Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10787 LG2 48503350 48504950 PREDICTED: transcription factor MYB1R1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 48503413 missense_variant p.Arg182Gly
A/T 48503480 synonymous_variant p.Val159Val
G/C 48503520 stop_gained p.Ser146*
T/A 48503898 downstream_gene_variant
T/A 48503904 downstream_gene_variant
C/G 48503954 downstream_gene_variant
T/A 48504302 downstream_gene_variant
A/T 48504303 downstream_gene_variant
G/A 48504369 downstream_gene_variant
T/C 48504504 downstream_gene_variant
C/T 48504580 downstream_gene_variant
G/C 48504598 downstream_gene_variant
G/A 48504744 synonymous_variant p.Arg69Arg
T/C 48504869 missense_variant p.Asn28Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10787.1
MGIARKCSYCGKLGHNSRTCKSPLGHGNLKLFGVQLDISSSSSSSTISFSSPSYSALTNHFFSSSPSFRDENQNSDAFLLTANTLLSRIQDTKKGVAWTEEEHKVFLLGLQKLGKGNWRGISKSFVKTRTPVQVASHAQKYFLRQSHNTFHKTKHSRTLFHVPSSSTSTSSSSNCTAQMPHPDLELKLATPMPLELYQMHDF*


CDS Sequence:
>Vu_10787.1
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Promoter Sequence:
>Vu_10787::LG2:48504950-48506950(-)
GACTATTAGACATACTGATATAACTATGAACATAAAATTAAAAAGAACTTTAATATTAAATAATAAAATAATTATAAAAATAAAATGTACGATATAAAAAATAAAAAATGAAAAAAACTAATTATTATATACCATCATTAATATTTATAACTGTAAAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAAAAACAAATTATCAGAGCTAATATTGTAAAAAAAAAAAATTACCAAATATACCTAAGAAATTTACCAATCTTTTCTGTTAGTAAAAAAATGCTGTATCATAATAATGTATATGTACTCTTAAAAATTCATAATTTTAGTTCCTAATTTTGTTTAACTTTTTTATTCTTCGATTTGTTGCTATTTCTAACTCAATTTCGATTTTAAATTTAAAAAAAAAATACTTTTACACTTAAACGTTTGATTAACTAAGTAAGATTTGTTGACTAAAATGTAAAAATAAATAAATAAGATTTAAATATACCCTGAATCATTATCAACACTTGGCACTCTCTCAATCTTGTAAAAGAAAGTCACATATATGAAACTATTCTCTCCTATATCACCGTCTCATGTCCAAAGTACGAGAAACTTGTTTTTTTTTTCTTTTCTTTATTGAACTCCATGACTCAAAGACTAGGTTTATCGAACTCCATTTACATCTCCTTCTTAAAATATATCTATTTAAAAAATATATTGCTTAAATAAACTTATTTCTACTTTAATTTCCAAACTAAATTTGTTTGTTGTTCATCAGTTGAGAATTTGGTTTTTGGAACTCAAATTCTCAATAATACTACTGATTTTTTTTAATTTAAAAAAAGTTAAAGAAAAGAGAGGTAAATAATTGTTTAAGTTGAAAATTCTGTTGTGAAAAATGAGATGTGGGTTGAAAATATGACGTCAATTATATATCTATCTATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACCTCATTTTAAAAACTATTTTTATGGCTTGAGTTATTCTTCAAATCTATTTCTTAAGAATTAGGAACATAAAAAATAATAAAGTTTAATTAAAAAAGTTAAAGTAAAATTAATTAAATAGTTTATTAAAATGGGTTTATTTAAAAAATTCTCTCGTATATATTTTTTATTCATTAAGTCTCCTTTAAAAGAATTATTTGTTCAAGAAAGCTATGCAAGCCTTCCATAATTTGAAAAAAAAAATCATTCTTACAACATAATTAAAAGACAAGTATTTGTTTTATATTTTATCTTTTAATTTTTAAGCTATTAAATCAAACACCATCTAATCAGTTAACTTTATAATGGTAAACTTTTAAAACCTTTTTGAAATTAATAAATTAAAAAATAACTTAAAGATTAAAACAGTAGATTTTGTAATATATATATATATAAACAAAACATACAAGTAAACATAAAAAAGCTAAAAACTTGTCACTGAGTAATCAAGCATAACCAATATGGACAGATAAAGAAAATAATGACTAGTAAAAATAGGAAACATTAAAATAAAAAAAGTTATTTATAAAACGGGAACGTACCTTTATTATATTTTAATGTACGGATAATACTATTCCCAGATGATGGGTGATGTAGTGCAGGCATAGAAGGAAGAATAATTCTCTTGATTCCGCACTCCTAAGGTGCCACTTGACAAGATAATTGATTATGTATTAATTAAGAAAAAGCTTTTTATAAGGTCGTCCAATTATAGTTTAAAGAGAGTTCTTAGATTTCTTTCTGTTTTTGGTTTCAACTGCAAAACCTTGGGTTGGAAAAAGCTCCCAACAAAAAACTATGTTCTATCGCTATTTTTTACTCCAATATTCAACCTTTTTGCTCCCACTTTGCACGTTAACAATAGCGCCACCAAAGACCGCACAATTAATGCAAATAATCTATCATTTCTATGCCTTTTTCTTCGGATTTCTGACTCTATATATTCCTGTCTGTGTGGTTTTCTGGTCTCCATTAGGTAGCAGCTTGTTTGATAAGTTTAAGAA


Gene Sequence:
>Vu_10787(-)
ATGGGAATAGCCAGAAAATGTTCATACTGTGGCAAATTAGGTCACAATTCAAGGACTTGTAAAAGTCCTCTCGGTCATGGAAACCTGAAGCTCTTTGGAGTGCAGCTTGACATTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTACTATTTCTTTCTCTTCACCTTCGTATTCTGCCTTGACCAACCACTTCTTCTCTTCATCTCCTTCTTTTCGCGATGAAAATCAAAATTCAGATGCTTTCTTACTCACTGCCAATACCCTCCTATCGAGAATTCAAGACACAAAAAAAGGTTATTTTTCTTTCTTCATCTGTTATTAATTCCAGTTATTAAGGACTTTTTTTTATTTCCATTTGTTTTCAGGAGAAAATCGTGTGTGTACATACTTCTTTGAAATCATTGTTATCAATTTTTAATATGTTTATTTAAGATTTTATAAAATGATAATGTTATTATTCTTATCAGAGAATGAAGTTAGCTTTGTGTGAAGTTGAAATTTGCACTCAATATTGTAATTTGGTCACTCGTTTAGTAGAATATCACATGCTAATGCTATAAATAACTCTTTTAATGAATTTATGGTATGCTGCAATATTATATTAGAAGATTAATTTTAAATATAAACCAACCTTTAATGAATAATAACTAAATAGTCTATTTTTTTTTACTAAAAGTCCAAAAAGAGAAAAATTAATATAAGGTAAAATGAGTTATGTGGTATACGTTATTTTATAGCTTTTTAAATAAATAATCACATTTTATGTTTATAATAAAATAACACTCACTTGCTTTATATTTTTAATAAAGTGACACATCGACACATTTTATTTAAAAATATCACATTAACTAAAATTTGAATAAAAATCGAAAATAAAACTTCAAAAATAAAAAAATAAATTAAAAAAAGGAAAAATACATTTTTTTATGAATAAAATAAGAGGAGCAATATTGTTACGTTATAAAAAAAAGAAATGAATATATATTTAAAAATTACAGACAGTACAGAAAGTATTCTATTAAAAACATAAAAGAAATAAGTTTTTATTTTAAAATTAAAAAGAGTTCGAGTATTATTAGTAAATAAATTTATTGAAGAAAGTAAATCACTTCTTTTTTAAAGTTAAACAAGAGGGCCAAACTAAAAGAGTGCGACTTTACATAAACAATTTCTGACATATCTAAGGTGAAACTATTGTATAATGTATATATAATAAATATTGTTTTACATAGATAAATATTGATGGTGGTTTGTAAGAAAATGTTGTTGTCTGTGGAAAGTTCAGGTGTGGCATGGACAGAGGAGGAACACAAGGTGTTTCTCTTAGGGCTACAGAAGCTGGGGAAGGGAAACTGGAGAGGCATATCGAAAAGTTTTGTCAAAACAAGAACACCTGTGCAAGTTGCAAGTCATGCACAGAAGTATTTTCTCCGACAATCTCACAATACCTTTCACAAAACAAAACACTCTCGTACCTTGTTCCATGTCCCTTCTTCTTCAACTTCCACTTCATCTTCATCTAATTGCACTGCTCAGATGCCACACCCAGATTTAGAACTCAAACTCGCAACTCCCATGCCATTGGAGCTATATCAGATGCATGATTTTTGA