Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11141 LG2 51641782 51646316 probable serine/threonine-protein kinase PBL21
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 51641840 3_prime_UTR_variant
C/G 51641841 3_prime_UTR_variant
A/C 51641844 3_prime_UTR_variant
G/A 51641906 3_prime_UTR_variant
T/C,* 51641926 3_prime_UTR_variant
C/A 51641949 3_prime_UTR_variant
C/A 51642040 3_prime_UTR_variant
C/T 51642245 3_prime_UTR_variant
C/G 51642246 3_prime_UTR_variant
T/C 51642341 3_prime_UTR_variant
T/C 51642426 3_prime_UTR_variant
T/C,* 51642459 synonymous_variant p.Gln366Gln
A/G 51642540 synonymous_variant p.Asp339Asp
G/A 51642576 synonymous_variant p.Leu327Leu
G/T 51642585 synonymous_variant p.Ala324Ala
T/A 51642600 synonymous_variant p.Ala319Ala
G/C 51642710 intron_variant
T/C 51642884 intron_variant
A/C 51642912 intron_variant
A/G 51642941 intron_variant
G/A 51643068 synonymous_variant p.Ile268Ile
G/T 51643134 synonymous_variant p.Ala246Ala
G/C 51643329 synonymous_variant p.Gly181Gly
G/C 51643334 missense_variant p.Arg180Gly
T/A 51643696 intron_variant
A/T 51643843 intron_variant
A/T 51643850 intron_variant
A/C,* 51643852 intron_variant
C/T 51644050 intron_variant
G/T 51644086 intron_variant
G/A 51644118 intron_variant
G/C 51644123 intron_variant
A/T 51644153 intron_variant
T/C 51644271 intron_variant
C/T 51644276 intron_variant
T/C 51644279 intron_variant
T/C 51644280 intron_variant
A/T 51644288 intron_variant
T/A 51644347 intron_variant
A/G 51644420 intron_variant
G/T 51644491 intron_variant
C/A 51644573 intron_variant
G/A 51644641 intron_variant
G/A 51644689 intron_variant
C/T 51644788 intron_variant
A/G 51644914 intron_variant
G/A 51645078 intron_variant
T/G 51645079 intron_variant
G/C 51645097 intron_variant
A/T 51645113 intron_variant
A/G 51645118 intron_variant
G/A 51645223 intron_variant
C/A 51645266 intron_variant
C/A 51645289 intron_variant
G/A 51645431 missense_variant p.Thr114Met
G/C 51645528 intron_variant
C/A 51645558 intron_variant
A/T 51645575 intron_variant
A/G 51645596 intron_variant
T/A 51645810 missense_variant p.Lys36Met
G/A 51646066 5_prime_UTR_variant
A/T 51646207 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11141.2
MSCFSCFVSRRKDVRRVEIDNGTRSATAASSEGERKRESSEAKGKSVSSGKGSTAAASFGFRELAAATRGFKEVNLIGEGGFGRVYKGRLSTGELVAVKQLSHDGRQGFQEFVTEVLMLSLLHHSNLVKLIGYCTDGDQRLLVYEYMPMGSLEDHLFDPTQDKEPLSWSSRMKIAVGAARGLEYLHCKADPPVIYRDLKSANILLDNEFNPKLSDFGLAKLGPVGDNTHVSTRVMGTYGYCAPEYAMSGKLTLKSDIYSFGVVLLELITGRRAIDTSRKPGEQNLVSWSRPYFSDRRKFVHMVDPLLQGNFPLRCLHQAIAITAMCLQEQPKFRPLIGDIVVALEYLASQSITEVHRHGGRSSPQQPSSEMDRN*

>Vu_11141.1
MSCFSCFVSRRKDVRRVEIDNGTRSATAASSEGERKRESSEAKGKSVSSGKGSTAAASFGFRELAAATRGFKEVNLIGEGGFGRVYKGRLSTGELVAVKQLSHDGRQGFQEFVTEVLMLSLLHHSNLVKLIGYCTDGDQRLLVYEYMPMGSLEDHLFDPTQDKEPLSWSSRMKIAVGAARGLEYLHCKADPPVIYRDLKSANILLDNEFNPKLSDFGLAKLGPVGDNTHVSTRVMGTYGYCAPEYAMSGKLTLKSDIYSFGVVLLELITGRRAIDTSRKPGEQNLVSWSRPYFSDRRKFVHMVDPLLQGNFPLRCLHQAIAITAMCLQEQPKFRPLIGDIVVALEYLASQSITEVHRHGGRSSPQQPSSEMDRN*


CDS Sequence:
>Vu_11141.2
ATGAGTTGTTTTTCGTGCTTTGTTTCTCGCCGGAAAGATGTCAGGAGGGTTGAAATTGACAATGGCACTCGATCTGCTACTGCTGCTTCCTCAGAGGGTGAAAGGAAGAGAGAATCCTCAGAGGCAAAGGGGAAGAGTGTGAGTAGTGGTAAAGGAAGTACCGCAGCGGCTAGTTTTGGTTTCCGCGAACTCGCTGCGGCGACGAGGGGTTTCAAGGAAGTGAACTTAATTGGGGAAGGTGGTTTTGGAAGGGTTTACAAGGGTCGACTTTCAACGGGCGAGCTTGTTGCCGTGAAACAATTGAGCCATGATGGTCGACAAGGTTTTCAGGAATTCGTGACGGAGGTTCTTATGTTGAGCTTGCTGCACCATTCTAATCTTGTGAAGTTAATTGGCTACTGCACGGATGGAGATCAGAGACTTTTGGTTTATGAGTACATGCCCATGGGTTCACTGGAAGATCATCTTTTTGATCCGACCCAAGACAAAGAACCCCTAAGTTGGAGTTCTCGAATGAAGATTGCTGTTGGAGCTGCTCGTGGCCTCGAGTATCTCCATTGTAAAGCAGATCCACCTGTTATTTACAGAGACTTGAAATCTGCTAACATCTTGTTAGATAATGAATTCAACCCAAAACTATCAGATTTTGGGCTTGCTAAACTTGGACCTGTTGGAGACAATACCCATGTTTCAACCAGAGTGATGGGAACATATGGCTACTGTGCACCTGAGTATGCCATGAGCGGCAAACTAACTCTTAAATCTGATATCTACAGCTTTGGTGTGGTTTTGTTGGAGTTGATCACTGGACGTAGAGCAATAGATACCAGTAGAAAGCCAGGAGAGCAAAACTTGGTTTCGTGGTCTCGTCCATATTTTAGTGACAGGAGAAAGTTTGTGCATATGGTTGACCCTCTTTTACAAGGCAACTTCCCCTTACGCTGTTTGCATCAGGCAATTGCTATAACTGCCATGTGTCTCCAGGAGCAACCAAAATTCCGTCCACTTATTGGTGATATTGTTGTTGCACTGGAATACCTAGCTTCTCAGAGTATTACTGAAGTGCATAGACATGGTGGGCGCAGCTCACCGCAACAACCATCTTCGGAAATGGACAGAAATTAA

>Vu_11141.1
ATGAGTTGTTTTTCGTGCTTTGTTTCTCGCCGGAAAGATGTCAGGAGGGTTGAAATTGACAATGGCACTCGATCTGCTACTGCTGCTTCCTCAGAGGGTGAAAGGAAGAGAGAATCCTCAGAGGCAAAGGGGAAGAGTGTGAGTAGTGGTAAAGGAAGTACCGCAGCGGCTAGTTTTGGTTTCCGCGAACTCGCTGCGGCGACGAGGGGTTTCAAGGAAGTGAACTTAATTGGGGAAGGTGGTTTTGGAAGGGTTTACAAGGGTCGACTTTCAACGGGCGAGCTTGTTGCCGTGAAACAATTGAGCCATGATGGTCGACAAGGTTTTCAGGAATTCGTGACGGAGGTTCTTATGTTGAGCTTGCTGCACCATTCTAATCTTGTGAAGTTAATTGGCTACTGCACGGATGGAGATCAGAGACTTTTGGTTTATGAGTACATGCCCATGGGTTCACTGGAAGATCATCTTTTTGATCCGACCCAAGACAAAGAACCCCTAAGTTGGAGTTCTCGAATGAAGATTGCTGTTGGAGCTGCTCGTGGCCTCGAGTATCTCCATTGTAAAGCAGATCCACCTGTTATTTACAGAGACTTGAAATCTGCTAACATCTTGTTAGATAATGAATTCAACCCAAAACTATCAGATTTTGGGCTTGCTAAACTTGGACCTGTTGGAGACAATACCCATGTTTCAACCAGAGTGATGGGAACATATGGCTACTGTGCACCTGAGTATGCCATGAGCGGCAAACTAACTCTTAAATCTGATATCTACAGCTTTGGTGTGGTTTTGTTGGAGTTGATCACTGGACGTAGAGCAATAGATACCAGTAGAAAGCCAGGAGAGCAAAACTTGGTTTCGTGGTCTCGTCCATATTTTAGTGACAGGAGAAAGTTTGTGCATATGGTTGACCCTCTTTTACAAGGCAACTTCCCCTTACGCTGTTTGCATCAGGCAATTGCTATAACTGCCATGTGTCTCCAGGAGCAACCAAAATTCCGTCCACTTATTGGTGATATTGTTGTTGCACTGGAATACCTAGCTTCTCAGAGTATTACTGAAGTGCATAGACATGGTGGGCGCAGCTCACCGCAACAACCATCTTCGGAAATGGACAGAAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_11141::LG2:51646316-51648316(-)
AAATTTATTAGAAATAAATAAAATATATAGTGCTCTCAGTTACCTGATTTGATTCATGACGAGTTGGTTATTTAGTGAATAAAAAAATTTGAATCTCATGGGTTAGTAAGTTAAATAGATTGGCTCAATGAGTCACTTAATTACAAGTTATTTTTTCTTTAAATCCAAAAATATTATAATTTTTTTTATTATTCAAATTTAAATAAATTTTATTGTAAAATAATGTTAAACTCCAAAGACAATTCAAAATAAAAAATGTAACATGCAACTCAAACGTAATAAAAAACAAACTCAAAAAGTGAATAAATAAGTTTATAATATTGATAATTTTTATGTCACTTATCAATTTATAAGATTAAAGTCTTGAATAGATAAATTTATAATATTTTGCTGTCTTGAAACATTTTTTTTACTCACATCATACAATAAAAAAAATGTTAACAAATAATACTGAAACAAAAAATAATAAATAATTAAATCAAACTAGGTTGGTCACCACTTATCACAAATTCAACTCGGATAAGCCGAGTTTTATATATAAAAGAATTTGCACTTTGTAACAAAATTGTTTCATATAACATAAAAAATATCTCTTTATTTATATTTTGTATAATATTAAACTAATAGCATTAAATGGCATGTTCATAATTTTCAAGTTTAATTTTCTCTTGTAAATGTATCTTATGGAGTAAAAGAATCAAATATTAAATGTATATACACTTTTTTTATCGACGTTTTCTTAGTTCATCACATTAGAATAAATTTTAGACTATTTGAATGAAATAAATTAGGAATGAATTGAAGTTAATTGCATAAACTTAATTATTCTGAATCAAATTAAACCAAGTTATTATTTTTATTTAATTTTAAAAAGCAATTACTTATAGTAAAACTACTCGAATTACAATTTAAAAAAAAATTAAAAGCATGTATTTAAATAATATATTTATCAATGATAGTTTAAACAATTTTCAATGTAAACAGTTATTAAACATTTGAAAATAGTTTGATTTGTTCCATTATCTCAAATCATAATATAACTTAATTCAGCCGTTTAATAAAATACACCGCATCATTTTATAGTTCATTAAAGTTTCATTCAATTTAATTACGTTATCGATTTAGATATAACTTGCCAATATTATTTAAGCTGATTTTTTCATAATAAAAGAAATTTGTCTATTTTAAATATTTCTGTCCAGATACAATACGTAAGATGTCAAACTTTATGGAGGAGAAAATAATTCGTACGTATTACAATTCAACCATCCAGCTGTATTTACAAAATTGGAAACTAACAATATTATTATTATTGTCCTTATCACTTGTCAGAACATTATTATTATTACGCATATTATTATTCTAAATTATATTTCAAAACTAAAAGAAAAATAGATTTATTCAAACCAATAGAAAAAGGTAAGTTACATTTTCATATTCGTTTAAAAAATCTAAAATTTACATAATAAAAAAATATTATTTTGAAATCTCCAACTAATTCAACAACCAACATTTCAAAACGGTGGAAAGTGAACGGGGTTATTTGAAATGGTTTTCCATTGAGTAACGGCGCGGCGTTAAAAGTTAAACAGAGAGAAGAACTTTTGGTAACGGTTAGATAGGGATTGGTGAACGCAAAAGACTGCAAAGCGAACGGAACAGCGAGGGTGAAAATGTAAAAACACAAAGGAAACGATGATGAGTGGGACCGTAACGTTTATAAATGCGCACTAAATTGAAAGAGAAGGGCTGAGTTGAGAGCGACTCGCAGCAATCACGCGGAGACATAAATGCAACCAAAGTGGAACTCGAATAATTCAAAACCAAAACAAAATAAAAACAAGGAAAAGGCCAAGACTATAAACACTTATTATATATAATTTTAAATTAATACTAATATAAATTAAAAAATCCAACTTGGAAATTAATAAAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAGCTATCCACTAATTTAGATACAGTGTTCCATCTAGTTCCAGAA


Gene Sequence:
>Vu_11141(-)
GAAGCCTGAACTAGCTGACAAAGTAAAACATAGTCAGATTGTTTCCTACGCGTCTTAAATTTTATCTTCCAGAAACGGCATTTTGCTTTCTCTTTGAATTTTGCGGATCTTGTTATTATTTTTATTCTTATTTAATAGATTTAATATTTAATATTACTATACTTTCCATAATTATTATTATTTTGGGGACTGGGCTCAGTGATCCTTAGAGAGGGGAATCGGAAATGCAGAACATCCTCTCTCTGATTCACTCCTTGGGATCTTGTTTCTTCTTAATTGCTATTATTTGTTATTCAGTTTAAACGAAATTGAGTTCTCTGTAGCTATGAGTTGTTTTTCGTGCTTTGTTTCTCGCCGGAAAGATGTCAGGAGGGTTGAAATTGACAATGGCACTCGATCTGCTACTGCTGCTTCCTCAGGTTCGTTACGAGATATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAGTTTAATTTGTTAAATAGTTTGTTTAATTTGAATTGCAGAGGGTGAAAGGAAGAGAGAATCCTCAGAGGCAAAGGGGAAGAGTGTGAGTAGTGGTAAAGGAAGTACCGCAGCGGCTAGTTTTGGTTTCCGCGAACTCGCTGCGGCGACGAGGGGTTTCAAGGAAGTGAACTTAATTGGGGAAGGTGGTTTTGGAAGGGTTTACAAGGGTCGACTTTCAACGGGCGAGGCAAGTTTTATTTTTGCTATTTTCGTTATTTTCTTCATTTTTTTTTTGGAATGTTAGTTTCTGAATGTTGGTTTGGGGCATTTGGATATTTCGGTTGTGGTCTCGTCATAATGATTTTTTTTTTTAACTAAAAAATTTTGCGCAGCTTGTTGCCGTGAAACAATTGAGCCATGATGGTCGACAAGGTTTTCAGGAATTCGTGACGGAGGTTCTTATGTTGAGCTTGCTGCACCATTCTAATCTTGTGAAGTTAATTGGCTACTGCACGGATGGAGATCAGAGACTTTTGGTTTATGAGTACATGCCCATGGGTTCACTGGAAGATCATCTTTTTGGTAAACTTATGATTGCTTCTTTTTGGTAACCACGAGTGGTGTACTTTCAGCATTTAGAAGTTGCTTTCTTGTGTCACGTTTTCTAGTTCATTAATTTGTATTGTATGTATCCTACATTACAACTTTGGCTGCGGGAAGTAATACAAACTTAATGTGTGTTTGGATGCGCGTTTTACACCTTTGCACTCGTGTGTTTCTGAAGCATGACAAGGTTGTTTCTACGGCTTTTCAAGAATTTGATGCTAAAGTGTCAACTCATACATGTTCAAAACGCCACACCAAACATTCTGTTAAATTTTCTTGATAGGTTCTTCAATTTCGGGTCATTCCTGTATTTGTTAGTCAAGAATCTATGCGATTATGCAAAATGCACATTTTGTTCTTATTGAGATAAGGGTTGTTCATTTGTGTTAGCATTACGAGATGATTTTTAACCTTAGGTATATATCATTTGTTTTCTGTTGATGTTTTATTGCTATTAACTCCATGCGTAGTATTTCTAGCTTTTGTCGACTTCCTTCTTGAAAAGATTCTCCGTTACTAAATATAAATTGACTATGAAACTGACTGGAGCGGGTTTAAGGAGAGTCGTACCAATTAAATTGGTCCACTATGGAGGAAAAATTCCATTGTTTGCTTTCTAGTCATTGACTACATCCCGACAGAGTCCCTGACTCACTTGTATTTATGCAAATATATGAATGAGCATAGGCCTTATGAAGAAAAGGTTTTTGCTCCCTCTAAAGGAGGGTGTTAGTTGTTTTCTTGTTCTGGGATTTAACTATTTTAGTGTAGGGGCTACAAGCAGCTTCTGGAGATTGTCATAAATAGCTGCATTATGGCGTTGTGGAATTCTTCATAACTTTGATCACAACTCCGTCCACTATGGGTGTTGTGGTTGTGGCAAGTGTCCTATATCCTCTTGTCATCTCTGGCGAGTCACCAACCAATTAATCCTATATTGGCAAACACACTGCTACTGCAGCAAATAGGAAATAGCAGTAGCGAATTTGATGCAAAAGGGTGTAATGTTGCAGGTTTGAAGAAGTGGAATGCAGCTGCTATTTCACTGCAAATGTCAGAGGTCGTGTGCTTTAGTGCCTGTGATTTTGATGCAGCACTGGAAACCAAACTTTACCCCTTTTTTGGGGTTTTAATATTTTTTTTTTGTCTTTCCGGCTCCCCTTTTTGCTTTATTAGGTTGACCCTTCTCCCATTTGAACAAGTTGGCAAAACGAGTCTTTGATTAGTATTGGATTTGAATGTTAATGACTTTGGCAATGGATTTTGATCATTGATTATGATCATGTCTTCAAAATTGATTATTTTTAGTATTTATGTGTATGATATAAATTATGCATATTATTTTTTAGACTTTGCAATAGTGATCATCTTCCGTCCTGGTATTCTGCTTTAGAAAATTTTGGAGTTGGCCGATATGTGCTGCTATCCAGGGTTGACTACAAATTTTGAACTCTTTGGTTAATATTATGTGACAATGGTATATATTTAATTTTTGTTTGCACACAACTTACATTTTTATATTTCAACTGCTATTTTTGCCCTATAGCAGATTATTGGTTTTCTGCAATCTGCAATCGATAGCATACCTGTTTTTTCAGCAGAGGTAGTTTTGTGCTTGAATTATTCTGTATGTACTTAAAAGAGATCACGGTTATTTTTGTGTAGGTCAAGATGTGGTAAATTTAAAATAATAGATATCTTGGCCTAAATGTGAAGTTATGAGAAGATCGGTTTAGTTTTGATTAGGTTGCATGGTTATGAAGTCCTCTTGAAATATATCCCTAAATTAATTTTTCCTTTATGTTATGTTTACCTCCTACTTTGATAATTAAATATACTATTACTAATCAGGTTATAACTTTATTCCTCCTTTCAGATCCGACCCAAGACAAAGAACCCCTAAGTTGGAGTTCTCGAATGAAGATTGCTGTTGGAGCTGCTCGTGGCCTCGAGTATCTCCATTGTAAAGCAGATCCACCTGTTATTTACAGAGACTTGAAATCTGCTAACATCTTGTTAGATAATGAATTCAACCCAAAACTATCAGATTTTGGGCTTGCTAAACTTGGACCTGTTGGAGACAATACCCATGTTTCAACCAGAGTGATGGGAACATATGGCTACTGTGCACCTGAGTATGCCATGAGCGGCAAACTAACTCTTAAATCTGATATCTACAGCTTTGGTGTGGTTTTGTTGGAGTTGATCACTGGACGTAGAGCAATAGATACCAGTAGAAAGCCAGGAGAGCAAAACTTGGTTTCGTGGGTAAGTGTTTAATTTGTACAGTTTCTTTAAAAAGAGATTCCCCTTTAAGTTAAGCGTGTAAGTTTGTCTTAGCTTTGCATGTAAGTGGTTCCTTTTAAGATTTTAATATTTTCTCTACCTACTAACCCTCACATCATTTTATATTTAAAATTGTGCAAAAACTATTAAGTAGATCATGTCTCATTGTGAAAGCTATAACGTGGGATCATAAGATGTTTCTTCACTAATTATAATAAATCATTGGGATTAACTTTATTGAAATGAATCTTCTTCACATATTGGTTTACTTCTTATACTCGGTATTTTTTTGTCCAGTCTCGTCCATATTTTAGTGACAGGAGAAAGTTTGTGCATATGGTTGACCCTCTTTTACAAGGCAACTTCCCCTTACGCTGTTTGCATCAGGCAATTGCTATAACTGCCATGTGTCTCCAGGAGCAACCAAAATTCCGTCCACTTATTGGTGATATTGTTGTTGCACTGGAATACCTAGCTTCTCAGAGTATTACTGAAGTGCATAGACATGGTGGGCGCAGCTCACCGCAACAACCATCTTCGGAAATGGACAGAAATTAATATTCACAGGTATCTGATTCTAGCCTGCGTACAGATTTCCTTAGCGGTTTGGTCAGCGTAAACTACCAACTTGGCTATTTTAAGTGTCGTATTATTGCTTGAATGAACTTATTTGGCATAGCAGTAGTAAAGATAAACTTGGTGATATAGCAGTAGTGAACATGTGAATGTATTTAATTAGAATGGGTATGATTTGTTGTTGTTTAGGCTTAAACATGCTCGAGTCACCTCTGACACGCATCTTGTCTTTTCAACCAATTGAGAAAGGGTGGAGGTGAAGAGTGTTTTTACTTGTTGCTTTTGGTGTTTGATCTAGCGAGATTGGCTGGTGGTGGAGGTATAAAATGAAGGGTATTTATTTATTTACTTATTATATATTTCAGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAATATTAATGCTTCCAAATGCGTTCTTCTTTATTCTTTGGTGTTGTTTAAGTATATAGATTAGCGAGAGGATGGACGCAGCTTGTACATATGTTGGTCTATGACGAAATAGTCTTGTATCGGTCTTTAGAGTATTCTTGCACTATGATCCTTCATTCTGTCTGTTGTGAAAGAACAGCTAGTTTGTTTCTCCACTTGTATTTCTAAAAGTGCACCATTTTGTTATAATGGACAAGGAATTACCC