Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11195 LG2 52002220 52005883 PREDICTED: probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g34500
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, developmental growth, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 52002817 missense_variant p.Cys377Ser
A/T 52002858 missense_variant p.Ile363Asn
T/C 52003192 upstream_gene_variant
G/A 52003352 synonymous_variant p.Leu260Leu
T/A 52003819 upstream_gene_variant
A/G 52003901 synonymous_variant p.Leu186Leu
A/G 52004068 upstream_gene_variant
T/C 52004247 upstream_gene_variant
T/G 52004254 upstream_gene_variant
G/A 52004255 upstream_gene_variant
T/C 52004319 upstream_gene_variant
A/T 52004320 upstream_gene_variant
T/A 52004386 upstream_gene_variant
T/C 52004389 upstream_gene_variant
T/A 52004440 upstream_gene_variant
C/G 52004523 upstream_gene_variant
T/A 52004615 downstream_gene_variant
C/T 52004725 downstream_gene_variant
G/T 52005121 downstream_gene_variant
T/C 52005236 synonymous_variant p.Ala153Ala
C/T 52005510 missense_variant p.Ser62Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11195.1
MAASATASGGVLTDLTHRTPFLGLKLYALILILVIMVVAAVLLILLCFRRSSKKRKMRVKHSSGAIPLVSKEILEVNTLELKIEEADEEDPKKEEMKLEDSPSVESPNIGWGRWYSLSELEAATQGFAEGNVIGEGGYGIVYRGNLLDGSVVAVKNLLNNKGQAEKEFKVEVEAIGKVRHKNLVGLVGYCAEGAQRMLVYEYVDNGTLEQWLHGDVGPVSPLTWDIRMKIAVGTAKGLAYLHEGLEPKVVHRDVKSSNILLDKKWNAKVSDFGLAKLLGPEKSYVTTRVMGTFGYVSPEYASTGMLNEGSDVYSFGILLMELITGRSPIDYSRPPGEMNLVDWFKGMVANRLGDELVDPLIDIQPSQRSLKRALLVCLRCIDLDVSKRPKMGQIVHMLEADDFPFRSEHRTNREKDPVYSKAAGSSKIPYPTRHVEPVDKSNWR*


CDS Sequence:
>Vu_11195.1
ATGGCGGCATCCGCCACCGCCTCCGGCGGTGTGTTGACGGATCTAACTCACCGAACCCCCTTTCTCGGTCTCAAACTCTACGCCCTGATCCTCATTCTAGTTATAATGGTGGTGGCAGCAGTGCTCCTGATCCTACTCTGCTTCCGCCGGAGCTCGAAGAAGCGGAAAATGCGAGTGAAGCACAGCTCCGGCGCGATCCCGCTGGTATCGAAGGAGATCCTGGAAGTGAATACTCTGGAACTGAAAATCGAAGAGGCGGACGAGGAGGATCCGAAGAAGGAGGAGATGAAGCTTGAAGATAGTCCGTCGGTGGAGTCACCGAACATAGGGTGGGGACGCTGGTATAGCCTCAGTGAGCTTGAGGCTGCGACGCAAGGGTTCGCCGAAGGGAATGTGATCGGAGAAGGAGGGTATGGGATTGTGTATAGAGGAAATTTGCTCGACGGTTCTGTCGTCGCAGTCAAAAATCTTCTCAACAACAAGGGGCAGGCAGAGAAAGAGTTTAAGGTGGAGGTTGAAGCCATTGGAAAAGTGAGGCACAAGAATTTGGTGGGGTTAGTTGGATATTGTGCAGAAGGTGCTCAAAGGATGCTTGTTTATGAATATGTTGACAATGGAACATTGGAACAGTGGCTGCATGGTGACGTAGGACCTGTTAGCCCCTTGACATGGGATATACGAATGAAGATTGCTGTTGGGACTGCGAAAGGGCTAGCCTACTTGCACGAAGGATTAGAACCCAAAGTTGTCCATCGAGATGTAAAATCCAGTAACATTCTCTTGGACAAAAAGTGGAATGCTAAAGTATCAGACTTTGGACTGGCCAAGCTCTTAGGGCCTGAGAAAAGCTACGTGACAACGCGTGTAATGGGGACATTTGGATATGTGTCACCTGAGTATGCAAGCACGGGTATGCTTAATGAAGGCAGCGATGTGTATAGTTTTGGGATTCTACTTATGGAGCTAATTACAGGGAGGAGTCCGATCGATTATTCTAGACCACCTGGAGAGATGAACTTGGTTGATTGGTTTAAAGGAATGGTTGCAAATCGTCTTGGTGACGAACTAGTTGATCCTTTAATAGATATTCAACCCTCTCAAAGATCTTTGAAACGAGCTTTACTTGTTTGTCTGCGCTGTATAGATTTGGATGTCAGTAAGCGACCAAAGATGGGCCAAATTGTTCACATGCTTGAGGCTGACGATTTTCCCTTTCGTTCTGAACATCGAACAAACAGAGAGAAAGATCCTGTTTATTCTAAAGCAGCTGGTTCCAGCAAGATTCCATATCCAACAAGGCATGTAGAACCAGTAGATAAATCAAACTGGAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_11195::LG2:52005883-52007883(-)
TTTTCACCTTTCAGCGTAAAAGCAAATATTATTATCTAATAAATTTTAAAACTAATGCACCTACATCTTATACATATCTAAATATATAATTAAAATTTTAACATACATTTAAATTTAGTTATCACTTTGACATTTATCTTATATCTAATTATTATATCAAGACACGAAAACATGGATTATAATTTCATGATCTTGAATTTCAGTTGTAAATTTGATCTTCTAATCACGATTAAGAATAGTCTTTTTATGTTATAGTTATACTAATGAGATTCTCCAGGAATCAAGGTTTTATACCTTAGTTCTATTAAACATGTTTTAAGTAAACGTGACAAAGAATTTTACGGTTGAAATCACACAATTGTGATTCATATAGATATAGTCGAAATAGCTAGAATTACGGCATTAATCACACACTTAAGAAAAAAACAAACAATTAAAATATAATAAATTTAATAGTAAGAGTTATGTTATAGACCAAAAGTGGAAATAAGGGGATAAATAAAACAAGGAAGTGAATAACTTTCTTTTCTGTTGCTATTTTATAATTGGGTAAATTTTTCATTGTAAATTTTGATCAAAATGTACTTAATATATTTTTGAACAAATTAATTTCAGTTTATTTTCTTAACCATAAGAGATACATTAATGATACTAACTATGTTTTTAATAATAATTTACTGTTAATTAATTGTTGATACGATAGTTAACAACCATATATGATTTGAATTATTTTGAAAATAGGGTTGAAGTAGAGGGAGTGCAATTCATACCGACACATTTAATATCTATGAACTGATAGCTCACGACAACTAATTTTTTCACGTACTTCCACATTCCTTAATTATTTGGACACGCGCTCAATAACTTCTCCATCATCGTATACATAATATTTATAAGAAATACGTCTATTAATATAAAAAGATTAAAAAGCTCGTTTTATAAAAGTGATTATGGTACGAATAAGTTATTTAGCAATGTATGGGAGATATTTGAGTTGCATGTGTAGGGCATTGGAAGTTAGTTACTGTAGGTGGAGCTAGTTGAGTTGGTGAAAGTAAATGGGAAGTATGAAAAGAGAATGAAAATGGCATATTGAAAGAAATGGTTTGGTGGTGAGTTACGTTGGATAATCACGTTTACGAGTCAATTTGTCATCTACATATATAAGATCAACCCTAGTCCTTTTCATCAAATCACAATGGATAATTCTGTTTCAACTTCCACCATTCGCTCCACTTCAAAGCAAACCAAACCCTATTTTCTTCTCAAAATATTACAAGTTAGTTACTATATATATTCGAGATTATCTATTTTGAAGACTACAATTTTGTCATAATTTTATTTTTAGAAAACATATTAGATTATTGAAAAAAATATATTTAAATTATCTTGCCTACGATATTTGATCACTAATATTGTAAAAGTAATATCTTAAATTAATTATTTTTTATTATTAGTGTTTAGATTAAATGTATTTTTAATTTCTTATATAAAATTATTATTTTTTAGTTTAAATTTTGATATAATTTAATTCTTAAATTTTATAAATGAATAAATACATTTTTTTTTTCAAATCTAATAATGTGAATTGTTAAACAGTATTTCAAGCTAAGATTAAAATTATTAACACAGTTTAACATGTTATTGATAAAATATCGTTCTAAAGTCTTATTTAAGACATAAAATTATATCAATTTATTTTTTAAATTTAATAAGCAAATATATTAAAATTTTAAAACAATAAATTTTGACTTTCGTTCAAGATTTAAAAAATAAAAACATATTTCATTATTATTATTTATGCCAATTCATCATGTACTTGAGTTGTAATTACATTGGAGTCCCCACGGTGATGACGTGAATGGGGAAGTTAAGGGAGCGTGCGCGAGTGGCATTTATGTAAATAGAGTCCCAATCGGACCCAAAAAGCAATAACTACAATCCCGGTTCTGTCTTGCTTTGCTTTAGCTTTTGTATCCGTTGATGAAAGTTGAAACTTC


Gene Sequence:
>Vu_11195(-)
ACACTTTTCCCAATATTCTCGCTTCTTTTCTTTTTCTTCTTTTCTTCTTTCGTTCATATCATTTTTTTCAATTCTGAAGCAACCACTTCACTGCATCACAGTTTCCACAACAGCAACAACCAAACGCTGTCAACACTACATTCTCTCGTTTTCACTCCATTCCATTCTCGCTCCAAATAAATATCAGCAATGGCGGCATCCGCCACCGCCTCCGGCGGTGTGTTGACGGATCTAACTCACCGAACCCCCTTTCTCGGTCTCAAACTCTACGCCCTGATCCTCATTCTAGTTATAATGGTGGTGGCAGCAGTGCTCCTGATCCTACTCTGCTTCCGCCGGAGCTCGAAGAAGCGGAAAATGCGAGTGAAGCACAGCTCCGGCGCGATCCCGCTGGTATCGAAGGAGATCCTGGAAGTGAATACTCTGGAACTGAAAATCGAAGAGGCGGACGAGGAGGATCCGAAGAAGGAGGAGATGAAGCTTGAAGATAGTCCGTCGGTGGAGTCACCGAACATAGGGTGGGGACGCTGGTATAGCCTCAGTGAGCTTGAGGCTGCGACGCAAGGGTTCGCCGAAGGGAATGTGATCGGAGAAGGAGGGTATGGGATTGTGTATAGAGGAAATTTGCTCGACGGTTCTGTCGTCGCAGTCAAAAATCTTCTCAACAACAAGTATGCATTTCTCTCTACGTTTTTCTGTTTCTCTTTTTCATTTTTTTCTCACGTTGCTGTGTAGTTTTCTTATATTGGTTTGTATATAATGCAAATAAAAAGCAGCTAAGAGAAACTGTTTTCTGTTCTGGGATCCTACACGTGAATTGTGGAACAGGAATTTCACATGTGTTTCTAAACATAACTATAGACAGAAATTCCTTAAATAAATCTTAATATATCAAGAAATTAGAATCTGAATATCGATTAGATTAGAACTGGCGTAAACAATGAGTAGCTTTTTAGTCTCCGACAAGGATCGTCTCGAATTTATAATTATGAGTTGTTACTTGTTTTGGGGAGTATTAAGGACTAACGTGAGTGGATGGTCAATGTGCTCTTCTTCTTTGCTTTTTTCTTTGGGGGGCCTCTGGGTGATGTTATTTTAGTATTTTACCTTTTTCTTTGTCTCCTTTTGCTTTTTTGTTTATTTATTTATTATTATATTGTTCGTGATTTCTGTATCTCAACCTTTTCTTTTCTAGGCATGTTAATTTAGCTTAATCTGGATAATACTTTAGTTTAAAGTTTAAACAAACGTGTCAGTTGCTGTGAATTAGGTGGGCCAGCGAGAGACTGATGGTAGTATTAATTAGGAAAATGTTATTTGGACAACAAAAGTTTGACACAATTTTGACAACAGCGACGTGGCAGCTGTGCATTGGCTCAGTGAACCGGGGTGAGGGGTATTTTGGGTTTTTTCTGGTTTGTTTTCAATTCACTGAGCCAATGCACAGCTGCCACGTCGCCGTTGTCAAAATTGTGTCAAACTTTTGTTGTCCAAATAACATTTTCCTATTAATTAATAGCTTCATATTACTCTCTACAAAAATGAACTTGGATCTTCTCTCTCTAATTTTTTTTTTTTCCAAGTAAAGTGCGATAATCACGTTAGAAAGTGAAAAACACAATTGTTGTCAGATATAATTATTGGATCTTATTTGTGTTCGTTTTCAATGTCACTCTATATTGAAGAGATCTAAATCTAACCAAAACGGCAGCTACACATTTGCATGACATTGGAACTCGCTGCAATAAATTAAGTAGCATTGTAGAACTCTAGACTAGAGGAAAATATGCGAAGGTTGTTTTACCACAGCAACTTTGCTGAAATCACGGAATGTTTTCAATACTCTCTTTCTTCCTCACCATCCTGCAATGGCTTATTGAAACTCATGTGTTATTGTATTGTAACAAAGGGGGCAGGCAGAGAAAGAGTTTAAGGTGGAGGTTGAAGCCATTGGAAAAGTGAGGCACAAGAATTTGGTGGGGTTAGTTGGATATTGTGCAGAAGGTGCTCAAAGGTAAAATATGTTTAAGCATGTGTCTTTAATTATTTCTTTGAAGGTCTTTCAAATGAAGAAACTTGTGAATATGACACTTTTGCTGACTATTCATTCAGGATGCTTGTTTATGAATATGTTGACAATGGAACATTGGAACAGTGGCTGCATGGTGACGTAGGACCTGTTAGCCCCTTGACATGGGATATACGAATGAAGATTGCTGTTGGGACTGCGAAAGGGTGTGTTTATGGAGTCTCCTGTGTCGTTTTATTGAACATATACCTCAAACTTTCACTCATGCCAGCTATCTCTAATTGTAGTATAATTCTTGTCAACTGATATATTACTATTTTTTACAATACGTATTTCTAGTACAACTCTTATCATGATCCCTTAATATTACATTTCTATTACTTTAAATATTTTTTCGTGGAGTATTAATTAACCTTCCTACATTACGAAACAGGCTAGCCTACTTGCACGAAGGATTAGAACCCAAAGTTGTCCATCGAGATGTAAAATCCAGTAACATTCTCTTGGACAAAAAGTGGAATGCTAAAGTATCAGACTTTGGACTGGCCAAGCTCTTAGGGCCTGAGAAAAGCTACGTGACAACGCGTGTAATGGGGACATTTGGGTTAGTTTCATTCTCAAGTAACATTCTCAAGTAAACATTCTCTTACATGGAGGTGGATACTATTTATCTGTTTCATTCAACGCCACAAATTTTGTGCAGATATGTGTCACCTGAGTATGCAAGCACGGGTATGCTTAATGAAGGCAGCGATGTGTATAGTTTTGGGATTCTACTTATGGAGCTAATTACAGGGAGGAGTCCGATCGATTATTCTAGACCACCTGGAGAGGTGATTCTATGATTTCTCTATATTTTCTTACTGTCTCCCCTGAAACTCCAATGAGTCTTATGTGTGCGTTTTGTTTGGTGCGCTCAGATGAACTTGGTTGATTGGTTTAAAGGAATGGTTGCAAATCGTCTTGGTGACGAACTAGTTGATCCTTTAATAGATATTCAACCCTCTCAAAGATCTTTGAAACGAGCTTTACTTGTTTGTCTGCGCTGTATAGATTTGGATGTCAGTAAGCGACCAAAGATGGGCCAAATTGTTCACATGCTTGAGGCTGACGATTTTCCCTTTCGTTCTGTAAGCCTCCTCCCATGCTTTCATCCTCTGTGATTTATAAGACAAAAACATGTGATGCAGCGTTACACACAGTTTTTGATACTATATGTCACATCCTAATGTGGAATATTTAATTTCACAGTAAATTTGAGTATAGCTTCACCAACTGAAATGACTTGCTTTGCTTTCTGAATAGGAACATCGAACAAACAGAGAGAAAGATCCTGTTTATTCTAAAGCAGCTGGTTCCAGCAAGATTCCATATCCAACAAGGCATGTAGAACCAGTAGATAAATCAAACTGGAGATGATATGACAAATCGTTAGATAAAAATATTTTTTCCAGCGATTTTCAATATGTTGTGATCAAGTCAGAAGCCATTGTGCATATAGTGTAGTTTCATATCTGTAGGAGAGGTCTTAGCATATTCTGCTGTATGGCATTATCTTGTGAAGAAACGAGCCTTGTAAATAATATTATCCGTCTGCATAATATTTCGGCAATAATATTGCTGATATTTATTCGT