People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11110 LG2 51318296 51323623 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to abscisic acid, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, chloroplast organization, protein phosphorylation, cellular response to hypoxia, cellular response to hypoxia, response to abscisic acid, protein phosphorylation, cellular response to hypoxia, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, cellular response to hypoxia
Cellular Component   located in   nucleus, cytosol
Molecular Function   enables   protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11110.1
MSQKLWFLVLRTDLWAHFYRLPARHTKSSYALDMNVERAEEVLMHKRLLDIAGGPTTAIGPAIEVRLVQVRSASASAGGSSKSLLLNSQSKVCSEDSGIPGSMSFHPPPAFGSSSNVEHNTQFLPVRDRDNYLNFYTHYARPMHEITISTNDKPKLLSQLTSLLSETGLDILEAHAFSTTDGYSLDVFVVGGWPIEETKKLKHELAKKIQKLQQHQLKENGSLPTSTTAKQEQTGMNFIWRIDAGRLRYEKKIASGPLTDLYKGTFCNQDVAIKVLKHENLNENIQREFAQEVYILSKIQHKNVVKFVGACTKPPNLYLVTEYMPGGSMFDFLHKQKTALALPCLLKVAIDVSEGMKYLHQNNIIHRDLKAANLLIDENGVVKVADFGVARVHNQSGIMTAETGTYRWMAPELPYEHLSPLQAAVGVIQKGLRPKIPSHSHSKLVELLHWCWHHDSSLRPNFSEILEFLLRVTKTVTGECEG*


CDS Sequence:
>Vu_11110.1
ATGTCCCAGAAGCTGTGGTTCCTGGTTTTGAGGACTGATCTTTGGGCGCACTTCTATCGCCTTCCCGCAAGGCACACCAAATCTTCGTATGCGTTGGACATGAATGTGGAGAGGGCAGAAGAAGTTCTTATGCACAAGAGGTTACTGGACATCGCCGGAGGCCCAACTACAGCAATCGGACCTGCAATTGAAGTCCGTCTTGTACAGGTTCGTTCTGCTTCTGCTTCTGCCGGTGGTTCTAGTAAATCCCTTCTTTTAAATTCACAAAGTAAAGTTTGTTCTGAAGATTCTGGTATTCCAGGCAGCATGAGCTTCCATCCTCCACCTGCCTTCGGTTCGTCATCTAATGTGGAACATAACACCCAGTTCTTACCAGTCCGAGACAGGGATAACTATTTGAATTTTTATACACATTATGCTCGGCCAATGCATGAAATCACAATTTCAACAAATGACAAGCCAAAACTTCTGAGTCAGCTGACTTCCTTACTTTCTGAGACTGGGTTGGACATTCTAGAAGCACATGCTTTTTCGACAACAGACGGCTATTCGTTGGATGTTTTTGTTGTTGGTGGTTGGCCAATAGAGGAGACGAAGAAATTAAAACATGAACTAGCAAAGAAAATTCAGAAACTCCAGCAACATCAATTGAAAGAAAATGGGAGTCTTCCTACTAGTACTACTGCAAAGCAAGAGCAAACCGGGATGAACTTTATCTGGAGAATTGATGCCGGGCGTCTGAGATATGAAAAGAAAATTGCATCTGGACCTTTGACTGATTTGTATAAAGGTACATTCTGCAATCAAGATGTAGCTATCAAGGTTTTAAAGCACGAGAATTTGAATGAAAATATACAAAGGGAGTTTGCTCAGGAAGTGTATATCCTAAGTAAAATTCAGCACAAAAATGTAGTTAAATTTGTTGGCGCTTGTACAAAACCCCCAAACCTGTACCTGGTCACAGAATACATGCCTGGTGGAAGTATGTTCGACTTTTTGCATAAACAGAAGACCGCCCTTGCTCTTCCATGTTTACTCAAAGTGGCCATTGATGTTTCCGAAGGAATGAAATATTTGCATCAGAATAATATCATACATCGTGACCTTAAAGCGGCTAATCTTTTGATAGATGAGAATGGGGTAGTTAAGGTTGCTGATTTTGGTGTGGCTAGAGTGCACAATCAGTCTGGCATAATGACTGCAGAAACAGGAACTTATCGGTGGATGGCTCCAGAGCTTCCTTATGAGCATTTGTCCCCATTGCAAGCAGCAGTAGGAGTGATCCAGAAGGGTTTAAGGCCTAAAATTCCAAGCCATAGTCATTCAAAGTTGGTGGAATTGCTTCACTGGTGTTGGCACCACGATTCATCTTTGAGACCCAATTTCTCAGAAATTCTGGAATTTCTGCTACGTGTGACCAAGACGGTTACTGGGGAATGTGAAGGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_11110::LG2:51323623-51325623(-)
AGAATAACGAACAAGAGAAAAACGACCACACAAGACTTGAATCAAGATGCACGATAACTTAGACTGAGGATGATAAATTCAACAGATTATTTTTATTATATAATATATTATTCGTTTTGTGTCTTAATTTCCATAAAAGAATGATAATCTATACTTTTTTTTCTTAAAAAAAATAATTATTATGCATTCCAAGTGCAACATAGTAGAAGTGCTCGTGATTTATTATGTGTTATTGACCTCATACGGCTAGAAATATTTTTTTTACTAGTTTAAATTTGAGATATTAGGCTCAGGTTCATGTTGTGATCGTTTTATTTCATATTCGAATTCCGAGTTAGGTTTGAACCTAAAAAAATTATTACACAAAAAACTTTAAAATATATGCAGACCAATCCCATAATTCCAGAAATCCATTATTATACATGCAATCAAATTATTATCAATGAGATGCAATATTATACTATTAATAAGTACTTTTTTTATTACAATAAGTAATGAAGCATAGATTAAAATATGTAAAATCAAATATATATATATATATATATATTTGTTAACTTATGTAACTTATTAAAGCGTATTAAATTTTAGTTTACAAAAATACCTTCATATAAATTCTAAATTTTAAGATTAATGGTATTTAATTAATTTCTGATTTTTTTTATTTTAAATTAAAATAAAAATTATTAAAATATTTTTACTTTTAGAATATATCTTTTTTTATGAATAGAAATTTTTTTATCGACTAAAATTTGATACACTTAAAAAATTACATAAGTTAACAAATCATACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTAAATAAGTAAAATAATGATCTTACATTTGATAGAAATATGGTAAAATTAAGAATGGAAATATATTAAAAATGTAGATATTTAAAATCTAAAATAAAATAATTTAATGTAAAAATTTAAAGCAAATAATCTGAAATTTAAGAGATAAATAAGTCTTAGCATAAAAAACCATTTGCAAATAATTATATTTATTACTTATCAGGAAAAATATTATATAAATATAACATATATCATTAGACTAATATACTATAATTTAAAATAAATAAATTTGTTAAACTAGTTTTTATTATAATTTAAAATAATTACGAAACTAGTCTGCGTTCACCCGTCTATATAGCCCACTAAATTGAAGAGAACGCAACCCTTTCACTCATGAAGATTTTTTTTTTAAATGAATCAATTCATATTGAGTAGCTCTGATTGAAAATTTTAATTAAATAAACACTATTTTGATGATAATTATTAATTATGTATAAATATATTCAATGTAGATTAATTAAGGAGTAAGAGAGAAACGAAAATAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAAAGATGAGTGGATAAATTATAAATAAGAGGGTGAAATAGTAAAATCAAATTTAGTTGTGCCTGACTAAGTGTGAGTGTGATGTTATGGTAGTTTATGCGGGAGGCGAGAGAAACAAGGTGCGTGAGTGTTTGGTGGGTGGGTGATGCCATCAAAGATGTATATAAACTAATTATTTAATATATTAAAAAACGATTTTTATTTTATTGTGTTTATCGTCATTGCTTAATCTCTATGGTTAATTTTTGTGTACAATCCACGTCGATTTGGGTTAGTCAAGCTAACGGTGCGCATTACTCCCCTCGTTAATGATGTTATTTAAAACTCACTTCCAGTAATTTCTCGACAGGAGTGTCAGAGCAATTTTTGTTTCATGCAGAGGTCTTTTGATGATGTCCTTCCAACTTCTTTGTTCTTGATATTGTTCTTGTTCGTCTCATATTACGATCTTACGATATTATGGATCACTGATCTTTGCTTGCTGACTCGGATTCAGTAAACATGGGAGACACAGAGAGTTGCAATAGCGGAATTTTGAACTCTGGATGGAATCATCGATGTCCGAAACAGAGACAGAAGGTCGGAGTTTACAACGAGGTTTTGTGTAGGCTTAAGGAATTGA


Gene Sequence:
>Vu_11110(-)
ATGTCCCAGAAGCTGTGGTTCCTGGTTTTGAGGACTGATCTTTGGGCGCACTTCTATCGCCTTCCCGCAAGGCACACCAAATCTTCGTTTCTCGTGCTTTTTACTGTTTGATTGTTCATACGTTGTTTTAGTGTTGCTGGTGATCATTTTTGGAAGTTGTTAATTTGTGAATTGAATTGATATATGTTGTCGTGTTAGGTATGCGTTGGACATGAATGTGGAGAGGGCAGAAGAAGTTCTTATGCACAAGAGGTTACTGGACATCGCCGGAGGCCCAACTACAGCAATCGGACCTGCAATTGAAGTCCGTCTTGTACAGGTCATTTTCGCAATCACAACAACACAATGGCCACCAAACACACTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTACCACCAAAATAAGTTTTGACTTCTTATGTTTGCTTTCATCTTCATGGGTCAATTTTCCTTGAATTCCAATCACTATAATACTATATAGTATATGTTTATGTATGACGCACTACTGGCTATTGGCATTAGGCGACATTGTTGGCGAAGGAACCAACGTCACGCTTCCTTTACTACAAAGAAATTACCTATAAAATATATATAAATAGAAATCTATTTTTTTATTTTTTTTATTTTTGACTTTATTATTTACTAATGGCCAACACTCCCTTTTATTATTAACTAAGCCTCTTTAACTTTCCAAAAACTATTATCGATTGTGTCTTATGGTTTTGTTTTTTCTTTCCTTTTCTTTTTCTTCACCGTATTCCTTTTCAAAACGTAGCCACTTCAAAAATGTAAAAGAAAATATTATTTTTAGAACTCTGTCAAGGATTATATCTTTTGTATGACAGTTCATCTAGAGTTAAAGAATTAAAGATGTAATTTAGAGACATAATTAAAAATATTACTCAGTAAAAAATACTAATATTTGAATTTTCATTTAAATTATCATTTTCTACTCTCCATTTACCTATACTTTTTCACTTAAAAATAGTACTTTTCAAAAGCAATGTATTGTCTTTTCTTTTTAAATTGTTATCCAATTATTACGTTACATTTAAATTAATATAGAATATAGTTAATATAATTTTAAAGTAATTATTATAAAATTAATAAACTTTATTACACATGATGTTTTACGATTAAATAAATAAAAAATTAACGAGAACGAGGGCGTTTTCTCAAACATTTTTTACATTACAAATGATTACGCTCTGAATTCAGTAGTACGTAGAACATAAATTTCTTCACTTTATATATAAGGCACTTGAAACTTTGCTTGTGGGGGTACCTGCTGGTTGATTTTGCTCTATTTTGATAATATGTGTTTTATGCAGGTTCGTTCTGCTTCTGCTTCTGCCGGTGGTTCTAGTAAATCCCTTCTTTTAAATTCACAAAGTAAAGTTTGTTCTGAAGATTCTGGTATTCCAGGCAGCATGAGGCATGTTAACAGTATATTGAATTCATCACCTACTTTTTAAGTTGTATGATAAAGTTTTTGTTTTTCATGCTTTCACAGCTTCCATCCTCCACCTGCCTTCGGTTCGTCATCTAATGTGGAACATAACACCCAGTTCTTACCAGTCCGAGACAGGGATAACTATTTGAATTTTTATACACATTATGCTCGGTAAATATACTGCTTATTTGTTTAAATTTCCTTTCTTTTTAAAACAATATATATAAGAGTTTCTTACTATCACTTCCCGTTCTCCTACTTACGGCAGGCCAATGCATGAAATCACAATTTCAACAAATGACAAGCCAAAACTTCTGAGTCAGGTAATTAGTTAATCTTCTTATTGTTGTGCAATTTTTTTCTAGCTAACGAGAAAAGCCTATGCTTTAAGCCCTTTAGCGTTTTCTACTTTTCAGAAATTCTTCTACAATATTTCCTATGTATTTTTTGTTTGCTTTAACAACCCTAATACTATAATAATGTTTGATTGGGAAAGGAATGACGGTACTAAATTTCGTTGACTCAATCCTAAGCATAATGCTAATGGGTCACAGTCTCTAGTTTTGGTTTTATTGATCTCATTGTTTTATACATCTATTGATAACAACATCAATAAAAGCTTTTTCCCACTACACTGATAGCTACAGAAAAGTATTGATCTTGCTGTATAATTAATGAGGACTGAACTTATGGATACCAGAATGCTGGTGTTATTAATCTAAGTGTCTGACTTGAGGCTGCTATAGCAATTTGAACAATGTAAATTGCAGTGCGGATATCGTATATAATTTTACAACCAGAAAGCTAGAGATGTGCTAATATGCAGCCTCAGTTTGCATTTCTTTTGTTAAATTTTGCAGAAATCAATGTTTCTGTAGTTTTAAGCTTTTGTGTTGAACTACAGCTGACTTCCTTACTTTCTGAGACTGGGTTGGACATTCTAGAAGCACATGCTTTTTCGACAACAGACGGCTATTCGTTGGATGTTTTTGTTGTTGGTGGTTGGCCAATAGAGGTATTTCCCCATTATTTTGCAGATTGAAGTACAATAGTTCATTGAATTTTATGTATAGGAAAATCAACAAGTGTCCATTTTTGAAATTTATAGGAGACGAAGAAATTAAAACATGAACTAGCAAAGAAAATTCAGAAACTCCAGGTAGATCCTCTATATGTCACTGATGGTTGCATATTTACTTTATATGTATGAAAAAAAAAAATCCTTTTGCTTTTTAAGAAAAATGATCAGTTGTGCCCAAAATTTCATATATAGTTTAAGGTAACAGTTTTACTGCCAGTCACAATATTCAATTTCCATAGTTAATGACAAAAGATGTTCACTTTGAATAGAAGTTAACTGGTTGAACTGAGAAATATGCATACACAAGCGGTAGAACTTTTACTGTTCTTGACCAATATTTAGCTTAACAAAATAAGTTTCGCTTGCATTTCCACTTATATAATAGAGAACCATTTATAAGTTATTATTTTTGGTGGAAAAATTCCGGAAGCAACATCAATTGAAAGAAAATGGGAGTCTTCCTACTAGTACTACTGCAAAGCAAGAGCAAACCGGGATGAACTTTATCTGGAGAATTGATGCCGGGCGTCTGAGATATGAAAAGAAAATTGCATCTGGACCTTTGACTGATTTGTCAGTATTATCAATCCTTCTTCTTAATTTGTTTGTGGATCAGTACATTCGAGTAACCGATTAGTTGAAACAGGTATAAAGGTACATTCTGCAATCAAGATGTAGCTATCAAGGTTTTAAAGCACGAGAATTTGAATGAAAATATACAAAGGGAGTTTGCTCAGGAAGTGTATATCCTAAGGTTCGCTTTATCAACAACTTCCACTCATCTCCCCTGCCACCGAGCCTTTCTTCGAGTTTCACTGATATTTCATGAAGATTGTTGTTAATACATGGCTTTTATAAATTCAATTCTTGCAGTAAAATTCAGCACAAAAATGTAGTTAAATTTGTTGGCGCTTGTACAAAACCCCCAAACCTGTACCTGGTCACAGGTAAAACTGGTTCTTGTTACTTCTCTTATTGATTAAGGGGTCAATGTAATGGGAAAAAGATACTGTCAATTTCAATGCACTTTTTTTTTTCACAGAATACATGCCTGGTGGAAGTATGTTCGACTTTTTGCATAAACAGAAGACCGCCCTTGCTCTTCCATGTTTACTCAAAGTGGCCATTGATGTTTCCGAAGGAATGAAATATTTGCATCAGAATAATATCATACATCGTGACCTTAAAGCGGCTAATCTTTTGATAGATGAGAATGGGGTTAGTTTACACTATAACGTCTTCTTCTGACTCTATCGGCTTGGCTTATTACTTCTTTGTAAATGCTCTCAACTTGTTGTGGGGTAATTACAGTTGTGTTTTCATCATTTTTCTATGCTACATGTGTTTTATCACTTTACAAAGTTGAGCTATACTTGATCTTATGGCTTGGTGGAATTTATGCTGTTGTGTTTTATTTTTAAAATCTTTTCCGACAGGTAGTTAAGGTTGCTGATTTTGGTGTGGCTAGAGTGCACAATCAGTCTGGCATAATGACTGCAGAAACAGGAACTTATCGGTGGATGGCTCCAGAGGTCTGTGTATATCTATGAGTATTGGCATATAGGGTTGATCACTTTAAATTTATTAAATGTATAACTTACAGGCATGGATGGGGCTGTTTAAGGACACGATAGGCAGCAGTTTTTGATGTAATAAGATGAATCTAGACAGGTTGGAATGAGAATGATGATTTTTTTTTTTTTTTCTGATAAACAATACTTAATGCTAACATGGTTTCAGTACTGCTTTTGGTTGCCCATGCGCTTTGCAAAAGAAAAATGTAACAATATCCAATAAAATACAATGGTAGGCACTCTGGTTTTTTTCATGGAGGCTTTAGTTGCTTATGTAAAACAACTAAAAAAACTGATATTTCTTGTATTCTACTGCTTACTGTATTGATTATTATTAAACTTGTGATTCCCTTGACATATGGAAGGTTATTGAACATAGACCATATGATCACAAAGCCGATGTCTTTAGCTTTGCCATTGTGCTTTGGGAACTGCTCACAGGAAAGGTAGCACCTTTCCCTTTTACTTTCTCTTGTTTGATATTCATGGAACCAAAAACTAGTTTCCAAATGAAAACTGATTTACTCTCTCTACTCTGTAAACTATATTAACCTCTTCATATTGAAGAAGTACTGAGCAGAAATTCCTAGGTACTTTGATTCGTATAGGATTAATAGATAGTGTACAACATGGCATAGAGTAGAACAAAAGTGAGTAACAGTATTTAACAGAAATGGAGAACAAAGACTTAGTAGGTATACTTTAGACATTGTTTTATCAGTATTTTCGTTCAGTATTACTTTACTTGCTCAGACTTCACATCTTTCGCCTATGTTTTATGACTACACGACAGCTTCCTTATGAGCATTTGTCCCCATTGCAAGCAGCAGTAGGAGTGATCCAGAAGGTATTTCTCAACTATAAATTACATATGCAGTGTCAGTGGACACTAAACTGAAAAGCTCTATCTATAGTATCTTAAGCTACCAAGCCACAAAAATATGGTGAAATTGAGTAAGCTTTTTGTAAATGAATTGCAGGGTTTAAGGCCTAAAATTCCAAGCCATAGTCATTCAAAGTTGGTGGAATTGCTTCACTGGTGTTGGCACCACGATTCATCTTTGAGACCCAATTTCTCAGAAATTCTGGAATTTCTGCTACGTGTGACCAAGACGGTATGTGTAGGAGGATTCTTGACAAATTTTGTCTTATATTCAAAAGAAAAATCGAAGCCTCTACACCACTACTTTTTCTTGAACAGGTTACTGGGGAATGTGAAGGCTAG

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1438227