Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11510 LG3 1935792 1941671 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase makorin-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein ubiquitination, protein ubiquitination
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   ubiquitin protein ligase activity, ubiquitin protein ligase activity
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 04121 Ubiquitin system [BR:ko04121]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 1935948 5_prime_UTR_variant
T/G 1936092 intron_variant
T/A 1936185 intron_variant
A/T 1936194 intron_variant
T/A 1936334 intron_variant
G/A 1936379 intron_variant
T/A 1936380 intron_variant
G/A 1936672 intron_variant
T/A 1936737 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ile34Ile
T/C 1936740 synonymous_variant p.Cys35Cys
A/G 1936745 missense_variant p.Tyr37Cys
T/G 1937109 missense_variant p.Phe158Leu
C/T 1937119 missense_variant p.Pro162Ser
A/T 1937142 missense_variant p.Glu169Asp
G/A 1937231 missense_variant p.Arg199His
C/T 1937245 missense_variant p.Pro204Ser
T/A 1937280 synonymous_variant p.Pro215Pro
C/A 1937638 intron_variant
T/G 1937668 intron_variant
T/A 1937722 intron_variant
A/G 1938100 intron_variant
T/A 1938103 intron_variant
T/A 1938110 intron_variant
T/C 1938118 intron_variant
T/A 1938286 intron_variant
T/G 1938287 intron_variant
C/A 1938554 intron_variant
A/T 1938563 intron_variant
A/G 1938585 intron_variant
T/C 1938697 intron_variant
G/A 1938842 intron_variant
A/T 1938851 intron_variant
A/G 1938906 intron_variant
T/G 1938910 intron_variant
G/T 1938923 intron_variant
T/A 1939094 intron_variant
G/A 1939117 intron_variant
T/C 1939386 intron_variant
C/G 1939655 intron_variant
T/A 1939719 intron_variant
A/T 1939720 intron_variant
T/A 1940148 intron_variant
C/T 1940444 intron_variant
T/C 1940505 intron_variant
A/G 1941035 missense_variant p.Glu352Gly
G/A 1941609 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11510.1
MSNRVCKFYARGACLKGDQCDFVHERKDGVSSNICTYYQKGVCAYGSRCRYKHVKAYEATSSSSNGRHPPVSDSVLNQTTKGASSCVPKASKSSSSDKCARSSQHKNLVSSGNDVGQSSSSGATASGLLFCSFAAANCPLGNKCSRVHGNRCFYCRKFCLHPTDSEERENHLATCEKREKYLQALNDSQEVECNVCLERVLSKPKPSDCKFGLLPQCDHAFCLSCIRNWRNSAPTSGMDTSNNGTANTVRKCPVCRKLSYFVIPSGIWYSTKEEKQEIIDNYKANCKQIDCKHFNFGNGNCPFGACCFYKHTVKPGSYTWIHRRPPPPPQRRQNNLNEMLDMLSDVDLTSAEYLSIMRDSDLFDDMDPFGMIDISDRLAGESGLCLGPFDSDEEGVDFFQMAALSEALVSGVDDFGLEDFDDEEFNPMEAALLSMMMHSNIDEDEDEDEEEYSDEYY*


CDS Sequence:
>Vu_11510.1
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Promoter Sequence:
>Vu_11510::LG3:1933792-1935792(+)
ATTCATGAGTGGATGCTGAGATGACGAACGAACACTCGTCCACCAGCGAACGAACGCTCGTCCACCAGAGAACGAACGCTCGTCCACCAGAAAACGAACGCTCGTCGACCTCTTACTGCTGGACGACCGTTCGTTCCACACTGGACGACCGTTCGTTCGGTGGTCGACGAGCGTTCGTTCGCTGATGGACGAGCGTTCGTCCGCTGGTGGACGAGCGTCCGTTCGTCATCTCAGCATCCACTCATCAATTTTTTTAACGCCGTCCACCCAACTTAACGGAAAGGACTCAATTGATATCAATTTTCAAAATTAAGGACCATTTTGATACACTTTAAAAAACGAGGACCCAATTGAGACATTCGTACATAAATAGGGATGTACTAAAGGATTAAACCTTGTTATAATTATTCCTATCAGCAGGGACACATCATCATCATTTTTATTGTACCCTTTGATGATAATGAGATAGTTTAATCCTTCAAAAGATTCATTATTGGTTTTCAAGTGAGTATCTACCCTCACTAATATGAAGGATAAAGTAAAAAAAAATACTATAGAATAAAAAGTTTTTCTAAAAAAATTATCCTAACTTAGTAAGTATCTTAAGTGTATATAAGATTTCGTTAATTATTGGAAGATTTACAATTTTGTCCACAAAAAAATTATACAATAAAGACTTGCAATTTTGTTTACAAAAAGTACCAAGAAAGTTTGTAGTTTTTTTTAAAAAAATTGCATTCATAGGTCTTGAAGTATGTAGTACTTATTCATACTCTTATTTATGTATATGCTTTCCTTAAAAGGTATTATTTTTAGGTGTGATTTCTAAGCGTGATATTAAAATTTAAATTCTAATTAAAGAAGAAAAAAATTGACATGATAAATAACATTAATATAACATATTTTGTCTTTGAAAAAGAGATTATTATTATATGTGATCATGTATTACCAAAACAAAATCTAGATTTGACATATTATCCATACAAAATATCTTTATAAAAAAATTAATGTGATAACATGCACGCAATAATATTAATTATACTTGTTATTAATTAATTCTATTATCGCTAATACAAATTTCTTATTTTAGGTAATCAGCCTTAAAAATTACATCTCAGAGTAGCGAAAATAAGTGCTTTTGTATTTCTATAAAAGAAATAAATAATTTTGTAAAGATATAAACTGAAAAATTAGACAATTATTTATTAGTTTAAAAATTATACCATTCCTTTTAGCTCACAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATGAAATAATAAACTTAATTTGGTTTAATAAAAGTAAAATGTTTAATCTATTATAATATAAGAAAATAGATACTAACAAATTGTCTTATTATTCATCTTATTTTATTGATAAGTGTTTAAAAATGAGTTTTTTTAGTCCTTTGATATTTTCAATTTGTTTTGTTATAATATGTGAATGAAAGTTACTTTATTTTTTTAACTATTTATTTTATTTTTAAACTAATTTTTCTATACTATTTTTTTAATTTTAATTTTATTCTTTTATAACTTCTAATTAACTGGTCATTTAATAAATTATTAAAAAATAACTTAATTTTAAAGTATAGAATTTTTTATATTATTTTTTTCATTTTATTTTTTATGATTTATAATTATTTAATCATTAATAAAATTAAATTTAAAAACATGACAATAAAGATATATTGAACGAGTTTATCAGTACATTCATTAGATTAAATGAATCTAATCATTCATATTATATTAATACACTGATTTATAGCAAATTTTTTATATTTTTAGAAAATCTACAATATTTTTGTATATATTTTATCTTTTTTATTTTTACAAAATCTGTTATTTATATCTGTATACAAATATTAACAGTGTGCCATGTATCAACAGTGTGAAATTGTTCCAGGTAAGACTTATGAAAAATTGTCTTTTTAAAAAAAAACTAAATTGCTCCTTCG


Gene Sequence:
>Vu_11510(+)
GAAACACATTCGCATAACCGTAGATTTTGCAATTTAACGGACCCCGAGACACCGCCAAAAAAACCCTCGTACCCGGTTCAAATGGATCGCACTTAGGTTTTCACCGTCACATTTTGTCTTTTATTCCCCCTTTCTTCCGTTCCAATTCCTCAATTCCCACTCCATCGTCATGTCCAACAGGTGAATTTCTCACCCTCTTTTCTTCTTTTCCGTTCCTTCATTCTCTCTTCGATCTCTTTTATCTGATTCTTGAATTTTTTTCCATGACTCTCTTCTCGATTTTGCCTTTTGTTTTATCTTTTGTCTGGCTCGAACAATAGAAAGGTCAGAAAGAAAAGAAAAAGGGTTTTGTTGTTTCGCGTGGTGGGATAATTGACATTTGCCACTACTCTTTATTTGTTCAAACGCCAAGTGGTGGATTGTATGGATCATGTTCTTGTGTCTCTTTCTCGTTTCCTGTTTTACTGATTGAAAAATACTTGTTTGTTTAAAATACAAATTTTGATCAGTTTTCTCTTAAGGTGGTTTGGGATTGTTGATGTTTGATATAAACAAGGTTGATTTTTTGACTTGGAAATTGTGTGTTCGTTTTGATTTGTTTGATGTGTGCAATTTTTGTTGAGACTTTGTGATTTATTAATTAACCAATTTAGGAGTTTACTTGCTTATTGAATTTTTATGTTGAATTTTTGTAGACCCTTGATAACATTCTTACTCATTTATAAGTTGTTTGGAAATAATTATTTGTCTTAGGGTTTGCAAGTTCTATGCCCGTGGAGCGTGTTTGAAAGGGGATCAATGTGATTTTGTTCATGAGAGAAAGGATGGTGTAAGTAGTAATGTAAGTTGTAACTCATTCTGATTATCTTGTACTGTGTTTGCCCCCCACAGATAAATCTTTTTATTGACTTTCCTACTCTTTTGTTTCTTATGTTAAACACAGATTTGTACCTATTATCAAAAAGGAGTATGTGCTTATGGCAGTAGATGCAGATATAAACATGTCAAAGCTTATGAAGCGACGTCTTCTTCATCAAACGGACGTCATCCTCCTGTTTCAGATTCTGTGCTGAATCAAACCACCAAAGGGGCATCAAGTTGTGTTCCAAAGGCTTCGAAGTCATCTTCATCAGACAAGTGTGCAAGGAGTTCACAACATAAGAATCTGGTCTCTTCTGGAAATGATGTTGGTCAATCCAGTTCTAGTGGTGCTACAGCATCTGGACTTTTGTTTTGTTCATTTGCTGCTGCCAACTGCCCCCTTGGAAATAAATGTTCTCGTGTTCATGGAAATCGATGTTTTTACTGTAGAAAATTTTGCTTACATCCTACTGACAGTGAGGAAAGAGAAAATCATTTGGCAACTTGTGAGAAAAGGGAAAAATACCTTCAGGCTTTGAATGATAGTCAAGAAGTAGAATGCAATGTCTGTTTGGAGCGTGTTCTTTCCAAGCCTAAACCATCTGATTGTAAGTTTGGGCTGCTTCCTCAATGTGACCATGCTTTTTGTTTATCCTGTATCCGCAATTGGCGTAATAGTGCCCCAACCTCTGGAATGGACACGAGTAATAATGGAACTGCTAATACAGTGAGAAAATGTCCTGTTTGTCGCAAACTATCATATTTTGTCATTCCAAGTGGTATTTGGTATTCTACTAAGGAAGAAAAACAAGAAATTATTGATAACTACAAGGCAAACTGCAAGTAATTTCTTCTCTACTCAACACCCCCTTCACTTTCCCTAAATTGTATTGTTACTTGGTAACTGGTGATTTTGAATTTATTGTTGTATTATAATTAATTAGTCAAAGTTGTTGGAGATTGTGGTTGGTTGGGAAAATAATTCCCTCCTTTTCTCATTACTATATCCCCTCTCTTACACAACAATAAAACACTCCCAAAAGTACATAAAAAATTCATACATGCATTGTGTTCCAATATTTTGTGAAATGTTGATTGTTCACTCTTCACATGGGTCTATTGATGAGGGTACTGTATTCAGATTTCATCTATTTAGGTGAAAATCTGATTACTAAAGATATCGAAGACAGTATTTTTATTAAGGGATTGAATGGTTTGATGTTTGATTTTTTTTTTCAGACAAATTGATTGCAAGCATTTTAACTTCGGAAACGGGAATTGTCCATTTGGGGCTTGTTGCTTCTACAAGGTACCCAAACTACTATCTCTTTTGTCATTTGCTTGCTTTAATAAATTCCTTGGGCAAATTTGATTACCATTCTTAATTAATTAGTAACATCACTTTTTGAACAGTGAATAGCATTCTACCATATTTGTCCTTTCACTTAATTAATATTTATTATATTGCTATTAGATATTAGATGTCAAATTTGATTTTAGTGGTATAAATAATCATATTTGGGCTGACTATTCATTTGGTTATAAAATCTACAACGGTTTTTGGTCTTATATGCCACCAATATTATTTTATTATTTGTTTTAGATGAATTATTTTATTATAAAATCTAATGAGTTGTTTGTTTTAGATGAATTAGTTTACGAGTAGTGAGAGTCATAGCTTGATATTTGGATTCAGCTTCAGACCTTGCAACTTCAATTTGTTTCATGCTTTTCCATGTAATGGAATTCTCTCCAAATAGGACACAATAGGTTTAGTAGGAGAACCAGCCTGGTCAGCATAAGCGTAGGCATATGATCTTTTCATGTCCTTTGTTCTCATGCACTAATCATCCTTCTACTAGTGATCCTTAAAGAAGTATAAAGATTTGACAATTGCATTCCCATGATCAACATGAGGATAATTAAGGAATTAACTCACCACGCTTATAACAAAAGTGATGGCTAGTCTGGCTACTACTGAATAGTTCAGCTTTCTTACCAATCTCTAATATCTACTTGGGTTGCAAACTAATTCAACTTGACCTGGAGGAAGCTTAAAACTTTGGATACATGTGATTATTGTTGGTTTACAATTCAACATTTCAATTGCTTGAAGACCATAGTTTCTTAGGGATATAACAATTCAAGATCTTGATTATCAAGCAACTAAAATTCCCACAAACTATCTCGTTTGGTCCAAGTCTGATTTACCAAAATATTATACGAATCAGTTTGCATTTTGGGGAGTTCAGAAATCTGAACTGAAGTAAGCCATATGCCTGCATATTTATTATTATGATTAAATTTTTTTAAATCTTTTGGGGAATGCAATAATGATAATGGCATTTCTGTGTTGCACAATGGTACTATTATTTTTAGTTACTAGCTTGACCATTTGCAGTTGTACATTACTACTATTGTACTTGGTTAGTTTAAGTACTTCCTTTCATACAAATATAGTATGGACTGTTACTTCAGCGTTGCCAAATTTGTGATTTTACTTTTGTACAACCCTTGAGTTTTGGTTGTCTTCCATGCTTGATTCAGTGTAGGATTTTCAAGAATGGGATCATACTAGAGGGTTGAAGAGCTATCTGGCTTGCATGGAGAGATTGTTATTTTTCTGTGTTGAAGGCTCACAAATTTGTGAGCCCGTGTGCTTGATGCAGTGCAGATAAAACCCTATTTTGTTGGTCTTTTTGCCCTAAATAGCTCTTACCTTTGAGAGACATCTCTCTTCCTTTCAGCTGACAGATTTGCAGTAGCTTTCCTCTTCCTAACCGCACACCACGTTTCTCTTTTCTTTACCTGCATTCTGTTTTTGTTTTTAATACCCCTTTTTCTTTTTACTTCTCATGTCTCTCTCTGAGGTCTCCTTAGTTTGTGTGGCTCATCTTACCTTTCTATTTGGATTGGCTTCTGAAGTTGATAAGTTGGGCTTGTTCTTTGCCTTTGAAATAGCCCTCTTAGGCTCTAACTTTTGGTTTCTCTTGTTATCTTTTCTTCACACCCACCCTTTGATAACAATTATGTAATAAAATAGAAATTAAGATATTAATAATTAAATAACTACATAATGAATATGTAGATTATTGAATTTTGGTGGATTTATTTCACGTATTGGTTGCATTGTTATCCTATTTTCGTGTTATACTCTTTACATTTTACGATTCCACAATCTACACTTTTCTCCCCATTAAACGTAGGTAGGGTCTTGATTTTGCCAAACCTGGTTATGATAATTAAAGTTGAAAGAACTGGGGATTTGCTTTGACAGTTCCGGTGTTTATAATAAAATGTTAAAAAGTTTGTGCCATTATGCAAACTAGTGATGTTTGTGTCACAACACTTTTTTATTTTATTTTACTAATATGAATGACTTCTGCAACAATATTAGCTACTACCATACGAACTACGTAGTTTATGTACTACATTTTTCGTTATGTATTATCTTTTATTAAATTTACAATTTATAATTAATAATGAAAGAGTATTTGTTGTAATGGAAAAGACCATGAGCTGTGATTTGGATCCATGCTAGATCTGGAGTTGTGTTTTGTTTCAGTCCCATGTTTCTAAAATTAAGCTGTCTTGTTTCAAACTTAAGGATAGGCTAGTACTACATGATTAAATGAAGGAAGAGTTGTAAGTAGTTTTTAAATTGGTTTTACTTAAAAAAACACGAAATTGAAATTGGAAACAAACTCGGTCTCTGCCGCTTTGGCTCTGATCAATGAGGCACTAATACTTCAATTTGTTATTTATGTCTAATATGTATATATTTTATACTTCATTGATACTTAATCAATGAAATATATAATCTATAAAAGAGTAATACTTTTCTGATAACAATAATTTATAATTTTTTATTTTGGCAACCTTTAATACATTTGATTTTAATTTAGATTCACAAAATAACAATTATATATTTATTATGTTTTTAAGAATTTTTATACATTTAACATTATGCGTGTATATAATGTGTTGTATGTGCTTATTTTGAAAATAAGCTTATTGTCGTATCAGACGTGTGTTGTATCCTATACAAGGAACTTATTAGTGCATCAAAGGGTTTGATCTATGTTTGAAGCAAACATTTATAGACTTTAAAATATCTAGTACAAAGAGAAATACTATTCATATTTGGATACTTGTAAATCTGGATTTTTGGGCCATGATTTATTTATCTTTAGTCCTTTACATAGCTTATATTTGTACATTTTTTATCTCTAATAATTCTGATATCTGTTACTTTCAGCATACTGTGAAGCCTGGCTCATACACATGGATACATCGCAGGCCACCACCACCACCACAGCGGAGACAAAACAATCTTAATGAGATGTTGGACATGCTCAGCGATGTTGATTTAACTAGTGCTGAATATCTTTCTATCATGAGGGACTCGGATCTTTTCGACGATATGGATCCATTTGGGATGATAGATATATCTGATAGGCTTGCTGGTGAATCAGGTCTTTGTTTGGGCCCTTTTGATTCTGATGAAGAAGGGGTAGATTTTTTTCAGATGGCTGCATTGTCAGAAGCACTGGTTTCTGGTGTGGATGATTTTGGTCTTGAAGATTTTGATGATGAAGAGTTCAATCCTATGGAGGCTGCCTTGTTATCCATGATGATGCATTCTAACATAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGAAGAATACAGTGATGAGTACTACTAGAATTACATAGTTCATTATCAAGCCACTCTATAACAAGTTAATGAGGTTCCTTTGGCTGTATGGTGCCCTATCATTTGTTCTTGAAAATCATTTAGGAAGAAACTCCGAGATATGGTATGCTAGTACTCATGTTAATACTTGGTATTCATGATCATATGCCATTTTGTATATTTTCTGTTATGACCATATTCAAATAGTTTTGGCTTGTTATGACCATATTCAAATAGTTTTTGCTTGAGGGTCTGCTTACTCTTGTCTCATTGTACTTTGAACTGCGATTGCTGTTGTATGTAAAATATGGCTTGATATTCTTGATC