Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11048 LG2 50749261 50752867 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 50749470 synonymous_variant p.Ala28Ala
C/T 50750491 missense_variant p.Leu369Phe
G/A 50750706 synonymous_variant p.Thr440Thr
G/A 50750735 missense_variant p.Gly450Asp
T/A 50750736 synonymous_variant p.Gly450Gly
C/T 50750754 synonymous_variant p.Ile456Ile
G/A 50750781 synonymous_variant p.Leu465Leu
G/T 50750838 synonymous_variant p.Thr484Thr
C/T 50751080 missense_variant p.Ser565Phe
C/T 50751178 missense_variant p.Pro598Ser
T/C 50751246 synonymous_variant p.Ile620Ile
A/T 50752517 missense_variant p.Glu1044Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11048.1
MATTVTFFTLRLVAFFAFLTITITITTAQNTTASEIQALTAFKRNLHDPLGSLDGWDSSTPSAPCDWRGIVCLNNRVHYLRLPRLQLAGELSPSLSNLLQLRKLSLHSNNLNSSIPPSLSQCLFLRAVYLHNNRLSGHLPRQLLNLTNLQILNLAHNLFTGEIPDQLSVSLRFLDLSDNAFSGDIPANFSSKSQLQLMNLSYNRLSGGIPGSLGKLQNLQFLWLDSNHIHGTFPSAIANCSSLVHLSAEDNVLTGLLPLTLVTIPKLQVLSLSGNQLSGLVPKSFFCNSHLQSLNLGFNSFTGFSAPQSEECNSILEILDVQENHIAPTRFPSWLTRTTKSLKVLQLSGNFFTGSLPVDIGNFLALEELRVANNLLSGGIPPSIVNCRLLKVFDLEGNRFSGLIPEFLGDMRNLKEFSLAGNLFTGSIPSSFGTLSALETLNLSDNKLTGVVPKEIMKLENVTELNLSNNEFSGQLWSNIGDMTGLQVLNLSRCGFSGRVPASLGNLMRLTVLDLSKQNLSGELPLEVFGLPSLQVVALQENRLSGKVPEGFSSIVSLRYLNLSSNEYVGDIPMTYGFLSSLTILSLSHNSVSGEIPPEIGGCSQLEVLQLQSNFLQGNIPGDISRLSHLKELNLGHNRLKGDIPDEISECSALSSLLLDGNHFTGRIPGSLSKLSNLTVLNLSSNLLNGEIPVELSSISGLEYLNVSSNNLEGEIPYVLGARFNNPSVFAMNQGLCGKPLQRECAKVRRRKKRRLIMLIGVGVAGLCLLALCCCGYVYSLLRWRKKLREGVTGEKKRSPSTSAGSRGSGENGGPKLVMFNNKITYAETLEATRNFDEENVLSRGRYGLVFKASFQDGMVLSIRRFVDGFLDEANFRKEAESLGKVKHRNLTVLRGYYAGPPDVRLLVYDYMPNGNLGTLLQEASQQDGHVLNWPMRHLIALGIARGLAFLHSVPIVHGDVKPQNVLFDADFEAHLSEFGLERLTVAAAAEASSSSTPVGTLGYVSAEAVSSGVATKESDVYSFGIVLLEILTGKKPVMFTEDEDIVKWVKKQLQRGQISELLEPGLLELDPESSEWEEFLLGVKVGLLCTATDPLDRPSMSDVAFMLQGCRVGPEIPSSADPTTLPSPA*


CDS Sequence:
>Vu_11048.1
ATGGCAACAACGGTTACATTTTTCACCCTCAGACTCGTCGCTTTCTTCGCCTTCTTAACCATAACCATAACCATAACCACTGCGCAGAACACCACTGCTTCGGAGATTCAAGCCTTAACAGCATTCAAGCGCAACCTCCATGACCCTCTGGGTTCCCTCGACGGCTGGGACTCTTCCACGCCCTCTGCACCCTGTGACTGGCGCGGCATTGTCTGTCTCAACAACCGAGTTCACTACCTCCGTCTTCCCCGTCTCCAGCTCGCCGGTGAACTCTCTCCCTCCCTCTCCAATCTCCTCCAACTCCGTAAACTCAGCCTCCACTCCAACAATCTCAACTCCTCCATCCCTCCCTCCCTCTCTCAATGCCTCTTCCTACGCGCAGTTTACCTCCACAACAACCGCCTCTCCGGTCACCTTCCTCGACAGCTTCTCAACCTCACCAACCTACAAATTCTTAACCTTGCCCACAATCTATTCACCGGAGAAATCCCGGACCAGCTTTCCGTCTCCCTACGTTTTTTAGACCTATCTGATAATGCCTTCTCCGGCGATATTCCGGCTAATTTCTCATCAAAGTCTCAGCTTCAACTCATGAATCTCTCTTACAACAGGTTGAGTGGAGGAATTCCTGGTTCACTGGGAAAGTTGCAAAATCTGCAATTTCTTTGGTTAGACTCTAACCATATTCATGGAACTTTTCCGTCTGCCATTGCCAACTGTTCCTCTCTAGTTCACCTTAGTGCAGAGGACAATGTTCTGACCGGACTTCTTCCTCTTACGTTAGTAACCATACCAAAACTTCAGGTACTTTCACTTTCAGGGAATCAACTTTCCGGTTTGGTTCCCAAGTCCTTTTTCTGCAACAGTCACCTACAAAGCTTGAATCTTGGTTTCAATTCCTTTACGGGGTTTTCTGCACCTCAAAGTGAAGAATGCAATAGTATTTTAGAAATTTTGGATGTTCAAGAAAATCACATTGCTCCCACAAGATTTCCCTCGTGGTTGACCCGGACTACAAAATCGTTGAAGGTGCTTCAGCTCTCGGGAAATTTCTTTACTGGTTCTCTCCCTGTTGATATTGGTAACTTTTTAGCTTTGGAAGAGCTTAGAGTCGCAAATAATTTGTTATCGGGTGGTATTCCGCCTAGCATTGTGAATTGTAGGTTGTTAAAGGTTTTTGATCTTGAGGGGAACCGTTTCTCTGGGTTAATTCCTGAATTTCTCGGGGATATGAGAAACCTAAAGGAGTTTTCTCTTGCCGGTAACCTTTTTACCGGTTCGATTCCTTCTAGTTTTGGAACACTTTCTGCACTAGAGACGCTTAATTTGAGTGACAATAAGTTGACGGGTGTGGTGCCTAAGGAGATCATGAAACTGGAGAACGTGACTGAATTGAATCTCAGCAATAACGAGTTTTCGGGTCAACTTTGGTCAAATATTGGGGACATGACGGGTTTGCAAGTTCTTAATTTGAGTCGATGTGGGTTTTCAGGAAGGGTTCCTGCTTCGTTGGGGAATTTAATGAGACTAACGGTTCTGGACTTGAGCAAGCAGAATCTCTCGGGTGAGTTGCCCCTTGAGGTTTTTGGGTTACCTAGTCTGCAAGTTGTGGCACTTCAAGAGAACCGTTTGAGTGGTAAAGTTCCTGAGGGGTTCAGCAGCATAGTTAGTCTGCGATATCTTAATCTCAGCTCTAATGAATATGTTGGTGACATTCCAATGACTTACGGGTTCCTCAGTTCTTTAACTATTCTCTCTCTGTCTCACAATAGTGTTTCTGGTGAGATACCGCCAGAGATTGGTGGTTGTTCGCAACTTGAAGTATTACAGCTGCAGTCAAATTTTCTACAGGGTAACATTCCTGGTGACATCTCTCGGCTATCTCATTTAAAGGAGCTTAATTTGGGGCACAATAGGTTGAAAGGTGATATCCCAGATGAGATATCTGAGTGTTCTGCCTTGAGTTCACTCTTGTTGGATGGTAATCACTTCACGGGTCGCATTCCCGGTTCCTTGTCAAAACTGTCTAATTTGACCGTGTTGAACCTTTCTTCAAATCTTTTGAATGGGGAAATTCCCGTTGAACTGTCAAGCATTTCTGGTTTGGAGTATTTAAACGTGTCTAGTAATAATCTTGAGGGTGAGATTCCATACGTGCTTGGTGCCAGATTCAATAACCCTTCCGTGTTTGCAATGAACCAAGGTTTGTGCGGGAAGCCCTTGCAGAGGGAATGTGCAAAGGTGAGAAGGAGAAAGAAGAGAAGGCTAATAATGTTGATAGGCGTGGGAGTGGCTGGCTTGTGCCTTTTGGCGTTGTGTTGTTGTGGGTATGTTTACAGCCTCTTGAGGTGGCGGAAGAAGCTTCGAGAAGGGGTGACGGGTGAGAAGAAACGGAGCCCCTCAACAAGTGCAGGTAGTAGAGGGAGCGGTGAAAACGGAGGACCAAAGCTAGTGATGTTTAACAACAAGATCACGTACGCGGAGACATTGGAAGCAACGAGAAACTTCGATGAAGAGAACGTGTTAAGCAGGGGAAGATATGGCCTCGTGTTCAAAGCCTCCTTCCAAGATGGAATGGTTCTCTCCATTCGTCGCTTCGTTGATGGGTTCTTAGACGAGGCTAACTTCCGCAAGGAAGCAGAATCACTGGGCAAAGTGAAGCATCGAAACTTGACAGTTCTTCGTGGTTACTATGCGGGTCCACCAGATGTGAGACTTCTTGTGTATGACTACATGCCCAATGGAAACCTTGGCACACTGCTTCAAGAGGCGTCTCAGCAAGATGGCCATGTGCTGAATTGGCCAATGCGTCACCTCATTGCACTGGGAATTGCTCGAGGGCTAGCTTTCTTGCACTCGGTACCAATAGTTCATGGTGATGTGAAGCCTCAAAATGTTCTTTTTGATGCGGATTTTGAAGCCCATTTGTCTGAATTTGGATTGGAGCGGTTGACAGTGGCAGCAGCGGCAGAAGCATCGTCGTCGTCGACTCCAGTAGGGACATTGGGGTATGTTTCAGCAGAAGCTGTATCGAGTGGGGTGGCGACAAAGGAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGATAGTGTTGTTGGAGATACTAACGGGGAAGAAACCGGTGATGTTCACGGAGGATGAGGACATAGTGAAGTGGGTGAAGAAGCAGTTACAAAGGGGCCAAATATCGGAGTTGTTGGAGCCAGGGTTGCTTGAGCTAGACCCAGAGTCATCGGAATGGGAAGAGTTTTTGTTGGGTGTGAAAGTGGGTCTCCTCTGCACAGCAACGGATCCTCTTGATCGACCGTCAATGTCGGACGTTGCTTTCATGCTACAAGGTTGCCGGGTCGGACCGGAAATCCCGTCATCGGCCGATCCCACAACACTACCTTCTCCTGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_11048::LG2:50747261-50749261(+)
TATTTTTTAATAAATAAATTTTGTTTCTGCATTTTTATATTTCAATAATAGACAATACTTTTTTTCATAAGTATTCATCAGATATAAAAAATAAACCGTGGCAAGAAAAGTAAAATTTACTAATAAATTTATTATACATTGACAAGTTAAACTTTTAAAAACAATAAGATATTATGAAAATTATTTATCTTAATCAATACACATTATTTATATCATATCGTAATCAAAATTTAAATAGTAACAATATTAGCTAAATTTAAAGCTTTTATTTGAGAATAAAATATGGCAGAAATAAAAACTAGTAGTATGTTCGAAATTAAAAACAAGAGAGATAGACAGTTGAAGTTTATATTACATGAGAACAAACCTTAAATCATAGTATAAAATTGTAATTTTAATTTACATTTACGATTAGATAAAGTAAACTTAAGTGATGATAATTACAAATGATAAGAAAATATAAGTAAAATACAAAATTATTTTGTAAATCCTATAGTTTTCATTTTACTAAACTCAGTCTCTTTAGATAAAGTTTATGTTTTACATCTTGTTGATGAAAAATACAATTAGGAGGAAAACCTCAAGTTTTCAAAATATTAGTCAACCACAATTTGATTATTCGTATTAATAACAAAATTATCTAAAAATTTGTTTCATAATTTATTTTTAAAAAAAAAGAAACATAGTATATAATCCTTCACACGAAACCGTGTTGCATGGAAGCTAAAATCCTGTACCTCCTACTATGTCATTCTTTCATTCATGATATTGAATGTTAACTGATATCTTCACGATACCATTTCTATTTTGGTACTCTCCATCACCATTCATAATATTAAATGTTATTCTCATCACAACTACTCATGCCTATAATTAACCAGTTTCAAGTTTTAAATTAATGCACAAATCTGAATAAATTGATGTATTTTATTTAGTTTGAATGCATTTATCACGTTATCAAATATCCGGTCTTATTATAGTTTTTTTATCAATGAAAATATTTTTAATTAATCATTAATGTACTTTTAACAATTTTTATTATCCAATTACTTAAAACAAACTAAATAGTTTAAAAACAGTATATACTTAAAAAGCACTTTAATTTTTGTTTTCATATACCCAAAAATGGAATAAATATACTTAATCTATACATTATCATTTATCAAAACTCATGACTTTTAAGATTTAATTTATTACATTAAAAAAAAATCATTTTAGAAAAAATGTCTCTATTGTAACTCTAGTAATTAGTTTTTAAATAACTATATTACCTAGTGGTTAAAATAATATTAAGACAGTAGAAGTGACGTTCTCTCAACCTATATTAATCATTACTAGCTAGCTTTAAAATATTCTGTGGATTACATCTATAGAAAACAAATACAATAATTCATACAGGTTTTTAAGTTAAAAATAGTAGTTATGTGATATCTATTTCAAATTATCGAAATCAGATTCTTTAACTTTTTAACTAGTATGTCTATAAAAGAAATTATTGACTAATTAGTAAAAGAAGTACTATAACTTACATCGATATCATAAATTATAAATACTCATATAAAGTAACGTTGGATAACATTTCCCGTAAAATTTTAAAAAGTTTACATCTTTTCCAATTAAAAATTAACGGCAATACATTATGAATGTATTAAGTTGTTTTATTTTCAAAACAAAACATTGAAAGTAAATATTTTGAATAAAATAAGATTATGATATATATCATTTAGAATGTGTGATATGAATAAGTGAAAGCATTGAGTCCGAGGTGAGGTGCAGAAAACAGCTAACAAACAGTAACAGGGTAGACCACACCACACACCATGGTTCAAAAAAACCCTTCAAATCAAACCATTTAAGGAATAAAATAGCAATGGCGACCAAAGCCATCCATAACATAACTTAAAGCCTTGTCATTTGCGGGGAACATGGCTAGCTAACAAACGCTCCTCTCTCTATTTTCCAAACTCCAAAGTACACAGAAACACAACACAGCACTACCA


Gene Sequence:
>Vu_11048(+)
AAACAAACAAATGCTGTCAGCCCCTGAACCTAAAAACTCACTTTAACCTCTCACAATCACCACCATCACCACCACCACAATTCCAATAATAACATCAACACCTTCTCCAACAACACACACCTCCAAATGGCAACAACGGTTACATTTTTCACCCTCAGACTCGTCGCTTTCTTCGCCTTCTTAACCATAACCATAACCATAACCACTGCGCAGAACACCACTGCTTCGGAGATTCAAGCCTTAACAGCATTCAAGCGCAACCTCCATGACCCTCTGGGTTCCCTCGACGGCTGGGACTCTTCCACGCCCTCTGCACCCTGTGACTGGCGCGGCATTGTCTGTCTCAACAACCGAGTTCACTACCTCCGTCTTCCCCGTCTCCAGCTCGCCGGTGAACTCTCTCCCTCCCTCTCCAATCTCCTCCAACTCCGTAAACTCAGCCTCCACTCCAACAATCTCAACTCCTCCATCCCTCCCTCCCTCTCTCAATGCCTCTTCCTACGCGCAGTTTACCTCCACAACAACCGCCTCTCCGGTCACCTTCCTCGACAGCTTCTCAACCTCACCAACCTACAAATTCTTAACCTTGCCCACAATCTATTCACCGGAGAAATCCCGGACCAGCTTTCCGTCTCCCTACGTTTTTTAGACCTATCTGATAATGCCTTCTCCGGCGATATTCCGGCTAATTTCTCATCAAAGTCTCAGCTTCAACTCATGAATCTCTCTTACAACAGGTTGAGTGGAGGAATTCCTGGTTCACTGGGAAAGTTGCAAAATCTGCAATTTCTTTGGTTAGACTCTAACCATATTCATGGAACTTTTCCGTCTGCCATTGCCAACTGTTCCTCTCTAGTTCACCTTAGTGCAGAGGACAATGTTCTGACCGGACTTCTTCCTCTTACGTTAGTAACCATACCAAAACTTCAGGTACTTTCACTTTCAGGGAATCAACTTTCCGGTTTGGTTCCCAAGTCCTTTTTCTGCAACAGTCACCTACAAAGCTTGAATCTTGGTTTCAATTCCTTTACGGGGTTTTCTGCACCTCAAAGTGAAGAATGCAATAGTATTTTAGAAATTTTGGATGTTCAAGAAAATCACATTGCTCCCACAAGATTTCCCTCGTGGTTGACCCGGACTACAAAATCGTTGAAGGTGCTTCAGCTCTCGGGAAATTTCTTTACTGGTTCTCTCCCTGTTGATATTGGTAACTTTTTAGCTTTGGAAGAGCTTAGAGTCGCAAATAATTTGTTATCGGGTGGTATTCCGCCTAGCATTGTGAATTGTAGGTTGTTAAAGGTTTTTGATCTTGAGGGGAACCGTTTCTCTGGGTTAATTCCTGAATTTCTCGGGGATATGAGAAACCTAAAGGAGTTTTCTCTTGCCGGTAACCTTTTTACCGGTTCGATTCCTTCTAGTTTTGGAACACTTTCTGCACTAGAGACGCTTAATTTGAGTGACAATAAGTTGACGGGTGTGGTGCCTAAGGAGATCATGAAACTGGAGAACGTGACTGAATTGAATCTCAGCAATAACGAGTTTTCGGGTCAACTTTGGTCAAATATTGGGGACATGACGGGTTTGCAAGTTCTTAATTTGAGTCGATGTGGGTTTTCAGGAAGGGTTCCTGCTTCGTTGGGGAATTTAATGAGACTAACGGTTCTGGACTTGAGCAAGCAGAATCTCTCGGGTGAGTTGCCCCTTGAGGTTTTTGGGTTACCTAGTCTGCAAGTTGTGGCACTTCAAGAGAACCGTTTGAGTGGTAAAGTTCCTGAGGGGTTCAGCAGCATAGTTAGTCTGCGATATCTTAATCTCAGCTCTAATGAATATGTTGGTGACATTCCAATGACTTACGGGTTCCTCAGTTCTTTAACTATTCTCTCTCTGTCTCACAATAGTGTTTCTGGTGAGATACCGCCAGAGATTGGTGGTTGTTCGCAACTTGAAGTATTACAGCTGCAGTCAAATTTTCTACAGGGTAACATTCCTGGTGACATCTCTCGGCTATCTCATTTAAAGGAGCTTAATTTGGGGCACAATAGGTTGAAAGGTGATATCCCAGATGAGATATCTGAGTGTTCTGCCTTGAGTTCACTCTTGTTGGATGGTAATCACTTCACGGGTCGCATTCCCGGTTCCTTGTCAAAACTGTCTAATTTGACCGTGTTGAACCTTTCTTCAAATCTTTTGAATGGGGAAATTCCCGTTGAACTGTCAAGCATTTCTGGTTTGGAGTATTTAAACGTGTCTAGTAATAATCTTGAGGGTGAGATTCCATACGTGCTTGGTGCCAGATTCAATAACCCTTCCGTGTTTGCAATGAACCAAGGTTTGTGCGGGAAGCCCTTGCAGAGGGAATGTGCAAAGGTGAGAAGGAGAAAGAAGAGAAGGCTAATAATGTTGATAGGCGTGGGAGTGGCTGGCTTGTGCCTTTTGGCGTTGTGTTGTTGTGGGTATGTTTACAGCCTCTTGAGGTGGCGGAAGAAGCTTCGAGAAGGGGTGACGGGTGAGAAGAAACGGAGCCCCTCAACAAGTGCAGGTAGTAGAGGGAGCGGTGAAAACGGAGGACCAAAGCTAGTGATGTTTAACAACAAGATCACGTACGCGGAGACATTGGAAGCAACGAGAAACTTCGATGAAGAGAACGTGTTAAGCAGGGGAAGATATGGCCTCGTGTTCAAAGCCTCCTTCCAAGATGGAATGGTTCTCTCCATTCGTCGCTTCGTTGATGGGTTCTTAGACGAGGCTAACTTCCGCAAGGAAGCAGAATCACTGGGCAAAGTGAAGCATCGAAACTTGACAGTTCTTCGTGGTTACTATGCGGGTCCACCAGATGTGAGACTTCTTGTGTATGACTACATGCCCAATGGAAACCTTGGCACACTGCTTCAAGAGGCGTCTCAGCAAGATGGCCATGTGCTGAATTGGCCAATGCGTCACCTCATTGCACTGGGAATTGCTCGAGGGCTAGCTTTCTTGCACTCGGTACCAATAGTTCATGGTGATGTGAAGCCTCAAAATGTTCTTTTTGATGCGGATTTTGAAGCCCATTTGTCTGAATTTGGATTGGAGCGGTTGACAGTGGCAGCAGCGGCAGAAGCATCGTCGTCGTCGACTCCAGTAGGGACATTGGGGTATGTTTCAGCAGAAGCTGTATCGAGTGGGGTGGCGACAAAGGAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGATAGTGTTGTTGGAGATACTAACGGGGAAGAAACCGGTGATGTTCACGGAGGATGAGGACATAGTGAAGTGGGTGAAGAAGCAGTTACAAAGGGGCCAAATATCGGAGTTGTTGGAGCCAGGGTTGCTTGAGCTAGACCCAGAGTCATCGGAATGGGAAGAGTTTTTGTTGGGTGTGAAAGTGGGTCTCCTCTGCACAGCAACGGATCCTCTTGATCGACCGTCAATGTCGGACGTTGCTTTCATGCTACAAGGTTGCCGGGTCGGACCGGAAATCCCGTCATCGGCCGATCCCACAACACTACCTTCTCCTGCTTGATTTTTTTATTTTATTTTATTGTTGATGAAATTGTATTGTTACTTTTCTGAATTGAATTAAATTATCCAAATTTTGGAGGGGTCCGTCC