Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10912 LG2 49626017 49630547 PREDICTED: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 5
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 49626183 3_prime_UTR_variant
A/G 49626465 downstream_gene_variant
A/C 49626538 downstream_gene_variant
C/T 49626592 downstream_gene_variant
T/C 49626630 downstream_gene_variant
G/A 49626757 downstream_gene_variant
C/T 49626867 downstream_gene_variant
A/T 49626922 downstream_gene_variant
A/G 49626959 downstream_gene_variant
C/A 49627031 downstream_gene_variant
G/A 49627034 downstream_gene_variant
T/A 49627038 downstream_gene_variant
G/A 49627120 downstream_gene_variant
T/A 49627178 downstream_gene_variant
G/A 49627409 downstream_gene_variant
G/A,* 49627515 downstream_gene_variant
T/C 49627518 downstream_gene_variant
T/C 49627536 downstream_gene_variant
T/A 49627544 downstream_gene_variant
A/T 49627582 downstream_gene_variant
T/C 49627586 downstream_gene_variant
T/G 49627623 downstream_gene_variant
T/A 49627951 missense_variant p.Gln374His
T/A 49627958 missense_variant p.Glu372Val
T/A 49628244 downstream_gene_variant
T/A 49628360 downstream_gene_variant
T/C 49628401 downstream_gene_variant
G/A 49628512 downstream_gene_variant
A/T 49628576 downstream_gene_variant
A/G 49628670 downstream_gene_variant
C/T 49628697 downstream_gene_variant
T/C 49628882 intron_variant
A/G 49628921 intron_variant
A/G 49628958 intron_variant
T/A 49628972 splice_region_variant&intron_variant
C/T 49628973 splice_region_variant&intron_variant
C/T 49629010 missense_variant p.Arg345Lys
G/T 49629156 synonymous_variant p.Ser296Ser
C/T 49629188 missense_variant p.Ala286Thr
A/T 49629192 missense_variant p.His284Gln
C/T 49629282 synonymous_variant p.Arg254Arg
T/G 49629479 missense_variant p.Asn189His
G/C 49629587 missense_variant p.Pro153Ala
C/A 49629753 synonymous_variant p.Arg97Arg
G/C 49629762 synonymous_variant p.Thr94Thr
C/A 49629942 synonymous_variant p.Thr34Thr
A/G 49630106 5_prime_UTR_variant
C/T 49630116 5_prime_UTR_variant
T/A 49630119 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 49630120 5_prime_UTR_variant
T/C 49630359 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 49630364 5_prime_UTR_variant
A/T 49630468 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10912.1
MNFKSFGNEAGGDGGGRPVGNFSLTRQPSVYSLTFDEFMNSMGGSGKDFGSMNMDELLKNIWTAEEVQTMASAGVATEDVGAGVSHLQRQGSLTLPRTLSQKTVDEVWKDISKDYGGHGGPNLAQTPRQPTLGEMTLEEFLVRAGVVREDAKPNDGVFMDLARAGNNNGLGFGFQQMNKVSTATGLMGNRLNNDPLVGLQSSANLPLSVNGVRSSSQQPQMQSPQSQQQHQQQIFPKQSPMSYAAAQMPQGMVRGGIVGLGGDQGLSVQGGGIGRVGLAPGSVHVATGSPAANQISGDKMTKSNGDTSSVSPVPYVFNGGMRGRKTGGAVEKVIERRQRRMIKNRESAARSRARKQAYTMELEAEVAKLKEENQELVKKQAEIMEIQKNQVKEMMNLQREVKRRRLRRTQTGPW*


CDS Sequence:
>Vu_10912.1
ATGAATTTCAAGAGCTTCGGGAATGAAGCTGGTGGCGACGGAGGAGGGAGGCCGGTGGGGAACTTCTCCCTCACGCGGCAGCCGTCGGTGTACTCGCTGACGTTCGACGAGTTCATGAACAGCATGGGAGGTTCCGGGAAGGACTTTGGCTCCATGAACATGGACGAGTTGCTCAAGAACATTTGGACGGCGGAGGAGGTTCAGACAATGGCTTCGGCGGGCGTTGCCACCGAGGACGTAGGAGCCGGCGTCAGCCATTTGCAACGGCAGGGGTCGCTGACCCTGCCGCGGACTCTGAGCCAGAAGACAGTGGATGAGGTTTGGAAGGACATTTCGAAGGATTACGGTGGGCACGGAGGGCCCAATCTTGCACAGACGCCGAGACAGCCCACTCTGGGAGAGATGACTTTGGAGGAGTTTCTGGTCAGAGCTGGTGTTGTTAGAGAAGATGCGAAGCCAAACGACGGCGTTTTCATGGATCTGGCTCGTGCGGGGAATAACAACGGTTTGGGGTTTGGGTTCCAGCAGATGAACAAGGTTTCTACTGCTACCGGTTTGATGGGTAACCGGTTGAACAATGATCCACTGGTGGGTCTTCAGTCTTCTGCCAATTTGCCTTTGAGTGTTAATGGGGTGAGATCGTCCAGTCAGCAGCCACAGATGCAGAGTCCACAGTCTCAGCAACAGCATCAGCAGCAGATATTTCCTAAGCAGAGTCCTATGTCTTATGCAGCTGCTCAGATGCCCCAGGGAATGGTTAGGGGTGGGATTGTGGGACTCGGTGGTGATCAGGGTTTGAGCGTGCAAGGTGGAGGGATTGGTAGGGTTGGTTTGGCACCTGGGTCAGTTCATGTTGCTACTGGGTCTCCTGCTGCTAACCAAATATCCGGTGATAAGATGACCAAGAGCAATGGTGATACCTCGTCTGTCTCACCGGTTCCTTATGTCTTTAACGGAGGCATGCGGGGGAGGAAGACTGGAGGAGCTGTGGAGAAGGTGATAGAGAGGAGGCAGAGAAGGATGATAAAGAACAGAGAGTCAGCTGCCAGGTCACGGGCACGCAAGCAGGCTTATACCATGGAATTGGAAGCAGAAGTTGCAAAGTTAAAAGAAGAGAACCAAGAACTTGTGAAAAAACAGGCTGAAATCATGGAAATTCAGAAAAATCAAGTTAAGGAAATGATGAATTTGCAACGAGAAGTCAAGAGAAGACGCCTCAGACGAACACAAACTGGTCCGTGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10912::LG2:49630547-49632547(-)
GTTTCACATTATTAAAATAAGATAAAAAGACGATAAAATTGTAATACCGTTGGCTAATTTGAAAATTATTATAGGAGAAAAACAGTGTAAGAAATAATAATGTATAAGTAGTTATATACAAATAAAATGGAATATAAAAAACTTGGGTAAAAACTCACAATTCCTATAGTTAATATGAATGCACAAGGATTTGATTTTCCTTGTTATAAATGCTTTTGAACGATAGAAGGAAGAAGTAAAAAGGAATGAATTAGAAAATAACTGCATCAATAAATTTTGGCATAGATAAAAAATTTAAACACATTAGTTTGGATTTGACTCCTAACAACATGTGTATTGAAAATAGATTTTTGGACAAGCCAACAAATGATATAGATATTTCATGGTTATTTTTTATTTGTAAAAATAAAATAAATATCAAAGAATTTTATAATAATTCAATCTTAACAAACTAAGTTAAACTGTTTTAACACTTCAAGAACCTCAATTATAAATTTAATTGTAACAGTGATATAAAAAATGTTATTTACAAATAGAAGATTAAACAATAAAGTCAATCAAGGAATTATTTTTCTCGTTTGAGACTACAAAAGTAATACGAGTTATACCATTTTTTTAACCTAGTTACAAATTCTAGTTTTTTTTTTTCTGCATAACTTTAGTAAAATATTTATTAATAACTAAATGAATTAAATACATTAATAAGTAAGTATGGTATACTTTATCATCTCTGGTTTCTTTCAGCACTTTTATGATACATACTTTTTTTTATAGGATAGGAAGAAAAGTGTTATGGTGAAGCACTTTATTTAATTTTTTAAAACAATTGGGTGGAAGGACAGTGTTCAGTGCAAGGAAGAAAGCAGGAATTGGTGACCATACCTTTATCAGAAACGTGTACGGCTGAGATTCTCCCAGAAAGCGGAATACTATTGGTTGGCTATCACATCGCACACAATCCTTTTTCATTGGTACACCTCTCCAAGTCGGCACTCTGCAAACTCCATTATTATGTCTTTCTCATCATATTTTAATGCTTTCTTTATTATCACACACATCTTAATAATAATATTAATATTATTTTTACAAATACCATTCTAATTTAGATCTATTCCAATCCATATTATTATTATCAGTTTGAAAATACGATTTTTTTATTAATTCATAAATCAACACCTTGGAATATTCGTTAACAAAACGCGTCTTTAGTTATTTGTGTTGGAACCTAATATAATAAAATTAAAAAATTGAAATTAAAGTTCTTTATTAAATAATCTTCACACACCATGCGTGAAGCTCTTTTCACAGTCAGGTTACTTTATTTTTGAAACAAATTATCTGATAAGCATAATATTCAAAATTTGATTAAAAACAGTGATTTAACAAAATCTTAATCGAGACTCTTGTATTAAAGTAAATTCAAACCCGAGTATATTTCACAAATTATTATTATTATTAGCATACTTTGTATTTAATTTAGAAATCTAAAAAAAGGTTTAAATAATTTTAGCATATGATATTAAGTTGAAATATCGACCTAATAACATGTCACCGAGCACAACATACCAAACAGTGATTTTGGATAATAAACCTACATATCATGTTTATTTATTATCCTAATAAGAAAAGCAAAAATATCTTGAAATAAAAGAAGATATTTAGATATCTAAAAGGAGCATTAGATATATTTTAGGAAACTAATTCAGCCATATATGATTTAAAAGTTTTTTTTGGGTTGATATTTTGAAAAGAAGCAATAATAGAAGGAAAGTTGAAATTAAAAAAAAAAAGAGATTTGAATTGAATTAGCAAGATAAAATAAAAGTTAAGGGATTGTTAGTGTGAAGAGACAGAAGGACACTTGGCGGTTGGAGCAGAGGGTTGGAGAGCGAGGAAGGAGGAACGCAGCCAAGGAAGTGTAAACTCTCATCAGACACCAAAATCATACCAAATCGGGAATACCTAAGTTTTGTAAAATAAATAGCAAAGGTATTGCTATT


Gene Sequence:
>Vu_10912(-)
GCCCTCCATTCTTTTTATATGCTTACAAATTCTTATCTGCTTTTATTCCTCCACTTTCTTATTTCTATCTTTTCTATCTTTTCTATCTTTCACTTCAAACACTAACACGCAACAATTCTCTTCACAATATCATCTACTAGGGTTCAAATTCGGATCTCAATTCATCTTATTACTAGGATGCTATATCTAATTATTTCCTCTATAATATGTATAGATAAAATAGGTTACCGAGATAAAATGTAAGTGTAACACAATCCAACTGTATCGCACTCACTCACAATAGATTAACGCCTCTTTTGTAGTTTCATCATTCTTGCAAGCTCTCTGCTTCTTCTTTTTTTAGGTTTTTATTTGGATGTAAATAGTTTGTACTTGGTTGGTAATTCATGATTCTCTGAATTTCCTGCTGGAAAATTAAGAAACAGACCAGTGTTAGTTTGGTGGAAAACTGAGATTTGGATTCGGATCAGGTTGGGATTGTGTTTGGTTGTTCATAGTTTCGATATGAATTTCAAGAGCTTCGGGAATGAAGCTGGTGGCGACGGAGGAGGGAGGCCGGTGGGGAACTTCTCCCTCACGCGGCAGCCGTCGGTGTACTCGCTGACGTTCGACGAGTTCATGAACAGCATGGGAGGTTCCGGGAAGGACTTTGGCTCCATGAACATGGACGAGTTGCTCAAGAACATTTGGACGGCGGAGGAGGTTCAGACAATGGCTTCGGCGGGCGTTGCCACCGAGGACGTAGGAGCCGGCGTCAGCCATTTGCAACGGCAGGGGTCGCTGACCCTGCCGCGGACTCTGAGCCAGAAGACAGTGGATGAGGTTTGGAAGGACATTTCGAAGGATTACGGTGGGCACGGAGGGCCCAATCTTGCACAGACGCCGAGACAGCCCACTCTGGGAGAGATGACTTTGGAGGAGTTTCTGGTCAGAGCTGGTGTTGTTAGAGAAGATGCGAAGCCAAACGACGGCGTTTTCATGGATCTGGCTCGTGCGGGGAATAACAACGGTTTGGGGTTTGGGTTCCAGCAGATGAACAAGGTTTCTACTGCTACCGGTTTGATGGGTAACCGGTTGAACAATGATCCACTGGTGGGTCTTCAGTCTTCTGCCAATTTGCCTTTGAGTGTTAATGGGGTGAGATCGTCCAGTCAGCAGCCACAGATGCAGAGTCCACAGTCTCAGCAACAGCATCAGCAGCAGATATTTCCTAAGCAGAGTCCTATGTCTTATGCAGCTGCTCAGATGCCCCAGGGAATGGTTAGGGGTGGGATTGTGGGACTCGGTGGTGATCAGGGTTTGAGCGTGCAAGGTGGAGGGATTGGTAGGGTTGGTTTGGCACCTGGGTCAGTTCATGTTGCTACTGGGTCTCCTGCTGCTAACCAAATATCCGGTGATAAGATGACCAAGAGCAATGGTGATACCTCGTCTGTCTCACCGGTTCCTTATGTCTTTAACGGAGGCATGCGGGGGAGGAAGACTGGAGGAGCTGTGGAGAAGGTGATAGAGAGGAGGCAGAGAAGGATGATAAAGAACAGAGAGTCAGCTGCCAGGTCACGGGCACGCAAGCAGGTGAATATTTGTTCCACTATCCTAAATTTAGCAATCATAGTTCTCTTGCATTTGTATATTCAAAGGAACAATTACTTAAATGCAAAAAGACTGATTTAATTTCTCTAGTTAGAACATAAGGATATCAATGGGTTGATGCAATCACTTTAAACATGTACATAGGCATGTTTGAGTAAAAATTTAATTAAAAAGAGCTTATGTCATTAGGGCTTAATCTATAACTTTGATGAGATCAAGCTAGCATGAAGCTTATTAAAAAGCAGCTAAAAAGAGCTTTGGGAGGGTTGTAAGCTACGTTTTCAAGCTTTAATTAAACACCTTTAACTTTCAGTTTAAATGCCTAAATGCAAGACGAGCCTATGATAAAACTTGTGTTTGTCTACAACTCATCTGTTGTCTTGCAACCTCCATCTACTGGTATGAGATAATCAAATGCCTGCCGTTGCAGACTGTAGATTTTACTCTCAATATCAGAAAGGAGGGAGGAGTAGCTGTAACATTTTTCATGAAAATACGCCACATAATTTTCTATAATAGGGTTAGTGAATGTTCAGTTCTAAAATCGAAAGAATATAATGACGATATGCGTCATGTTATTTCTTTACTAATAGTAATACTGCTCGGCCATTGACGTTCTGCTTTTATCCTCTGTGAACATGCTGTATACCTTGAAAGATTATGCAGCAGAATGGTAATATGATAGCGATCTGATCTGATGAAAGGTGAAAGATATTGAGAAGTTACAATCATGAGAAGTTGTAAAGATCCAGGTTATTACAAGGTAATTGAACAGCTGGTTGGGAACATCACTAACAGTTGGATCATCATAAAATCCAAAGAAGCATATAATAAGTAAAAATGTATTAACTTGCAAGACATAACGTGGGAGGAAGTGCAGGCTGAAATTTTGTAAGATGTATTTATTTTTCTGGTGTAAGTTCGGCCTCACATTTTCATTTTGTTTGTTTCAGGCTTATACCATGGAATTGGAAGCAGAAGTTGCAAAGTTAAAAGAAGAGAACCAAGAACTTGTGAAAAAACAGGTAATTATGGTTATTGACTCATGTCACTTCACATACAAATGCAAGCACCCATGTATACGAATTTATGTCGTATGTTCGCATTAAAATTTTCTCTAATCGACATTTATTTGCGTATTGCAGGCTGAAATCATGGAAATTCAGAAAAATCAAGTAAGTTTTTTTTTTTGTCAGCATTCCATTTGCTGTTTTTATTTTTCATTAGTCCTTGTAAAGTATTTTGTAGACCTTAATTTAGGGAGTGCTGTAACCTTATGTCCTGTTGCATGACTGATTGGTTAACATATATCATGAATCAGGGTTAAATTTTCTACACGAGTACATATTATTTTGTCAGTCCTTAACTAAGACCATTTTTTTCCACAAAAAATATTCACCGACAAATGGAGCAAACCGAAGAAAATGTGGTCACAAACTATGCCAATCAGCGGCACAAATTGGTGTGCCGGTCATGTTAAACTTGTGATGAATGAGGTGGTAGGTTTGGTGCAAAATTGTGCTACAATGATAGACCTGATTTGAACTACCACCTACTTTAGGTTCTTCTGTTAATTATGTCATGCGATTAATTACTAAAACAAGTGTTTCAGTCCATTTTTATTTGATTAAATATTTGTCAATGTATTGTCTGTAAGGATCACTTTTAATTCTCTAGTTTAGTCTCTGTCTCTCAGACATTTTTTCTTTGGTTTATGGGTGTTGAATTGATTTGATGATCATTATGTAAAGCTAGTAAGAAATATGTTTTAATATAACCATTTAAATGAACTGAAAATCCTGTTCACTTAGTAATTATCAATCTTACAATAGAATCACATGAAAGGTTGTAGTAGAGAGACATCAGCAATAATCACTGTCAGTGAATGTATTTTTGAGATCAGATAATTTTAGCCATGTAAACCAGGTTACTGATCTGTTCATATGGCTTGTGTCCAAAAAGTCTTTTGGAACAATCTGTTACTAGTTAGGTTGTTTTTTATTGTTGGGGGTGGGTGGGTAAATTTTTGCTACATTAGTGGAGGAGTGGTTTTGGAATTTCAGCTTAGAAGTCTCTAGGATTTTCCGTATGAAGAAATGTCAGTTCCGTGCGGTGATTGTGCTTATGTTTTAAATTCCTGGATAAGATATCATATCTATATACAACTATCACGTTCAGAAGTTTCATCATATTAGCCTGTCATGCCCCAAACTTGGAGCTCTTTTGATGAGTACAATACAATTACAGTGATTATGAACTAGAATGTCCTATTGACGAATTGACGAATTCCTTTTTAATAAGGGTTTTCTCCCCTGCTTCGTTGTGTTAATATATGTTTAGGACTGTCTGCACTTGTTCCAGAATCGTATAAAGCTAAAACATAGGATTTTCAAACTCGAACGAAATGCTCCCATTTCAATGGACTATTAATTGATATTGTTCTGTCTGTGTTTTTTTCTTACAAGTTGTTACTGTAATATGCAAGGACTTACTGATTCAAAGTATATATTGTAAGAGATTACAAATTTAAGCATCCTTTTTACTGAATTTGCTTTCATCCGATAATATTGCAGGTTAAGGAAATGATGAATTTGCAACGAGAAGTCAAGAGAAGACGCCTCAGACGAACACAAACTGGTCCGTGGTAGAGTGAAGATTGTACTATGACTCTACCGTTAAAATATATGTACATAATTATAAAAACGTATTCTGTTGTAGATCGAGGCTCTGGTAGTTTTTAGATTAGCACTTGGAAACTTTCACGAATTACTTATCTTTTGAACACGTTAGGAAGGGTATGCATAGTATCATGAGAATATGTTTCAGCACACATCCAATTTCTTGTCACCATTGGTTGGACAATCTTGTGAAGTGGCACATTTCCTGGATTTGATTTGGTGAGATTGGGTGTCCAATATATGCACTTCTCTTCATTCACCAT