Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10951 LG2 49923734 49924950 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 49923943 synonymous_variant p.His70His
T/C 49923949 synonymous_variant p.Asn72Asn
C/A 49924088 missense_variant p.Pro119Thr
C/A 49924102 synonymous_variant p.Thr123Thr
G/T 49924323 intron_variant
C/A 49924347 intron_variant
G/A 49924356 intron_variant
G/T 49924401 intron_variant
T/C 49924502 intron_variant
C/T,* 49924641 intron_variant
C/T 49924642 intron_variant
A/C 49924691 intron_variant
G/A 49924735 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10951.1
MCTTPHAVMPTFAPLPEPDLSLNISPPFTSDPDAKQLETTCSGFTLTTKTLYTDLCSTSDSGSSGSDLSHENGFRHTVYNLVHREPPTLSLGSGRENLNPYPIQGAVSRNFNHLHNYQPQTNTADFKRNARGIQGVKRSSRAPRMRWTTTLHAHFVHVVQLLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVKSHLQMYRTVKSSDKSSAGSWMFPLKDPIFVSSIIVILFV*


CDS Sequence:
>Vu_10951.1
ATGTGCACCACTCCGCACGCAGTAATGCCAACCTTTGCACCCTTGCCAGAGCCAGATCTCTCCTTAAACATCAGCCCTCCATTCACTTCAGATCCTGACGCTAAACAACTGGAAACAACCTGCAGCGGATTCACATTAACCACCAAAACGCTTTACACCGATCTGTGCTCAACCTCGGATTCTGGTAGCAGTGGAAGCGATTTAAGCCACGAAAATGGTTTTCGCCACACTGTCTACAACCTTGTTCATCGTGAACCACCGACATTGAGCTTAGGCTCCGGAAGGGAAAATTTGAATCCTTATCCTATACAAGGAGCTGTGTCGAGAAACTTCAATCACCTCCACAACTACCAACCTCAGACGAACACCGCTGATTTCAAACGAAATGCTAGAGGCATTCAGGGTGTGAAAAGAAGCTCCAGAGCTCCTAGAATGCGATGGACCACTACCCTCCACGCTCACTTTGTTCATGTGGTTCAGCTTCTTGGTGGACATGAAAGGGCAACTCCGAAGTCGGTGTTAGAGTTAATGAACGTGAAGGATCTAACTCTAGCTCACGTGAAGAGTCACTTGCAGATGTATAGAACAGTGAAGAGCTCTGACAAAAGCAGCGCAGGTAGTTGGATGTTCCCTCTCAAGGACCCCATTTTCGTTTCTTCTATTATTGTTATTCTCTTTGTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10951::LG2:49921734-49923734(+)
TATCGATTTTGATATCATATAGAACTATGTTTTGTTGTTATTATAATGTTATGGCTTTATCCCATTTTTCGAACAAAGCCAAAAATTTAGTCTGAAAATCATGTGGAAAAATCAGACCACATTATCCGTTCACAAATAATTGGTAAACAGATTAAGACACGGGTTGCACAACCCAAAACATATTGAAGAAAAAAAACTGATCAAAACAAGACAAATCTACATGAGTCAACTTTTTTGTTTAAAAAATAATTTAAATTTTTTTCAACAGTACCTTTCTCTAAGTACACGGTTTCGCAGTTAAATTTACACACGAATTGCTATTATTTAGCTTTTTTGCTATTAATTTTTTATGCAAAAAAAATCTATGATTTTTTCATTAATATATAATTTATTTTTATTTTGATGACTTTAAATCAATTTGTTAGTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCAAATAAGTGAAGTACACGAAATTAATGGTTTGACCAATTAATAACTGTACAGATCTGAGCTTTGGAAGATCAGCTTAAGCAAAATGATTATCACAAATCATATATAGCTGGCAGTGGTTTGAGTTAGATCGAGCATAAAGAATTTTGAAACCATATCTGTTCTGTGATTAATATTACTGATATATTTTAGTATCACATTTATGTATAGAACACACATTTTTGTAACAAAGTAGAGAGTTTTCCTACTTGAAAATTGGAACACCATAATTTCTCCCAACATCTTCATGTGAAAAAAACAGTCTTGGTATGGTTTCTCTCTACTCCATATTTGTGTCATCTTGCGTGTTTGATGGATCAGAAAATAAGTAAGTAAAGTGGGTTACTTTTAGGGTGAGTTGAACATAAAGAGAGATGTGATGGATAATAATAGAAGGTGAAGAGGTTTAACGCGGCAAAGATGGATCTGCATTAGGCAGCCATTGAAGAATGCATCAAGGTGAGGATAAGGATAAGTTTAAGCAGCTACATTTTGGAGTGCATGTCAGGGTTTGATAAAACGAGAATATTCCTATTAAAGAAAATGGTATTAAAAAGAGATAAACTAAACCTCGATTTTGAAACAAAAAGAGCAGGGAATTTTAATGGGTCGTCGCAATCCATCAACGTTATAGGGAGACTCCAATTCCCATTCCAATATTCCCTTGAATAGTACTCATTTTGTTTTTCTTCAATTCCAACCATTCCTGACAAAACCACAATTATATCACCCCAACCTCATTAAGTAAAAAGAAAAAGAAAAACATTTTACTGCTGCACTGCACTGCACTGCACGTACCTGCTTCTCTATTTCCTTCTCTTACTCTCTGCATACACAGTCCTTTCATATTGATGACTAATCCCCAGCTTCCATAAATAACTACTCCTTTTTCGCTACCTTTTCGTTCAAACAACAAACAACTCCCATCAATTCTCTTTCCCTGCTGGTGGCAACTAGTCTCTGCAATATTAAACATTGTTTCGTCACTGCTTTGATTACAACTTTCCGTGTCGTCCTTCATCCCTACTGGGATGCTACTTAAAAAGCCCACCATCACCTCTCACCAAACCAATGCAATAGCATAAACACATCCATTATAAAACACAAATCTTTTTGCTTATTTATAGACACTTCAACCATTCTTTACAATAAACACTTCTGTTTGAACCGGATACTACTCTTTTGACTATTTAATGCAATTGTACGTCATGAGCTCGTACTCAAAACCACTTTTAAATTGGAACAACGGTACACCAGTGAGTGTTACTCGGTTACTCTCTACCTTTCGTTTTTTTAATTACCTCCTTCAATCATTCACTCTATTCTCTTCTTCATGTTTCCCTCTCAACACCTCCTCCTACTTTCTATGTTTTACTATATTTGATTCACTGTGTCATTTCCACATTCTTTTCCTTTCTTATGTAATTGTACTACCTCACTGCCCACTTCTGTATCTGATATTCCAGATCTCTACAATCCCTA


Gene Sequence:
>Vu_10951(+)
ATGTGCACCACTCCGCACGCAGTAATGCCAACCTTTGCACCCTTGCCAGAGCCAGATCTCTCCTTAAACATCAGCCCTCCATTCACTTCAGATCCTGACGCTAAACAACTGGAAACAACCTGCAGCGGATTCACATTAACCACCAAAACGCTTTACACCGATCTGTGCTCAACCTCGGATTCTGGTAGCAGTGGAAGCGATTTAAGCCACGAAAATGGTTTTCGCCACACTGTCTACAACCTTGTTCATCGTGAACCACCGACATTGAGCTTAGGCTCCGGAAGGGAAAATTTGAATCCTTATCCTATACAAGGAGCTGTGTCGAGAAACTTCAATCACCTCCACAACTACCAACCTCAGACGAACACCGCTGATTTCAAACGAAATGCTAGAGGCATTCAGGGTGTGAAAAGAAGCTCCAGAGCTCCTAGAATGCGATGGACCACTACCCTCCACGCTCACTTTGTTCATGTGGTTCAGCTTCTTGGTGGACATGAAAGTAAATCATCAACTCAACTATCTAAGCATAGTTTGCATGCTATGATTCAGGATTTAAACAGTGGTTGTAAACGCGGTCACTGTTTCTTGCGATGTTTGACGTTGTGTGGAATTGCAGACAAATGCAAGTTCTAGTTGTGGTGGAAGAAACCCTGAAAACCATGATGTCGAGGCGGAAATCGTGACTGCAGACCATTTTTTAAACCTTGAATTATTAGTTTGATCGTTATTCCATTATGAAAGTTTGATATCATATTACTCTCGTTAATTTCCTTTGGTTGCATGTTTTGTTGGTGGCAGGGGCAACTCCGAAGTCGGTGTTAGAGTTAATGAACGTGAAGGATCTAACTCTAGCTCACGTGAAGAGTCACTTGCAGGTGGGGTTACTGTTTCTATCTCTCTGCATTCTCCCTGGTTCCTTTTTCGTGGTAATTAATGAAATTTTCTTTTTATTTTCTGACTTGACAAAACAAACATATAAAGTTCCTTAGTCATTGCCTCCCGTAGTGGGGAAGCTAGAACAAAGACTAAGGACAAAGAGGTATCTAGATGCTAATCTTAGCGTTGTGGACTTTTCTTCTCATTTTATTTCATGCGGGATGTTCATGCAGATGTATAGAACAGTGAAGAGCTCTGACAAAAGCAGCGCAGGTAGTTGGATGTTCCCTCTCAAGGACCCCATTTTCGTTTCTTCTATTATTGTTATTCTCTTTGTTTGA