Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11809 LG3 6075863 6080711 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108334234
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   histone acetylation, histone acetylation, histone acetylation
Cellular Component   is active in   NuA4 histone acetyltransferase complex, NuA4 histone acetyltransferase complex
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 6077177 missense_variant p.Ser374Ile
T/C 6077741 intron_variant
G/T 6080494 stop_lost p.Ter727Leuext*?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11809.1
MENHQNHKGEAEPDRENNQNQNNNQAWGTWEELLLAFAVNRHGFKDWDTVAMEVQSRATRLLATARHCEQKFHDLSRRFADQCNDGVTPPQHDGEATGDNSDHVPWLDELRKLRVDELRREVQRRDDSIMSLQLEVKRLEEEKAKENDGKDGEKPDLAVPGEVRPENDKTGGEVEEVGPANSGPERTANADKMLPTTGDESDRENQSVNESNSTGSRFDKTGEGDAKLKVEPDPVQTGSKEVDPVARKGKPVGEESNNGSYDALAKVPTCESVPPSGERKVEQDDDSSELHDSVAHSGEGGTRESSEVQSSASLTRKRKTRRRKDVSGGDGRGVGASTLPENEEVAVKSEPLVGILELIKGHEHCSLIESRLESQLESDRYKDIVKQPLDMETIQSRIQKGQYFSCTSAFFRDLLLLFTNATVIFPVDSPESQAARQLHRLVTTEMKNHGQAQSDPIPRKSDSLPPNIPVAKADSLLSKNKASGPILVCRKRSSMSAKPSSTNFGQKNDQPIFNDKKERAPSDSKPPTKPSSSDTDEDEPPKAKEKPVTGARSLRRSNKNLNTKKLPSNSTPKAGSSGNKPSESLKPEKSKAEGGADKKRSAAADFLKRIKRNTSVDAVKGGGAGGGSSSSSKGGGGGVGAKEQKKMVNNVKGDKGKERASRHGVGGGSGSADKRNKNIENSSQSKRSVGRPPKKAAETNAGSSKRGRENSASAGKDKRPKKRSKK*


CDS Sequence:
>Vu_11809.1
ATGGAAAACCACCAAAACCACAAGGGAGAGGCAGAACCTGATAGAGAGAACAACCAAAACCAAAACAATAACCAGGCGTGGGGCACGTGGGAGGAGTTGTTGCTAGCGTTCGCTGTGAACCGCCATGGCTTCAAGGACTGGGACACCGTCGCCATGGAGGTTCAGTCGCGCGCCACGCGCCTCCTCGCCACGGCGCGCCACTGCGAGCAGAAATTTCACGATCTCAGCCGCCGATTCGCCGACCAATGCAACGACGGTGTTACGCCGCCGCAACATGACGGCGAAGCCACCGGGGACAACTCCGATCACGTCCCTTGGCTGGACGAATTGCGTAAACTCCGTGTTGACGAGCTCCGCCGCGAGGTCCAGCGGCGCGACGATTCCATTATGTCGCTGCAGTTGGAGGTGAAGAGGCTGGAGGAGGAGAAAGCGAAAGAGAATGACGGTAAAGACGGCGAGAAACCAGATCTGGCGGTTCCCGGCGAAGTGCGGCCGGAAAACGACAAAACCGGCGGAGAAGTTGAAGAGGTTGGACCGGCGAATTCCGGACCGGAGAGAACCGCAAACGCTGACAAGATGTTGCCAACAACGGGCGACGAATCCGACCGGGAGAATCAATCAGTTAACGAGTCTAACTCGACCGGTTCGAGGTTTGATAAAACCGGAGAAGGTGATGCAAAGTTAAAAGTCGAACCGGATCCGGTTCAGACCGGTTCAAAAGAAGTGGACCCGGTTGCGAGGAAGGGAAAACCGGTTGGGGAGGAATCGAATAATGGAAGCTACGATGCCTTGGCGAAGGTGCCAACGTGTGAGTCGGTGCCTCCGAGTGGCGAGAGGAAGGTGGAGCAGGATGATGACTCGTCTGAGTTGCACGACTCGGTGGCTCACTCCGGGGAGGGAGGGACGAGGGAGAGCAGCGAAGTGCAGAGCTCGGCCAGCTTGACGCGAAAGAGGAAGACGCGACGTAGAAAAGATGTTTCCGGCGGCGACGGTCGCGGAGTCGGCGCTTCTACACTGCCGGAGAACGAAGAGGTAGCGGTTAAATCAGAACCGTTGGTTGGTATTTTGGAGTTGATCAAGGGACATGAGCATTGTTCATTAATCGAGAGTCGTCTTGAGAGCCAGCTGGAGTCGGACAGATACAAAGACATAGTGAAACAGCCACTGGACATGGAAACCATACAATCAAGAATCCAGAAAGGTCAGTATTTCTCATGCACTAGTGCATTCTTCCGCGACCTCCTCCTCCTGTTCACCAACGCTACCGTCATCTTCCCCGTTGACTCTCCAGAGTCACAGGCGGCAAGGCAGCTGCACCGCCTTGTCACCACCGAGATGAAGAACCACGGCCAAGCACAATCCGACCCTATCCCCCGGAAGAGCGATTCACTCCCTCCAAACATACCAGTAGCCAAAGCAGATTCTCTCTTGTCCAAGAACAAAGCCTCTGGTCCCATATTGGTTTGCCGCAAACGCAGTTCAATGTCAGCGAAACCTTCCTCGACCAATTTTGGCCAAAAGAATGACCAACCCATCTTCAACGACAAGAAGGAAAGGGCACCTTCTGATTCAAAACCTCCTACGAAACCTTCTTCTTCTGATACAGACGAAGACGAGCCCCCCAAGGCCAAGGAGAAGCCTGTCACTGGAGCGAGAAGTCTGAGAAGGAGCAACAAGAACCTCAACACTAAGAAACTTCCCTCTAACTCCACTCCTAAGGCGGGGTCCTCGGGTAACAAGCCATCAGAGAGTCTTAAACCAGAGAAGAGCAAAGCAGAGGGAGGGGCAGACAAGAAGAGGAGTGCTGCTGCAGATTTCTTGAAACGGATAAAGCGAAATACTTCAGTGGACGCAGTGAAAGGTGGTGGTGCCGGAGGAGGAAGTAGTAGCAGCAGCAAGGGAGGTGGAGGTGGTGTTGGTGCCAAAGAGCAGAAGAAAATGGTGAATAATGTAAAAGGGGATAAAGGGAAAGAAAGGGCATCAAGGCATGGCGTTGGAGGGGGATCAGGGTCTGCGGATAAAAGGAATAAGAACATCGAGAACAGCTCTCAGTCGAAGAGGAGTGTTGGTAGACCTCCAAAGAAGGCAGCAGAGACAAATGCAGGAAGTTCAAAGCGTGGGAGGGAAAATAGTGCTAGTGCTGGCAAAGATAAGCGACCCAAGAAACGTTCCAAGAAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_11809::LG3:6073863-6075863(+)
CGTCAATTATTGATTCCACATCACATTAACAACTCAGCTTAATTTTAACCCGTTAACCCAATTTAACATCAGGGACCCAATTGTACTGATTTTGCATTTTTAGGGATCCAATTGAAAAAAAACAGAAAAAGAAACCTATTTGAGAAAACCCAACATAAATAGGAACTATCATGATTAAACCTTTATGTTTAAATGATATAATTTTGAACTATGGGTAAAAAAAAAAGTTAAACTATTGCAAGAAAATTTTACTAAGTTTATCAAGTGTAATACTCAATTAATAAGTTCTCCAAACAAAAAAAAAGTTCAACATATATCATTGTACATTTTGGTGTAATATTGAAAAACACTTCTTAAATATATAATTAGTTGATTTAAAAGTGTATATGCGTATATAAGAGAAAAAACTTATTAAGAATTTTCAGAATATAAAGTTAATCCATTGATATAACTACTGATTATATTTAATTTTTAATAATACAATCAACAATCAATTATATATATACACTTTGATTTTTATAATAATGAACTAAATGCTAAAATCAATATATTTTTTATATTTATAAAATCCTAAACAAAAATATAATAATATAAATTGAACTTTTGTTAATAAACAAAATTTACAACCATATTTAATTTTTAGTTAAAACAATAAATTTATGTTTTGAACAAAAAAACATTGCTTACACCACCAGTTTCTCAAGCTATCACTCAAAAGTTTCACCGCACTTTGCTGATTATAATTTGTCTCGTTTCTACTTGAAGCTCGTCAATTAATTTCAGTGAACAAAAATGGTTATAATTTTATTCTACGTCTCACTTTTAATTATTTTTTTTAAGATGTAAGAACAGCCTGATATAATATTTTAGTACTCTAAAGTGAGCTAGCAGATTGATAAGTGGGGTTTTGTTAATACATTCTGTATAAAATTATAAATACTATTTTATAAAATGTTTTTTTTATCATTATTTTAAATTACTCCTTTTACATTTAGTGTGTTATTCAAGGTCTTAAATTTTCCATTAATTACATCACACAATTGAAAAATAGGAACTATACGAAAACTTTAAACACTTGTAGAATGATTTTCTGAAGTAACCAACTTACTTTTAAAGTAAACTAAGTATACTAATTATTGATGGAAAATTAATAAATAGTATTATATATATATATATATATATACACACATGTGTGTATGGATACTTTATGAATACTAATAGTAATATACGGTTTAGAGTAGATAAACCCTCCATAAACTGATTCATGGTGCAACATGGGCCGGGCAACATTAATGACAATACGTTGTAATGAATTTATAATTAAAAAAAGAGTTTAGTTTTGAAAACAGTAACCACAAAATTTGTTTTACTTTTTGTTATTAAAAGGGACAGAACAGAATCATGTAACTCGTTTTACTTAAATTACAACAGGGCTTCAGAGCCTTTATTGGAAGTACTAAAGATTGGGCCACTGAAGAGAGTACAGAAGGTAGAAGAAAAACCAAAAGCGGGTCAAGAGTCCAATTTGGAGGAGAACCCGAAGCACAAGGAGGGAGAGAAATTGGCGATTCAATTTGAAGGGTCAGTGTCGCAAGTAGAAAGCAAAATTCAATTCAGTGCTTCATTGGAGTAATGTGCTGAGGATAAGTAAGACCCGTGGAACGAAGACGTTAGTGCACAGTGTTGGTTTGGTACGTTACAATTTCTAATCTCGAACTATCACACACAAAACACTAGAGCACCACCACCGCGTCCAAAACCCCAGCCCCCAAGCCATGACACGATGAAGTTGGAAGATTTTTACCAACCAAAAGCCACAAACTCAAAGCACACCACCGCTTAGGAGAGATTTGTTAGGAGCCTTAAGCCATGGAAAAAGCAAGAAAAAACCCTAATGACTGCTTTTAATTTTATTTAATTAAAGTTAATTTAGTTTCTCAAAATAAATATTATTTTAAAAAATAATAATTAAGATATTGGATTTGAAGAGGTGTGAGAAG


Gene Sequence:
>Vu_11809(+)
GAGGAGGCGGGTGTTGGAAAGAGCCAGTTTATGGTTAAACCACAACATATTTTTCTTTTTCCTTCTTCTTTCTCGTAGCGTATGGAAAACCACCAAAACCACAAGGGAGAGGCAGAACCTGATAGAGAGAACAACCAAAACCAAAACAATAACCAGGCGTGGGGCACGTGGGAGGAGTTGTTGCTAGCGTTCGCTGTGAACCGCCATGGCTTCAAGGACTGGGACACCGTCGCCATGGAGGTTCAGTCGCGCGCCACGCGCCTCCTCGCCACGGCGCGCCACTGCGAGCAGAAATTTCACGATCTCAGCCGCCGATTCGCCGACCAATGCAACGACGGTGTTACGCCGCCGCAACATGACGGCGAAGCCACCGGGGACAACTCCGATCACGTCCCTTGGCTGGACGAATTGCGTAAACTCCGTGTTGACGAGCTCCGCCGCGAGGTCCAGCGGCGCGACGATTCCATTATGTAAATCTCCGAAATTCTTCTGATAATATTTTATTCTTTTTAGGTTTTAGATCTAATTTTACCTTTTTCTTTAATTTTTGTTTTTTTTAATGGTCCGTTTTTTTTATACCAAGGTCGCTGCAGTTGGAGGTGAAGAGGCTGGAGGAGGAGAAAGCGAAAGAGAATGACGGTAAAGACGGCGAGAAACCAGATCTGGCGGTTCCCGGCGAAGTGCGGCCGGAAAACGACAAAACCGGCGGAGAAGTTGAAGAGGTTGGACCGGCGAATTCCGGACCGGAGAGAACCGCAAACGCTGACAAGATGTTGCCAACAACGGGCGACGAATCCGACCGGGAGAATCAATCAGTTAACGAGTCTAACTCGACCGGTTCGAGGTTTGATAAAACCGGAGAAGGTGATGCAAAGTTAAAAGTCGAACCGGATCCGGTTCAGACCGGTTCAAAAGAAGTGGACCCGGTTGCGAGGAAGGGAAAACCGGTTGGGGAGGAATCGAATAATGGAAGCTACGATGCCTTGGCGAAGGTGCCAACGTGTGAGTCGGTGCCTCCGAGTGGCGAGAGGAAGGTGGAGCAGGATGATGACTCGTCTGAGTTGCACGACTCGGTGGCTCACTCCGGGGAGGGAGGGACGAGGGAGAGCAGCGAAGTGCAGAGCTCGGCCAGCTTGACGCGAAAGAGGAAGACGCGACGTAGAAAAGATGTTTCCGGCGGCGACGGTCGCGGAGTCGGCGCTTCTACACTGCCGGAGAACGAAGAGGTAGCGGTTAAATCAGAACCGTTGGTTGGTATTTTGGAGTTGATCAAGGGACATGAGCATTGTTCATTAATCGAGAGTCGTCTTGAGAGCCAGGTATTCCATTTACTATTTTCGTGGATAAAACCGGTAATTCACTTCTTTCAAATTTTAAATAATAATAATAATAATCTTTCATTCTTTTATTATTAAAACAAATTACTTTTTTTTAATACATGCACGTTGAATATATACAAAATGTTTCCTACACTAATAATTAACTAAAAGAAATTAAATATATTTTTTTAAATAAGTAAAATTTAATTGCAAGCAAGAGGTTTTAAAATCGTGACTGTCCAACGGAAGGGGACCACTTTTGAAACAGATTGGTTTTAATGGGTATGGAATTTGTGAATAGAAAAGAGCGAATCGAAAATAAAAATTGAAAGAGCATGATATATATTCAATTTCATCATAAAGAGAAAAACGAATGAGAGGATCCATTTCTAGTTTCTTTTTCTAGGACTAAAGTGAAGTTAAAGATTTGATAGTTTCCCACGGCCGAAAATGGTAGATAACACATGGCCGTGTTCGTATTGTTTCATGGCACTTATTTTAAGAAAGAGATGAATTTTTAATATCGTTAATATGTCAGAAGGTAAAATTAATTACATTATTTGGATAAATAATTTTATAAATTTCTTTCTACACCCGCCCATTATTATGAACATGGGAGTACAATCTGTCGGGTCTCAATGTGAAACATGGAAGTCTTTTAATTTGGAAGATGTTTATTATAACTTCTCATTATCCCATGGCCAAAATAGAATGAATAAGGCCAATTTAATTTTCTCCCACGAGAAAATTACTTTATTTTACCCTAAATGTGGGAAGGAAAGTAAGTATCAATATTACCATATGTAGTTTTGTGAGCCCAGTATTTGAGTGCAGCCGCATGCAACGAGCTCACAAATTATTTTAGACCGAATCGTCATAAGCCCACTACTAGGAGAGCTTTTTGGGCTAAATCCTATTTACTACGACCCAAAATAAACAACTTGACCAAGACCAAGTTTATTTTTAATTATTATTCTGGTTAAACTTTTCTTTTTCGTTCCCTTTTCTTGCGCCCATGCTTCGCGGCGGTGACGTGTTTGTTCACGAGTCTTTGTCATCCAACTGTGTCTTCTCTGAATATTAAATTTGGATACTTTCTGTTTTTTAGAGTAAACCTGCTTATTGCAAGTTATTATTTGCATTTTTCATTCACTGTTTACTTTTTTTTTCTTTCTAAACATCTATTTTCCTTTATTATATATTTATGAATAATGAATTTCGCACAGATAGAGTAATAATTTTGTAATGATATTTATTTATCCATTTAGAATGCATCTATACCTATTTGATAGAGATTATTAGTTTTGTAACTGCCTCATGACATTTTTTTTGTCTACATGTTTTTACCTATTTTATCTTTATTAATATTAATACCCTTCTTAATATAAATTATTTTATTATTTTACTTTATAAATTTTATAATTACTTTTAAATTTTAATTAATTATCTATAATAAAATTATACGTATCTTTCTTAATATGAATAAATTTATTTTTCCTGTTTAAATTGTATAATTAATTTTTAATTAACTGCCTAGAATAAAATCATAAAAAGTATTTCTTTATTATATTATTATTTTTAATGATTATGATAAAACGTGGATATAGATGTGTTTCCACTGTTATATAAAAATGTAAATATCAACTAAGTTAATATAATAATATAATTATAATTAGTATTTTATTAAAAAATGTAATCAATTTAATGTTCTTTGTCTAATCGAATGTGTGGATTGGACGGGACGGGAATGCTACCGAATTGGCACTAAGCTGTTAATGTTTGGATTTGATAATAAAAAGAAAATCTGTACGGTAGTGGAAATACTAATGGACAGTAGCTTTTTGTGCCCTTTCCCTGGTTGTTCCTGTGCTCGTCCTTTCTCGTTGAAACAGCAAAAGCGCGGTCATAGATGTGTGCGCCCTCTCATGGTTATTTTAAAGATCTTTTTATTGCTAAATATATCCCAAAAATTAATTGCAAGTAATCAAATGTTTTATCTATATTATAATAATTCAATTTTTAATCTGACCAAACCCTTAGACCTTAGAAACTCATATATGTTTCCTGAGTGGACATTATATGTACACGTGTGCTAATAAAAATAAGTATTTGTACATGTTGACGAAAAGCCCAATGATTTCGCAGGATAAAATACCTGTTTCGCATGTTAAAAATTTAACCTTGAATGGATATTAGATGTAGGTTCGTGCAATTATGACAATTTAGTGAACATATTTTGGTGTGGTCTCTTGTGGCAGCTGGAGTCGGACAGATACAAAGACATAGTGAAACAGCCACTGGACATGGAAACCATACAATCAAGAATCCAGAAAGGTCAGTATTTCTCATGCACTAGTGCATTCTTCCGCGACCTCCTCCTCCTGTTCACCAACGCTACCGTCATCTTCCCCGTTGACTCTCCAGAGTCACAGGCGGCAAGGCAGCTGCACCGCCTTGTCACCACCGAGATGAAGAACCACGGCCAAGCACAATCCGACCCTATCCCCCGGAAGAGCGATTCACTCCCTCCAAACATACCAGTAGCCAAAGCAGATTCTCTCTTGTCCAAGAACAAAGCCTCTGGTCCCATATTGGTTTGCCGCAAACGCAGTTCAATGTCAGCGAAACCTTCCTCGACCAATTTTGGCCAAAAGAATGACCAACCCATCTTCAACGACAAGAAGGAAAGGGCACCTTCTGATTCAAAACCTCCTACGAAACCTTCTTCTTCTGATACAGACGAAGACGAGCCCCCCAAGGCCAAGGAGAAGCCTGTCACTGGAGCGAGAAGTCTGAGAAGGAGCAACAAGAACCTCAACACTAAGAAACTTCCCTCTAACTCCACTCCTAAGGCGGGGTCCTCGGGTAACAAGCCATCAGAGAGTCTTAAACCAGAGAAGAGCAAAGCAGAGGGAGGGGCAGACAAGAAGAGGAGTGCTGCTGCAGATTTCTTGAAACGGATAAAGCGAAATACTTCAGTGGACGCAGTGAAAGGTGGTGGTGCCGGAGGAGGAAGTAGTAGCAGCAGCAAGGGAGGTGGAGGTGGTGTTGGTGCCAAAGAGCAGAAGAAAATGGTGAATAATGTAAAAGGGGATAAAGGGAAAGAAAGGGCATCAAGGCATGGCGTTGGAGGGGGATCAGGGTCTGCGGATAAAAGGAATAAGAACATCGAGAACAGCTCTCAGTCGAAGAGGAGTGTTGGTAGACCTCCAAAGAAGGCAGCAGAGACAAATGCAGGAAGTTCAAAGCGTGGGAGGGAAAATAGTGCTAGTGCTGGCAAAGATAAGCGACCCAAGAAACGTTCCAAGAAATGATTCAAGTTTCATAGTTAGTCTCTCTTTTCCTTCCTCTGTATATTATTATTTATTATTATTATTATTTTATCTCCAAAGCATGGGTTTCTTTTTTTGTTTTATACTGCTAATTTATTGATCAGCTGTAGCTTGTAGTCAGTTGGCCGGTACATGTAACAGTATTTTGATTTGGTAAACCTTGTAACAACATTGTCCTTCCGCGGACTGCTTTTCTTG