Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10810 LG2 48661645 48664085 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HAT22-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 48661657 missense_variant p.Gln262Leu
G/A 48661735 missense_variant p.Pro236Leu
G/A 48661749 synonymous_variant p.Pro231Pro
T/G 48661817 missense_variant p.Thr209Pro
C/T 48662184 downstream_gene_variant
A/C 48662215 downstream_gene_variant
G/T 48662460 downstream_gene_variant
T/G 48662492 downstream_gene_variant
T/C 48662494 downstream_gene_variant
T/A 48662498 downstream_gene_variant
T/C 48662518 downstream_gene_variant
T/A 48662520 downstream_gene_variant
T/G 48662523 downstream_gene_variant
A/G 48662524 downstream_gene_variant
G/A 48662529 downstream_gene_variant
T/A 48662531 downstream_gene_variant
T/C 48662642 downstream_gene_variant
T/G 48662814 downstream_gene_variant
C/G 48662988 downstream_gene_variant
C/T 48662993 downstream_gene_variant
A/T 48663169 downstream_gene_variant
A/G 48663215 downstream_gene_variant
A/T 48663634 downstream_gene_variant
G/C 48663662 downstream_gene_variant
G/A 48663666 downstream_gene_variant
T/C 48663837 synonymous_variant p.Leu83Leu
A/G 48664012 missense_variant p.Met25Thr
G/T 48664059 missense_variant p.His9Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10810.1
MVLGTSNLHLGLGLGLQDQSQETCMKSHERRQRQRQSQKKKDSDECFDFHRRASPPSAVSSFLNSSSIIKRERDELAGEEIELEVEKFPSNLRVVDLDEYGYSKKKLRLSKEQSAVLEDSFKEHSTLTLTQKQGLAKKLNLRARQVEVWFQNRRARTKLKQTEVNCEILKKCCESLTEENKMLQKELEELKSMKTALQGPLFMQLPVPNLTICPSCQRISGGSAATTNSASPPTTTTTLLVGPKPRHDHHFYKNNYTFTQSSAAC*


CDS Sequence:
>Vu_10810.1
ATGGTCTTAGGTACCTCTAACCTTCACCTAGGTCTTGGTCTTGGCCTCCAAGATCAGTCACAAGAAACATGCATGAAGAGCCATGAACGAAGGCAAAGACAAAGACAAAGCCAGAAAAAGAAGGATTCCGATGAATGTTTTGATTTTCACCGTCGTGCTTCTCCTCCAAGTGCAGTGTCTTCGTTTCTCAACTCATCAAGCATCATCAAGAGAGAGCGAGATGAGTTGGCCGGAGAAGAAATTGAGTTAGAGGTAGAGAAGTTTCCCTCAAACTTAAGAGTTGTGGATCTCGATGAATATGGTTACTCCAAGAAGAAGCTGAGGCTCAGCAAAGAACAATCTGCAGTCTTGGAAGATAGCTTCAAAGAGCATTCTACTCTCACTCTGACACAGAAGCAAGGATTGGCAAAGAAACTGAATCTGCGGGCGAGACAAGTGGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCAAGGACAAAACTGAAGCAAACGGAAGTGAACTGTGAGATACTGAAGAAGTGCTGTGAAAGTCTAACAGAAGAGAACAAGATGCTGCAAAAAGAGTTGGAAGAGCTTAAATCGATGAAAACAGCATTGCAGGGACCCCTTTTTATGCAGCTTCCAGTGCCAAACCTTACAATATGCCCTTCCTGTCAGAGAATTTCCGGTGGCAGCGCCGCCACCACCAACAGTGCCTCCCCTCCTACCACCACCACCACCTTGCTTGTGGGACCAAAGCCCCGTCACGATCACCACTTCTATAAAAATAACTATACATTCACACAATCATCAGCAGCTTGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10810::LG2:48664085-48666085(-)
GCTTTGTAATATCCATAAATAAAATGAAACTATATTCTATCATCACAAGTTTTAATATTGAAAATTTTCAACACAAAAAAATAACAAACAATATTATTCATATACTTAATATATTTATTCTCAATTATATGTACCAACTTTATAACTTAAGAAAACAACAAAAATAAAAACAATTGAAACCTTAAATATATTTTAGTTTTCTATCCACTAAATCATCTTTATAATTATAATAATAACAATCATTTTAGTTAACGAACTAAAAAACACTACATAAATGAAACAATCAAACTCATATATTGAAAAATTGAAGCTTTTGAAACACTCACTTCAATAATTCCCACAACCACAATTAAATAGTATGAAAATTTAGTTTCATATAAGAATTTGTTCAAATTTGATTTCTCTTCTTTTCTTTTCAATTTTCCGTCACTTTTACTCTATGCTCTCAAACTCTCTCAATATTATTCTTTTTATTTGTAAAAAGTCAACACATTAAAGTTTACGATAATTCACCCATATTCTTCAATCAACCGATTGAGATGACCCGTTAAATTTATAATATTCCTTTTACTTACAAGAAGATAAAAAAAGACTATATTCCATTCAATGAATTAATAAAAGCACCATACTTAACAGAAATCGAAAAGAAAAACCTTCACAATTCTAACCTTTTAAATATTCTAAATTAACTATTATAATATATTATGTTCAGTAAAATGACGATTTAGTGTTTCGTGAAAAAAACAAACTTGATTATAATTATTTAAATTAAAAGAACGTAATGAAAGAAAAATCATGGATGCTAATCATTATTTCCTTAACATAATACAATTAAACTGCAAAAGGGTGAAATATCATGTGCATGATGGAGTTTTTCTATTGTGGCGACTACTTTCCACGTATACTATATACCACATACAATGACACAGCCGCATAGCTTTTGTAGGATTTGTCCGCTTACCAGAGACTTAAAATAAATTACCTAATAATTATATTCTCATTATTAATGAATATCGTTTAATAGATTTAATAAACTTGTTATTCAATCCATAAAAGATTAAGTTGGAGTTTAGATAGATTTAACTTGACTGAAAAAAACTCAATTCAATATACTTAGATTAGATTAAATCGTGGAGTTTTTTTAATATTTACTATAAATACTTTACGTTTTCAAAAATAATAATAATAATAATTTAAACGTTTCTGTATTTTAATAATTAATGTGTCAATTTATTTAAATGATAAAAAAGTTAAAAAATATTTATATAATTTTTTTTATCTGTAGTTAATTATGTTTTTGCAGTAAATTATTAATTCCATATTTATAATTAAAAATAATAAAATATTTTTTTGTAAGGAATATTATTTTATAGAAGATAAAAATTCAATAAAAATTTTAATATCAAGTAGATTTCTTCTATTAAAGAAAATGACGATATACATCATAAAAATATAGTTACAATAAAAATGCACTTAAACATTTCGATTTCAGCAAATAGAAAAGCATATGATCCTTATGACACGGCTTTGCAATTTATTATAAACTGCCTATGGAAATAACAAAATTTTTAAATACAGACAGCTCAAAATATATTTTTATTAAAAATATCTCTTAAACATAATTTTAAAAGAAATCCTTTTACAAAAGATAAAAATAAGCTTAGTAAAAAATAAGTATACTTTAGTTTGTTTTGGATGCTTTTTTATTACTGCTTTCCATAAAAACTTTCTATCATAGCAATATTAGTAATTTAAGACTTTGTTGTATTTTCCTTTAATGCATTAATTATTTCATTTGTTTCTTGATGAACAATAATAAAAGGGTCCCCACCAAAAACCCTCTCCACTATAAATTGTTCTCTTTGGACCATTCCACATCTCTCTCGCTCTCTCCATTCGTTCATCTTCTACCTCTCACTCCTCTTTGCGCATTGCTGTAGACTGTTCATAAGATTACTGCATCAATTGAACTCTGTTCATTAGATCTATCTCAGAATATC


Gene Sequence:
>Vu_10810(-)
ATGGTCTTAGGTACCTCTAACCTTCACCTAGGTCTTGGTCTTGGCCTCCAAGATCAGTCACAAGAAACATGCATGAAGAGCCATGAACGAAGGCAAAGACAAAGACAAAGCCAGAAAAAGAAGGATTCCGATGAATGTTTTGATTTTCACCGTCGTGCTTCTCCTCCAAGTGCAGTGTCTTCGTTTCTCAACTCATCAAGCATCATCAAGAGAGAGCGAGATGAGTTGGCCGGAGAAGAAATTGAGTTAGAGGTAGAGAAGTTTCCCTCAAACTTAAGAGTTGTGGATCTCGATGAATATGGTTACTCCAAGAAGAAGCTGAGGCTCAGCAAAGAACAATCTGCAGTCTTGGAAGATAGCTTCAAAGAGCATTCTACTCTCACTCTGGTATATTTATTTTTACTACTTTTTCATTTTATCAAACTTCTCTTCCTCCCTTATTACAGATCCTTAAATAGTAAATCTTTTAAAGTTCTTAGACTTTTCTGAATGCACTTATCTCACAATTATTATCAGTTCTCAGTCATTTCTAGTGGATGTACTATTTCATCCATTTCACTTTAGGTGTAGTTTAAGTTTTTCTATGAATTTTTAAATTACTTCTTTTCTAATACAAGAATATTAATCTTATTCCAAATAAATATTAAGACTAATTTCATGAATCAAATAAACCAGAGAGAAACTATGGTTCAGTAACTATTGTTACATTACAAATTATAACCTAAGTGGGAGAAAAATATATATAGTATTTTAAGTTTTATTGAAAAGAATATAAGAATATTTTAGTAAAAGTTTTCAGAATTGGTAAAAGTGTCGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGGTGAATTTAGAATATATGAATGAGTATATAATCTTATCTTACACTAATTTTATACATGATTATTTTGATTCTTAATATATATCTTGATGTTTTAATTCAGACACAGAAGCAAGGATTGGCAAAGAAACTGAATCTGCGGGCGAGACAAGTGGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCAAGGTGAGTTATAATTTCTCTGATATTTGAACTGCATATTCCCCCAAATACAAATCCACGTTCAGTCTGTATTTCACTCCCTTTTTATAATTTTTAATAAATTTTTAGTAAAACTATCAATGAAGTACTCGTCTATTATAAATAATCATTAAAAAAAATTGTAGATTGATTTATAACAGCCAAATTTTTTCACTTCATAACCTTTAACAAATTATCCACATAAGAATTACCATGATAAAATATAATAAGCACTGTAATTATAATAATTAATAAAAAAAATTATGCTTCTAACTATTTTCTTTATCTTTACATTATTCCATAATTTTAACATAAGTTTTAACAATTTTTTATTTTTATAAAGGTTATAATAATGGTTTTTATTTCCACTTGTTATATTTATGTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGGGAATTATCATTTTTGTTGTTCATAATTTTTTTATTTTTATTCTTCAAGTTATCATTTTAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATAAAATATAATTAATCAACATATATATTCTATTTTATTTTTTAACTATAAAAAATCATTAGTTCTTTTTCACAATCGTATTTTATTTAATAACTTATATAACTCACCATATAAATCTTTCACTTTTTATTATTTAACCAAGATAATTTATTTCTTTTCATAGATTAGCTGAAGCATGTGACGAGATGTTTCTTATTCAATTACTATTGTTTATATAAACAATGTTGTGTAAGTATGTAAATCAATAAAAATACAGTTTTTTAGGTCAAGAAACAGAAGAAGAACTAAAACAGAACAAAAAAGGCACTTTAATAGTTTTAGTATTAGAAGTATACATTTTTTAAATGATAGTAAGAAGCTCTTAAGATTTAAAAGAAAGCATTGAATGAAGTTATAATGATACATCATAGGTATAGTAATGATATCGAGTGTGTGGAAATATCAGTGGCTGGTGGCAATGATATTATATATATATATATATATACATGTGTGGTGTGGTAGGACAAAACTGAAGCAAACGGAAGTGAACTGTGAGATACTGAAGAAGTGCTGTGAAAGTCTAACAGAAGAGAACAAGATGCTGCAAAAAGAGTTGGAAGAGCTTAAATCGATGAAAACAGCATTGCAGGGACCCCTTTTTATGCAGCTTCCAGTGCCAAACCTTACAATATGCCCTTCCTGTCAGAGAATTTCCGGTGGCAGCGCCGCCACCACCAACAGTGCCTCCCCTCCTACCACCACCACCACCTTGCTTGTGGGACCAAAGCCCCGTCACGATCACCACTTCTATAAAAATAACTATACATTCACACAATCATCAGCAGCTTGCTAG