Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10812 LG2 48689578 48690810 PREDICTED: transcription factor RAX3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 48689610 missense_variant p.Asn11Lys
G/T 48689739 intron_variant
C/G 48689965 intron_variant
G/A 48690487 missense_variant p.Arg180Gln
T/G 48690493 missense_variant p.Ile182Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10812.1
MGRAPCCDKANVKKGPWSPEEDAKLKSYIEQHGTGGNWIALPQKIGRTDNDIKNYWNTRLKKKLLGKHRKELQARSKENGVVKQENNSSLLLQENIVQQQPCWPQIPAPPLSPYTSQNPSFNDQDSIRKLLIKLGGRFSDDYQPIGVNVQFPQGSLTSTQQIQEEQVHVSSSGCMNSIGNGQLQFGQSNEYCSELVQGEVSFSSAAIGEMVSTNDYSQRLLGGLEFLYGEEMISDKIMGGCASSCCGQSTNWGETSSLIYPPLVASSFEGVREEMPRENAFQELSYP*


CDS Sequence:
>Vu_10812.1
ATGGGAAGAGCACCTTGCTGTGACAAAGCAAACGTGAAGAAAGGTCCTTGGTCGCCAGAAGAAGATGCCAAACTCAAATCCTACATCGAACAGCACGGAACCGGAGGCAACTGGATCGCTTTGCCACAGAAGATTGGAAGAACTGATAACGACATAAAGAACTACTGGAACACGAGGCTGAAGAAGAAGCTTTTAGGGAAGCACCGCAAGGAACTGCAGGCACGTAGCAAAGAAAACGGTGTCGTTAAGCAGGAGAACAATTCTTCACTCTTGCTTCAGGAAAACATTGTTCAACAACAGCCTTGTTGGCCACAGATTCCGGCGCCGCCACTTTCGCCGTACACAAGTCAAAATCCAAGTTTCAACGACCAAGACTCTATTAGAAAACTTCTAATCAAGCTTGGAGGGAGATTCTCCGATGATTATCAACCCATAGGGGTGAATGTTCAGTTTCCACAGGGTTCTCTCACATCAACACAACAAATTCAAGAGGAGCAAGTCCATGTTAGCTCTTCTGGGTGCATGAACTCTATTGGCAACGGCCAATTACAATTTGGTCAGAGTAATGAGTACTGTTCTGAGTTGGTGCAAGGAGAAGTGAGTTTCAGTTCCGCAGCTATTGGGGAAATGGTTTCTACTAATGATTATTCTCAAAGGTTATTAGGAGGGTTGGAGTTCTTGTATGGAGAGGAAATGATTAGCGATAAGATAATGGGTGGTTGTGCATCTTCATGTTGTGGGCAAAGTACTAATTGGGGCGAGACAAGTTCTTTGATTTATCCTCCTCTTGTTGCTTCGAGTTTCGAGGGTGTGAGGGAAGAGATGCCACGAGAAAATGCTTTTCAAGAGTTGAGCTACCCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_10812::LG2:48687578-48689578(+)
CATTTTCAATGCTGTTATAAGGCCTCATTTATTTCCTTCTAGAAACTATAACCTTTCAATTATAAAATGCACATGGATTTGATACTTCATCATAATTTTCAACTTTTTGGTTTTCTTTTTCTCCTTTGGGAGAAGTTTAGTGGATTAAAGACCCTACAAAAATTTATTACTATTGGTGAATGTGAACCTAAAGTTCCGTATAGTACATATAATCAACTAATAAGTGAAAAAAAATTACAAATGTAAGATGAATTAAGTGTGATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTATACTATAACTCTATTTTTACTATTGGTCCAAAGTTGATTAATGATTTTTTTTACTCTCTTTCTTATAATATGATCTTATTTCTCTTTCTCAATTTTATAGTATTTATAATTTTTTAAGTGGGATTGAGTAATAATGAGACTTGAACAAAATATATAAGAGACTTATACCTTCTTTAACTCAAAATTTTTAAAGAATAAATTTATAAATCTTATTTCATACATATTACTTAACTTTCTCTACTTTTACTAAATGTTGAACTTGTCCTTCCTTATTTCTGTATAAATATTTAATTTTTGATAAGTACATGTTACTCTCTCACTTATTTTCTAAATAAATTTGCTTTGTAATTACACTTAGTTTTCATTCTCATTTGTTAGAATAAACATATATAATACAATTATTTAACTAAAATTGTATTCATTTAGTTAAATATTTAGCTAATATACATGTGCACATAACATTTTTATATAGAGTTATTTTTTAAAATCAGGGTTCTTTTCAGAATATTTGCTACTAAACATGAAATAAAAATAATTAAAAAAAAGCTAAGAAGTTTAATAGAACACTTATATGATTTATAACTATAATGATCTTGATTATTTTCTTATAAATTAAAATATAAATCATGTCATAGAAATTAGTCATAGTCCTAAGCATATGATAGTCTTGGGTATTGATTATCTAATAATATCACTCCCCTTTACCCTCCAAAACAGTATCCTTTTACAAGCACTTTCACTTCAAAATTAGTTAACACTATTTATAAATATTAGGTCCTAAAAAAGATAACTAAAATTATTTCAACTCAACTATGCTAGACTCAAATTCAATTTTCCCATAAAAAATGTGAAAAATCTTCTAAAACATGTTAGCTATGTTTCCATTAAATTCTATATAATCTAGACCAAATACCTAAATTTTAGAAAAAGAAAATATGTATTCTTGTTGAAATAAAAAGATGATAACATGTTATAAGAATATTTTAGTTGTGGTTAAAAAATAAATTTTATGTTTAATTCAATTTTATAAAATTATTTTTTCGTGATATATTTGTGTCGTGACATATCTATATTTTGAATGTAAAATTAAATCCAATAATAAATTAAACAATAGACTTAAGATACACGATAAGTTCTAATTTATAACTTTGATATTATGGTAAAAAAAGAATTTTATCCTACAAAATTTATTTACAAAATTAAGTTTGCATTGTTTATATATAATAAATTAATTGTTTTTTACTGAACGATGTAGTTTCAATAATTATTAATGACATAAACTATGGTAGTGCATTGTATTAATTTTGTATAAAAAGAGGGAAACAGTGAGCAAAAGGAAGAGGTATGGTAGTATATAGTTGGACAGCGAGGGTCAGAGTGGAGTGGACTTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTTGATTCCAGTTTAAGAAAGACAAGAAGAACCACCCTCGTTCTCGTATTCTACCAATACTAAATAGCTGGAATTTTCTACATAAACATCTTTCTTTTCTGCCACACTCTTATATAAAATTTGTACGATTGGATGTTCAATTGGAATCATGTTTATCCGCTCCTACTTTTATAATTAAATAACTTTCTCTCTCTCAATTATTCACACCCTAAATAGAACCCTTGTCCCAATAATCAATGAAAGTTTTCTCAGAGCAACAACATCACCA


Gene Sequence:
>Vu_10812(+)
ATGGGAAGAGCACCTTGCTGTGACAAAGCAAACGTGAAGAAAGGTCCTTGGTCGCCAGAAGAAGATGCCAAACTCAAATCCTACATCGAACAGCACGGAACCGGAGGCAACTGGATCGCTTTGCCACAGAAGATTGGTATCATACACATACTATATACTCAGATATATAACCCTAGCTACACTTTTCCATCAACTTCTCTTTCTTTCTTATTATTTCTCTTCATTTCTGAGTCAGGCCTCAAACGATGTGGCAAGAGTTGCCGTCTCAGGTGGCTAAACTACCTCCGCCCTAACATCAAGCACGGTGGCTTCTCTGAAGAAGAAGATAACATCATTTGCAGCCTCTACGTTAGCATTGGAAGCAGGTAACTACTATTGTTTCTGAAACAGGATACAGTCTTATTTTTCTTAAATAAACATGGGAGTTTCATTTTCCGTTGAACGATTAATGAATCGTTTTGTGTGATGTAACGCAGGTGGTCGGTGATTGCGGCACAATTGCCAGGAAGAACTGATAACGACATAAAGAACTACTGGAACACGAGGCTGAAGAAGAAGCTTTTAGGGAAGCACCGCAAGGAACTGCAGGCACGTAGCAAAGAAAACGGTGTCGTTAAGCAGGAGAACAATTCTTCACTCTTGCTTCAGGAAAACATTGTTCAACAACAGCCTTGTTGGCCACAGATTCCGGCGCCGCCACTTTCGCCGTACACAAGTCAAAATCCAAGTTTCAACGACCAAGACTCTATTAGAAAACTTCTAATCAAGCTTGGAGGGAGATTCTCCGATGATTATCAACCCATAGGGGTGAATGTTCAGTTTCCACAGGGTTCTCTCACATCAACACAACAAATTCAAGAGGAGCAAGTCCATGTTAGCTCTTCTGGGTGCATGAACTCTATTGGCAACGGCCAATTACAATTTGGTCAGAGTAATGAGTACTGTTCTGAGTTGGTGCAAGGAGAAGTGAGTTTCAGTTCCGCAGCTATTGGGGAAATGGTTTCTACTAATGATTATTCTCAAAGGTTATTAGGAGGGTTGGAGTTCTTGTATGGAGAGGAAATGATTAGCGATAAGATAATGGGTGGTTGTGCATCTTCATGTTGTGGGCAAAGTACTAATTGGGGCGAGACAAGTTCTTTGATTTATCCTCCTCTTGTTGCTTCGAGTTTCGAGGGTGTGAGGGAAGAGATGCCACGAGAAAATGCTTTTCAAGAGTTGAGCTACCCATAG