Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10789 LG2 48518086 48520215 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 48518205 synonymous_variant p.Ser40Ser
A/T 48518215 missense_variant p.Asn44Tyr
T/A 48518411 missense_variant p.Leu109His
T/A 48518604 missense_variant p.Ser173Arg
G/T 48518610 missense_variant p.Trp175Cys
G/A 48519054 synonymous_variant p.Ala323Ala
G/A 48519543 missense_variant p.Val406Ile
T/C 48519547 missense_variant p.Leu407Pro
G/A 48519569 synonymous_variant p.Arg414Arg
T/G 48519867 downstream_gene_variant
G/C 48520072 missense_variant p.Ala511Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10789.1
MYIAPLEISGRGATVIDEISQHPTSNPLIQCYSLDLNNQSHIINGISMLSGEQGEPTSNVHADACFISPSTIADSTPLVTSRRKTIVGDASNPMANSEFQEHLVGGVPLTPASLAAILADRIGLEENLENSAAALAPSIFSTGALEVFFNNLHGTSNPWFGTFEECAYNEIPSKWNANKFPKAPENDGTCQPYSSVANLDPNVWATSNVANMANYAHYSSNFSKELSLSLATSTAAGQCSDVTCSNMTPCMNGTISCSSSREISMNLGGNKHAQISPEVLESRYLLGIQEILAQIARYSFQNLEQLNYSAPGNRAGGHKSTSAFPPKRNILTDHNASSVYESHAESPLQRQAAESKKAQLLALLQLVDSRYSQCLDEIHTVVSAFHAATELDPQIHAHFALQTISVLYKDLRERISNYILAMGSSFKKSCTEDSEWSIETSFLQKQWALQQLKRKDQLWRPQRGLPERSVSVLRAWMFQNFLHPYPKDAEKHLLAVKSGLTRSQVSNWFINARVRLWKPMIEEMYAEMNKRKACRNEEEIQNNHGNRISMSNQRFNVN*


CDS Sequence:
>Vu_10789.1
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Promoter Sequence:
>Vu_10789::LG2:48516086-48518086(+)
GCTAAACTAACTTATAAATTTGTCAATTATATTTTAAGTCACTACTGTAAACTTTTCCCATACACTTTTTTATAACTTAATAGTATTTCGCCGCGGACAAAGTAAATATATATTGTTTTCTATGCCGACTTCACTTATTAACTAAGCCAACAACGTACTCGAATCTAAAAGTAGTCACAATTTCAAATTACTTAAATATTTACAATTATCATCATTAAAACATTTAAGTCCTAATTTATTTGTAACCACCATTGATTTAACATTTTGTTTTTATTTTTAGCATAAATATAGTAGTAGAAGTGGTCTTTAATGAATTAAATCACAGATATGTGATTTTTAATAAAAAACAGTAAGAAGCGTGTTGTTACATTTAAGTAAAGAATTAAGAACCATTAGGATTTAATAACAGAATAAAAAGAAGTTACCTAGATTTACAACCACTATATTAATTGTATTAATGAAAATCATATAAAACTTCAATTACGTGGGTCCCACAAAACCACTTGTACAAATTATTCAATAACAAAGAGTGTAAAGATACAGTTTTTAACAGAAAAAAGAGTGCAAGTCTATTATTTTGACAGTTTGCATTTGCATGATGAACATAGAGAGAGTTTATGAGTGTAGGTATGGTAATTACCCGATATGCAAAGTTAGAATTCTGTATGAAGTAATGAATTTGGTGATGCAAAGGTAGAAATGTGGTAAGTAGGTAGTAAATAAGAGTAGTAATAAATAAGAGTTGGCACAGGTTCATTCGGTTGCACAGTATAATCCATTTATCGGAAATAACAACAATAAATTCATGTAAAAGTAGGTAGGATCATCCTAGCTACCAAAAATTGTTCGTCATGAGATGGTTTGCTTACATCACTCTTTGAATCTCCTCTCCTGTGTCTGGCCACCACAAAACCAAGAAAGGACACTGCCATGAGACTAAAACAACAGTGTTTCACTTTCCCTGTCCCTCTCTTTTCATTTGCCTTGTGCGCTTAGTTGTTACATTCTGACGGAAAAGCTTGCAACCCCATTTCTTTATTTACTCTCCTTTCTCCTCACATTAGCCTTCTCGTATTAAAATAGCTAAAAAGCAAAGGGCTTTCTCTGAAAATGTTTCTGAGGTTACCTGCCATGAACAGGAGTTTGAACAGAGAGAATCCATATATTTTGATTATGATGATTGCAGTGAAACAGATAATAAGGGGTGTTGAGGAGGACAAAAGAGATCAGAGAGAGAGCCAAGACATGGGCCCAGTAAAGCCTGCAACACAAATGAGTGCCACTGCACCAAACACTGATGTCTTCACCCTTCTCCTCCATCTCCCCCTCTTTTCTGCCTCTTTACCTTTCCCTCTTAATTTATGGCTTTTTTTTATTTCCATTCGTCTCCAACATCCCCACTTCCTTTTTCATTCTCTTTTCGACTTTGACTCACCTTTCCATGCTCTTCTTCTTCAACTTCTTGTCTTTAATGTGCAAGACTAGAGGAAAGCTTGATGGGGTCTAAGGAAACGACACTCTTGTTTTGGGCTTTGGACGCTTGAAGAAAAAGATTTTCCTGTTCATGCAAAAGAAACCAACACAACTTTCGTGTTGGTATTGTTTTTTTTTTTTTTTGGCATGGTGTAAGCAACTTTGGAATGCCTTGGTTTCTATTTCTTGCTTTTGAACAAATATATAGCCTTCTTTTTCATTTCCCTTTCACATTCTTGTAGGTTCTCCAAAGACAACATATATTGGCAAGGAGTTGTTAAGTGTTACTCCTTTGCAGATTAAGTGAAGGTCGGTTTTGCTAGCTCGCATCATTTTGGTTTGATACTTGACGTCTTTTGTCTGTCAGTTGATATTTTTATAACTAATCTAAAAGCATTTTTTGATTATCTTTTATTTATCCATTTCAATTTTGTTTTCTAGTTTATCAAAGTAAACCTTCTCTGGAAGACAACTTCTAAATCAATAGCCTCATTTATTAATTACTTGTTATTTGATGGAGAGAGATA


Gene Sequence:
>Vu_10789(+)
ATGTATATCGCTCCACTGGAGATTTCTGGTCGAGGTGCTACAGTAATAGATGAAATATCCCAGCATCCCACCTCAAATCCTCTCATTCAGTGCTATTCACTTGACCTTAACAACCAATCCCATATCATAAATGGAATTTCAATGCTTTCTGGAGAGCAAGGTGAACCTACAAGTAATGTCCATGCTGATGCTTGCTTCATTAGTCCATCAACTATTGCTGACTCCACTCCATTAGTTACATCACGGAGAAAGACTATTGTGGGAGATGCCTCAAATCCCATGGCGAACTCTGAGTTTCAAGAGCATTTAGTTGGAGGAGTGCCCCTCACTCCTGCTTCGCTTGCTGCCATTCTTGCTGATAGAATTGGTCTTGAAGAAAATTTGGAGAATTCAGCCGCCGCCCTAGCTCCCTCAATCTTTTCCACGGGGGCACTAGAGGTATTCTTCAACAATTTGCATGGTACTTCAAACCCTTGGTTTGGAACTTTTGAGGAGTGTGCTTACAATGAAATTCCTAGTAAGTGGAATGCTAACAAATTTCCTAAAGCTCCAGAGAATGATGGAACTTGTCAGCCCTATTCTTCTGTGGCAAACCTGGATCCAAATGTATGGGCTACATCAAACGTTGCAAACATGGCCAACTATGCTCACTATTCCTCTAATTTTAGTAAAGAACTTTCTCTGAGTCTTGCAACATCTACAGCCGCAGGACAGTGCTCAGACGTGACTTGCTCTAATATGACCCCGTGCATGAATGGAACCATTTCCTGCAGCAGTAGTAGGGAAATTTCTATGAATTTGGGTGGTAATAAACATGCACAAATTTCACCAGAAGTACTGGAATCGAGATACCTTCTTGGGATTCAAGAGATACTTGCTCAAATTGCAAGATATTCATTTCAAAATCTGGAACAGTTAAACTATTCAGCCCCTGGTAATAGAGCAGGTGGACACAAGTCAACTTCAGCGTTTCCACCCAAGAGAAACATCTTGACAGATCACAATGCAAGTTCTGTTTACGAATCTCATGCAGAGTCTCCTTTGCAAAGGCAGGCTGCTGAATCTAAGAAAGCTCAACTGCTGGCACTTCTACAACTGGTATGACACTGCATAAATTAATTCTTTTGATGTTCATATTAATTATGGTCATGGACAGAATCATGTTAGTAATACATTGCACTTGTCCACGTTCAGATTCATGGATGGTATATAAATTGCTAAAGTTGGTTCATAATAATGGTCTAAAAAACGGATAAGTAGAGGTGTTTAAGAGTAGAACGTGTAAGTTTTCATCATGAAATATTGTCATACAACTAACTAGTAATCTCTTTCTTAATCAGGTGGACAGTCGATACAGCCAGTGTTTGGATGAGATACATACTGTTGTATCTGCATTCCATGCAGCTACCGAGCTGGACCCACAGATACATGCACATTTTGCTCTTCAAACCATCTCTGTCCTTTACAAGGACTTACGGGAGAGGATTAGCAACTACATTCTTGCCATGGGATCAAGTTTCAAAAAATCGTGCACGGAAGACAGTGAATGGTCTATTGAAACTTCATTCCTTCAAAAGCAATGGGCTCTCCAGCAGTTGAAAAGAAAAGATCAGCTGTGGAGGCCCCAGAGAGGCTTGCCGGAAAGATCTGTCTCGGTTCTACGGGCATGGATGTTTCAGAATTTCCTACACCCGTGAGTTTCAAATATGCAATATGCCTTCTTGGACTGGCTCTATACTTCAATCATCAGAGTTTTATCCATGAAACGAATTTAAAGAATATATGTAAAGAAAGTATTTATTTATCATTTGATGGATTTCAGGTATCCGAAAGATGCAGAGAAGCATTTACTGGCAGTGAAAAGTGGGTTGACTAGAAGTCAGGTATTTATCTACTTGTTTGTTTGTTACTTTGTTCAAAGATGAACGATCTGATATGCTTGCTTGGTTGTGTCTTGAAACTCAGGTATCCAACTGGTTTATAAATGCTCGTGTGCGGCTGTGGAAACCTATGATTGAAGAGATGTATGCTGAAATGAACAAAAGAAAGGCCTGTCGAAATGAAGAAGAAATCCAGAATAACCATGGGAACAGGATAAGCATGAGTAATCAAAGGTTTAATGTTAACTAA