Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11196 LG2 52008145 52013451 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 52008240 3_prime_UTR_variant
T/A 52008355 3_prime_UTR_variant
T/A 52012987 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11196.1
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CDS Sequence:
>Vu_11196.1
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Promoter Sequence:
>Vu_11196::LG2:52013451-52015451(-)
TACACCCTAGCGACAACATTCCAGAGAGCTAGCGCTCAGTTGCACGCCAGCTGCACCCCAGCGGCAACATTCCAAAGAGCTAGCGTTCAGTTGCACGCCAACTAAAGCTACAATAAGTCTGGACGAATGGGGCTCAGCTGCACGCCAGCCGCACCCTAGCTTCAACATTTATCTTTGTTCTCAAAACTTCTTCTTTTACCTTCATTATTGCTTATATGGTTCTTCAATTCTTCAGTTTGGCATATAAGCTTGGATGTAAATGACCAAAACATACTAAACAATGTGAATTAGTGGTGAAATTGAATCATTAAAGTTTAAGATGCAACCACTTAAGAAACTAAAAGAAAATTAGGATTTACAAGACAAAAAGCTAATAAAGAGTTGATATTTTTTCTCAATTCGACACTGAAATCATGATAAAATATGTCATTATCACTCACTCGAAAAAATGATAATCATTACAAAAGAAAAACACACAAACACCATTGATCACAAATACATTAAAAGAAAAACTAATTTACAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTTAAAAGTTATAAAATAAATTTGTCTTTTATTTTTAGAACTCTCGATTCAAACTTTTATTTAAAAGTGAATTTGAAGTAAAAGAAATAATTAAGCCAAACACTATTTAAGTCTAAAATAAAAATATTTAAATGTTTTTTAGACAGGTTTATTTATCTTTCTTAAACATTTTTTTAATGACATTTTCTTTCAGCCATCTATGAATGCATGGCATGGGTAATAAAAAAGTACATTAATCGGCAATTTTAATTTTAAGATCAATGTAGTTTTTAGGGATAAAAATGTGCATAAGTAAGTTGGAGAGAACAAATGAACGACAAAACTCTGTTTTCAGGTAAAAATAACACCCAATTCTGAATTTGAAATAACTGTTATTGTGGAACAATTCTTTGTTCAGTTTTAATCGTTGATTTAGTATTAGTTAATTTATTATTATTATTATTATTTTCAGCATACATACGCTTATATATAAGTTGGATTCAACGACAATTAGTAGCACAACTAAGTAGGATTCTTTTGACGCAAAAAGATAACCCCGTTGACCCCATAACTTTTGAAAAAAGAACATGAAATGCATGCTTAAGTTTGAACCCTGGTTAAAGTACAAATAAAACCTACTTTTCTTAATTACTTTAATCCCTTTCTTTCAACAATGATTAAATGGTATGAAATCCTTGTTTAAGATGGCCAATAGTCAAATTTAGGAGAGACATACATAAGAACAACAAAGCTAACCTTAAGTTACATTGAGTTGAAGAAATTCTTAGAGAGTTTACCTAATTTTGACAAAAGTAAATTAATTACACAAATTTGCATATCAAATTATTGATGGCGTTTTAAATTCACATATAAATATTTTTATCAGTCACATTTTAAATTCACAAATTCTTAAATTTATGTCCAAAATATGATTCAAGAAGATATTCATTTAAACCCGAATATTGTAAATTTAATGTCCGTAAATATGAATATTATCGAGCTATTAATTAGGCAAATATTAGGATCCATAAAAATCTTACGACACAACACAATATTACTAAGCCCACCATTTTGTAGGTTCCTTGGATGAGTAAGACGTCAATTAGTCAAATGCTCTTAAAGAGGCACATAATTAATTTCCCAAAAGACTCTTGTAATAGCTCAACAAAATAACCACTGAAACACATTTTCGAGATCGATAACAATAAATTATACCTGGTAAATTAGTCATGGAGTGTTGAATATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTGAAATTGGCTTAAATTTATTTACCAAAAGGTGTAGAGAGAGGAAGAGAGGGGAGGTTAGAAGAAACTGGTGTCCTGAAACAGAGGGGTACAATAACATAAACATATAACACAGAGACAAAGGTGCAAAAGAGAAGAAAAGGGAG


Gene Sequence:
>Vu_11196(-)
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGCTTGCATATTAAGGGAAGAGATTAGAATAAATAGTTAGAGTTAGAGTGGTCTTTGCTGGACTTGGCGGGATTTCCGGTGCCGGATTCAGTGTCGGCTTGCATTCCTCACTCACTGCAATTTTCTCTCTCTCTTTCTCTGTCTCAACCTCAGAGAGAAAGAAGAAAACAGTCACAACCACAGCCGCAGAGAGCTACCTACTACTTCTTTGTCCCTGTTGTTAAACCATTCTCTCTCCAATTTGTTATTTTTATCTCAGGCCCCCATCGTCACAGTATAATATCTTTTTCTCTATTTTTTTTTCTTTTCCAAATTTAAATATTTTTCTTTTCGTCTTCCGTCAACTGAAGGAGGATTCAGAGAGACAGGCAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAGGTAGAACAATATAACCTCAGTCAGACACAGAAGAAAGGAAGAAGCATAGAAAGCGATACAGATTTGGCAGCCTTGGAAACTGCGGGGAGGCGAAATAGAACAAGGTTTGTGATTCCGGTAAGACTCGTTGGGTATTTGTTTTTGTTTTTGTCCTCTTTTTATTTATTTATTATTTTTATTTGGGGGTATGTGATATATTAGAAAGTTGAAGACTTTTGGGAGAAAGAGAAATGTAAATGTGTTGGGTGTGTGTGCAGACATTTGATGGAAATGGATGGATCTTTGGGTCAGCGTTGGTAAGAGATGGGGATAGTGTGGTTCCGGTTGTTGTTGTTGCTGGTGGTGAGTCAGGTGACATTGGAGCAGATTGAGCCACTGAGTTCCTCTGAGGAGCGAGAATCGTTACTTGAACTGAGGGCTTCTCTGGGGTTGAGGAGCAAGGAATGGCCAAGAAAACCAGACCCTTGTTTACTCTGGGTTGGCATCACATGCCAGAATGGTCGAGTCGTTGGGATCAGTATCTCTGGGTTTAAAAGAACAAGACTTGGGAGGGGGAACCCGCAATTTGCAGTGGATGCTTTGGCCAATTTCACTCTCTTGCAGTCCTTCAATGCCTCTAATTTCCTCCTTCCTGGACCTATTCCCGATTGGTTTGGTCTCTCCCTTCCTTCTCTCAGAGTGCTTGATCTTCGTTCTTGTTCCATTGTGAATGCTATTCCCTCCACTCTCGGCAATTTGACCAACCTCTCTAGTCTCTATCTTTCTGACAACAACCTCATTGGGAATGTTCCGGAGTCTCTGGGTCAACTCTCTGCCCTTGCGGTTCTTGATCTTTCCAGGAATTCTCTCGCTGGCTCCATACCAACATCTTTTGGCTTTCTTGGGAATCTTTCTTCCCTTGACATGTCTGCCAATTTTTTGTCGGGGCCGATTCCCCCTGAAATAGGGTCTCTTTCCAGGTTACAGTACTTGAATCTTTCCAACAACGGACTTGCCACTTTGCCTAGTCAATTGGGGGGTCTAACTAGCTTAGTTGTCCTTGATCTTAGTCAGAATTCTTTTGCCAGTGGAGGACTGCCTCAGGATTTGGTTGGGTTTAGGAACTTGCGGCAGATGATACTCACAAACAGCATGCTCACGGGGGCCCTGCCCGGCAGATTGTTTACTGATTCATTGCAGTTGCAGTTCCTAGTGCTGAAGCAGAACAATTTTAGTGGTGCTTTGCCTGTTGAGTTGTGGTCTCTGCCAAGATTGAGCTTCCTTGACGTGTCTGCCAATAATTTCAGTGCTGTGCTTCCTAATTCGAGTTTGGCTGCTAATGCTACTGTTGCGGTGCTCAATATTTCGCACAATAAGTTTTATGGAAACCTCTCTCCTGCTTTAAAAAGGTTTGGGTTTATTGATCTTTCAAACAACTATTTTGAGGGCAAGGTTCTGGATTTCATGCATAATGTATCTCTAGATAGCAATTGTCTCCAGAACGCCACAGATCAGAGATCAACGGCGGAATGTGCATCGTTTTATGCAGAGAGGGGGCTCAGTTTTGATAATTTTGGACAGCCGAATACAACAACACCTCCTGCCTCAAAAAGATCTGGGAAGAGCAATAAGACTAACATTATACTGGCTGCAGTCTTGGGTGGATTGGGTTTAATTGCACTTTTGGTGTTGCTAGTGGTTCTGCTGCTTCTGTGTATTCGTAAGAGGGGTAACTCAAATCAGAGAGGAAACGGTGTGGGTCCTGCGCCTGTTGGCAGCAGTCCTCCAAACCCTGGTGTACCTATCGAATTTCCAAATGTAGGGGACTCATTTACATATCATCAGCTGCTCCAGGCAACAGGAGATTTCAATAATGCAAATCTTATCAAACATGGACACACTGGGGACTTCTTCAATGGTGTTTTGGAAAGTGGGATTCCTGTCGTCATCAAAAGGATCGACATGCGTTCAGCTAAAAAAGAGGCTTACCTGTTGGAGTTGGAGTTCTTCAATAAGGTTTCTCATCAGAGATTCGTTCCATTGTTAGGTCATTGTTTAGAAAATGAGAATGAGAAGTTTCTGGTATATAAAAGCATGCCAAATGGGGACTTGTCTAATTGCTTGTACTACAAAAACACTACATCCGAAGATGGTACTTTGCAATCACTGGACTGGATAACCAGGTTGAAAATTGCTACTGGAGCCGCAGAGGCCCTGTCGTATCTACATCATGAATGTGTGCCTCCCATTGTTCACAGGTATTTCCAGCATTCCTTCTTGAATTTTATTTCTATTTCCCTATTGATTGCTTTAACAATCCATTGGATTCTGGAGCCTGATGAAGTGCCTAATTTCATTAACTCTCAACTGCTCATCCCCACTTCATCCTTGGATGCATCTTTTTTAAGAGTTCAACCTTTTGAACTGATCCTCTTTATAATTTATATGGATCCATACTCTTTGAAATAAATTTCCCTTGAGTTTTGGTCATTGAATTTGAGGTTGCTGTCATAAGTTTTGGCATTTGATTTTATATCTTTTAGGTGATTGAATATAAGTTTCCCTTGAGTCTGGACTTTTTCATTATTAAATGTTACTATGCATTTTCCATCTAATGGAGCTGTAAAATAGAGGTTGGGAGAAAGTCTCACTTGGGGGTGCATTCCCTGTATTTGATTGGGCATTTCAACACTGCATGCATAGGATGAGTTTTGTCACAAGTTTTCCTCTCAAAGTTCAATCTAAAGTTTAAATGTTATGGTAGAAGTGACATGTCTATCTTCTATATATTGTAGGGATATTCAAGCAAGCAGTATACTTCTTGACGACAAATACGAAGTTCGGTTGGGGAGTCTAAGTGAAGCCTGTGCTCAAGAAGGTGACATTCATCAAAGTAAGATCACCCGGTTTCTGCGGTTGCCTCAGTAAGTACTCAACCAACAACGTATTCAATGAATCTCATGAAAAATGTCTGACAGGTCAATCAATTATGCATAGACAGTATCATTCTTCTTTTTGACTTGATCCTTTTGGCTGTTTGTTGAAAAATGCTTACACGTTGAAACTTTTGCTTTTGGATTGCTTATCTATTTCAGACCGGTTATCATGTCATTTTTAATGTGGGTGTTTTTAAATAAGAAATGTCACTTAAAGTTGTCATTTTTGGTTTTCATTAATGACTGCTCCAAACTGAAAGTTGTCATTTTTGGTCTCTGCAACTAAGAAGTCCTTTATCCTGTTCGTTCTCTCGCAAATTCTTCCACTATGTCATTAATTCATGATTTGGTTGTGTTATGATTTTTGAACAAGTTTTGTATTCCTTATTACAAATTACAAATCTATATTATTTGTTATATTTTTTTCTAATTTTCTTTTTAAATGTGCAGGTCCTCAGACCAAGGCCCATCTGGTAAGTAGAAACTCAATTTTAATTTTTGGTTTAGTTTCGTGATCTGTTCTGTCCTTGATTGTATGTTTCTTCACTCATACCTATTAAGAACTGAACTTTAAGCCAAATTCAATCCTACAAAACTATCACTGTGGACATCTAAGTTGAAAAAGAAAATGTTTTGGCATTACCATTTATCCGTGATAGTTTTGTGCCAGCAAAATTCATTTTCAGTAAGGCAGTTGGAAATCCTTCTGATTATCTAGAATTATGAGATTCTATTCACTCTGAAGTAGTTAAGTGGTCAATATATTGTGCTGAGATGTTCTTCTGTTTATTCACACGAAAAGCTCAGTAGAACTCCGAGTGGTTTGTGGTTGTCTTTCACAAACTGTGATGGATAATTTGATCATGTGGTTTATTGTATGTGCTTATTGTGAAGTATATAATCCTCTTTTTTGGCTCTAGCTTTGTATGAATACAGATAAATGCATAGTTTTGACATGGATTTGATTTACCGTGAAACAGGTTATTCAACAACAATTTGTGCCTATGACGTTTATTGCTTGGGAAAAGTTTTACTCGAACTGGTGACCGGTAGGTTGGGAATGAGTGCAGCCAGTGAAGCCGAAGTAAAGGAATGGTTTGATCAGATTCTGCCTTGCATTAATATGTATGAGAAGGAGCTCGTGACGAAAATTATCGATCCATCGATGGTCGTCGACGAAGATTTCCTAGAGGAAGTGTGGGCTATAGCCATTGTTGCCAGGTCTTGCTTAAACCCCAAACCTTCAAGGAGACCCCCAATGAGATATATTCTGAAGGCTTTGGAAAACCCTTTGAAGGTGGTGAGGGAAGAAAATTCCAGTTCTGCGCGGCTCAGAGCAACCTCTTCCAGAGGTTCTTGGAACGCTGCTACTTTGTTTGGGAGTTGGCGTCAGAGTTCTTCTGATGTAGCGGCAACTCCAGCAGCCTCAGGTGTAAAACTAGAAAGAGCTGGTAGTTTGAAACTGTCAGGAACCACCGGGTCGCGGTCGCAGTCGCAGGGTAGTTTCCACAATGGCGGCGGTGAGATTTCGTTGTCGCGGAGACGACACTCGAAGGAGATATTCCCAGAGCCATCAGGGGTTGATGATGTAGAGAGGTTGGAGCTGGAATAACAGAGAGTTTGGTCGTAAATTTAATTCTTTTGGTAATGAGAGAA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