Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11225 LG2 52250134 52251060 PREDICTED: B-box zinc finger protein 20
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 52250359 downstream_gene_variant
G/A 52250366 downstream_gene_variant
T/A 52250561 missense_variant p.Ser115Thr
G/C 52251046 missense_variant p.Val233Leu
C/T 52251052 stop_gained p.Arg235*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11225.1
MKIQCDVCDKMEATIFCPADEAALCHGCDRTIHHANKLATKHPRFPLIFPTSKDFPLCDICQEKRAYLFCQEDRALLCRECDLPIHRANEHTQKHNRFLLTGVKLSATSLDYASSSTNCTDTLTASEGKNARSRMNTPRSISNENLSSSCKVEDNVGSDTGSVSTSSISEYLIETIPGYCFEELLDGSFAPNNGFCKKENHDHLWEFQEQDLAQELRKFQTGDVMVVPFLKLVVRD*


CDS Sequence:
>Vu_11225.1
ATGAAGATCCAGTGTGATGTATGTGACAAAATGGAAGCCACAATCTTCTGTCCTGCAGATGAAGCTGCTCTTTGCCATGGCTGCGATCGCACCATTCACCACGCCAACAAGCTTGCAACCAAACACCCTCGTTTCCCTCTCATCTTCCCCACCTCCAAAGACTTCCCTCTCTGTGATATCTGCCAAGAGAAGCGTGCGTATCTATTCTGCCAAGAAGACAGGGCATTGTTGTGCAGGGAATGTGACCTTCCAATACACAGAGCGAATGAGCATACTCAGAAACATAACAGGTTTCTTCTAACGGGGGTGAAGCTCTCGGCTACATCTTTGGATTATGCTTCCTCCTCCACCAATTGCACCGATACACTCACTGCCTCTGAAGGAAAAAACGCTCGATCTAGAATGAACACACCCAGATCAATTTCCAATGAAAATCTCAGCTCTTCTTGCAAGGTTGAAGACAACGTGGGCAGTGACACTGGCTCGGTTTCAACCAGCAGCATTTCTGAGTATTTGATCGAGACAATACCCGGTTACTGTTTCGAAGAACTCCTTGATGGTTCATTCGCACCTAATAATGGTTTCTGTAAGAAGGAGAATCATGATCATCTTTGGGAGTTTCAGGAGCAAGATCTAGCTCAGGAGTTAAGGAAATTCCAAACGGGGGATGTTATGGTTGTGCCGTTTCTTAAACTAGTTGTTCGAGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_11225::LG2:52248134-52250134(+)
ATTAATAATTTTTATATAAATTTTTCATCTATAACATTAGAGTCTTGAATAGATAAATCTATAATATTTTTCTCTCTTGAAACTTTTTTTTATCTCATCTACAATATAATAAAAAATTTGTTAACTAATGATATTGAAACACCATAATAAATAATTAAATTAAATTAGGCAGATTTGTGAGCCAACTCGGTCCACCATGGATTCAACCCAAATGAGCCGGGTTCTAAGTGTGCCAGATTGAAAACTAACACGCATAAAAAAAATATATTTTTTTCAAACCCGACCCGGTTCAAATCTATACTGGGCCGGATTGACTCGTGAGTTATAACTTATTTTGACAACACTAATTAAATATATTCCATTATGTATTTTTGATAATTTTAGAAACATGTGTTGGATAAATTCTGAAAGTTGAATACGTAACTAAGATGTTGGCACAGTGGTTACATGGCTTTGATGATCTCATTAATGACGATAGGGCTCTTAGTTTAGCCTTTAATTTCGCTATGCTAGATAGGCTTGCATGCATGAACTTGTTTGTTAATAATGAAAGCAATTTAAACTTTCAAAGCACTTCGCACTCTTTCTCTCATTTATTAATATGTTTCTTTTTCTCCTAGTTTGTTCAATTTCGGTTTCTTAATTGTATATTAAAATTGGCATCCTTAATTTTTCTAATAAATCGTTTAATGTTTCTTAAAGTTCATTATAAATAATTATACATCAATGATTATGTTTATTTTAACCTATTACTTTTGTGACAAACGTACTCAGGGAGAAAAGTAAGGAAATTAAATATGGCAAGCAATCGATGAAAATAAAATCCTTTAATTATACAAAATAGCAAATTAGCATGTTTAGTGAAATATGTGATCATAAGTGGTTGTTCTTTAGAAAAAAGATAAAAAGAGAAATAAAGAATAGAGAAAACATACAAATGATAATATAATACATCTAACTATTTAATATTGAAAATAACTCTTCAAAATTGTTTTTCAAACATATGTTTTTATAATATTTTATTTTGATTATCTTTTTTCAATCGATGTTAATTATATATTAATCTCTCTCGATCATCTAGTAGGAATAAATAGTCGTTTTTTACTTGTTTTTCCAATGAATAAATAATCGTTTATGATATTTTTCACTTACATTATACTCATAAAATATTATGTGCGTGTACCTTTTTTATCTTACAATTTTTATAAAATTTAACTTTTTTTTTAAGAAAATGATACTTTGACCCATAAAATTTGTACATTTGTTATATTTTTTTCTTTTTCAAAAAAATATAAAAATTTATTCTTTTATAACTATTTTATCTTTGTAATAAAAACGTGTTACTTTACCGTTGTGAAATACCTTTAATCTTGGCTCCCTAAGCAGTCTGGATGATTTTCCCGTATGTCATCAGAAAAATATGCAGTGTTTATTAAATTATGAGTGAAGAGTTTGGCAATGGAGAAAAGTTATTAAAGATGGCTTTGAAACACAGCAATAAGAAGGATTGAAGTGATAACCAAAATTGACGAATAAGAAAGTATTGAAACTATGGAAAGGAAAGTTGTTTAACATGTTAAATCAGTGTTAATTTGGTAATAAGACTTTTTCATGGTTAAATCGAAGAAGAAAAGATAAAATTAAAGAATATAAGATAATTATGGTGTTGAGAGGATGATTTAGAAAGTGATTAGAGGTTGAATGAAGATAACACAGAGCATGGGTGAGAAGTTGAGAAGCAGCGAGAATGAGAGTGAAAGGTTTTGGAATATGTTGAGAATAAAAATAGGAGAAGGAGAAGCAAGTTGGTGTCTCCCAATCCAGATTTCTGTGAAAGTCAGAAGACACTAAATAGGGCTCAACCTAAAGCCAAGTCGCCCATAATTCTTTTGTCCCCATATACACTCTCACCCCACCATCAATTAAAGCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTAACTCTTCCACCACAAAACTAAGCTAAGGAAAACAGAGAGAAAGA


Gene Sequence:
>Vu_11225(+)
ATGAAGATCCAGTGTGATGTATGTGACAAAATGGAAGCCACAATCTTCTGTCCTGCAGATGAAGCTGCTCTTTGCCATGGCTGCGATCGCACCATTCACCACGCCAACAAGCTTGCAACCAAACACCCTCGTTTCCCTCTCATCTTCCCCACCTCCAAAGACTTCCCTCTCTGTGATATCTGCCAAGTACTCACTCACTATAACATCATAAATTTTCATATTTTCAGATACTGGCTCTTCATGTTCTTGGTCGTGTTTTTTCTTTTAACAGGAGAAGCGTGCGTATCTATTCTGCCAAGAAGACAGGGCATTGTTGTGCAGGGAATGTGACCTTCCAATACACAGAGCGAATGAGCATACTCAGAAACATAACAGGTTTCTTCTAACGGGGGTGAAGCTCTCGGCTACATCTTTGGATTATGCTTCCTCCTCCACCAATTGCACCGATACACTCACTGCCTCTGAAGGAAAAAACGCTCGATCTAGAATGAACACACCCAGATCAATTTCCAATGAAAATCTCAGCTCTTCTTGCAAGGTTGAAGACAACGTGGGCAGTGACACTGGCTCGGTTTCAACCAGCAGCATTTCTGAGTATTTGATCGAGACAATACCCGGTTACTGTTTCGAAGAACTCCTTGATGGTTCATTCGCACCTAATAATGGTTTCTGTAAGGTTTGCTTTACACCTTGTAATATGATACAACTTAAAAATTACAACTATAACTTGTTTTTGTTCCCTGAGGTTTTGTTTAACAACTTTGAACCGTGTTTTTTGTTGCTGCTGTTTTGTCGTTGTGGTCGCAGAAGGAGAATCATGATCATCTTTGGGAGTTTCAGGAGCAAGATCTAGCTCAGGAGTTAAGGAAATTCCAAACGGGGGATGTTATGGTTGTGCCGTTTCTTAAACTAGTTGTTCGAGATTGA