Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11322 LG2 53052056 53055510 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 32
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 53052532 intron_variant
G/A 53052618 intron_variant
T/C 53053196 intron_variant
A/T 53053297 missense_variant p.Val336Glu
G/C 53054173 missense_variant p.Gln83Glu
T/A 53054907 intron_variant
A/T 53054908 intron_variant
A/T 53054950 intron_variant
G/A 53055045 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11322.1
MEKEEPMQQPLTDSSLTTHSSTSTASDEEQLHSETLSLHSSAHMQRSSTASKLGQDESKQSAQHSDEETIVKETVEAPQKQTQNQLQMSVCSTSSSKLSPTSVSMYLSSAPSSSVPQQRPSPKAVKVQKMDKGTPSGDTTLSSVSVSRTSASDGYNWRKYGQKQVKSPTGSRSYYRCTHSNCCAKKIKFCDHSGYVIEIVYKSQHSHDPPHIVDSTKESKFLPYSEPKIKCSIPKQSSRVQIDSDPSSPRKPLYESPCSANKNQENSSHDENDKVLLKKEHVNDPEPKRRLNKGDLTCLDSAIKPGKKPKFVVHAAEDMGISSDGYRWRKYGQKLVKGNPHFRNYYRCTSAGCPVRKHIETAVDNAKTVIITYKGMHDHDMPVPKKRQGPPRASLVAAAAPASMKNLHFKKGGLVQNQETSSAQCSEDTEDEALDLGGEKAIESARTLLSIGFEI*


CDS Sequence:
>Vu_11322.1
ATGGAAAAGGAAGAACCGATGCAGCAACCGCTCACAGACTCGTCGCTAACCACCCATTCATCAACTTCCACTGCTTCCGATGAAGAGCAACTCCACTCAGAAACCCTATCTCTGCATTCTTCTGCTCATATGCAAAGAAGCTCTACCGCAAGTAAGCTTGGTCAAGATGAGAGTAAGCAGTCAGCACAGCATTCTGATGAGGAAACTATTGTAAAGGAGACAGTAGAGGCACCTCAAAAACAGACACAAAATCAACTTCAGATGTCTGTTTGTTCAACTTCATCGTCTAAACTATCACCAACTTCTGTATCAATGTATTTATCATCTGCCCCTAGTTCAAGTGTACCACAACAGAGACCATCTCCCAAAGCTGTAAAAGTGCAAAAAATGGACAAAGGAACTCCTTCTGGTGATACAACCTTGTCTTCAGTTTCTGTTTCAAGGACATCTGCATCTGATGGATACAACTGGCGGAAGTATGGTCAGAAGCAAGTGAAGAGTCCTACAGGTTCTCGAAGTTATTACAGGTGTACCCATTCAAATTGTTGTGCAAAGAAGATTAAATTTTGTGACCATTCAGGATATGTGATAGAGATTGTTTACAAAAGTCAACATAGTCATGATCCCCCACACATAGTTGATTCTACTAAGGAAAGTAAATTCCTGCCTTACAGTGAACCTAAAATAAAATGCAGTATTCCAAAGCAGTCTAGCAGAGTTCAAATTGATTCTGATCCATCTTCTCCAAGAAAACCTTTATATGAATCACCTTGCAGTGCCAATAAAAATCAAGAAAACTCATCCCATGATGAGAATGACAAAGTTTTGTTGAAAAAAGAGCATGTTAATGACCCTGAGCCAAAAAGAAGACTGAACAAAGGTGATTTAACATGCTTGGATTCAGCAATAAAACCTGGAAAGAAACCAAAGTTTGTTGTACATGCAGCAGAGGATATGGGGATATCAAGTGATGGATACCGATGGCGCAAATATGGACAAAAATTGGTGAAGGGAAACCCACATTTCAGAAACTACTACAGATGCACTTCTGCTGGATGTCCTGTTCGAAAGCACATTGAGACTGCTGTGGATAACGCAAAAACTGTGATTATAACATACAAGGGAATGCATGATCATGACATGCCTGTGCCCAAGAAACGACAGGGTCCACCAAGGGCTTCCCTTGTGGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCAATGAAAAATTTGCACTTCAAAAAAGGTGGTTTGGTACAAAACCAGGAAACTTCTTCTGCTCAATGCTCAGAGGACACAGAAGATGAAGCATTGGACCTTGGTGGTGAGAAAGCAATCGAATCAGCTCGAACTCTTTTAAGTATTGGCTTTGAAATTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_11322::LG2:53055510-53057510(-)
CTTTCTAACATATGTCTTGTATTTCTTTGACTAACTAAACTAGTAACATAGCTAACTAATAACTAAAGGATCTATCAGATAATTTTAATTTTGTTTACTCTGCAGTAGCTTTTCTCTGAAACTTCCAACACTAGAGATTTAATGTTATGTGGTTATTGGCTTTGTAGATTTGTGCAATTTGGTCCAGAGGTTAAATGCAACTGTGGTGCAGCAAATTGTCAAGGCTTTCTAGGGACCAAAAAGAAGATTGGCAAGCTAGATTTCTGTTGGGGCTCTAAACGCAAGCGAACATCATCAAATGCTTGCATTACGCTGGTAACAACTGTATGATATGCCAATATATTAAGTGTATCCATCACTGTTGTAATGTAGACAGAAAAGTGAAAAGGGATGGTCGGATGGAGAGGTCTGGGTGTAAGAAAAGATGGGAAAAAGAATATCTCAAATATTCTGTTCCATTGTTGTAGAGGGAAATGCCAATTTATTGATTCAAGATTTTGACAGCGTTGTCACTCAAATTTTCATCCCAGGAATTAAAACATGTAAATTGATATTTCTGAGATAGCACACATCAGTGTTGAATAATGACCAGTATCAAATTTGTGTTTGATTAAAATTTGAAGTATTCTTATTTCTAAATCGTGAAGGATGGTGAAATCAATTTTACCAATTAATCGAAATGTACTGTTAGGCTGGAAACTGAATAACTTCCTAAAATGGATGAAGAAGGATCAACAATGTTACATAAGATCTGCTTTAACTGATCGGAGTAATAGATACTACAACTTTTTGGTTTTCTAACAAATTCCTAACCTAATTTTTTTTAAAAGCACATAACAATTTGATTTTTTTAAATTAGTCTTTTAATCTTGTAAGATTATACATTTAGGATACTTAAGTTCTTTACATGGTTCTAGCCATTGGTAGGGAATATAAAACAATAATCTTTATCAATACTGTTATGTGCATGTATGTTTAATTCTTTTAAATATAATAAAAAATAAAAGGGTCATTATTATAATTATGAAAATGAATTTAAATAATTCTAATAATTTTGTCGTAGATAGTTTTTATTTATTTTTTAGATGTTTTTTTAATCACAGATGGTTATTTTAATTTTAAAAAATAACCAAATTAAGAAAAACAGTTAAATTTTAAAAAAATGGTCAGAATAAAATTAGTAAGAAAATTATTTTAGTTTAGAAAATGGTTACTTAAAAGAATAAACTTGGAAAAAATATGTACTTAATAGTTAAGTTATGACTACTGTTTACAGCACAATTTCTTATATGAAGTAAGGATTAAAATATGGATTTTTTTACATGTTTATTGTCTCTTAAGATGAAATTCTATAAATTGTTTTTTAGTTCTTTCAACCTGATTTTAATAAAATCATCTACTTGCATAAAAATATTTGCAAGTAAAAATTTGTTATTACATCTAAGAATTTTATTGCAATTTGTAGTTCTTAAGTGGCGAATGATAGTTTATTCAATGAAAAAGGAGGGTCAAAACGTACAAGTTTCACCGTAGTATTGGCTTTTTTTGTTCAGTTCTAGTAACTTTTTCTTCCATTTTTTACACAACAATTAGAGTTATATCTTGTTCAAGAACACTTTTTTTCTGCAATTATTTTTTTAGGTTGAATATATGCTTTTCAAATTAGTCAAACAAGACTTTCATGAGGGTGTCTAAAATGATGAAGTATATGACGCTGATTATAATATAATAGTATTATGACAATTAATTTTTTGTTTAAATATTGGAAGACATATTAGTTTTTGAAATGATTTCTATGTATAGTTTAATGTTATGCATGTTGAACAAATCTATTATCTTTCAATTAAACTAAACTAATTAACTTTTTATTCATTTTCTTACTTTTAAATAAATCATTCATTCAGCTCACAGGTTCCTTACTCAAATGCTGTTTGAAGAAGGTGCGATAAAATAAAACAAACGGCGTTAACAAATACCGTGAAATGGAATAGAAGATGAGC


Gene Sequence:
>Vu_11322(-)
AGGTCCAAAAGACAAACATCGAACGCGGGCAAACGGTTAATAACAGTGCAGACAACCTCCGTTTCCAAGTCGCAGCAAAACCCGACAACCCACCTGAAAGAGAGAGAAAGAGAGTGGTCAATAGCAGTCAACACATCTTGTTTTCTTTCACTCGGCTGTTCGCTAATCAACAAAACAAGATCAAATCAAAACCAGAAAATGAAAATTCGTGATCGAATCGTAAACTGAACAAACCAAAAATTGTCGTGCACTGTCATGGAAAAGGAAGAACCGATGCAGCAACCGCTCACAGACTCGTCGCTAACCACCCATTCATCAACTTCCACTGCTTCCGATGAAGAGCAACTCCACTCAGAAACCCTATCTCTGCATTCTTCTGCTCGTAAGTTGCGTTTCAATAACACTTTTCTCTTCTCTGTTATATTGTATTGATAGTAGTAAATACTGAATAATGGTGTGTTCATGCGGCAGATATGCAAAGAAGCTCTACCGCAAGTAAGCTTGGTCAAGATGAGAGTAAGGTTAGAGCATCTGTGTTAAATTATTAATTTTAAAAAAATTAAAACATTGAGATTGTGAATTTCAAAGGTGTGATTTTTTTTTATTTTTTTTTTAATTTTGAAATGTTCTGCTTGGTCTCAGTCACCTTATAAAGGGATTCTGGACGTGGTTTATGAGCCGTTGTTGTTGCTTCTTGTTCTTATGAGTGCTGAAGATATAGGTTTAGAATGACTATGGCTATGGCTACCCAGCTTTATTAAGTGCTTTTTAAATCAGTGTTTGTGTATAAGATATTTCTAGAATCCAAGACGAAATGAGGTTTAGTATTATTGAAATAAGCTTAAATGTATCATAAGCTATGTTGTAATCTCTTCCGAATGAGTGTTCATGTCATTAGATAACCCCGATTAAGCTATGATTAAGCTCTTTAAACACACCCTCAGTGTATTTTTCTGTCACTGTTTGAAAGTTTCGTGACTTCTTGGCCTTTAAAGGTATTTGTGAGGCTTAGAAACCTGAGGTTACATGAAGCTTATAAAAGAAAACAAGAAGCAAATAGTCTCGAATTATAGAATTATTCCTTGACAGTAAAAATTAATTTGACCAAAACTGCCATGAATCCAGCTGCAAAATCCAGTTTTTGATGTTTGGTATTAGATCTTCCATGAATAAATGGATCGGAGTTTGTACTTTGATTCATGCTCTCCCTTCTCTGCTTCCCATTTATTTGATTTCTTCAGCACTGAAATGCACCATTTTATGTACAGCAGTCAGCACAGCATTCTGATGAGGAAACTATTGTAAAGGAGACAGTAGAGGCACCTCAAAAACAGACACAAAATCAACTTCAGATGTCTGTTTGTTCAACTTCATCGTCTAAACTATCACCAACTTCTGTATCAATGTATTTATCATCTGCCCCTAGTTCAAGTGTACCACAACAGAGACCATCTCCCAAAGCTGTAAAAGTGCAAAAAATGGACAAAGGAACTCCTTCTGGTGATACAACCTTGTCTTCAGTTTCTGTTTCAAGGACATCTGCATCTGATGGATACAACTGGCGGAAGTATGGTCAGAAGCAAGTGAAGAGTCCTACAGGTTCTCGAAGTTATTACAGGTGTACCCATTCAAATTGTTGTGCAAAGAAGATTAAATTTTGTGACCATTCAGGATATGTGATAGAGATTGTTTACAAAAGTCAACATAGTCATGATCCCCCACACATAGTTGATTCTACTAAGGAAAGTAAATTCCTGCCTTACAGTGAACCTAAAATAAAATGCAGTATTCCAAAGCAGTCTAGCAGAGTTCAAATTGATTCTGATCCATCTTCTCCAAGAAAACCTTTATATGAATCACCTTGCAGTGCCAATAAAAATCAAGAAAACTCATCCCATGATGAGAATGACAAAGTTTTGTTGAAAAAAGAGCATGTTAATGACCCTGAGCCAAAAAGAAGGCAAGTTGCATATGAATTAATTTTTTTCATAGGAAATTTTTGAGGAATTTACTCTTTTTCTTGTACATGTGGCTGGATGTAATGTCTAATGCTCTTGTCCTTAATATGATAACTAGACTGAACAAAGGTGATTTAACATGCTTGGATTCAGCAATAAAACCTGGAAAGAAACCAAAGTTTGTTGTACATGCAGCAGAGGATATGGGGATATCAAGTGATGGATACCGATGGCGCAAATATGGACAAAAATTGGTGAAGGGAAACCCACATTTCAGGTTCATGGTTATATCTTGCTTTCTTTTTGTATTTCAAATAATACCCCTACTCGTAGTTCTGTTCTTCTATGGAAGTCGTAGCTGCAGTGTGGAATTTTATAAATAAATTTCCTGTTTGATTTGTTGGGTCAAATCAATTGAAGATATTGGTTTCACAAAAAATCTCTCGTGCTTATGTTCATAGATGCCATTGTTTTGGTTAATCAATAAATGGAATGCTAAGAAGTGTTTGAGTGTTTTGTTTTAAATCAAGGGTTGCATGTCTCCTTTTAATATTCCAAGATATAGCTAGTCTGATATGCTTGGTATGCACAGGTCCATTAAAATTGTACTTTTTTTTTATAATTGTATTTTATATTTATTTAAAAATAAAAACAAGTTTTAAAACATATATATTAAAATTGAAGATGATTAATTATATTTTTAATTGAACACATGTTACCCTAAAATATTATTATCTGATCTTTCTTCAAGTAATAATAGTGATACTATATGTATACAATAACTTAAAAATCAATTGTAATAGATATAAACTTATAATTAATTAAATTTTAGTATTCATTCTCTTTTACTTCAAATACTGTGTTTACATGTTGAATTTAATTTTTGTGACATAAAGGATTACATAAGTGACATAAGTTCAATCAGGATTGACATCACTTTTAACCCAAAAAATTTGTCTTTTTTCTTGTACAGTGTTAACTTAAAAACACTTAAAAACCCACTTTTCTGTGAGATGTTAACTTCCCTTTTGTTTTATTTAATATGACTGTTGAAATCTTACTTCTGTGCTTATCAATGTGAATTTCCAGAAACTACTACAGATGCACTTCTGCTGGATGTCCTGTTCGAAAGCACATTGAGACTGCTGTGGATAACGCAAAAACTGTGATTATAACATACAAGGGAATGCATGATCATGACATGCCTGTGCCCAAGAAACGACAGGGTCCACCAAGGGCTTCCCTTGTGGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCAATGAAAAATTTGCACTTCAAAAAAGGTGGTTTGGTACAAAACCAGGAAACTTCTTCTGCTCAATGCTCAGAGGACACAGAAGATGAAGCATTGGACCTTGGTGGTGAGAAAGCAATCGAATCAGCTCGAACTCTTTTAAGTATTGGCTTTGAAATTTAACCCTGTTGAATGTATCTTTCAGAAATCATGCAACTTTTATCCATGTATAAATTAATTGGTCGGTCTCA