Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11644 LG3 3530379 3535029 mitogen-activated protein kinase 19
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, intracellular signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation, signal transduction
Cellular Component   is active in   cytoplasm, nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, mitochondrion, mitochondrion
Molecular Function   enables   protein binding, MAP kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein binding, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein binding, MAP kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 3530496 5_prime_UTR_variant
C/G 3530510 5_prime_UTR_variant
G/A 3530567 5_prime_UTR_variant
C/A 3530618 intron_variant
C/G 3530643 intron_variant
A/G 3530705 intron_variant
T/G 3530948 intron_variant
T/A 3530954 intron_variant
C/T,* 3531094 intron_variant
C/A 3531212 intron_variant
A/T 3531222 intron_variant
A/T 3531504 stop_gained p.Lys88*
T/C 3531602 synonymous_variant p.Asn120Asn
G/A 3531745 intron_variant
C/G 3531748 intron_variant
C/T 3531785 missense_variant&splice_region_variant p.Ala145Val
C/T 3531917 splice_region_variant&intron_variant
T/A 3532320 intron_variant
T/A 3532658 intron_variant
T/A 3532792 intron_variant
G/T 3533103 intron_variant
T/A 3533179 synonymous_variant p.Ser274Ser
A/T 3533593 missense_variant p.Glu323Val
G/T 3533594 missense_variant p.Glu323Asp
A/T 3533595 stop_gained p.Arg324*
G/T 3533598 stop_gained p.Glu325*
C/T 3533605 missense_variant p.Ser327Leu
G/A 3533671 missense_variant p.Arg349Lys
G/A 3533673 missense_variant p.Glu350Lys
G/A 3533863 splice_region_variant&intron_variant
G/A 3533866 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/T 3534610 missense_variant p.Gly531Cys
T/C 3534842 3_prime_UTR_variant
T/A 3534883 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11644.1
MQQDQLKKDIKELEFFTEYGDANRYKILEVVGKGSYGVVCSAIDTHTGGKVAIKKIHDIFEHISDAIRILREVKLLRLLRHPDIVDIKRIMLPPSKREFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTREHHQFFLYQMLRALKYMHTANVYHRDLKPKNILANANCKLKVCDFGLARVAFNDAPTTTFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEVLTGKPLFPGKSVVHQLDLITDLLGTPSPETIAGVRNDKARKYLMEMRKKSPVPFEQKFPNADPLALRLLQRLLAFDPKDRPTAQEALSDTFFKGLAKVEREPSCQPISRLEFEFERRRVTKDEVRELIYREILEYHPQLLKDYMNGTEGTHFLYPSAIDQFRKQFAYLEENHGKSGPVIPPERKHVSLPRSTVHSSTIPPTTQPSFASYESKQMVAEASKISRSVESNSGSQLRSSRPPPRVPAAKPGRIVGPVLHYDNGRTIKDAYDQRIFYRNSLPHAVSPHCFHRVQPANTKATSETYKDISQGKHQLSCQQCSMPARPAIDLNTNPYYQQGKRDHLNDPVGSIDAKLLQAQSQFGAVGAAAVAVAAHRHSGSFHYGLS*


CDS Sequence:
>Vu_11644.1
ATGCAGCAAGATCAGCTGAAGAAGGATATCAAAGAGTTAGAGTTTTTCACCGAGTATGGGGATGCCAACAGATACAAGATTCTTGAAGTTGTTGGGAAGGGTAGCTATGGAGTTGTTTGTTCAGCAATTGATACACACACTGGGGGAAAGGTTGCAATAAAGAAGATTCATGATATTTTTGAACATATCTCTGATGCCATTAGAATCCTAAGGGAAGTCAAGTTGCTTAGACTTTTAAGACACCCTGATATTGTTGATATTAAGCGGATCATGTTACCGCCTTCAAAGAGGGAGTTTAAAGATATTTATGTTGTCTTTGAACTCATGGAGTCTGATCTCCATCAGGTCATCAAAGCTAATGACGACTTGACCCGAGAGCACCATCAGTTTTTTCTTTATCAGATGCTACGTGCATTGAAGTATATGCATACAGCTAATGTATATCACAGAGACCTTAAACCCAAGAATATCCTGGCAAATGCAAACTGCAAACTGAAAGTTTGTGATTTTGGTTTGGCTAGAGTTGCGTTTAATGATGCCCCAACAACAACATTTTGGACGGATTATGTTGCTACAAGATGGTACAGAGCCCCAGAGCTGTGTGGCTCCTTCTTTTCTAAGTATACACCGGCAATTGATATATGGAGCATCGGATGCATTTTTGCAGAGGTGTTGACAGGAAAGCCACTATTTCCTGGAAAAAGTGTTGTGCATCAATTAGATTTGATTACCGATCTTCTTGGGACACCATCTCCAGAAACTATTGCAGGAGTCCGAAATGACAAGGCTAGGAAGTACTTGATGGAAATGCGGAAGAAATCTCCCGTGCCATTTGAACAGAAATTTCCAAATGCAGATCCATTGGCACTGCGTCTATTGCAAAGGCTTTTAGCATTTGATCCAAAGGATCGACCAACAGCTCAAGAGGCACTATCCGATACATTCTTTAAGGGTTTGGCCAAAGTTGAGAGAGAACCGTCGTGTCAGCCAATTTCACGATTAGAATTCGAGTTTGAGAGGAGACGGGTGACAAAGGACGAAGTTAGGGAACTAATATATCGGGAAATACTGGAATATCATCCCCAGTTGCTTAAAGATTACATGAATGGAACTGAAGGCACTCACTTCCTTTACCCTAGTGCAATAGATCAATTCAGAAAGCAATTTGCTTATCTTGAGGAAAATCATGGTAAAAGTGGTCCTGTGATTCCTCCAGAAAGGAAGCATGTCTCCCTTCCAAGGTCTACTGTTCACTCTAGTACAATTCCTCCTACTACACAGCCATCTTTTGCTTCATACGAGAGCAAGCAAATGGTGGCAGAGGCATCAAAGATTTCGAGATCAGTAGAATCAAATTCTGGAAGTCAGTTAAGGAGTTCGCGACCTCCGCCAAGAGTGCCAGCAGCCAAACCAGGTCGAATAGTAGGGCCAGTTCTGCACTATGACAATGGGAGAACCATAAAAGATGCTTATGACCAAAGGATCTTCTACCGAAACTCACTTCCTCATGCCGTCTCTCCACACTGTTTCCATAGGGTGCAACCAGCTAACACCAAAGCTACATCAGAAACATACAAAGATATTTCACAAGGCAAACATCAACTCTCTTGCCAGCAGTGTAGCATGCCAGCCAGACCAGCTATTGATCTTAACACTAACCCATACTATCAACAGGGGAAGAGAGACCACTTAAATGATCCTGTTGGTTCCATTGATGCAAAACTGCTGCAGGCACAATCTCAATTTGGTGCAGTTGGTGCTGCAGCAGTAGCTGTTGCTGCTCATAGGCATTCAGGGAGCTTTCACTATGGATTGTCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_11644::LG3:3528379-3530379(+)
CTAAATATTACTACATATTAAAAGCTTAATTATTACATTTATATATTATAAATAATAACAAAACATATTTTAAATAAACCAAATTCAAATGTATACTGTTATAACTTATAATTGTTGATTTTTGTCATATATTAATAATTTGACTAAAATATTAGTTATTGTCTTTTATGTATTTAATGGTAAATTATATTTTATTATTACAATTGATTAATTAAAATAATTTAAAACCATTCATGCTATACAATTTATAAAATCCTTACACTAAATTACGCTGTGTTTTATATGTAATATATAAAATATTAAGGTTGAGAAAAACATTTAGTGCACTTGTTTGTATAATTTAAAAATACAACAATATTTAGAATCCAATAGCTATGATTTGATCCAGTTTTTGTTACTCAGAACAAAAAATTAATAAAATATGAATCTTTGACATTGCATTATTATTTTAATTAAAATAATATATACTATTTACTTTATATCTACTATTATTTAACTATTTTTAATCAAACTGCTGCAATACATTGCTTCACTATTTATAATAAGAATATAGACAATTATTCTTTTCATCTAGAAAAGAAATTTTACTTTTTACATTTTTGATAATTGCACCCCTCACTATTGTAAAAGGATGAATGGGGGTGTTGTCTTTCTTAATAATTTATTACACTTTTATTATCTTAACTTATAATAATAACAATATAATATGTTTGGATAAATGAAATTGTAAAGATCAAAACTTTTTAAAGAGAAGTATGATGAAATACAAAATGTATTTTTTTTAATTTATCAGATCAGATAGTTACATAATAAACACAAATGTATTTCCATTAGGTGTAACTAGAAAAAAAGAGAAAAACATAAATGACAATTATGAGTATGGATACAAGTATTATATCTAATTTATGCAATATATCAGTTGAGATTTTCCACTCATTGTGGTAATCATAATGAAATGCAATGTTTAGTTTTTTCCCAAAAAAATCTAATTTATGTACAAAGCATACAATTCTTTTTAAGCTACTAAAAACATTATTATAATTTACAACTTCTATTAACGAGAGTTTATTTAGAAATTTTAGAAAAAATAAAATATTTATTACAATTAACTTTAATATTTGAATGACGGATTGAAAACATCAATTTTTAAGCAACTTCGTATTCATAAGATTTAACAAACTATATAAATACTCCAACTAATATTTTCTATTAACTGAAATGAAATTTAATCAATTATAAGAATCACGATTTTGGTATGAATTTTTTCAGTACCAAAGCCGCTTAAAGTCAAATTATTGTGATCCTTCTGGTGGTAATAATAAAAATGGTAAAAATAAAGAAATAATAAAAATATAAAATGAATATAATTTTTCTCTCTCTTAAAAATAATACAGTTCTCAATCTTGAATTTTTTTTAGTGAAACGTGTTTTATATCATTAATTCATACAAACATTATAATTAAACATTTAAAATTGGTAAGCCTAAAATAAAGTAATATTTTTAAATAGTCATTATCAAAATTAATTAATTGAAATTATTCATGGTAAGATATAAATTAATATGATTTGACATAGGCATAAAATGCTTTTAAACTTTGGATGAAATCTATTTATTATCTGTATACGCGTGAGGTGTCTTATAAATAGAAACGTGATCGATAATAAAAAAAATTGTTATAATTATATTATTATACATTTATACATTTATTTATACTTTAATTTTATTAGACAGTAAAAGACGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATAATAAGATCATTTGACCCACCTTCGTCCCAATTGTCCTTCTCTGCGTATTTGGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTCCTCTGAGCTCAGATCCTCTGCACTGAACCCTTTCTGCTTCCGCTACACCCCCAACTTCTTCTCCTTCTCGTTCACGCTTTTTTATCTCCATTTCTCA


Gene Sequence:
>Vu_11644(+)
AATCTGGTTGATCGCTTCAATTTCTTGTTTCCTAGCTCAATTTTGAAGTTGGGGCTCGATCTTCGATCTGGGGTTTCGGGTTACCCTTTTGGTTGGGGAGTGAAGTTACCGACACGGTAGGTGGCCGGTGACGTTACTTCGTTTTGGATCTGTTCCAAGGAAGAAAAGAAAAGGAAGGAACAAAGAAAGAAGATGCAGCAAGATCAGCTGAAGAAGGTTGTTTCTTTCTCCACTGTTGCCCCTTTTGTTTGCACAGTTTGTTGCCGTATTGTGAGGTGACGTGGCACACGGTTGTGTTATAGAAATGGAAAATTGGAAACTGGGGTAATGGAAAATGGAAAATAAAAATAAATTTTGGTAATGAAATGAAATTGTGAAATGGTCATACAACGAGTGTGTTGAGGTGTTTGCTGTAAAAAGAAAATCCTTTTTTTGTTCTGGTTTCTAGATGTGAAGATGGGGTTTTTCTCCTTTGTGGTTGGTGGATCTTGCATGGTTTTAGTTTGGAGTGTGCAAATTTGGATGAGCATCACTGTTGGATTGGCTCGATTCTGCCGAATTTTGTTGATTAATGGTGGTTGTTGTGACAGAATCTTGCTCATTATTTTCAAGAAAATTTACATGTTTGGAGTCCATTTTGAGTATATGTATAATTAATATTCTTTTCAATAGTGGTATCTTGGTAGTGATGGTTTGTGAAATAATAATTTTGGGACTCGATTGTGTATTTTCTTTTTTGTAGATACGGATGAGTTTGTTAATCCGGTACATGTATATGTAGTTTGATTTTGTTCCTTCATAAATGTTTTTGTGTTATTCTGGTTAACTTCAACCAATACTTATAAGATGAATTGAGTGTAAGAATTTGTGTAATTTATTAATGCGCAGGATATCAAAGAGTTAGAGTTTTTCACCGAGTATGGGGATGCCAACAGATACAAGATTCTTGAAGTTGTTGGGAAGGGTAGCTATGGAGTTGTTTGTTCAGCAATTGATACACACACTGGGGGAAAGGTTGCAATAAAGAAGATTCATGATATTTTTGAACATATCTCTGATGCCATTAGAATCCTAAGGGAAGTCAAGTTGCTTAGACTTTTAAGACACCCTGATATTGTTGATATTAAGCGGATCATGTTACCGCCTTCAAAGAGGGAGTTTAAAGATATTTATGTTGTCTTTGAACTCATGGAGTCTGATCTCCATCAGGTCATCAAAGCTAATGACGACTTGACCCGAGAGCACCATCAGTTTTTTCTTTATCAGATGCTACGTGCATTGAAGTATATGCATACAGGTATTTGCGCTTTCATTGTGCAACATTGATATGCATTCTTTTCACACTGTTATATTTTCTTCAATAATTGCACCAAGTTTCTTCTAAATGATCTTATGTGTGGTTGCAGCTAATGTATATCACAGAGACCTTAAACCCAAGAATATCCTGGCAAATGCAAACTGCAAACTGAAAGTTTGTGATTTTGGTTTGGCTAGAGTTGCGTTTAATGATGCCCCAACAACAACATTTTGGACGGTACCGTTTTGTTTTGATTTTAAATTTGGATTGCAAGTAGAGCATATGGGAGTTATGACTGTTTCTGAATATTCAAAAGTAATATTGAGTTTTCTCGTTATTTCTTCTGGTCCATATTGCAGGATTATGTTGCTACAAGATGGTACAGAGCCCCAGAGCTGTGTGGCTCCTTCTTTTCTAAGGTATATAATTTGTCCAAAATTTATGTAATATAGATCATTTATAGAGGCATATATGCTTATTTTTAGCTGCAAGGCAGTATTGATATTATTGTTGAGACTTGTTTGAGTTAATAACAACTTTGTGGACACATTATTGCATGCTGCTGTATCATAATCTTAACTGGATTTGTTTGATTTTTATTCAAGGGTTGTTCCCTTTTAAATTTGCATCTGAAGGAGAAAATGTAATTGCATTTTGTGGTTGGAGAGTAATGTAGAACTATGAAGTTGAGTATCATGCACATGCTGAATGTCTAGTATGCAATATAAATGTTAATAAATTGATGGGACATTTGGTTAGATTTTTCAAGAAAATATTTTTAGGACCTGAGTCCTGACATCTAGGTAGGCATGTAGAGGAGGTTAATATTGGGCATTGCAAGGTTTGAAAGTTCGTACCATATATGTTACTAATATTTGCTGTTTATCATTTTAGTTTCCCAGAAAGGAGAAACTGGAAACATAGTTTGCTTGCATGGCTTGTAAAGGTGTTGCCATTATTTCTGTATGAAATGCTTTGTGTGTTTTATAGTAAACAGTAAAGCCTAGATTGTAATAATTCTTGTTCAGGGAGGACTATTGATCTCTCCTGGAAGTTGATTTTATCTGTCCTTCAGGTAACTGTGTCAGTTTGTCTGTTTCTCTGAAGTGGTTTCGTTGGGATGTGTAATTGCACTTCTTCTTTAGTATAATCATTTTCTTGGAATCTTTTTTGCAGTATACACCGGCAATTGATATATGGAGCATCGGATGCATTTTTGCAGAGGTGTTGACAGGAAAGCCACTATTTCCTGGAAAAAGTGTTGTGCATCAATTAGATTTGATTACCGATCTTCTTGGGACACCATCTCCAGAAACTATTGCAGGAGTATGGACTTCTTTTTGTTTATCTTTGACTTAATCTTATTATACATTTGGGCTTGCTAGTGTTGTTACTTTCATGAAAAACTATTTTAGAAATATCTGAGAGTTACTTTCATTTTGAATTTATGCAGGTCCGAAATGACAAGGCTAGGAAGTACTTGATGGAAATGCGGAAGAAATCTCCCGTGCCATTTGAACAGAAATTTCCAAATGCAGATCCATTGGCACTGCGTCTATTGCAAAGGCTTTTAGCATTTGATCCAAAGGATCGACCAACAGCTCAAGAGGTATCTTTTTATTTACAATTCCTTTATATTGTTTTTTTTATCAGCAAAAGGAAAAATATGTGTTGATATGAATATATACAATGTACAAGATACAACAGAAAAAAACATATTAGTGGTAAGAACCATAATCTGTATTACAAAAGCATCCTTATATTGTACCCCATTTAAGGTGAATATAGTGACATATATTCAGGTTCACTGTATTGAAAGTTACATTTTTTATTCAATATAAATCTGAAAGAAATCATTATGCATCTATCGTTGGCAGGCACTATCCGATACATTCTTTAAGGGTTTGGCCAAAGTTGAGAGAGAACCGTCGTGTCAGCCAATTTCACGATTAGAATTCGAGTTTGAGAGGAGACGGGTGACAAAGGACGAAGTTAGGGAACTAATATATCGGGAAATACTGGAATATCATCCCCAGTTGCTTAAAGATTACATGAATGGAACTGAAGGCACTCACTTCCTTTACCCTAGGTTGGAGCTTATACTCGTTGATTTTTCTTACTGATGTGCAACATAACATAATGTATACATTACATTCAATGCTTATTATTTACGGAGATATGTTATTTGCAGTGCAATAGATCAATTCAGAAAGCAATTTGCTTATCTTGAGGAAAATCATGGTAAAAGTGGTCCTGTGATTCCTCCAGAAAGGAAGCATGTCTCCCTTCCAAGGTAATAATGCCAACTTTTACTGACCATGTAATGCTTTGTAATTACTGTATTTAGTTTGTGGCTCTAAGTTTTGGTTCCCATGTTAAGTTTGTTACTTTTTTAGGTGAATACTTTGTGATGTATAATAATTTCCATTTAATTTGTGAAGGTCTACTGTTCACTCTAGTACAATTCCTCCTACTACACAGCCATCTTTTGCTTCATACGAGAGCAAGCAAATGGTGGCAGAGGCATCAAAGATTTCGAGATCAGTAGAATCAAATTCTGGAAGTCAGTTAAGGAGTTCGCGACCTCCGCCAAGAGTGCCAGCAGGTATAAACTATATGATTAATGTGATGCTACCTTATCTCTTGTAATGAAACTAAACTAAATCATTAGAGACAAACATGAATAATGGCACTGTACCTCGAAGCTGATTTTGAACTAGATACTAATGTTTTTCTTTCCTTGCCACAGCCAAACCAGGTCGAATAGTAGGGCCAGTTCTGCACTATGACAATGGGAGAACCATAAAAGATGCTTATGACCAAAGGATCTTCTACCGAAACTCACTTCCTCATGCCGTCTCTCCACACTGTTTCCATAGGGTGCAACCAGCTAACACCAAAGCTACATCAGAAACATACAAAGATATTTCACAAGGCAAACATCAACTCTCTTGCCAGCAGTGTAGCATGCCAGCCAGACCAGCTATTGATCTTAACACTAACCCATACTATCAACAGGGGAAGAGAGACCACTTAAATGATCCTGTTGGTTCCATTGATGCAAAACTGCTGCAGGCACAATCTCAATTTGGTGCAGTTGGTGCTGCAGCAGTAGCTGTTGCTGCTCATAGGCATTCAGGGAGCTTTCACTATGGATTGTCATAGGTTCTAAGGTTTAAGAGGGTCGCATACAATAACCTGTATGCTTTTTATGCCTAGGGTTGGAAGGAGGTTGATCAGATTTTAGACGGGTTTAGTTCTGGTAAGGTTTTCCACTTTTGCTTTCAGATTGCCATCATTGTAATTATATGTACATCATTTAATTGATTAATAAAAAAATTGATTGTTTCTCAC