Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10742 LG2 48088277 48088975 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 50
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SNP Position Effect Amino acid change
A/T 48088300 synonymous_variant p.Pro8Pro
G/T 48088304 missense_variant p.Asp10Tyr
G/T 48088352 stop_gained p.Glu26*
G/A 48088397 missense_variant p.Asp41Asn
A/T 48088455 missense_variant p.Glu60Val
T/A 48088733 splice_region_variant&intron_variant
G/A 48088963 missense_variant p.Arg157Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10742.1
MSGDNPKPPDSPESDFTKQWPSELSEYLNLDDDQWSYDDLDSFVSGHAFSHKTEANEVGELGGSSTHHEEFSIGDDGDEHEKKEVRDRVAFKTKSEIEIMDDGFKWRKYGKKMVKNSPNPRNYYRCSVEGCSVKKVVERDKDDPRYVITTYVGTHTHPSYS*


CDS Sequence:
>Vu_10742.1
ATGAGTGGTGATAATCCAAAACCACCAGATTCACCTGAGAGTGATTTCACCAAGCAATGGCCTTCGGAGCTCTCCGAGTACCTGAATTTAGATGATGATCAATGGTCATACGATGACCTCGATTCATTTGTTTCAGGGCATGCTTTCAGCCATAAGACTGAAGCCAATGAAGTTGGTGAGCTTGGAGGAAGTAGCACCCACCATGAAGAGTTTTCTATCGGAGACGATGGTGATGAACATGAGAAGAAGGAAGTGAGAGATAGAGTTGCGTTCAAAACAAAGTCAGAGATAGAAATAATGGATGACGGGTTCAAGTGGAGGAAGTACGGAAAGAAGATGGTGAAAAACAGCCCAAATCCAAGGAACTACTACAGGTGTTCAGTGGAGGGATGTTCAGTGAAGAAGGTAGTTGAAAGGGACAAGGATGATCCGAGGTATGTAATAACAACCTACGTAGGCACCCATACTCATCCGAGTTACAGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_10742::LG2:48086277-48088277(+)
AATCAGTTAGCCAATAATATCAAATAACATTTCACTGCTTGAGCTTATCATAATAAATCACTGAAAAGTCACATAAATGACTTAAATATCTATTTTGGAACCACCAAATTTAATTAAAGACAAGCTTGAAATATATCGTATTGAGTATAAAGTTAGGATCACATGAATATTAAAAAAATAATACAAAATATAAGTTACGTTATTTATGGACTTTAAAATAATTAAAATAATTAAAATAAAATGACGTTGACTTTATAGATATCATGACTCTCTTTTTTCACAATATTATTATTATATTTTATTTTATTAGAGATAGATTCAGGTGAAGTAATGCACAAAGTGTATATCAGGGACTTTAAAATTTTATAAAAAGACAATTTTCTATAAGGGTTATATATATATTATATATATATATATATATTAGGTTTATTGTCTTAAAATTTTTTTAAAATAAGTATCTTCTTCATACATAGAGTAAATTTTGATTTCATATATTTTTTATTTTAATAAAGTAATTTTAGGAGAATTATCATACACTCCATTTATAATATATAACTTTGTGATACTTACTACTCTAGAATTGGTTTAAGGCAAATTTCAAATTGTTTTAGTAAGAAAGAATATATGTTATAAATTCACAAGTAATAAGTATTGTTATAATTAATTAGTTATAATTAAACAGGAATAATGGAATGCATCAATGGTCTTTCTATTTTAGAAAAGGAAAGAATTACCAACATTTCAATACTTTGCATAGAGGATTATCATTAATAAAGTAACTAGATGACAATCCACAAAATAGGAGTATTGAAGTGGATATGACATTTAACATGTGTTAATAAAGCAATGAAAGTAGCAGTGGAAGACATGAGTGTTTACGACCTTTTATTTATTTATTTTCTTTGTTTACAAAAAAATGTATAGATATTTTAGATTAGGCTTAATACCCTATTTTGTCCCTAGTTTCGCTCGAAAATGTCAAATTAGTCCATCTTTTAAAAAATGCGTCAATTACGTCCTCACTTAATAAAATTTGCATCAATGAAATCCCTTCCGTTAAATCCGTACAAACGGCGTTAATTATTTTTCTCTCTTATTAAGTAACGCCGTTTGTACGGATTTAACGGAAGGGATTTCATTGATGCAAATTTTATTAAGTGAGAACGTAATTGACGCATTTTTTAAAGGACGGACTAATTTGACATTTTCGAGCGAAACTGGGGACAAAATAGGGTATTAAGCCTTTACATTATTTCAAAACCAACTTTCTATTACAATATAAGAGAGCAATCAAACATATCTATTAAGATAACCAAAAACTAGTGGTTCGAAGGAACCTCAAAGCACCATCACTTTTGACTTAGTTCTCACCTCTGTGAAGGGGTTGGTCTAACCACGACACTCAATAGCCAATTAAAACTTTAACAGGTTACGTACTAATCTAATATCAACAAAAAAAACTTAACACTATTGGAAATAATTAAAATATATATTTTGTCAGCTCAAATTACTTTAAATTACCAGCTCTCCTTTTTTTGTTTTTCCTATATAGCAAAGCAATTAACTGCATATTATTAAAATTGGTGGAAGTTGTATTCTGATTACTTATAATTGATGAGCTATATATCCTTTAAAAAGTCATTTTAACTTTATATGCGATCATTTTTATATTTGAGTAATTAAACTCATACTTTAGAAAGTCTTCCTGAGTCATCCGAGGCATGTCCCACACTCAGTGTATGTTTTCTTACATTTTTAACTGACATTAATGGATACCTACCATTGTGTTTTTAGAGACACGTTATTACTTTTCCATAAACTGGTTCTCATGATCATATTAAAGAGGAGTTATTTATGTGTCATTATATATATATAGCCGTAGAAGCTTCCTAATGTAGTTCGTAGGAAGGTCACAAAGAAGCTGCCTCGTTTAGAAAAAGGCTATGGGGTTTATATTATGTGAGCCATAGTCCATTCTTTTCGTATCAATGGTGCCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_10742(+)
ATGAGTGGTGATAATCCAAAACCACCAGATTCACCTGAGAGTGATTTCACCAAGCAATGGCCTTCGGAGCTCTCCGAGTACCTGAATTTAGATGATGATCAATGGTCATACGATGACCTCGATTCATTTGTTTCAGGGCATGCTTTCAGCCATAAGACTGAAGCCAATGAAGTTGGTGAGCTTGGAGGAAGTAGCACCCACCATGAAGAGTTTTCTATCGGTAAATGAAGTTCCTGAAATGAAGTTTATTATGCTTTATTTACACCTTGTATTTTTCTTAACTTGTATATGTGTCTGGTTGTGTCGTAAAGGAGACGATGGTGATGAACATGAGAAGAAGGAAGTGAGAGATAGAGTTGCGTTCAAAACAAAGTCAGAGATAGAAATAATGGATGACGGGTTCAAGTGGAGGAAGTACGGAAAGAAGATGGTGAAAAACAGCCCAAATCCAAGGTGTGGGAGATTATTGCATGGTTCATCACGATTGTCATGACAAGTGTTGTTTATGTTTTATTCAATCTTCCATATACATATATATTAAAAAACTTTGTTATATGATAAATATTGTTTTACAGGAACTACTACAGGTGTTCAGTGGAGGGATGTTCAGTGAAGAAGGTAGTTGAAAGGGACAAGGATGATCCGAGGTATGTAATAACAACCTACGTAGGCACCCATACTCATCCGAGTTACAGTTAA