAAATAACATATATAATAAATAAATGTTTCAGTTATAACAATTATGAATTGCACCGATACTTATAGTTATACATTATATTATATATATTTTCAATATCTGTATAAAATACTTGTTATCAATTAGATATTTAGATTTTGCGGTGGTTTATCGTAAAATTCAAACAATGCTAAATAATATAAGATTTGCAGATGCTATGAAACAATATAAGATTTACAGATGCTATGAAATAATATAAGATTTACAGATTTTTTATTATTTTATTTTCATTATGAAATATTCATATTTTTAAAATACTTGTTGATGAAAATTCACGTAAAGATGATGACCCATATTTATAACTCATCCATGGATCCTAAACTCATTTCAGACCCTATAAAATAAAAACAGACTTATCTTTAGATTCGGTTGCAGATAAAAAAACTTACTAATATCTTTTACTCATATTTGATTATCTTGCTATTATGGGCTAGATTAATAGTCTAATTACTTATCGGTCCATTAACACATTGATTCTGCCACGAGACTTTAATATAAATCACTAATTTATTGACCAAATTACGGTTCAATATATGATGTTAACCGATCAGCTAATTATCTTAACCGCTCGACCCAAATATCATACTATACATATTATAAAATTATTTTAAAATAAAATAATCGGTTTCATTATTCTTAATACACCTACCAATTCTAATACTATATTTTCTAGGTGGAAGTTATAATTGATTTAGTAAAGAATATTGTAAATTGAAAATTGATAATATTTTTGAGATATTGGATTGAAGATGAGTAAAATTTATTGTAAAATAATTTTAGTATTTATTTTAGGAAAATGACAAGATAATTAAAAGAATTGATAGCAAATTTAGTAATGAACGTAGCTTTAAAAGCTGAGAATAAATCTGATGATAACATAATAAACATGTTTCCTTTTTTTTTCTACCTATGGAAACGAAACACTTGTTCATCATCAACTCCAATGCAAGTTAGAAACATTATTTGATTAGATCCGAATAACAAGGAACTAACCCTATCCAATTTATGATTAAAAGAAGAGAAGATAAAAAGATAAAAGAGAGTCACTATATATATGCAAGTTTGAATGAGTCATTCGGTTCATCAAAATCACAAGAACCATTGTTCTCAGATTATC


Gene Sequence:
>Vu_11830(-)
ATGGGAAAGTTATCAATCATGTTGCAGGGTAAGTGCAAGAACCGCAAGGAATCATCATCATGGCCATTGACAAAATGCTTTCACCACACCAATACAAGAGATACTGCCACGAGAATTGCAGAAGAATGGAACGTTGATTTTTCTGATCTCTTCATCGGGAACAGGTTTTCTCACGGTGCTCACAGTAAAATTTACCATGGCATATACAAGCAGCAACAAGTTGCTATAAAAATTTTCCAGGTAGGAGAATGTGAGGAAGATGGAAACCTTAGATCTCTTTTGGAGACACAGTTTTTGAGAGAAGTCGCACATCTACCTCGTCTGCACCATCAGAATGTGGTGAGTTTCATAGCAGCATGCAGAGATTCTGATTCTTATTACATTCTCACGGAGTATCAACAAAACGGTTCTTTGAGGGCACATTTGAACACGTTGGAGTCGAAGCCAATCTCTCTCAGGAAGGTCATACTTTTTGCTTTGGATATTGCTCGTGGAATGGAATATGTGCATGCACAAGGCATCATTCACAGAGACCTTAAACCTGAGAATGTGCTTGTAGATAATAACTGTAACCTCAGAATTGCTGATTTTGGCGTTGCTTGTGTGGCTTCAAAGTGTGACTCATTGAGGGGAACATATCGTTGGATGGCACCAGAGATGATCAAAGGAAAATGCTATGGGAGGAAGGTTGATGTGTATAGTTTTGGGCTTATTTTGTGGGAGTTGGTGAGTGGAACACTGCCATTTGAGGACATGAATCCAGTTCAGGTTGCTGTTGCAGTAGTTCATAGGAATTCAAGGCCTGTTATTCCCACACATTGCCCACAAAGTTTGAGAGATTTGATCAATCAATGTTGGGCATTGAAACCACAGAAGAGACTTGAATTCTGTCAGATTGTTCGAGTTTTGGAGCAAATGATCAAAGACATTCTTCTCTAA