Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10925 LG2 49733858 49736929 PREDICTED: B3 domain-containing protein At5g42700-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 49733939 intron_variant
T/A 49733940 intron_variant
A/T 49734122 intron_variant
T/G 49734154 intron_variant
C/T 49734257 intron_variant
A/T 49734302 intron_variant
A/G 49734328 intron_variant
C/T 49734421 intron_variant
A/G 49734440 intron_variant
C/G 49734535 intron_variant
A/C 49734536 intron_variant
T/C 49734548 intron_variant
A/T 49734562 intron_variant
A/G 49734567 intron_variant
G/A 49734609 intron_variant
T/A 49734708 intron_variant
C/G 49734805 intron_variant
T/A 49734876 intron_variant
T/C 49734931 intron_variant
G/A 49735057 intron_variant
T/A 49735135 intron_variant
C/G,* 49735142 intron_variant
G/T 49735154 intron_variant
T/A 49735255 synonymous_variant p.Ala200Ala
A/G 49735291 synonymous_variant p.Gly188Gly
C/T 49735303 synonymous_variant p.Gly184Gly
A/G 49735614 intron_variant
T/C 49735778 intron_variant
T/C 49735786 intron_variant
C/T 49735851 intron_variant
G/A 49735894 intron_variant
T/A 49735901 intron_variant
A/G 49735957 intron_variant
T/C 49735967 intron_variant
C/T 49735972 intron_variant
T/C 49735989 intron_variant
C/T 49736096 intron_variant
T/C 49736136 intron_variant
T/G 49736148 intron_variant
G/A 49736163 intron_variant
C/A 49736166 intron_variant
A/T 49736293 synonymous_variant p.Ile117Ile
C/G 49736367 missense_variant p.Gly93Arg
A/C 49736435 intron_variant
G/A 49736485 synonymous_variant p.Arg82Arg
G/T 49736565 intron_variant
A/G 49736567 intron_variant
A/G 49736639 missense_variant p.Val60Ala
A/T 49736646 missense_variant p.Leu58Ile
G/A 49736659 synonymous_variant p.Thr53Thr
A/T 49736705 intron_variant
C/T 49736713 intron_variant
G/T 49736726 intron_variant
A/G 49736770 intron_variant
T/C 49736779 intron_variant
G/T 49736811 missense_variant p.Pro40His
T/A 49736813 synonymous_variant p.Ser39Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10925.1
MVAASAYEETRRKRVEENRKRMEALNLPLLSRALHKSPSPKSSPLKSIKKSRTTEKELVVVRRSGRLAKLCSPVYKEMPIDRVSIPRRCVSNRHRDLSNRVYASDEARMEALEQAENLMSGLKSDIPNFIKSMLQSHVSGGFWLGLPVHFCKSNLPKGDEVMTLIDEDGNEYPTIYLKRKTGLSGGWKGFAVAHDLADGDALIFQLIKRTTFKVYIIRANGPSKDKQLE*


CDS Sequence:
>Vu_10925.1
ATGGTGGCAGCATCTGCATACGAGGAGACTCGTCGCAAGAGAGTAGAGGAAAACAGAAAGAGAATGGAAGCTCTCAATCTCCCTCTCCTCTCTCGAGCTCTTCACAAATCCCCTTCACCCAAATCTTCTCCGTTAAAATCGATCAAGAAAAGCAGGACCACCGAAAAAGAGTTAGTTGTAGTGAGAAGATCTGGTCGTCTGGCGAAATTGTGTTCCCCTGTTTACAAAGAAATGCCTATTGATCGCGTTTCTATACCTCGAAGATGTGTTAGCAATAGGCACAGAGATCTTAGTAATAGAGTATATGCCTCAGATGAAGCCAGGATGGAAGCATTAGAACAAGCAGAAAATTTAATGTCGGGTTTAAAATCTGATATCCCAAACTTCATAAAATCTATGCTCCAATCTCATGTCAGTGGAGGGTTTTGGCTGGGCCTTCCAGTTCATTTTTGCAAGAGCAATCTTCCAAAAGGAGACGAAGTGATGACTTTGATTGATGAAGATGGGAACGAGTATCCAACAATATATTTGAAACGCAAAACAGGACTTAGTGGGGGATGGAAAGGTTTTGCGGTTGCTCATGACCTAGCTGATGGGGACGCATTAATTTTCCAATTAATCAAGCGCACTACGTTCAAGGTGTACATTATTAGAGCGAATGGTCCTTCAAAGGATAAACAACTCGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10925::LG2:49736929-49738929(-)
TAAAATAAACTTGTTTTTATATTTAAATTGTACTGGGAAGTAAATTTGAGTATTAACGCAAGAAAAGCAACCAGAAGGAAAGATGCTAGGAATAGTTTCAATTCTCCTGGTCATCAATAACATCGTTCTTAATGCAAAGTTTATGTTTAATTACTTAAGGAATTAATAATTGAACATAATTCTTTAGAACTTGTTTTAAGGAATTAAACCAAGATACTGTGATGTTGATGTGTGAACGCAAGTTATATTGCTCAGATTAGTCACTGTAATGTGGTCATGAAGTCAATTCCAATGAAGCTTTCTTTAAATTTTAATTTCAATTTAAAATTGTCATCTAGCTTGAAACTGTTAATTCACCTATATTTTGTTGTTCAATTGATTTTGATAAATAAATTTTAATTGAATAACGTAACACAAATTCCCTGAGGAGAACGATACTTTATTTATCACTGTATTACTTGTAACGATTTGGTATACTTGCCAAAAAGTTATCATGTTACAATGTTAGTAATCCCTTTTTTGGTTCACCCATATTGTATCAATGAGTTAGTAAATTAACTTCATTGTTTTTTAGGATTCTGATGTGTTATAAAAATTAATGGACACAAGTTTTGTTAATCTAGGAGTATTGTTTTGATTTCAGGTCTCTTCAAATAAAAAAAAAATGTTATTATGAAAAAAAATTGTACTTTAAAATTTGGAGTTTCATGATAATTTTGTCTTTATAAAAGTTTATAATGTAATCTATTTAGATGTATTTCATGAAAGCCAATATAAAATATTTTATTTTTCAAGTAAACAAACAAAGTTATATAATAAACTAAAATATAATGTCTACATTTCATTTATTAATATTTTATATTAACTTTCATAAAATACACGAAGTAATATTTTATAATTTAATTTAAAAATTAAACATATTTTTTCATAATAATTAAAAAAACATATTTAATTCATTATTACAAGACGGTTACTTTTGTTTGGATATAATAAAACACTTAATAATATTTGTAATTTTTATATAATACTATATTTTCTTTTTTTATTTATTAATATGTATTTTTTAATTAATGAATAATAATAAAAGAATTTAATAAGTCATAAATAATAAGAAAAAATATGATACATTGATAATATTTTCTAAAAATATAAATAAAGTGAAATTAAACTAATTTCTTTATTAAATTTTTGTATTGATTACATAAATATCTTCTAAGATATATTTTTCAGATGATATTCTCAATCATCACACTTTTTTCCCATGAAAACAACTTATATTAAAGAAAAATAAAAGATTTTCAAACATATTCTAAACGGTTTCACTCGCTTGTTCAAAACATGACTACCATAATGTTAAAGACTGTCATTGCATTAACAGAAGTATAGTGGTTGAAATTGAACATAAAATCATTGGAAAATAGATTCAACAACAACTGTGTTATTTGTTATGTGTTGAAATTGGAAAAAGAAGTTGCAACTCAATGCATTCTTTTACATCTAAATAGGTTGATCCAGAGAAAAAGTGACTGAGTAAACTGTCAAATAAAAATCTAAAATACTTTCTACTAAGAATAATAATTTAAAATTAGTGATTTTAGTTCAAAATAACTCAAGTGAGGAGGCCTTTTACACATAATAAAAGATAGAAATTTATGATCGTAGATAACAAGAATGACTTTAGTATTGGTACTACTAAAAACTTAAATTCAAATTTTCTCAATCTTTATTGGCACAAATAAATTATTTTACTGTACAGGTTTCAGATTTTAAATTTCTGATTACTAAAAAAATATACTATATTTGGACGAATTTTAAAAAAAAATAGCGCTTTATTTTGAAAATAAAATTCTGCAAATGACGATGCACTGTACATAGGAAAGTGGGAATGCAACGGTCGATTTACAAACACACAGCAGTTGCCATGCCACAGGAGATATATACAAATAAGATGAAAGTAACCTAAACATAATTTCTCCTGCATTGTCTTCTCCAAAGCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_10925(-)
ATGGTGGCAGCATCTGCATACGAGGAGACTCGTCGCAAGAGAGTAGAGGAAAACAGAAAGAGAATGGAAGCTCTCAATCTCCCTCTCCTCTCTCGAGCTCTTCACAAATCCCCTTCACCCAAATCTTCTCCGGTAAACCCTAAACTCTACATTCTAAATTTAATAATGTAATTCTTTTTTTATTACTTTTAATTTATTTACATCATTCATCTTATTGCATTTCATCACCTTTGTTTGATTGAAGTTAAAATCGATCAAGAAAAGCAGGACCACCGAAAAAGAGTTAGTTGTAGTGAGAAGATCTGGTCGTCTGGCGAAATTGTGTTCCCCTGTTTACAAAGAAGTCAGCTTCTGTCTTTTCCTTCTTCCATTAATTACTTTGGTGCTTTCATCTTCCATTCTTTTCTTACTCGGTGTCATCTTTTGACAGATGCCTATTGATCGCGTTTCTATACCTCGAAGGTTAGACTCTCTTTCTCGTCTTAACTTTCATTTTACTTTTTTTTAAACTAACCAAACATAATTTTTTTTTTCATTTGTTTTTGTAGATGTGTTAGCAATAGGCACAGAGATCTTAGTAATAGAGTATATGCCTCAGATGAAGCCAGGATGGAAGCATTAGAACAAGCAGAAAATTTAATGTCGGGTTTAAAATCTGATATCCCAAACTTCATAAAATCTATGCTCCAATCTCATGTCAGTGGAGGGTTTTGGCTGGTATGTAAAATAATACTGATTTTTTATTTTTCATATTTACATATACGATCATAAATCATGGTTGATTTCTTATTTAATAGTAGTTTTCTATTTTGAATTGTGTGCAAATTTGATGGGTAAATAAAATTGTTGACATTTATTCGAAGAGTAGAGAAAGAGAGAAAGAGGGAGATAACATAAAAAAATATTTTATGTTCTACTATAGCTGCTGATGTCTAATTGGATTAAAAGTTACCATAAGAGGGATTTATATCCTTTTGATCATTCAAAAGGTACAGCACAGCATTTTTATGTGGTATTTGAATATTTGAAGTCTTCCATGTGTAACTTAAAGATATTAAGTTGGCTAATGAATTTCAGGGAAAATTGCATACAAACCTCATGTTTTCTTGAAAGATATTTTTATCTTTTATAGTTAAAAAATATACTTTAACATATATAATTTTTTTACATTCATTTTATATTATTTTTTACTTTTTCTTTTCTTTGAAAAAGTATAAAAAATTATTTTTTTAAGATTATTTTATTTTTTGTTAGTTTTGTCAAACGAATATTCATGTGTCATGTTATCCTTTTGAGTCTTCACTTAACATGTATGTTTATTTTTTTTCATATTAAAAGAGCGAGTTAAGTATAAAAAGTATTGATATTTTTTGTTTTCAGTATAATAAAAATTTAAAGTAATCAAGGATATTGGATGTAGGATTCCTAAGAAAAGTTTATACCCATGTACATACAACACCAGACAACCTTACTGAAGAAGTTACTCAGTTAAATACTTTTTCAGGGCCTTCCAGTTCATTTTTGCAAGAGCAATCTTCCAAAAGGAGACGAAGTGATGACTTTGATTGATGAAGATGGGAACGAGTATCCAACAATATATTTGAAACGCAAAACAGGACTTAGTGGGGGATGGAAAGGTTTTGCGGTTGCTCATGACCTAGCTGATGGGGACGCATTAATTTTCCAATTAATCAAGCGCACTACGTTCAAGGTGACTCATCATACCCTTGTGTTTTAGTTTATTACATTTTTTATAATTTTGAATTATGTGAGCGCTATTTACTATTGTTAGAAAGAAGAAAAAAATTGTGATGTGCCTAATAATTAAGTCCATGACAGCTCTTTAAAACTTTAAATAATCTATAGTATTAGCTAAAAAGACTTTTTTTACTTATGTTAGGTAGTAATCTATCTAATGTTGGATGCAGAAAGCATAAATTTAAGTTGGACGTAAAAATTCACTTTTTACAAACACGAATATTACTAAAAAAATGATAAAAAGTTCAAAATTTATGTTAGTAAAAAATCCGACATAAATATTGGATTTTTTTTAAATAGAAGGAGTCTAACTGACTAACTCATTGACATTGAAGTGTACATCTGATACTTCATCCTGAAAGTTTTGGAACACATGCTCCTGTGTTTATAAAGTGTTGAAGTTCCTCTATCTAATGACAGATAAAATTTTCTTCCTAACCATCTCAATATTGGAAATGTAAAAATTTTGATGTATAAATATTGGCGTCGTTGATCAATTTATTTAACTAGGTTAATAATAAAAGTGAATTTATAAGGTGTTGACATAAATGTTGTCAAATACCTAAATATCCTGCCTACTGTAGTTAAAATTGAGATTTTAGATTTTACTAATAAAATTGTACACCCTACAATTTTGTATAGTATTTTTATTCAAATCCACACGTGGATGAGGTACGACAAAATTGAACAAAATTGTGAAATAGTATGGATTGGGATCACTCCACTACCTTTATCTTCTTGGGTGAATGAGTTTAGTTTAAATAAAACATAAAGATAATTGAGACTTAATACAATTAAAAATTCATCATGTTATGTGTGCTACGTGTGCTGATACCATTCAGTTAAAAATTAATATAATTAAAATTCACTTTTTTTTTTTTCTTGAGCCGGAACACTTGTTCACTCTCTTGATGGATGGAGGTTTCAGTTAAAACAAAATTCAAACTCAAGGAGTGTTTCAGTTAAAATAAAATTCAAACCCAATTAATGGTTAAGGGTGTTTTCTACTCCACGGTCACATTGGCATAAATAAACTGTACTTTTTATAATAGACTGACCATACACTGCAGGCCAACTTTGTCTTAGTGATATTTGATACATACATCTGTTGTGGTTATTACACCATACACCTTCGTAATTCAGTTTTCTTTTCTGTTGTTACTTGATCCCTTTTGAGCTATCGCAATATTTGCTATTTACTGGAATTCTCTTTGAATTCTCTAACCATGACACATATTGTGGTTGCTAATGTTTTCTTTTCAGGTGTACATTATTAGAGCGAATGGTCCTTCAAAGGATAAACAACTCGAGTGA