Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_10733	LG2	47979219	47990972	hypothetical protein DEO72_LG11g3381	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
G/T	47981201	missense_variant	p.Asp476Tyr
G/A	47981222	missense_variant	p.Ala483Thr
A/T	47981338	intron_variant
C/T	47981426	intron_variant
C/T	47981436	intron_variant
G/A	47981455	intron_variant
C/T	47981480	intron_variant
A/T	47981686	intron_variant
A/T	47981702	intron_variant
T/C	47981857	intron_variant
G/A	47981871	intron_variant
C/T	47981967	intron_variant
T/C	47982003	intron_variant
A/G	47982005	intron_variant
T/C	47982015	intron_variant
C/G	47982096	intron_variant
G/A	47982277	intron_variant
A/G	47982609	intron_variant
T/C	47982964	missense_variant	p.Tyr558His
T/C	47990744	synonymous_variant	p.Asp1405Asp
G/A	47990786	synonymous_variant	p.Glu1419Glu

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10733.1

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CDS Sequence:
>Vu_10733.1

Promoter Sequence:
>Vu_10733::LG2:47977219-47979219(+)

CATACATATATATATATATATATATATATATATATATAATATAATAAAACAATATTGGTTAACACTACTGGGTCACGTTATACAGTGATTGATTTATTTTTTCTTTTTCAATAAAATTACTTAATTTTCTTTCATTGAATCTCTTCGCAACGTTTGTTAACAACGACTCTCTTATATTCTGTTTTAACATAGAATTTGATATTTTAAGTCGTTTCGGTGTAAGAAACGAAACAGGCCATCCAGTTTAATTTTAAAAAAAAAATCAATAAAACTGTTTTTTTTTAAATCGATTAGTAAAAAACTGATAGTGAGTGGCTCGATGAAAATATTCTTTAGGGTGTGTTTAGTTGGAGGTAATTGAGGGAGAGTGATTGGGGGAGAGTGATTGAGTGGATTTGAGAGGATTTGAGGGTGATTTTTGTGTGTGTTTATTTGAATGGATTTGAAGGTAATTGAAAGTGAATTTTGGGTTGAAGTTTGTGAGAATTAGTGTAGGATTTGATTGATGTGACAGATTTAAAAAATTAGTTTAATTGGTAGAAATTAAAGATTACCAAAATGTCCCTAACTATTAAAGTAATATAAAATGTTAATTTTTAATGTTAAAGAAAGGAAATTAATTAATAATAATTAAAATTAATTTTAAAATATTAAAAAAATTATAATGTAGTAAAATAAATTATTAATGTTATATTTAATTTTAGAAATGTTTATAAGAAAAAAAAGAATTAAAATTAATTATTAAAATGTAAAATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATTATTGATTATTACTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTTTATTTTGAGTGTCATTTTTTTTTATGAAGTATCTGGTTCCTCATTTTAATAATTCCTCTTATTTACAACCAAATTTCTCTTTATTTTGTGCTGGCTCTTGGGATTGCTTGAACATGCAGAGATGTGTTGGTGATAGTGGATCTCTGGCCGGAAGCCAAGACAACTGGATCCTCCACCTTTGTGGCATTTAATCCAGCATCCACCACCAAAGCAACTTCCAGCTTCGTCGAACATGGCGCTTGCACCTCCACCACGAAGCTTCAAAGCTTGGAAATGCTCCAGCGCTGGAACTGAAAACACTGGCAGTCAAACGTCAGCTTCAGCCACTATTCTTCATCTTGTTCGGCTTCAAACTTCATCTTCAACCATCATCTTCATATGGAATCAGTTATTTCATAGTTAGAATCGATGCACGTAAGCTTCAGGACTTGGACTGGAATTATATAATAGGCAAAGGGTAAAGAAGATATTGTATCGACAATCCTTCCAAATCGTCGCACTCTTGCGGGTGATGAAAATTTTATAAATCTCGCAAATCCGCGCCTTACGTCTCCCGCAAATCCACTCCTTTCATCTCAAACGAACATAAAAGAAATCGTATTTCTTCGCTCTCAAATACTCTTGAACAGTACTTTCTGTTGAAGCGAACACACCCTTAAGAAAGAGGTATTTTATGATAAAATATTCCGTACAATAATAATTTCTTTTTCTTAGTAAAATATCTAAATGACCACTGATATTTTGATTTATTGGACACAATGTATCAATGCAAATCACATATAAAAGTGTTTTGACGTGCATCACATATAAATCATCTCAAGATGGATCATAGAAGATCATCGGACTTTTTTCGTACTGAGATCAAAACACACATCTTCATTTCTCACCACCATTAGTTAAAGCATGGCAGAACCAACCAATGATGAAGGGTTATAGAGGAAAGTCTCTTAGTAATAGTTTTTCATAACAATCAACAAACTTCAAATTTTTCAACGGTCAATAACTGTCAGTTGCGCCCCTATATATTTCTCATGCATTCCATCAAAATTGTCTGTAAGAACACTAGTTGTCTCAATTACCAACAAATCGTGTCTCAGTGGCGGCGCTGTGTTTTTGGCGCCGCTACTACACACATTTCCATTTTTTCCACAGTGATTAAGGGTGTTTTTCTCCA

Gene Sequence:

>Vu_10733(+)

ATGGATAATAATTGTAATAACTACTCCGACTCATTTCACAGTCCACTTATCGGTAACTACATCGAACCAGACCCTGCACTTATCTATATATTAAACGACCAACCCAATGTACAGCAACGAAATGCACAACAAAATGATCCTTTTATCGTTGAACAGGATCATGTTTCCTTCACTGGTCTAACGATTCAAGATGTATCCACGCATAGCGATAATGATTTCACCATAGGAGGAGTTCCTAATTTGGTAAACGGGGGTTGGTCGACGAGGAAGCGTAAATTTCCCTACATGGATTCAATGATTGAAGATCATCCCGTGCATGGCGATAATACTTTTTCCAACGAACTTCAATTTTGGCCTCCTGGGCCGTTTGATATTGATATTGATGCCTCATTTGATCCATTTCTTCATAATTTGATCGACCGGGACATCTCAATTTTCGATCTATCCAATGATGAACTCATTGCACCCTCTTCTCAACAAAATGCATTGCCCCAGCACCAACACGCTGTGCCAGGGCAACAAAATGCACTTTGCAAACAGCCAAATGCGCCGCCTCAGAACCAAAATTTGTATCCCTTTGGCCTTGAACAGATTCATGTACCCATTTTGAATCCAACTTTCCAAGATCAATCCTTGCATGTCAATTATAATTTTGCAACTGGAGAAGTTCCTAACATTGACATGGAGGGTCCATCAAGGAGGAAGGTTAAACAACCCATGGCTGAACATCCATTATTAAAGCATGGTATACTGAACGAGGAAGATGTGGTAGCACTTGACCATTGGCCCCCGTCACCAAAGTCACTGTCTTGCTCTTGCTGTCAAATTCTTAGACAAATAATTCATACAGATGGTAATTAAGTTTATACACAAATATATATTAGCCAGTACGTTTTTCGTCCTCGTTTTCATTTTCTTTAAATTTTAAACACTCCGCAGGTTTTAAGTTCGAAAAGTTAGAGATTCATGGATCGCTTGGGGTGATTGGCCATGCGATATTCCACGTTCAGGATATGACACCGGGTGGTGAACCTCCAAGAGAAGTTTATCAAATGATAAAGCAAGTTCTAACTTCCATATGTGTTGCTTTGGTGGAACTATATATTTATTTGCATTGAAGCATGAACATGTGTTTAATTATTCAAAACAATCATTGTGAATTAAAGTCATAGTTTTTAGTTGCTATATCTGTCGTTATTAACCTTCATCTTTTCTGGTATTACCAGTTTCGGCCTCAAAAGCATAGAACAAATAAGGAGTTTCCTGGTAGCATACTGCAAGGACCAGACAAGATTAGGGTTCGTCACTCTGGATGATCCGTTATCTGCATATTATGATACCATCTGCACTGGACTTGATTGGGCTGAACATAATGACGGGGACGATGACTTGAGTCCACGTTGGTCTTCTTCTCTTAATTCTCAAGTTTCTCTTCGACCAATAATGACAGTTTCACTCTGAATTTTGAATATTTTTTTCTCCTGTAGTTAATGGCACAGAGCCCGAGTCTGATTCTGAGCCCGAGCCCGAGCCCGAGAGTGTTCCGGAGCCTGAGACTGTTTCTGAGCCAGACCTTGTTCCCGAGCCTGGTAATGCAGAGGCTTCAACTGCTAGGCCTAAGCCTAAACGTAATATGGCAGTTCAGGTAAGAGTTTTTGTTTTCTAGAGAAGTTTTGCGTTTGCGCGTAAATACCACTTGTTTTAATATTGTCTTTTATTTTTTTACGTTACACAGAGAAAGAGAGTACCAAAGATGACAATGAATGATTTGAGCCCTTTCTTCCATTTAACTATCAGGGATGCTGCAGATAAATTGGAGGTAAGCGACTCTGTGGTGAAGAAAATCAGTCGCTTGGGAAACTTAAAAAGATGGCCACAAAGAAAGGTTAGATTTGTTGTTTGATTTTCTGAACATCATGGGATTCTTTTTGGATTTATCACTATATAGGTGTTGATGTGTTCAGCTGCAAAGCCTTGCGAAGGATGTGAGAGTGTTGAGAAAAGCATTGGATTCGCCCTATGAAGGGACAAGGCAGAGAGTTCGACAAGAAATTCAACGACTCCAACTAGAAATGGTAGCGATCTGTGGTGGAGTTACCCCAACCGGAATAGAAATGGAAAATGTTATTTGGACAACAAAAGTTTGACACAATTTTGACAACGGCGACGTGGCAGCTGTGCATTGGCTCAGTGAATTGAAAACAAACCAGAAAAAACCCAAAATACCCCTCACCCCGGTTCACTGAGCCAATGCACAGCTGCCACGTCGCCGTTGTCAAAATTGTGTCAAACTTTTGTTGTCCAAATAACATTTTCCAATAGAAATTATCCAATTCGAAGAAGAATAGATTGTGGTCAATGTTTTCCTAATTTTTTTTTGTTTCTTTGTGACGGTCTGCTTGGTTTATGACTTTTCACGGTGGTGGTGGTGGTGATAACGAGTGAGTTTTTTTTTATATATATATAGATTTTTTGTTTTGATAACAATAAGATTATCTTTTCAATATTTTTGACATTATCACGAATTCGTTTTTATATCTAATTAAGTCAACCTCTAACAGATATTTAAGTTATAAGATACTGTAGACCTCACTCAGCGAAAAACCAAACATGGCAGTTCCAATTAAAATAATAATAGTTTGAGACACTTTTGCTTTAACATTCAAGTAGTGGTTCCACAGATAATTTGTTTTAGGAAAATAATTATTACACACCTAAATTTTTTATATTTATTTGATATTATTTTTACTTATTTTTTATTTTTTGAAAAAATACAAAATTATATAATTTTTTAGATCATTTTAAGTTACATCATCTTAAAAATCACTAACATATCACGGTATCAAATGAATGGATTTGACAAGTATTTGTTCTTTTCGAATTATAGAAACTTGTTGAAACTGTAATAATTATATAATAGAAAATGGGTGTTTTACTTTGATGAAAATTTCACTGACAAAAATAAATGGAATGTGTGAGGTCTATTAATCATATAAAAACTAATAATAATAATTGAATTTATTAAAACAAAATATAGTCTTTATCCTTATTTGACTTGGCAGCTATCAAATTAGTTGTATATGTGTGATGATTAATGATACTATGGCACATTTTTACGTTAATTTGATATAGGTTACAAAGATAAAATAGTAAAAAAATGTAAACTTATGTATTGTTTTAAGAAAAAATAAAATAAAAAGTAAATAAAGATAATGTTGAATAAATGTAAAATATTTAAATGTGTGAAAGAATTTTACTCATCTGCTATGTATAGAAATTATTTAAATTGATTAATTTTAAATTTATATTTTGTATAAATTGATTGTTTTATGATACGAGCTTGTGTAAAAGTCATTTAAAGGGCCATATTTGGAGGGAAAGAAAAGTGTGACAGTAGATGGCTCGGGCATTTGGAAAAGTCATAGCAAAACCTTCTTCTTCTTCCCTGTCTTCTTCATCCAGCATTCCAAATCGAAATCTCTGCCTCATAACATCCATCACCTCAATCCTTCAAAATCTAAATCCCCAAATCCCAGATTTCTCATCTCTCAATAAATTTTCTCCTCACCTCACCCCGAACTTGGTCATTCAGGTGATCAAGAACCAAAAGAACCCATACCACGCTCTTCACTTCTTCAACTGGGCCTCCAACCCCAACCCCAACCCTAAGAACTACTCCCACACCCCCTTATGCTACGCCGCCATCACCGACCTCTTGCTCTCCCACTCCCTCTTCTCCACCGCTTACTCCCTTCTTCACCACTCCAACAAACTCTCTGACTTCCTTATCTGCAGATTCATCAACGCTCTCGGTCACTGCGGCGATATCAGGGGCGCCGTTCACTGGTTCCACAAAGCAAAAAACTTGGGAAGAGAACACTGCGTCTACTCATGCAACGCCATCTTGGGCGTCCTCGTCAGAGCCAACCGTGTCAATTTTGCCAAGGCCATCTACAATCAGGTTCTCTCAGAAGCTGTGGTAGAACCCGATGTTTACACTCACACCATCATGATTCGTGGGTTTTGCAAAGTGGGGATGGTCGAGAGTGCGCGCAAGGTGTTCGACGAAATGCGCTGCGAACGCAACATTGTTACTTATAACACTTTGATCCACGGGTTTTGTAAGAAGGGTGACATGGAGGGTGCGCGGTGGGTTTTTGACAGATTGGTGGAGAGTAAGAGTTGTGAGCCGGATGTGGTGAGTTTCACCACTTTGATTGATGGGTATTCGAAAATAGGTGAATTCCAAAAGGCGGTGGAGTGTCTGAAGCAGATGACGGAACGAGGGTGTTCTCCGAATGTTGTGACCTACAATGCCTTGGTTGAAGGTCTTTGCTTGAGCGGAGAAGTGGATGAGGCAAAGATGATAATGGGTAGGATGCGGTTGAATGGTTTGACAGATAATGTGGCCACAAACACTAGCTTGTTGAAGGGGTTGTGTATTGTGGGAAAGTCCGATGATGCTTTTAAGCATTTCAGGGAAATGGCTAGTCGGGGGATGAAGCCGGATGTGAAAGCCTATGGGGTTGTTGTGAATGAGTATTGCAAGATTGGAAAACCAAGAGAAGCAGTCTCACTTCTGAGAGAAATGGTGACGAGGGGTGTTAAGCCAAGTGTGTCAAGCTTCAATGCAGTGTTTAGAGTTCTTGTGGATGAGGGGAAGATTGATGAAGGAGTTCTTCTTTTGAAGCAGATGAGTCGGATGGGAAGCTCACCCAACTTCTTGTCATATTGCATATTGGTATGTGGACTCTGTGAAGTGAAGAGTAGGATGCAGGCAGTTGAAGAGCTTGTTTCAGACATGCTTCAGAATGGGCATAACCTGGACGCGACTATGTATAACTGCTTACTTCAGGGATATTGTGAAGACGGGGATGAAGAAATGGCACTAAAGACATATTATGACATTATGAACAAGAACTTTGTAATCAAGCAAGACGTTTTCAGCACATTTGTGAAGGTGATGTGTGCAAAGGGGAAATTGAAAGAGGGGGATACAA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